Orthogonal organic and aqueous-based washes of tissue sections to enhance protein sensitivity by MALDI imaging mass spectrometry.

Imaging mass spectrometry (IMS) is an emergent and innovative approach for measuring the composition, abundance and regioselectivity of molecules within an investigated area of fixed dimension. Although providing unprecedented molecular information compared with conventional MS techniques, enhancement of protein signature by IMS is still necessary and challenging. This paper demonstrates the combination of conventional organic washes with an optimized aqueous-based buffer for tissue section preparation before matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) IMS of proteins. Based on a 500 mM ammonium formate in water-acetonitrile (9:1; v/v, 0.1% trifluororacetic acid, 0.1% Triton) solution, this buffer wash has shown to significantly enhance protein signature by profiling and IMS (~fourfold) when used after organic washes (70% EtOH followed by 90% EtOH), improving the quality and number of ion images obtained from mouse kidney and a 14-day mouse fetus whole-body tissue sections, while maintaining a similar reproducibility with conventional tissue rinsing. Even if some protein losses were observed, the data mining has demonstrated that it was primarily low abundant signals and that the number of new peaks found is greater with the described procedure. The proposed buffer has thus demonstrated to be of high efficiency for tissue section preparation providing novel and complementary information for direct on-tissue MALDI analysis compared with solely conventional organic rinsing.

Introducció d'una empresa a l'extracció del coneixement a partir d'unes dades

Treball de final de carrera de l'àrea de mineria de dades que té com a objectiu la implantació d'un projecte de

Implementación y entrenamiento de un modelo clasificatorio de red neural sobre la base de datos IGBADAT para la clasificación de las rocas basálticas de acuerdo a las clases del sistema de clasificación tradicional de Yoder and Tiller.

Aquest treball vol implementar un projecte de mineria de dades en l'àrea de la petrologia ígnia, especialitat englobada dins la geologia clàssica.

Elaboració d'un protocol basat en XML per a una xarxa de sensors

La progressiva reducció de dimensió i cost en els dispositius electrònics, la dràstica retallada de consum elèctric i la independència de què això els dota han fet créixer en els últims temps l'interès de les comunitats científiques i tecnològiques per les xarxes sense fils de petits dispositius. Per altra banda, l'XML (eXtensible Markup Language) és un metallenguatge extensible que ha esdevingut un estàndard per a l'intercanvi d'informació estructurada entre diferents plataformes. L'objectiu d'aquest treball és explorar les possibilitats que pot oferir la introducció de l'XML en les xarxes de sensors amb l'elaboració d'un protocol de comunicació basat en aquest llenguatge i demostrar la transparència en el canvi de plataforma. Per fer-ho, es disposa de dos dispositius amb capacitat de comunicació sense fils equipats amb detectors de temperatura, lluminositat, efecte Hall i nivell de càrrega de la bateria. El projecte constarà de dues parts: una, més extensa, dedicada al desenvolupament del programari per a aquests dispositius, encarregat de obtenir les lectures dels diferents sensors i emetre-les per la xarxa utilitzant el llenguatge XML, i una altra, per recollir aquesta informació present a la xarxa, interpretar-la, salvar-la en una base de dades i exposar-la al món en una plana web. El programari dels dispositius sensors s'escriurà en llenguatge nesC dins el sistema tinyOS que és el sistema operatiu que equipen. La part d'explotació de les dades es desenvoluparà sota la plataforma .NET de Microsoft.

TFC Magatzems de dades: construcció i explotació d'un magatzem de dades de planificació hidrològica

Aquest TFC consisteix en la creació d'un magatzem de dades que automatitzi la recollida de dades de l'estat dels embassaments de la Confederació Hidrogràfica Nord-Est mitjançant processos ETL, per posteriorment tractar aquestes dades amb processos PL/SQL amb l'objectiu de poder explotar aquestes dades mitjançant eines de Business Intelligence.

Construcción y explotación de un almacén de datos de planificación hidrológica

Construcción y explotación de un almacén de datos de planificación hidrológica para la Confederación Hidrográfica del Norte y Este.

Construcció i explotació d'un magatzem de dades de planificació hidrològica

Memòria del treball de fi de carrera on s'ha construït i explotat un magatzem de dades, partint d'unes dades en un sistema OLTP a un sistema multidimensional OLAP, tot això sobre amb les eines Oracle Express Edition 10v i Oracle Discoverer.

Recommender System Based on Consumer Product Reviews

Consumer reviews, opinions and shared experiences in the use of a product is a powerful source of information about consumer preferences that can be used in recommender systems. Despite the importance and value of such information, there is no comprehensive mechanism that formalizes the opinions selection and retrieval process and the utilization of retrieved opinions due to the difficulty of extracting information from text data. In this paper, a new recommender system that is built on consumer product reviews is proposed. A prioritizing mechanism is developed for the system. The proposed approach is illustrated using the case study of a recommender system for digital cameras

Aplicación de técnicas de minería de datos a los log generados por CATEDU

Extracción de conocimiento de los log generados por un servidor web aplicando técnicas de minería de datos.

Almacén de datos de planificación hidrológica

Construcción y explotación de un almacén de datos de planificación hidrológica.

A survey on voltage sag events in power systems

This paper aims to survey the techniques and methods described in literature to analyse and characterise voltage sags and the corresponding objectives of these works. The study has been performed from a data mining point of view

Visual management of sags and incidents gathered in distribution substations for power quality management

Monitor a distribution network implies working with a huge amount of data coining from the different elements that interact in the network. This paper presents a visualization tool that simplifies the task of searching the database for useful information applicable to fault management or preventive maintenance of the network

Proposta d'un model predictiu del risc d'ingrés hospitalari amb l'ús d'algoritmes bayesians

Model predictiu basat en xarxes bayesianes que permet identificar els pacients amb major risc d'ingrés a un hospital segons una sèrie d'atributs de dades demogràfiques i clíniques.

Reverse immunology approach for the identification of CD8 T-cell-defined antigens: advantages and hurdles.

One of the challenges of tumour immunology remains the identification of strongly immunogenic tumour antigens for vaccination. Reverse immunology, that is, the procedure to predict and identify immunogenic peptides from the sequence of a gene product of interest, has been postulated to be a particularly efficient, high-throughput approach for tumour antigen discovery. Over one decade after this concept was born, we discuss the reverse immunology approach in terms of costs and efficacy: data mining with bioinformatic algorithms, molecular methods to identify tumour-specific transcripts, prediction and determination of proteasomal cleavage sites, peptide-binding prediction to HLA molecules and experimental validation, assessment of the in vitro and in vivo immunogenic potential of selected peptide antigens, isolation of specific cytolytic T lymphocyte clones and final validation in functional assays of tumour cell recognition. We conclude that the overall low sensitivity and yield of every prediction step often requires a compensatory up-scaling of the initial number of candidate sequences to be screened, rendering reverse immunology an unexpectedly complex approach.

Estudi de les possibles causes de l'abandonament d'un determinat pla d'estudis del departament d'Economia de la UOC

La UOC ha detectat que en els estudis de Diplomatura de Ciències Empresarials hi ha una quarta part dels estudiants que no continuen els estudis després del primer semestre. La UOC, com a client, ha facilitat les dades de matrícula de 20 semestres d'aquests estudis. Es demana que es cerqui quina o quines poden ser les causes d'aquest abandonament i una proposta per evitar-ho.