Sensitive and specific detection of Clavibacter xyli subsp. xyli, causal agent of ratoon stunting disease of sugarcane, with a polymerase chain reaction-based assay

A sensitive, specific polymerase chain reaction-based assay was developed for the detection of the causal agent of ratoon stunting disease of sugarcane, Clavibacter xyli subsp. xyli. This assay uses oligonucleotide primers derived from the internal transcribed spacer region between the 16S and 23S rRNA genes of the bacterial rRNA operon. The assay is specific for C. xyli subsp. xyli and does not produce an amplification product from the template of the closely related bacterium C. xyli subsp. cynodontis, nor from other bacterial species. The assay was successfully applied to the detection of C. xyli subsp. xyli in fibrovascular fluid extracted from sugarcane and was sensitive to approximately 22 cells per PCR assay. A multiplex PCR test was also developed which identified and differentiated C. xyli subsp. xyli and C. xyli subsp. cynodontis in a single PCR assay.

Description of Skermanella parooensis gen. nov., sp. nov. to accommodate Conglomeromonas largomobilis subsp. parooensis following the transfer of Conglomeromonas largomobilis subsp. largomobilis to the genus Azospirillum

As a consequence of the transfer of the type species Conglomeromonas largomobilis subsp. largomobilis to the genus Azospirillum, the name of the genus Conglomeromonas must be changed in accordance with Rule 37a(1) of the International Code of Nomenclature of Bacteria. Consequently, it is proposed that the subspecies Conglomeromonas largomobilis subsp, parooensis be transferred to the genus Skermanella gen, nov. as the type species Skermanella parooensis gen, nov., sp, nov. This taxon belongs to an isolated subline of descent in the Azospirillum branch of the alpha-Proteobacteria. The spelling of the specific epithet of Azospirillum largomobile is corrected to Azospirillum largimobile.

Cyanogenic polymorphism in Eucalyptus polyanthemos Schauer subsp vestita L. Johnson and K. Hill (Myrtaceae)

Plant cyanogenesis, the release of cyanide from endogenous cyanide-containing compounds, is an effective herbivore deterrent. This paper characterises cyanogenesis in the Australian tree Eucalyptus polyanthemos Schauer subsp. vestita L. Johnson and K. Hill for the first time. The cyanogenic glucoside prunasin ((R)-mandelonitrile beta-D-glucoside) was determined to be the only cyanogenic compound in E. polyanthemos foliage. Two natural populations of E. polyanthernos showed quantitative variation in foliar prumasin concentration, varying from zero (i.e. acyanogenic) to 2.07 mg CN g(-1) dry weight in one population and from 0.17 to 1.98 mg CN g(-1) dry weight in the other. No significant difference was detected between the populations with respect to the mean prunasin concentration or the degree of variation in foliar prunasin, despite significant differences in foliar nitrogen. Variation between individuals was also observed with respect to the capacity of foliage to catabolise prunasin to form cyanide. Moreover, variation in this capacity generally correlated with the amount of prunasin in the tissue, suggesting genetic linkage between prunasin and beta-glucosidase. (C) 2002 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

A long-term study in Merino sheep experimentally infected with Mycobacterium avium subsp paratuberculosis: clinical disease, faecal culture and immunological studies

Two longitudinal experiments involving Merino sheep challenged with either bovine or ovine strains of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Map) have been conducted over a period of 54 and 35 months, respectively. Blood samples for the interferon-gamma test, the absorbed ELISA and faecal samples for bacteriological culture were taken pre-challenge and monthly post-challenge. Infections were induced with either a bovine or ovine strain of Map in separate experiments with infections being more easily established, in terms of faecal bacterial shedding and clinical disease when the challenge inoculum was prepared from gut mucosal tissue than cultured bacteria. The patterns of response for shedding and clinical disease were similar. Cell-mediated immune responses were proportionally elevated by at least an order of magnitude in all sheep dosed with either a bovine or ovine strain of Map. Conversely, antibody responses were only elevated in a relatively small proportion of infected sheep. Neither of the clinically affected tissue challenged sheep developed an antibody response despite the presence of persistent shedding and the development and decline in cell-mediated immunity. The results indicated that for sheep the interferon-gamma test may be useful for determining if a flock has been exposed to ovine Johne's disease. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.

A long-term study in Angora goats experimentally infected with Mycobacterium avium subsp paratuberculosis: Clinical disease, faecal culture and immunological studies

Two longitudinal experiments involving Angora goats challenged with either bovine or ovine strains of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (Map) have been conducted over a period of 54 and 35 months, respectively. Blood samples for the interferon-gamma (IFN-gamma) test and the absorbed ELISA and faecal samples for bacteriological culture were taken pre-challenge and monthly post-challenge. Persistent shedding, IFN-gamma production, seroconversion and clinical disease occurred earlier with the bovine Map gut mucosal tissue challenge inoculum than with cultured bacteria. The IFN-gamma responses of the gut mucosal tissue and bacterial challenge groups were substantially and consistently higher than those of the control group. The in vivo and cultured cattle strains were much more pathogenic for goats than the sheep strains with persistent faecal shedding, seroconversion and clinical disease occurring in the majority of bovine Map challenged goats. With the ovine Map, 3 goats developed persistent antibody responses but only one of these goats developed persistent faecal shedding and clinical disease. However, there was no significant difference between the IFN-gamma responses of the tissue challenged, bacterial challenged and control groups. Compared with sheep, the ELISA appeared to have higher sensitivity and the IFN-gamma test lower specificity. (C) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved.

Transfer of Conglomeromonas largomobilis subsp largomobilis to the genus Azospirillum as Azopirillum largomobile comb nov, and elevation of Conglomeromonas largomobilis subsp parooensis to the new type species of Conglomeromonas, Conglomeromonas parooensi

Analysis of the 16S rDNA sequence of Conglomeromonas largomobilis subsp. largomobilis supports a phylogenetic relationship with the species of the genus Azospirillum. This confirms results of previous nucleic acid hybridization studies (FALK, E. C., J. L. JOHNSON, V. D. L. BALDANI, J. DOBEREINER, and N. R. KRIEG. 1986. Int. J. Syst. Bacteriol. 36: 80-85). Conglomeromonas largomobilis subsp. largomobilis was most closely related to the species Azospirillim lipoferum and Azospirillum brasilense but sufficiently distant to warrant separate species status. Conglomeromonas largomobilis subsp. parooensis was more distantly related to the existing species of Azospirillum and represents an isolated subline of descent. On the basis of the phylogenetic evidence a prosposal is made to transfer the subspecies Conglom-eromonas largomobilis subsp. largomobilis to the genus Azospirillum as Azospirillum largomobile comb. nov. and to retain the genus Conglomeromonas by elevating the subspecies C. largomobilis subsp. parooensis to the type species of Conglomeromonas as Conglomeromonas parooensis sp. nov.

Transformation and transposon mutagenesis of Leifsonia xyli subsp. Xyli, causal organism of Ratoon Stunting Discease of sugarcane

Conditions have been developed for genetic transformation and insertional mutagenesis in Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx), the causal organism of ratoon stunting disease (RSD), one of the most damaging and intractable diseases of sugarcane internationally. Transformation frequencies ranged from 1 to 10 colony forming units (CFU)/mug of plasmid DNA using Clavibacter/Escherichia coli shuttle vectors pCG188, pDM302, and pDM306 and ranged from 50 to 500 CFU/mug using cosmid cloning vectors pLAFR3 and pLAFR5-km. The transformation/transposition frequency was 0 to 70 CFU/mug of DNA, using suicide vectors pUCD623 and pSLTP2021 containing transposable elements Tn4431 and Tn5, respectively. It was necessary to grow Lxx in media containing 0.1% glycine for electroporation and to amplify large plasmids in a dam(-)/dcm(-) E. coli strain and purify the DNA by anion exchange. To keep selection pressure at an optimum, the transformants were grown on nitrocellulose filters (0.2-mum pore size) on media containing the appropriate antibiotics. Transposon Tn4431 containing a promoterless lux operon from Vibrio fischeri and a tetracycline-resistance gene was introduced on the suicide vector pUCD623. All but 1% of the putative transposon mutants produce light, indicating transposition into functional Lxx genes. Southern blot analysis of these transformants indicates predominantly single transposon insertions at unique sites. The cosmid cloning vector pLAFR5-km was stably maintained in Lxx. The development of a transformation and transposon mutagenesis system opens the way for molecular analysis of pathogenicity determinants in Lxx.

Avaliação da qualidade da informação sobre a causa básica de óbitos infantis no Rio Grande do Sul (Brasil)

A partir de dados coletados para um estudo de casos e controles sobre mortalidade infantil por doenças infecciosas e desnutrição realizado em Porto Alegre e Pelotas, RS (Brasil), comparou-se as causas de óbito constantes do atestado médico com as causas obtidas através de uma revisão detalhada, realizada pela equipe da investigação. Concluiu-se que as estatísticas oficiais não são fidedignas, tendo havido sobre-registro de broncopneumonias (CID 485X) e de septicemias (CID 038.9), e sub-registro de gastroenterites (CID 009.1) e de mortes súbitas (CID 798.0). A concordância entre os atestados refeitos e os oficiais, em termos de grupos de causas de óbito, foi de apenas 27.9%.

Essential oils of Origanum vulgare L. subsp glandulosum (Desf.) letswaart from Tunisia: chemical composition and antioxidant activity

BACKGROUND: Characterisation of the essential oils from O. glandulosum collected in three locations of Tunisia, chemical composition and the evaluation of their antioxidant activities were carried out. RESULTS: The essential oils from Origanum vulgare L. subsp. glandulosum (Desf.) letswaart collected from three localities of north Tunisia - Krib, Bargou and Nefza - were obtained in yields of 2.5, 3.0 and 4.6% (v/w), respectively. The essential oils were analysed by GC and GC/MS and assayed for their total phenolics content, by the Folin-Ciocalteu method, and antioxidant effectiveness, using the 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazil (DPPH) radical scavenging assay. The main components of these essential oils, from Nefza, Bargou and Krib, were p-cymene (36%, 40% and 46%), thymol (32%, 39% and 18%), gamma-terpinene (24%, 12% and 16%) and carvacrol (2%, 2% and 15%), respectively). The ability to scavenge the DPPH radicals, expressed by IC50, ranged from 59 to 80 mg L-1. The total phenolic content, expressed in gallic acid equivalent (GAE) g kg(-1) dry weight, varied from 9.37 to 17.70 g kg(-1) dw. CONCLUSIONS: A correlation was identified between the total phenolic content of the essential oils and DPPH radical scavenger capacity. The occurrence of a p-cymene chemotype of O. glandulosum in the northern region of Tunisia is demonstrated.

Confiabilidade da declaração de causa básica de mortes infantis em região metropolitana do sudeste do Brasil

A partir de dados coletados para um estudo sobre a mortalidade infantil na região metropolitana de Belo Horizonte, MG, Brasil, foi selecionada uma amostra aleatória de óbitos infantis ocorridos em 1989, para avaliar a concordância da causa básica de morte registrada na declaração de óbito e a obtida após revisão detalhada do prontuário hospitalar da criança. Verificou-se que 11,7% dos óbitos neonatais não tiveram a causa básica registrada no atestado, confirmada pela investigação nos prontuários médicos (kappa = 0,61), o mesmo ocorrendo em 44,0% dos pós-neonatais (kappa = 0,47). Esta maior discordância no grupo pós-neonatal provavelmente se deveu a maior dificuldade de definição das causas contribuintes e da causa básica dos óbitos por diarréias, pneumonias e desnutrição, principais causas de mortalidade nesse grupo. Em relação aos óbitos por desnutrição e diarréia, observou-se associação entre ambas em 76,9% das vezes em que a diarréia foi selecionada como causa básica, mostrando que essas patologias podem ser destacadas como um mesmo grupamento em saúde pública. As discordâcias encontradas demonstram que os médicos ainda dão pouca importância ao seu papel como agentes geradores de informação de saúde. Os dados da declaração de óbito fornecem indicação razoável das principais causas de mortes infantis, principalmente quando se considera o grupamento diarréia-pneumonia-desnutrição, composto de patologias evitáveis e ainda de grande relevância como causa de mortalidade infantil na região.

Os contos infantis como objecto da narrativa publicitária

Dissertação apresentada à Escola Superior de Comunicação Social para obtenção de grau de mestre em Publicidade e Marketing.

Projecto Creche: as histórias infantis - estratégias promotoras do desenvolvimento da comunicação e linguagem em crianças surdas

O presente projecto de investigação-acção surge da necessidade de avaliar e reformular estratégias de intervenção que visem o desenvolvimento da comunicação e da linguagem com crianças surdas em contexto de creche (dos 12 aos 36 meses) envolvendo os profissionais, mas também as famílias, tendo como ponto de partida o contar de histórias infantis. A componente teórica deste trabalho aborda questões relacionadas com a comunicação e linguagem, o modelo bilingue para crianças e jovens surdos, a importância das histórias infantis no desenvolvimento da criança o envolvimento parental, o envolvimento das crianças e os estilos de interacção. A componente prática do projecto foi aplicada a um grupo de oito crianças da creche de uma Instituição dedicada ao ensino de crianças e jovens surdos. Foram contadas histórias em contexto de creche e em contexto familiar, foram recolhidos e analisados dados referentes ao decorrer das sessões e os participantes avaliaram o projecto. O projecto contempla, nos objectivos propostos, três dimensões: o plano didáctico, o plano do desenvolvimento da linguagem e comunicação e o plano de trabalho com as famílias. No plano didáctico foram adaptados materiais para trabalhar as histórias infantis com as crianças surdas e avaliada a eficácia das estratégias utilizadas, em função do envolvimento das crianças nas actividades e na frequência das interacções entre pares. No plano do desenvolvimento da linguagem e da comunicação procurou-se promover a aquisição e desenvolvimento da linguagem das crianças (léxico) e a sua utilização espontânea em interacções com pares e adultos, facilitar a aquisição precoce de comportamentos emergentes de leitura e escrita, fomentar as interacções sociais entre os pares e entre criança/adulto e aumentar os tempos de atenção e concentração individuais durante uma história. No plano de trabalho com as famílias foram proporcionados momentos de formação e discussão entre pais sobre as formas de comunicação e estratégias de intervenção, fomentaram-se as interacções entre as crianças e os seus familiares, incentivou-se os pais a usarem os momentos de conto (contar histórias) como momentos de interacção, promoveram-se hábitos de contar e explorar histórias no contexto familiar e envolveu-se os pais na ―Hora do conto‖ e no processo de avaliação do desenvolvimento da linguagem e comunicação. No geral, os objectivos inicialmente formulados como o desenvolvimento da comunicação e da linguagem, a melhoria das interacções entre crianças e adultos e entre as crianças e os seus pares foram alcançados.

Concentração de fluoreto em arroz, feijão e alimentos infantis industrializados

OBJETIVO: Determinar a concentração de fluoreto na refeição brasileira típica (arroz e feijão) e em alimentos infantis industrializados e estimar suas contribuições para fluorose dental. MÉTODOS: Os alimentos foram adquiridos de supermercados das cidades de Piracicaba e Campinas, SP, Brasil. Os alimentos infantis industrializados foram comprados em 2001 e o arroz e feijão em 2003, e imediatamente analisados. Foram analisadas três marcas de arroz, três de feijão e 36 amostras de alimentos infantis divididos em cinco grupos: prontos para o consumo; mingaus; alimentos formulados; leites em pó e outros alimentos. No arroz e feijão, foram determinadas as concentrações de fluoreto nas sementes "in natura" e após cozimento com água destilada ou fluoretada (0,7 ppm). Todas as análises de fluoreto foram feitas com eletrodo específico. Considerou-se 0,07 mg/kg/dia como a dose limite de exposição a fluoreto para risco de fluorose. RESULTADOS: A concentração de fluoreto encontrada nos grãos de arroz e feijão foi baixa. Porém, a concentração aumentou 100-200 vezes após cozimento em água fluoretada e mesmo assim, foi menor que a encontrada em alguns alimentos industrializados. Uma refeição com arroz e feijão preparada com água fluoretada seria responsável por 29% da dose limite de ingestão de fluoreto em termos de fluorose aceitável; a contribuição de alguns alimentos industrializados atingiria 45%. CONCLUSÕES: A alimentação típica brasileira, mesmo preparada com água fluoretada, é mais segura em termos de risco de fluorose dental que alguns alimentos infantis industrializados.

Efeito da Estratégia Saúde da Família na vigilância de óbitos infantis

OBJETIVO: Analisar o efeito da Estratégia Saúde da Família na vigilância de óbitos infantis. MÉTODOS: Estudo ecológico de múltiplos grupos, tendo municípios do Estado da Bahia no ano de 2008 como unidade de análise. Os 3.947 óbitos analisados foram obtidos do Sistema de Informação sobre Mortalidade e a meta mínima de investigação considerada foi de 25% dos óbitos. Foram utilizados modelos de regressão logística bivariado e múltipla, ajustados por variáveis sociodemográficas e de organização de serviços. RESULTADOS: Em 48,9% dos municípios houve investigação de pelo menos um óbito infantil e em 35,5% foi alcançada a meta mínima de investigação. Nos modelos bivariados para avaliação da investigação de pelo menos um óbito, foram observadas associações estatisticamente significantes com maior porte populacional, maiores valores de Índice de Desenvolvimento Humano, existência de Comitê de Investigação e de leito obstétrico no município; não foram observadas associações com a cobertura da Estratégia Saúde da Família e existência de responsável técnico no município. Na análise ajustada, a investigação de pelo menos um óbito infantil esteve associada a porte populacional (OR = 4,02) e existência de leito obstétrico (OR = 2,68). O alcance da meta municipal mínima esteve associado apenas com a existência de leito obstétrico no município (OR = 1,76). CONCLUSÕES: O percentual de óbitos de menores de um ano investigados foi inferior ao pactuado na Bahia em 2008. Não houve associação entre a cobertura da Estratégia Saúde da Família e essa ação, o que sugere que a Vigilância de Óbitos Infantis é incipiente no Estado, principalmente quanto à sua descentralização para a atenção primária.