Reconciling folksonomic tagging with taxa for bioacoustic annotations

Acoustic sensors are increasingly used to monitor biodiversity. They can remain deployed in the environment for extended periods to passively and objectively record the sounds of the environment. The collected acoustic data must be analyzed to identify the presence of the sounds made by fauna in order to understand biodiversity. Citizen scientists play an important role in analyzing this data by annotating calls and identifying species. This paper presents our research into bioacoustic annotation techniques. It describes our work in defining a process for managing, creating, and using tags that are applied to our annotations. This paper includes a detailed description of our methodology for correcting and then linking our folksonomic tags to taxonomic data sources. Providing tools and processes for maintaining species naming consistency is critical to the success of a project designed to generate scientific data. We demonstrate that cleaning the folksonomic data and providing links to external taxonomic authorities enhances the scientific utility of the tagging efforts of citizen scientists.

Firmicutes dominate the bacterial taxa within sugar-cane processing plants

Sugar cane processing sites are characterised by high sugar/hemicellulose levels, available moisture and warm conditions, and are relatively unexplored unique microbial environments. The PhyloChip microarray was used to investigate bacterial diversity and community composition in three Australian sugar cane processing plants. These ecosystems were highly complex and dominated by four main Phyla, Firmicutes (the most dominant), followed by Proteobacteria, Bacteroidetes, and Chloroflexi. Significant variation (p , 0.05) in community structure occurred between samples collected from ‘floor dump sediment’, ‘cooling tower water’, and ‘bagasse leachate’. Many bacterial Classes contributed to these differences, however most were of low numerical abundance. Separation in community composition was also linked to Classes of Firmicutes, particularly Bacillales, Lactobacillales and Clostridiales, whose dominance is likely to be linked to their physiology as ‘lactic acid bacteria’, capable of fermenting the sugars present. This process may help displace other bacterial taxa, providing a competitive advantage for Firmicutes bacteria.

Genetic variation within two sympatric spotted gum eucalypts exceeds between taxa variation

Population substructure and hybridization, among other factors, have the potential to cause erroneous associations in linkage disequilibrium (LD) mapping. Two closely related spotted gum eucalypts, Corymbia variegata and C. henryi (Myrtaceae) occur in sympatry in the east coast of Australia and potentially interbreed. They are morphologically similar but are distinguished as separate species based on capsule and foliage size. To determine whether they hybridize in nature and its implications for LD mapping, we investigated the level of molecular divergence between the two species at two sympatric locations separated by 300 kilometres. Very few individuals of intermediate morphology were identified, despite the two species occurring only metres apart. Analysis of genetic structure using 12 microsatellite loci showed that genetic differentiation between populations of the same species at different locations (FST = 0.07 for both species; p = 0.0001) was significantly higher than that observed between species at each location (mean FST = 0.02 and 0.04 for Cherry tree and Bunyaville respectively; p = 0.0001; all Mann-Whitney U-test p ≤ 0.01). No species-specific alleles or significant allele frequency differences were detected within a site, suggesting recurrent local gene flow between the two species. The lack of significant allele frequency differences implies no population stratification along taxonomic lines. This suggested that there is little concern for cryptic hybridization when sampling from sites of sympatry for LD mapping.

Pyrrolizidine Alkaloids in Crotalaria Taxa from Northern Australia: Risk to Grazing Livestock.

Crotalaria species containing hepatotoxic pyrrolizidine alkaloids grow widely in pastures in northern Australia and have sporadically poisoned grazing livestock. The diverse Crotalaria taxa present in these pastures include varieties, subspecies, and chemotypes not previously chemically examined. This paper reports the pyrrolizidine alkaloid composition and content of 24 Crotalaria taxa from this region and assesses the risk of poisoning in livestock consuming them. Alkaloids present in C. goreensis, C. aridicola subsp. densifolia, and C. medicaginea var. neglecta lack the esterified 1,2-unsaturated functionality required for pyrrole adduct formation, and these taxa are not hepatotoxic. Taxa with high levels of hepatotoxic alkaloids, abundance, and biomass pose the greatest risk to livestock health, particularly C. novae-hollandiae subsp. novae-hollandiae, C. ramosissima, C. retusa var. retusa, and C. crispata. Other species containing moderate alkaloid levels, C. spectabilis and C. mitchellii, also pose significant risk when locally abundant.

Selecting hardwood taxa for wood and fibre production in Queensland's subtropics.

Optimal matching of species to sites is required for a sustainable hardwood plantation industry in the subtropics. This paper reports the performance and adaptation of 60 taxa (species, provenances and hybrids) across two rainfall zones and a range of soil types in southern Queensland. Specifically, performance of taxa is compared across five replicated taxon–site matching trials at age 6 y. Three trials are in a 1000-mm y–1 rainfall zone of the Wide Bay region near Miriam Vale and two in a drier (about 750 mm y–1) rainfall zone near Kingaroy in the South Burnett region. In the higher-rainfall zone, the taxa with the fastest growth in the three trials at age 6 y were Corymbia citriodora subsp. variegata Woondum provenance, which ranked 1st, 6th and 5th respectively; E. longirostrata Coominglah provenance, ranked 3rd, 2nd and 3rd; and two sources of E. grandis, Copperlode provenance (ranked 4th and 1st) and SAPPI seed orchard (ranked 6th and 4th), which were planted in only two of the three trials. Similarly, in the lower-rainfall zone, E. grandis and its hybrids appear promising from the 6-y growth data., This excellent early growth, however, has not continued in either rainfall zone, with these taxa, 8 y after planting, now showing signs of stress and mortality. Based on trial results in these two rainfall zones, the taxon that appears the most promising for sustainable plantation development with high average annual volume index values and low incidence of borer attack is Corymbia citriodora subsp. variegata (6.7 m³ ha–1). Eucalyptus grandis and E. longirostrata both have better average annual volume indexes (8.2 m³ ha–1 and 7.4 m³ ha–1 respectively) but are very susceptible to borer attack. The current and long-term productivity and sustainability of plantation forestry in these rainfall zones is discussed. Further, the implications of predicted climate change (particularly reduced rainfall) for growing trees for fibre production and carbon sequestration are explored.

DNA sequences and austral taxa indicate generic synonymy of Paratrichocladius Santos-Abreu with Cricotopus Wulp (Diptera: Chironomidae)

In the century since the description of the orthoclad genus Paratrichocladius Santos-Abreu (Diptera: Chironomidae), separation in any life stage from the cosmopolitan, diverse Cricotopus Wulp has been problematic. Molecular analysis reveals the presence of two species in Australia that conform in morphology to Paratrichocladius and which form a well-supported clade including Paratrichocladius micans (Kieffer) from Africa and a distinct southern African larva. This clade clusters with taxa allied with Cricotopus albitibia (Walker), in turn nested within all other sampled Australian Cricotopus. Relevant nodes strongly support Cricotopus as nonmonophyletic without inclusion of Paratrichocladius. We synonymize Paratrichocladius with Cricotopus syn.n, treating Paratrichocladius as a subgenus. Cricotopus (Paratrichocladius) australiensis Cranston sp.n. is described for Trichocladius pluriserialis Freeman from Australia, which is not the same species under that name in New Zealand. Cricotopus (Paratrichocladius) bifenestrus Cranston sp.n. from Australia is described, also in all life stages. The many new combinations, listed in an Appendix, include three replacement names for new secondary homonyms, namely: Cricotopus (Paratrichocladius) sinobicinctus Cranston & Krosch nom.n. for Paratrichocladius bicinctus Fu, Sæther & Wang, Cricotopus draysoni Cranston & Krosch nom.n. for Cricotopus brevicornis Drayson, Krosch & Cranston, and Cricotopus (Paratrichocladius) sikhotealinus Makarchenko & Makarchenko nom.n. for Cricotopus orientalis Kieffer. We conclude with comments on wider issues in the taxonomy of Paratrichocladius, especially concerning New Zealand species.

Phalangopsidae crickets from the Indian Region (Orthoptera, Grylloidea), with the descriptions of new taxa, diagnoses for genera, and a key to Indian genera

The Indian region is presently the second region after the Neotropics in terms of diversity of phalangopsid crickets. Yet their study is impeded by the lack of necessary taxonomic tools for taxon identification. In the present paper, all generic diagnoses are clarified, using morphological and genitalic characters; female genitalia are described and illustrated for all genera with known females. New taxa are described from southern India: Kempiola flavipunctatus Desutter-Grandcolas n. sp., Opiliosina meridionalis Desutter-Grandcolas n. gen., n. sp., Phalangopsina bolivari Desutter-Grandcolas n. sp., P. chopardi Desutter-Grandcolas n. sp., P. gravelyi Desutter-Grandcolas n. sp., and Speluncasina Desutter-Grandcolas n. gen. The list of phalangopsid crickets from the Indian Region is updated, and a key to phalangopsid genera proposed. A lectotype and a paralectotype are designated to fix the name of Phalangopsina dubia (Bolivar, 1900). Opilionacris annandalei Chopard, 1928, previously transferred to the African genus Phaeophilacris Walker, 1871, is transferred to the genus Speluncasina Desutter-Grandcolas n. gen., while Larandopsis jharnae Bhowmik, 1981 and L. newguineae Bhowmik, 1981 described from New Guinea are transferred to the eneopterine genus Lebinthus Stal, 1877. Finally Luzaropsis confusa Chopard, 1969 is removed from its synonymy with L. ferruginea Walker, 1871.

Como reduzir a taxa de juros

Consultoria Legislativa - Área IX - Política e Planejamento Econômicos, Desenvolvimento Econômico, Economia Internacional.

Cobrança, pelos municípios, de "taxa de iluminação pública" ou de "contribuição de iluminação pública"

Consultoria Legislativa - Área III - Tributação, Direito Tributário.

Efeitos da administração de inibidores de fosfodiesterases na reversão da hiperatividade de camundongos expostos ao etanol no período correspondente ao terceiro trimestre de gestação em humanos

O consumo de etanol durante a gestação é um grave problema de saúde pública. Durante o desenvolvimento, o sistema nervoso é especialmente susceptível aos efeitos tóxicos do etanol e a exposição ao etanol durante este período pode gerar um amplo espectro de distúrbios neurocomportamentais, sendo o mais frequente, a hiperatividade. Recentemente, estudos têm sugerido que distúrbios na plasticidade neuronal podem estar relacionados com a hiperatividade. Os inibidores de PDE são drogas que agem impedindo a degradação de segundos mensageiros celulares como AMPc e GMPc, mantendo a ativação de proteínas quinases e de fatores de transcrição como o CREB, levando a expressão de genes relacionados à plasticidade. Neste trabalho, avaliamos através do teste de campo aberto se a administração de Vinpocetina ou Rolipram (inibidores de PDE) seria capaz de amenizar ou reverter a hiperatividade de camundongos Suíços expostos ao etanol no período correspondente ao terceiro trimestre de gestação humana. Para tanto, foram realizadas duas etapas: na primeira etapa, durante o período neonatal, os animais receberam injeções intraperitoneais de etanol (5g/Kg em solução salina a 25%, no 2, 4, 6 e 8 dias de vida pós-natal - PN2 a PN8) ou de salina, e 4 horas antes do teste comportamental no campo aberto (10 min), em PN30, receberam Vinpocetina (10mg/Kg ou 20mg/Kg diluídas em DMSO ip) ou somente DMSO ip. Na segunda etapa, os animais foram expostos ao etanol ou à salina no período neonatal nas mesmas condições da primeira etapa e no dia do teste comportamental receberam Rolipram (0,5mg/Kg diluídas em DMSO ip ou somente DMSO ip). Posteriormente aos testes, foram coletados o córtex cerebral frontal e o hipocampo dos animais para avaliação dos níveis de AMPc. Os resultados comportamentais indicam que somente o tratamento com Vinpocetina (20mg/Kg) reverteu a hiperatividade de camundongos expostos ao etanol, resultado que não foi observado com o tratamento com Rolipram. Desta forma, a dosagem dos níveis de AMPc foi realizada apenas nos animais que receberam injeção de Vinpocetina (20mg/Kg). A exposição neonatal ao etanol reduziu significativamente os níveis de AMPc no córtex e no hipocampo. O tratamento com Vinpocetina gerou um aumento nos níveis de AMPc no córtex e restaurou estes níveis no hipocampo. Nossos resultados sugerem que a reversão da hiperatividade pelo tratamento com Vinpocetina pode estar associada ao aumento da plasticidade neural induzida por esta droga.

Adaptações transgeracionais do pâncreas endócrino em camundongos provenientes de restrição proteica materna In Utero

A exposição materna durante o período gestacional a uma dieta restrita em proteínas (LP) prejudica o desenvolvimento do pâncreas endócrino em sua prole e aumenta a susceptibilidade à hipertensão, diabetes e obesidade na vida adulta. Há evidências de que esse fenômeno pode persistir em gerações subsequentes. Objetivou-se avaliar o efeito da restrição proteica sobre o metabolismo da glicose e morfometria pancreática na prole F3 de camundongos ao nascimento e ao desmame. Para tanto, fêmeas virgens de camundongos Suíços (F0) foram acasaladas e receberam dieta normo-proteica (19% de proteína - NP) ou uma dieta isocalórica restrita em proteínas (5% de proteína - LP) durante toda a gravidez. Durante a lactação e o restante do experimento, todos os grupos receberam a dieta NP. Os filhotes machos foram nomeados F1 (NP1 e LP1). As fêmeas F1 e F2 foram acasaladas para produzir F2 e F3 (NP2, LP2, NP3 e LP3), respectivamente. Semanalmente, os filhotes foram pesados e calculada a taxa de crescimento alométrico (log [massa corporal] = log a + log b [idade]). Os animais foram sacrificados nos dias 1 e 21 de idade, a glicemia foi determinada e o pâncreas retirado, pesado e analisado por estereologia e imunofluorescência; a insulina foi mensurada aos 21 dias. Como resultados, os filhotes restritos na primeira geração (LP1) foram menores ao nascer, mas apresentaram um crescimento acelerado nos primeiros sete dias de vida, mostrando catch-up com os controles; a prole LP2 demonstrou a maior massa corporal ao nascimento e tiveram uma taxa de crescimento mais lenta durante a lactação; não houve diferença na massa corporal e na taxa de crescimento na geração F3. A massa de pâncreas foi diminuída em LP1-LP3 ao nascimento, contudo foi aumentada em LP2 ao desmame. A densidade de volume e o diâmetro das ilhotas foram menores em todos os grupos restritos no dia 1 e 21, somente LP1 teve o menor número de ilhotas. Ao nascer, a massa de células beta foi menor em LP1-LP3 e permaneceu baixa durante a lactação. No dia 1 e 21, os filhotes foram normoglicêmicos, entretanto foram hipoinsulinêmicos ao desmame. Portanto, a restrição de proteínas em camundongos durante a gestação produz alterações morfológicas nas ilhotas pancreáticas, sugerindo que a homeostase da glicose foi mantida por um aumento da sensibilidade à insulina durante os primeiros estágios de vida na prole ao longo de três gerações consecutivas.

Práticas educativas durante a gestação na Estratégia de Saúde da Família: refletindo sobre limites e possibilidades

Estudo de natureza qualitativa que teve como objetivo analisar as práticas de Educação em Saúde desenvolvidas com gestantes atendidas pela Estratégia de Saúde da Família no município de Quissamã no Rio de Janeiro. Para a coleta de dados foi utilizada a técnica do grupo focal, sendo realizados três grupos em unidades com elevadas taxas de cesárea, a fim de refletir sobre a relação entre a participação nas atividades e a escolha pelo tipo de parto. Os sujeitos do estudo foram 18 mulheres que tiveram seus filhos no ano de 2008 e que participaram de qualquer atividade educativa desenvolvida pelas unidades. A análise de dados foi orientada pela análise de conteúdo de Bardin e das falas das mulheres emergiram 03 categorias e uma subcategoria. A investigação apontou que a participação nas práticas educativas ajuda nas escolhas durante a gestação, pois as mulheres sentem-se mais seguras e preparadas para o parto e o pós-parto. Contudo, a escolha pelo tipo de parto ainda é determinada pelos profissionais. O estudo indica que há uma disputa entre o projeto de assistência obstétrica delineado pela mulher e o projeto do profissional, de modo que a indicação médica continua a prevalecer. Apesar dos esforços dos profissionais da Estratégia de Saúde da Família do município investigado, as práticas educativas realizadas com as gestantes, ainda precisam ser desenvolvidas a fim de possuir um cunho emancipatório, na superação de uma prática transmissora de modo a empoderar a mulher para a sustentação de suas decisões. Observa-se que as atividades são orientadas por um planejamento, entretanto, a avaliação das ações não acontecem, de modo que se faz necessária a reflexão dos profissionais acerca das formas de avaliação das práticas desenvolvidas. A pesquisa recomenda a criação de comitês de avaliação das indicações de cesárea; o investimento na formação permanente dos profissionais, sobretudo em Educação e Saúde; e a reavaliação da metodologia de desenvolvimento dessas atividades com o intuito de se pensar em estratégias que possam envolver as mulheres na construção das práticas educativas, no sentido de empoderá-las para a tomada de decisão e para a defesa de seu projeto de parto.

Repasse cambial reverso: uma avaliação sobre a relação entre taxa de câmbio e IPCA no Brasil (1999-2007)

A presente dissertação discute o repasse cambial para o IPCA na economia brasileira durante o período compreendido entre janeiro de 1999 e dezembro de 2007. A ampla maioria dos trabalhos que versam sobre este tema aborda a redução do repasse após a adoção do regime de metas de inflação e/ou tem como único foco o impacto das desvalorizações cambiais no aumento dos índices de preços. Este trabalho, por outro lado, aborda de maneira explícita o papel da valorização do Real sobre a variação do IPCA no período recente, configurando o que denominamos de repasse cambial reverso. Para tanto, estimamos o repasse cambial por meio de um modelo de vetores auto-regressivos tanto para o referido período (1999-2007), quanto para outros dois recortes temporais: entre janeiro de 1999 e junho 2003 (amostra 1), período no qual se verifica uma tendência de desvalorização cambial e aumento de preços; e de julho de 2003 a dezembro de 2007 (amostra 2), período caracterizado pelo processo inverso, de valorização da taxa de câmbio e de cumprimento das metas de inflação na maioria dos anos. Os principais resultados foram: (i) no longo prazo os coeficientes de repasse cambial para o IPCA para as duas amostras foram superiores àqueles verificados para o período completo; e (ii) o repasse estimado para a amostra 2 foi bem elevado, ainda que inferior àquele obtido para a amostra 1. Estes resultados reforçam o argumento de que a taxa de câmbio desempenhou um papel proeminente no controle da inflação no período 2003-2007.

Relação da violência na gestação e o processo de abortamento: uma perspectiva da gestante

O estudo tem como objeto as relações estabelecidas pela mulher entre o processo de abortamento e as situações de violência vivenciadas durante a gestação. A violência e o aborto caracterizam-se por serem temáticas de grande complexidade, envolvendo questões interdisciplinares de gênero, saúde, saúde reprodutiva, religião, movimentos sociais, ética e direitos humanos. No aprofundamento do objeto de estudo, traçamos os seguintes objetivos: identificar os tipos de situações de violência vivenciados, durante a gravidez, pela mulher em processo de abortamento; descrever a vivência de violência sob a ótica da gestante em processo de abortamento e analisar as relações estabelecidas pela gestante em processo de abortamento e a ocorrência de situações de violência na gestação. Trata-se de uma pesquisa qualitativa, que teve como sujeitos 15 mulheres com o diagnóstico de abortamento, internadas em maternidades públicas da cidade de Niterói/Rio de Janeiro. A coleta de dados foi iniciada com a busca nos prontuários do diagnóstico e, posteriormente, foram realizadas entrevistas com roteiro semi-estruturado, gravadas atendendo à legislação vigente acerca das diretrizes de pesquisas com seres humanos. Na análise dos dados utilizamos a técnica de Análise de Conteúdo de Bardin. Os resultados demonstraram a visão ampliada da mulher sobre a violência, sendo de gênero e psicológica as mais apontadas. O aborto foi indicado como uma das manifestações de violência contra a mulher, tanto nos processos espontâneos como nos induzidos. Esse fenômeno, assim como o da violência, é permeado por determinantes sociais, éticas, morais e religiosas. Quando espontâneo, pode ser visto como um fracasso da mulher diante de sua capacidade vital de ser mãe gerando culpa e derrota diante de companheiros e familiares, além da possibilidade de ser vista como pecadora e/ou criminosa, em decorrência do princípio social, religioso e legal do aborto como crime, acarretando o desgaste psicológico. As relações estabelecidas pelas mulheres acerca da violência na gestação e o processo de abortamento versaram basicamente sobre os dilemas vivenciados nas gestações indesejadas; sobre o cotidiano feminino nos espaços públicos e privados, refletidos em conflitos; o excesso da dupla jornada de trabalho; e sobre a violência institucional perpetuada pelos serviços de saúde, principalmente na busca por uma assistência digna e humanizada nas unidades de emergência.

Análise da mortalidade perinatal na região do Médio Paraíba, Estado do Rio de Janeiro, de 2005 a 2009

A taxa de mortalidade perinatal (TMP) é um dos importantes indicadores de saúde que refletem a qualidade da assistência prestada durante a gestação, o parto e ao recém nascido. A TMP possui dois componentes: a taxa e mortalidade fetal e a taxa de mortalidade infantil neonatal precoce. O objetivo do presente estudo foi analisar a mortalidade perinatal na região do Médio Paraíba, estado do Rio de Janeiro, Brasil no período de 2005 a 2009, segundo causa básica dos óbitos, componentes do período perinatal e critérios de evitabilidade. Foram utilizados os dados referentes aos óbitos fetais e infantis neonatais precoces e de nascidos vivos, registrados, respectivamente, nos Sistemas de Informações sobre Mortalidade (SIM) e Nascidos Vivos (SINASC). A TMP na região foi de 18,4 óbitos por mil nascimentos totais. As taxas de mortalidade fetal e infantil neonatal precoce no período alcançaram, espectivamente 10,7 óbitos por mil nascimentos totais e 7,7 óbitos por mil nascidos vivos. A TMP apresentou redução ao longo do quinquênio analisado associada à queda do componente neonatal precoce, mantendo-se estável o componente fetal. As principais causas básicas dos óbitos perinatais, segundo a lista de mortalidade CID BR, foram as afecções originadas no período perinatal (89%) e as malformações congênitas, deformidades e anomalias cromossômicas (10,5%). Utilizando os critérios de evitabilidade segundo Ortiz, para os óbitos infantis neonatais precoces foi observado que mais de 41% eram reduzíveis por diagnósticos e tratamento precoces. Ressalta-se a necessidade da implementação de ações de assistência à saúde da gestante e de cuidados com o recémnascido com vistas à redução da mortalidade perinatal na região do Médio Paraíba.