Priority areas for the conservation of Atlantic forest large mammals

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Birds from cerradão woodland, an overlooked forest of the Cerrado region, Brazil

O Cerrado ainda recebe pouca atenção no que diz respeito à ornitologia embora seja a única savana tropical do mundo considerada um hotspot de biodiversidade. O cerradão é uma das fisionomias menos conhecidas e mais desmatadas do bioma e poucos levantamentos avifaunísticos foram realizados nessas florestas. Para revisar os estudos sobre aves de cerradão e complementar os poucos inventários já existentes realizados nesse tipo florestal no estado de São Paulo, foi realizado um levantamento bibliográfico dos estudos publicados sobre aves de cerradão. Adicionalmente foi conduzido um levantamento das aves de um fragmento de cerradão de 314 ha localizado na região central do estado de São Paulo, Brasil, entre setembro de 2005 e dezembro de 2006 com a utilização de transecções lineares com raio ilimitado de detecção. de 95 estudos envolvendo aves de cerradão, apenas 17 (18%) discriminaram espécies registradas dentro desta fisionomia daquelas que obtiveram registros em outros ambientes de Cerrado. Exceto por um estudo, nenhuma outra investigação encontrou mais de 64 espécies de aves neste ambiente, resultado compartilhado com diversas regiões do Brasil e também da Bolívia. Diferenças no número de espécies entre cerradões não puderam ser atribuídas à degradação dos ambientes estudados ou tamanho de fragmento. Considerando os registros de cerradões no Brasil e na Bolívia, a compilação de dados acumulou 250 espécies distribuídas em 36 famílias e 15 ordens. Durante nossos trabalhos de campo em localidade do interior paulista foram registradas 48 espécies distribuídas em 20 famílias, incluindo o fruxu-do-cerradão (Neopelma pallescens), ameaçada em São Paulo, e o soldadinho (Antilophia galeata), quase ameaçada no estado e endêmica do Cerrado. Dentre as espécies mais abundantes no fragmento, nenhuma delas é ameaçada ou endêmica do bioma.

Bird diversity and abundance in forest fragments and Eucalyptus plantations around an Atlantic forest reserve, Brazil

Little of Brazil's remaining Atlantic forest is protected, so it is important to assess how well the region's wildlife can persist in areas/habitats outside reserves. We studied bird diversity and abundance during 546 point counts in the Sooretama/Linhares reserve, 200 point counts in 31 forest fragments (10-150 h), and 50 point counts in < 30-year-old Eucalyptus plantations, within 7 km of the reserve. Only eight bird species were recorded in Eucalyptus, and this impoverishment, as compared to some Eucalyptus plantations elsewhere in Brazil may be a result of intensive clearance of understory vegetation. Species diversity in forest fragments was significantly lower than in the reserve. Twelve, mostly non-forest or edge species, were significantly commoner in the fragments, but nineteen species were frequent in the reserve but rare or absent in forest fragments. These included two Pyrrhura parakeets, a Brotogeris parakeet, a trogon Trogon, a jacamar Galbula, woodpeckers Piculus and Campephilus, Myrmotherula antwrens, and Hemithraupus and Tachyphonus tanagers. Bird species richness at points in forest fragments did not decline with fragment size, distance from the reserve, or forest quality. However, forest in fragments was more heavily degraded than forest within the reserve and poor forest quality may be the cause of declines in some species. Whilst protection of forest within reserves is a priority, management of forest fragments may aid conservation of some threatened species.

Biodiversity, Species Interactions and Ecological Networks in a Fragmented World

Biodiversity is organised into complex ecological networks of interacting species in local ecosystems, but our knowledge about the effects of habitat fragmentation on such systems remains limited. We consider the effects of this key driver of both local and global change on both mutualistic and antagonistic systems at different levels of biological organisation and spatiotemporal scales.There is a complex interplay of patterns and processes related to the variation and influence of spatial, temporal and biotic drivers in ecological networks. Species traits (e.g. body size, dispersal ability) play an important role in determining how networks respond to fragment size and isolation, edge shape and permeability, and the quality of the surrounding landscape matrix. Furthermore, the perception of spatial scale (e.g. environmental grain) and temporal effects (time lags, extinction debts) can differ markedly among species, network modules and trophic levels, highlighting the need to develop a more integrated perspective that considers not just nodes, but the structural role and strength of species interactions (e.g. as hubs, spatial couplers and determinants of connectance, nestedness and modularity) in response to habitat fragmentation.Many challenges remain for improving our understanding: the likely importance of specialisation, functional redundancy and trait matching has been largely overlooked. The potentially critical effects of apex consumers, abundant species and supergeneralists on network changes and evolutionary dynamics also need to be addressed in future research. Ultimately, spatial and ecological networks need to be combined to explore the effects of dispersal, colonisation, extinction and habitat fragmentation on network structure and coevolutionary dynamics. Finally, we need to embed network approaches more explicitly within applied ecology in general, because they offer great potential for improving on the current species-based or habitat-centric approaches to our management and conservation of biodiversity in the face of environmental change.

Transposon Tn1721 distribution among strains of Xylella fastidiosa

Transposons are mobile genetic elements found within the genomes of various organisms including bacteria, fungi, plants and animals. Fragments of the transposon Tn1721 were found included in the genome of Xylella fastidiosa strain 9a5c. Regions from such fragments were PCR-amplified using specially designed primers (TNP1 and TNP2). In order to detect insertions of the Tn1721 element, both primers were used and one of them included a region of the transposon (TNP1) and the other one had the right repeat and part of the bacterial chromosome (TNP2). The PCR products obtained from strain 9a5c were used as a pattern for fragment size comparisons when DNA samples from other X. fastidiosa strains were used as template for the PCR assays. Differences were observed concerning the PCR products of such amplifications when some X. fastidiosa strains isolated from grapevine and plum were used. For the citrus-derived strains only the strains U187d and GP920b produced fragments with different sizes or weak band intensity. Such variations in the X. fastidiosa genome related to disrupted Tn1721 copies are probably due to the possibility of such a transposon element being still able to duplicate even after deletion events might have taken place and also because the bacterial strains in which the main differences were detected are derived from different host plants cultivated under different climate conditions from the one used as reference. © 2002 Federation of European Microbiological Societies. Published by Elsevier Science B.V. All rights reserved.

Modeling Habitat Split: Landscape and Life History Traits Determine Amphibian Extinction Thresholds

Habitat split is a major force behind the worldwide decline of amphibian populations, causing community change in richness and species composition. In fragmented landscapes, natural remnants, the terrestrial habitat of the adults, are frequently separated from streams, the aquatic habitat of the larvae. An important question is how this landscape configuration affects population levels and if it can drive species to extinction locally. Here, we put forward the first theoretical model on habitat split which is particularly concerned on how split distance - the distance between the two required habitats - affects population size and persistence in isolated fragments. Our diffusive model shows that habitat split alone is able to generate extinction thresholds. Fragments occurring between the aquatic habitat and a given critical split distance are expected to hold viable populations, while fragments located farther away are expected to be unoccupied. Species with higher reproductive success and higher diffusion rate of post-metamorphic youngs are expected to have farther critical split distances. Furthermore, the model indicates that negative effects of habitat split are poorly compensated by positive effects of fragment size. The habitat split model improves our understanding about spatially structured populations and has relevant implications for landscape design for conservation. It puts on a firm theoretical basis the relation between habitat split and the decline of amphibian populations. © 2013 Fonseca et al.

Algas e cianobactérias aerofíticas de fragmentos de floresta estacional semidecidual no noroeste paulista

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Biologia Vegetal) - IBRC

Marcadores moleculares associados à qualidade de carne em bovinos Nelore

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Efeito de distúrbios ambientais sobre a fauna de cupins (Insecta: isoptera) e seu papel como bioindicador

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Efeito do tamanho da área florestada, grau de isolamento e distância de estradas na estruturação de comunidades de aranhas em Alter do Chão, Santarém, Pará

Dados recentes mostram que os processos de destruição da floresta e formação de fragmentos estão avançando muito rapidamente na Amazônia brasileira. Definir como esses processos afetam a fauna nas diferentes fito fisionomias amazônicas é fundamental para que se possam planejar políticas visando avaliar a vulnerabilidade relativa de diferentes grupos biológicos a esse processo assim estimar o valor de áreas fragmentadas para a conservação. Os invertebrados podem ser usados como bons indicadores para esse objetivo, pois são grupos com grande capacidade adaptativa e de dispersão, dependendo diretamente do ambiente para sua sobrevivência. A utilização de aranhas para avaliar o efeito da fragmentação florestal é recente e ainda pouco explorada, apesar das aranhas serem um grupo megadiverso e com sua biologia diretamente relacionada com a composição e estrutura do ambiente em que vivem. Destarte este trabalho objetivou avaliar os efeitos do tamanho da área florestada, do grau de isolamento e da distância das estradas sobre as comunidades de aranhas em 15 ilhas de floresta, isoladas por matriz de savana e seis áreas de mata contínua no distrito de Alter do Chão, no município de Santarém, no oeste do estado do Pará. As amostragens envolveram um esforço de 252 horas, utilizando-se guarda-chuva entomológico e coleta manual noturna, ambas com controle de tempo e área, sendo a unidade amostral representada pela soma dos resultados obtidos por três coletores em cada área, em transectos de 250m. O protocolo resultou na captura de 7751 aranhas sendo 5477 imaturos e 2274 adultos. Após a identificação do material araneológico obteve-se uma lista com 306 espécies distribuídas em 32 famílias. Os padrões da comunidade de aranhas, analisados através de um MDS (Multidimensional Scaling ou escalonamento multidimensional) utilizando a distância de Bray-Curtis mostraram separação entre as áreas de mata contínua e ilhas de floresta. A análise da resposta à primeira dimensão da ordenação foi feita para as espécies com mais de 10 indivíduos na amostra e uma ordenação direta foi feita com as características das áreas (distância das ilhas de floresta para a floresta contínua, o tamanho e o índice de forma das ilhas de floresta). Uma análise GLM, utilizada para avaliar os efeitos da degradação ambiental, indicou diferenças significativas para o número de árvores por área florestada e para a distância das estradas: a fragmentação florestal sobre a comunidade de aranhas foi significativa apenas para o tamanho das ilhas em relação ao eixo 1 do MDS. A análise de variância (anova), que foi utilizada para se achar as médias das riquezas que foram maiores nas matas contínuas, diferindo do resultado das curvas de rarefação, que apontaram uma riqueza levemente maior nas ilhas de florest. O padrão de hierarquia da comunidade de aranhas foi achado no programa Nestedness Temperature Calculator Program - Nestcalc (Atmar; Patterson, 1995).

Composição e riqueza de espécies de anuros (Amphibia) em fragmentos florestais no Lago de Tucuruí, Pará

A perda e fragmentação de habitats representam sérios riscos à manutenção das espécies de anfibios na Amazônia. Neste estudo, determinamos a composição, a riqueza e abundância das espécies de anuros em fragmentos florestais nas Zonas de Proteção da Vida Silvestre (ZPVS) estabelecidas no Lago de Tucuruí, leste do Pará. Os anuros foram amostrados através de transectos em doze fragmentos de diferentes tamanhos distribuídos igualmente entre as duas ZPVS, uma na margem direita (ZPVS-D) e outra na margem esquerda (ZPVS-E) do Lago. Os animais foram registrados através dos métodos de procura ativa e armadilhas de interceptação e queda. De janeiro a julho de 2005 registramos 2370 indivíduos de 35 espécies de anuros. Destas espécies, 30 foram encontradas na ZPVS-E (13 exclusivas) e 22 na ZPVS-D (cinco espécies exclusivas). Sete estimadores de riqueza de espécies foram obtidos com o auxílio do Programa EstimateS®. Para a maioria dos estimadores, as curvas de acumulação de espécies tenderam a uma certa estabilidade. Entretanto, as estimativas de riqueza de espécies variaram entre os estimadores, sendo a estimativa Bootstrap a mais baixa (38 espécies) e Jackknife a mais alta (45 espécies). A combinação das espécies de anuros observadas neste estudo com nove espécies registradas na Coleção Herpetológica do Museu Paraense Emílio Goeldi, resultaram num total de 44 espécies, indicando que os estimadores de riqueza de espécies tiveram um bom desempenho. A similaridade de espécies de anuros, foi maior entre os fragmentos de uma mesma ZPVS do que entre fragmentos do mesmo tamanho. A riqueza de espécies foi positivamente e significativamente relacionada com o tamanho, mas não com o grau de isolamento dos fragmentos. Não houve relação significativa do número de indivíduos observados por fragmento e o tamanho dos fragmentos. A diferença na composição e riqueza de espécies encontrada entre as duas ZPVS indica certa complementariedade entre as duas unidades para a conservação da anurofauna local, assim como a necessidade de maior esforço de amostragem de anuros, principalmente através da ampliação da área de estudo, para uma melhor compreensão destas diferenças e suas implicações.

Análise da dinâmica de fragmentos florestais: estudo de caso de Sorocaba-SP

Pós-graduação em Engenharia Civil e Ambiental - FEB

Site Selection for Restoration Planning: A Protocol With Landscape and Legislation Based Alternatives

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Herbivoria em Bauhinia rufa (Leguminosae: Caesalpinioideae) em fragmentos de cerrado

Herbivory is the basal link among the trophic chains and therefore has great importance in the energy flow in the ecosystems. However, the ecological interactions have been changed due to the process of fragmentation that has occurred in the cerrado. Thus, our objective was to evaluate the herbivory and the presence of possible constituents of defense in leaves of Bauhinia rufa in two cerrado fragments of different sizes . We evaluated in both of them species richness and abundance of herbivores as well absolute herbivory ( n = 25 plants / fragment ) . Through histochemical tests and scanning electron microscopy we verified the constituents of defense. The difference between the herbivory in the fragments was not statistically significant ( t = -1.387 , p = 0.166 ) . However , we found a higher abundance of morphotypes of herbivores in the smaller fragment. We detected chemical and physical constituents that may confer protection to the plant at all stages of leaf development. Although several publications have indicated that small fragments have a higher susceptibility to changes, our study revealed no effect of fragment size on the absolute herbivory, suggesting that there are other factors acting more strongly and maintaining this type of interaction in these ecosystems

Efeito do gradiente interior-borda-matriz, e do tipo de matriz sobre a entomofaúna edáfica em fragmentos de cerrado

edge effect. Thus, under the influence of the adjacent matrix, fragments undergo microclimatic alterations that accentuate changes in species composition and community structure. In order to better understand edge and matrix effects on the richness and abundance of edaphic arthropods, this study assessed: (a) the difference between habitat (fragment) and non-habitat (matrix); (b) whether there is a continuous interior-edge-matrix gradient; and (c) the difference between matrices for arthropod orders richness and abundance. We selected 15 landscapes, 5 of which contained a cerrado fragment surrounded by sugarcane cultivation, 5 with a cerrado fragment within eucalyptus and 5 with a cerrado fragment within pasture. In each landscape the soil fauna was collected along with the soil and then extracted with the aid of the modified Berlese-Tullgren funnel. We chose the orders Coleoptera, Collembola, Mesostigmata and Oribatida for analysis, and after separation of the individuals we used model selection analysis via AIC. The model type fragment x matrix was the most likely to explain richness, total and relative abundances of the four orders (wAICc between 0,6623 and 1,0). The model of edge distance (edge effect) was plausible to total abundance and relative abundance of Mesostigmata order (wAICc=0,2717 and 0,186). Local environmental variables (soil texture, temperature and relative humidity), and fragment size were also measured to avoid confounding factors and were not presented as plausible models to explain the patterns. So edaphic arthropods, despite protecting themselves under the ground, are extremely sensitive to fragmentation, even with the replacement of natural habitat by agricultural use, such as sugarcane, pasture and eucalyptus. This group should be studied environmental impact assessments because provides important ecosystem se ravincde s inacnludd eisd ainn efficient bio-indicator