Prevalencia del Helicobacter Pylori y factores asociados en escolares de la etnia Shuar del cantón Sucúa –Morona Santiago, 2014.

Introducción: Según la OMS, más del 50% de la población adulta está infectada con el Helicobacter Pylori, con prevalencias de hasta el 90%. La mayoría de contagios se produce antes de los 10 años de edad. Desde el descubrimiento del H. Pylori (1983), se lo ha relacionado con la úlcera péptica, gastritis, reflujo gastroesofágico e incluso, cáncer gástrico. Metodología: Se realizó un estudio transversal analítico. La muestra estuvo conformada por 250 niños escolares de la etnia Shuar del cantón Sucúa. La prueba utilizada para la detección del Helicobacter pylori es la identificación de antígenos en las heces por inmunocromatografía. Para establecer la significancia de asociación de variables se utilizó el OR con su intervalo de confianza al 95%. Resultados: El promedio de edad fue de 8.8 años (DS 2.0), con predominio de las mujeres (54.4%). El 56.4% consume agua potable, el 71.65% vive en hacinamiento, el 42% tiene servicios de letrinización y el 49.2% cuenta con servicios de alcantarillado. Se encontró asociación significativa con el nivel de instrucción OR 1.68, IC95% (1 – 2.84), p=0.049; letrinización OR 1.99, IC95% (1.17 – 3.36), p=0.01; deposiciones al aire libre OR 4.32, IC95% (2.13 – 8.77), p=0.000. Conclusiones: La prevalencia de Helicobacter pylori es alta en la población escolar de la etnia Shuar; está asociada a un nivel bajo de instrucción de los progenitores y una inadecuada infraestructura de servicios básicos.

An inter-laboratory validation of a real time PCR assay to measure host excretion of bacterial pathogens, particularly of Mycobacterium bovis

Advances in the diagnosis of Mycobacterium bovis infection in wildlife hosts may benefit the development of sustainable approaches to the management of bovine tuberculosis in cattle. In the present study, three laboratories from two different countries participated in a validation trial to evaluate the reliability and reproducibility of a real time PCR assay in the detection and quantification of M. bovis from environmental samples. The sample panels consisted of negative badger faeces spiked with a dilution series of M. bovis BCG Pasteur and of field samples of faeces from badgers of unknown infection status taken from badger latrines in areas with high and low incidence of bovine TB (bTB) in cattle. Samples were tested with a previously optimised methodology. The experimental design involved rigorous testing which highlighted a number of potential pitfalls in the analysis of environmental samples using real time PCR. Despite minor variation between operators and laboratories, the validation study demonstrated good concordance between the three laboratories: on the spiked panels, the test showed high levels of agreement in terms of positive/negative detection, with high specificity (100%) and high sensitivity (97%) at levels of 10(5) cells g(-1) and above. Quantitative analysis of the data revealed low variability in recovery of BCG cells between laboratories and operators. On the field samples, the test showed high reproducibility both in terms of positive/negative detection and in the number of cells detected, despite low numbers of samples identified as positive by any laboratory. Use of a parallel PCR inhibition control assay revealed negligible PCR-interfering chemicals co-extracted with the DNA. This is the first example of a multi-laboratory validation of a real time PCR assay for the detection of mycobacteria in environmental samples. Field studies are now required to determine how best to apply the assay for population-level bTB surveillance in wildlife.