Generation of biological association networks: A novel strategy to detect new targets in cancer therapy

The aim of this work was to design a novel strategy to detect new targets for anticancer treatments. The rationale was to build Biological Association Networks from differentially expressed genes in drug-resistant cells to identify important nodes within the Networks. These nodes may represent putative targets to attack in cancer therapy, as a way to destabilize the gene network developed by the resistant cells to escape from the drug pressure. As a model we used cells resistant to methotrexate (MTX), an inhibitor of DHFR. Selected node-genes were analyzed at the transcriptional level and from a genotypic point of view. In colon cancer cells, DHFR, the AKR1 family, PKC¿, S100A4, DKK1, and CAV1 were overexpressed while E-cadherin was lost. In breast cancer cells, the UGT1A family was overexpressed, whereas EEF1A1 was overexpressed in pancreatic cells. Interference RNAs directed against these targets sensitized cells towards MTX.

Divergência genética entre clones de guaranazeiro

As técnicas multivariadas, para estimar a diversidade genética de um grupo de progenitores, têm sido utilizadas com freqüência pelos melhoristas de plantas. Os progenitores são utilizados em cruzamentos biparentais ou múltiplos, para formação de populações segregantes que tenham maior probabilidade de recuperação de genótipos superiores. Este trabalho foi realizado com o objetivo de identificar clones de guaranazeiro produtivos e divergentes que possam ser utilizados em um programa de cruzamentos para obter híbridos com alto valor heterótico e materiais para propagação vegetativa. Foram avaliados 148 clones de guaranazeiro atualmente em uso no programa de melhoramento genético da Embrapa-Centro de Pesquisa Agroflorestal da Amazônia Ocidental. Utilizou-se, para estimativa da divergência genética, a análise de agrupamento, em que a medida de dissimilaridade utilizada foi a distância euclidiana média padronizada e os métodos de agrupamento de otimização de Tocher e do vizinho mais próximo para construção do dendrograma entre grupos de clones. Houve a formação de sete grupos divergentes de clones. Concluiu-se que a divergência genética entre os clones não é grande, pois dois grupos foram formados com dois clones e três grupos foram formados somente com um único clone. Os clones CMU384 e CMU801 foram os mais próximos geneticamente e podem ser utilizados na formação de uma população com desenvolvimento vegetativo uniforme para uso em plantios comerciais.

Avaliação de seis variedades de uvas sem sementes no Submédio São Francisco

Este trabalho teve como objetivo avaliar aspectos relacionados ao desenvolvimento vegetativo e produtivo das plantas, às características físicas e à composição química dos frutos de seis variedades de uvas sem sementes nas condições do Submédio São Francisco. Os dados foram registrados durante os anos de 1997 e 1998. As variedades utilizadas foram enxertadas sobre o porta-enxerto IAC 572 (`Jales'). O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, com parcelas subdivididas nos ciclos de produção. Houve diferenças significativas na resposta da maioria das variedades entre as épocas de poda. O peso médio dos cachos variou entre 164,8 g na variedade Marroo Seedless, e 203,5 g na `Beauty Seedless'. O diâmetro médio das bagas foi superior a 15,7 mm em todas as variedades. Foram obtidos teores de sólidos solúveis compreendidos entre 14,05ºBrix na variedade Canner e 19,6ºBrix na `Vênus', enquanto a acidez total titulável foi inferior a 0,91 g de ácido tartárico/100 mL de suco, resultando em adequadas relações SST/ATT, que variaram entre 19,05 na variedade Beauty Seedless a 28,57 na `Vênus'. As variedades Vênus e Marroo Seedless foram as mais produtivas, com produtividades anuais de 24 t/ha e 20 t/ha, respectivamente.

Cerebral perfusion CT in the evaluation of children with severe head trauma : 12.06

Purpose: To assess the value of cerebral perfusion CT (PCT) in children with traumatic brain injury in prediciting their consecutive clinical outcome. Materials and methods: Twelve paediatric patients with acute traumatic brain injury underwent cerebral CT coupled with PCT during their admission at the emergency room (ER). PCT maps were reviewed for mean transit time (MTT), regional cerebral blood flow (rCBF) and regional cerebral blood volume (rCBV) abnormalities. PCT results were compared to short- and mid-term clinical outcome. Results: 3 patients with low Glasgow Coma Scale (GCS) (98) and bad clinical outcome showed an increased MTT and decreased rCBV and rCBF. 5 patients with low GCS and good clinical outcome showed an increased MTT without abnormalities of rCBV and rCBF. In patients with GCS 08 and good outcome, PCT maps were normal in 2 cases; transient PCT abnormalities were identified in one case with an embedded fracture of the skull and in one case with an epileptic seizure. Conclusion: Cerebral PCT can identify diffuse abnormalities of cerebral perfusion in children with traumatic brain injury showing a low initial GCS and a bad outcome. PCT can be a valuable tool to predict the severity of the prognosis of these patients as soon as they are evaluated by CT-scan during their admission at the ER.

Produtividade de seis cultivares de maracujazeiro-azedo durante três anos em Vargem Bonita, DF

Avaliou-se a produtividade de cultivares de maracujazeiro-azedo (Passiflora edulis), com vistas à seleção de um material mais produtivo nas condições do Distrito Federal para frutos destinados ao consumo in natura. As cultivares Maguari, CSB Marília, NJ3 Vermelho, CSB Marília x NJ3 Vermelho, Roxo Australiano e Seleção DF foram avaliadas durante três anos de produção, em Latossolo Vermelho-Amarelo, no sistema de espaldeira vertical. A cultivar Maguari apresentou porcentagem de germinação das sementes superior à das demais cultivares. A média da altura das plantas das cultivares Seleção DF e Roxo Australiano foi superior à das outras quatro cultivares. A cultivar Maguari apresentou o maior vigor vegetativo durante os três anos de experimento, e o menor número de plantas perdidas por declínio da cultura. A cultivar CSB Marília foi a mais precoce e a primeira a produzir frutos. Na primeira safra, as cultivares CSB Marília, CSB Marília x NJ3 Vermelho, Roxo Australiano e Seleção DF foram as mais produtivas. No segundo ano de colheita, as seis cultivares apresentaram alta produtividade, destacando-se a cultivar Seleção DF, que produziu 50 t/ha. No terceiro ano de produção, em que ocorreu um declínio considerável, a cultivar Maguari apresentou a maior produtividade. Na produção média dos três anos, as seis cultivares mostraram-se superiores em produtividade aos resultados já conhecidos da pesquisa no Brasil.

Crescimento, produção e variação somaclonal em bananeiras micropropagadas

Foram avaliados os desempenhos vegetativo e produtivo de bananeiras micropropagadas comparado ao de bananeiras convencionais, das cultivares Prata-Anã e Nanicão. Plantas micropropagadas da 'Prata-Anã' foram significativamente superiores às convencionais, em todas as variáveis estudadas durante o período de desenvolvimento vegetativo, enquanto na 'Nanicão' esta superioridade foi observada somente até o oitavo mês. Quanto à produção, não houve diferenças estatísticas na 'Nanicão', mas a 'Prata-Anã' micropropagada foi significativamente superior à convencional. A freqüência de variação somaclonal foi maior na 'Nanicão' micropropagada, mas menor que 5%.

Bioelectrochemical Treatment of Contaminated Groundwater

To remove these pollutants from groundwater, different technologies can be used. Currently, the Environmental Protection Agency (EPA) considers ion exchange, reverse osmosis and reverse electrodialysis to be effective methods for the decrease of their concentrations, below their limit in drinking water. These technologies have some drawbacks, such as low selectivity towards the target pollutant, high energy or chemicals requirements, and the generation of waste brine (pollutants are separated from water, not treated), which require an additional treatment. Bio Electro Chemical Systems (BES) could fill this niche

Fenologia e produção de massa seca e de grãos em cultivares de milheto-pérola

O objetivo deste trabalho foi avaliar a fenologia e produtividade de duas cultivares brasileiras de milheto-pérola, BN 2 e BRS 1501, comparadas com três cultivares africanas, Souna III, Guerguera e HKP. Foram instalados dois experimentos no campo, sem adubação e sem irrigação, um em janeiro, com a cultivar BN 2, e outro em abril, com BRS 1501. Na semeadura de janeiro, o ciclo das cultivares BN 2 e HKP foi menor do que o das outras, em virtude do encurtamento da fase vegetativa, e BN 2 apresentou menor duração da floração. Com balanço hídrico de -40 mm, não houve diferença significativa em relação à biomassa, mas a produção de grãos da Souna III, com 2.950 kg ha-1, foi significativamente superior à das demais. Na semeadura de abril, com um balanço hídrico de -344 mm, a biomassa foi menor que na de janeiro, sem diferença na biomassa entre as cultivares, e a produção de grãos de BRS 1501 (900 kg ha-1) não diferiu da produção das cultivares africanas. A biomassa foi maior na maturação fisiológica do que na floração, e apresentou teor de N acima de 2,1% nas folhas medianas. A colheita do milheto-pérola no estádio de maturação fisiológica apresenta ainda a vantagem de utilização dos grãos.

From evidence to clinical practice: effective implementation of therapeutic hypothermia to improve patient outcome after cardiac arrest.

OBJECTIVES: Therapeutic hypothermia has been recommended for postcardiac arrest coma due to ventricular fibrillation. However, no studies have evaluated whether therapeutic hypothermia could be effectively implemented in intensive care practice and whether it would improve the outcome of all comatose patients with cardiac arrest, including those with shock or with cardiac arrest due to nonventricular fibrillation rhythms. DESIGN: Retrospective study. SETTING: Fourteen-bed medical intensive care unit in a university hospital. PATIENTS: Patients were 109 comatose patients with out-of-hospital cardiac arrest due to ventricular fibrillation and nonventricular fibrillation rhythms (asystole/pulseless electrical activity). INTERVENTIONS: We analyzed 55 consecutive patients (June 2002 to December 2004) treated with therapeutic hypothermia (to a central target temperature of 33 degrees C, using external cooling). Fifty-four consecutive patients (June 1999 to May 2002) treated with standard resuscitation served as controls. Efficacy, safety, and outcome at hospital discharge were assessed. Good outcome was defined as Glasgow-Pittsburgh Cerebral Performance category 1 or 2. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: In patients treated with therapeutic hypothermia, the median time to reach the target temperature was 5 hrs, with a progressive reduction over the 18 months of data collection. Therapeutic hypothermia had a major positive impact on the outcome of patients with cardiac arrest due to ventricular fibrillation (good outcome in 24 of 43 patients [55.8%] of the therapeutic hypothermia group vs. 11 of 43 patients [25.6%] of the standard resuscitation group, p = .004). The benefit of therapeutic hypothermia was also maintained in patients with shock (good outcome in five of 17 patients of the therapeutic hypothermia group vs. zero of 14 of the standard resuscitation group, p = .027). The outcome after cardiac arrest due to nonventricular fibrillation rhythms was poor and did not differ significantly between the two groups. Therapeutic hypothermia was of particular benefit in patients with short duration of cardiac arrest (<30 mins). CONCLUSIONS: Therapeutic hypothermia for the treatment of postcardiac arrest coma can be successfully implemented in intensive care practice with a major benefit on patient outcome, which appeared to be related to the type and the duration of initial cardiac arrest and seemed maintained in patients with shock.

Efeito de fungos micorrízicos arbusculares no desenvolvimento do abacateiro

O objetivo deste trabalho foi determinar a influência da inoculação de seis espécies de fungos micorrízicos arbusculares (FMA) (Glomus clarum, G. etunicatum, G. manihotis, Acaulospora scrobiculata, Scutellospora heterogama e Gigaspora margarita) sobre o desenvolvimento vegetativo de mudas de abacateiro (Persea sp.), nas fases de porta-enxerto, de muda enxertada e de muda no pomar. A influência dos FMA em abacateiros foi variável conforme a espécie do endófito em estudo. As espécies S. heterogama, A. scrobiculata, G. etunicatum e G. clarum colonizaram mais intensamente o sistema radicular dos abacateiros, promovendo melhor desenvolvimento vegetativo das plantas, na fase de porta-enxerto, ao longo do período de produção da muda e após o transplante para pomar.

Análise de crescimento de girassol em Latossolo com diferentes níveis de saturação por bases no Cerrado

Com o objetivo de avaliar o comportamento de cinco cultivares de girassol em um Latossolo Vermelho argiloso, foram realizados quatro ensaios sob quatro níveis de saturação por bases (18%, 35%, 56% e 77%) obtidos com aplicação de calcário dolomítico. Os dados semanais de crescimento foram ajustados pelas funções logística, Weibull de três parâmetros e a logística generalizada de quatro parâmetros empregando-se o procedimento NLIN do SAS, bem como os processos interativos do método DUD. A função logística forneceu os melhores ajustes aos dados de crescimento. As cultivares foram categorizadas de acordo com o porte das plantas e tendências de crescimento a partir da análise de agrupamentos (cluster analysis), usando o método das ligações completas e a métrica da distância euclidiana. Todas as cultivares tiveram o crescimento reduzido quando o nível de saturação de bases foi de 18%. A cultivar M734 apresentou bom desempenho no nível de 35% de saturação por bases. Nos demais casos, os melhores resultados foram obtidos nos níveis de saturação por bases entre 56% e 77%. As cultivares EMBRAPA 122 e M738 tiveram redução de crescimento quando a saturação foi elevada para 77%. 'EMBRAPA 122' apresentou maior crescimento inicial e menor altura ao final do ciclo vegetativo.

Resposta de duas cultivares de arroz a doses de zinco aplicado como oxissulfato

O objetivo do trabalho foi avaliar o efeito de doses de Zn, aplicado como oxissulfato, nas formas granulada e em pó, em duas cultivares de arroz. O experimento foi realizado em casa de vegetação em vasos com 3 dm³ de um Latossolo Vermelho distrófico. Todos os vasos receberam calcário, macronutrientes e micronutrientes, com exceção do zinco. Foram aplicadas as doses de 0, 1, 2, 5 e 10 mg de Zn por dm³ de solo. A dose de 4 mg dm-3 de Zn aplicado como sulfato foi usada como padrão de referência. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado com quatro repetições. O oxissulfato em pó na cultivar IAC 165 e granular na IAC 202 possibilitaram produções de grãos semelhantes às obtidas com o sulfato de zinco. Houve diferença nos teores de Zn nas folhas e colmos das duas cultivares associados à maior produção de grãos. A cultivar IAC 202 foi mais eficiente na utilização de Zn no crescimento vegetativo e na produção de grãos. Os teores de Zn extraídos por Mehlich 1 e DTPA correlacionaram-se significativamente com as doses de Zn aplicadas e com os níveis de Zn no tecido vegetal. Houve correlação significativa entre os dois extratores em relação às doses de Zn aplicadas no solo.

Stimulus-induced rhythmic, periodic or ictal discharges (SIRPIDs) in comatose survivors of cardiac arrest: Characteristics and prognostic value.

OBJECTIVES: To analyze the prevalence of stimulus-induced rhythmic, periodic or ictal discharges (SIRPIDs) in patients with coma after cardiac arrest (CA) and therapeutic hypothermia (TH) and to examine their potential association with outcome. METHODS: We studied our prospective cohort of adult survivors of CA treated with TH, assessing SIRPIDs occurrence and their association with 3-month outcome. Only univariated analyses were performed. RESULTS: 105 patients with coma after CA who underwent electroencephalogram (EEG) during TH and normothermia (NT) were studied. Fifty-nine patients (56%) survived, and 48 (46%) had good neurological recovery. The prevalence of SIRPIDs was 13.3% (14/105 patients), of whom 6 occurred during TH (all died), and 8 in NT (3 survived, 1 with good neurological outcome); none had SIRPIDs at both time-points. SIRPIDs were associated with discontinuous or non-reactive EEG background and were a robustly related to poor neurological outcome (p<0.001). CONCLUSION: This small series provides preliminary univariate evidence that in patients with coma after CA, SIRPIDs are associated with poor outcome, particularly when occurring during in therapeutic hypothermia. However, survival with good neurological recovery may be observed when SIRPIDs arise in the post-rewarming normothermic phase. SIGNIFICANCE: This study provides clinicians with new information regarding the SIRPIDs prognostic role in patients with coma after cardiac arrest.

Status Epilepticus Severity Score (STESS): a tool to orient early treatment strategy

BACKGROUND : Status epilepticus (SE) treatment ranges from small benzodiazepine doses to coma induction. For some SE subgroups, it is unclear how the risk of an aggressive therapeutic approach balances with outcome improvement. We recently developed a prognostic score (Status Epilepticus Severity Score, STESS), relying on four outcome predictors (age, history of seizures, seizure type and extent of consciousness impairment), determined before treatment institution. Our aim was to assess whether the score might have a role in the treatment strategy choice. METHODS : This cohort study involved adult patients in three centers. For each patient, the STESS was calculated before primary outcome assessment: survival vs. death at discharge. Its ability to predict survival was estimated through the negative predictive value for mortality (NPV). Stratified odds ratios (OR) for mortality were calculated considering coma induction as exposure; strata were defined by the STESS level. RESULTS : In the observed 154 patients, the STESS had an excellent negative predictive value (0.97). A favorable STESS was highly related to survival (P < 0.001), and to return to baseline clinical condition in survivors (P < 0.001). The combined Mantel-Haenszel OR for mortality in patients stratified after coma induction and their STESS was 1.5 (95 % CI: 0.59-3.83). CONCLUSION : The STESS reliably identifies SE patients who will survive. Early aggressive treatment could not be routinely warranted in patients with a favorable STESS, who will almost certainly survive their SE episode. A randomized trial using this score would be needed to confirm this hypothesis.

Refractory status epilepticus: A prospective observational study.

Summary Purpose: Status epilepticus (SE) that is resistant to two antiepileptic compounds is defined as refractory status epilepticus (RSE). In the few available retrospective studies, estimated RSE frequency is between 31% and 43% of patients presenting an SE episode; almost all seem to require a coma induction for treatment. We prospectively assessed RSE frequency, clinical predictors, and outcome in a tertiary clinical setting. Methods: Over 2 years we collected 128 consecutives SE episodes (118 patients) in adults. Clinical data and their relationship to outcome (mortality and return to baseline clinical conditions) were analyzed. Results: Twenty-nine of 128 SE episodes (22.6%) were refractory to first- and second-line antiepileptic treatments. Severity of consciousness impairment and de novo episodes were independent predictors of RSE. RSE showed a worse outcome than non-RSE (39% vs. 11% for mortality; 21% vs. 63% for return to baseline clinical conditions). Only 12 patients with RSE (41%) required coma induction for treatment. Discussion: This prospective study identifies clinical factors predicting the onset of SE refractoriness. RSE appears to be less frequent than previously reported in retrospective studies; furthermore, most RSE episodes were treated outside the intensive care unit (ICU). Nonetheless, we confirm that RSE is characterized by high mortality and morbidity.