SAGE transcript profiling of the juvenile cambial region of Eucalyptus grandis

Despite the importance of Eucalyptus spp. in the pulp and paper industry, functional genomic approaches have only recently been applied to understand wood formation in this genus. We attempted to establish a global view of gene expression in the juvenile cambial region of Eucalyptus grandis Hill ex Maiden. The expression profile was obtained from serial analysis of gene expression (SAGE) library data produced from 3- and 6-year-old trees. Fourteen-base expressed sequence tags (ESTs) were searched against public Eucalyptus ESTs and annotated with GenBank. Altogether 43,304 tags were generated producing 3066 unigenes with three or more copies each, 445 with a putative identity, 215 with unknown function and 2406 without an EST match. The expression profile of the juvenile cambial region revealed the presence of highly frequent transcripts related to general metabolism and energy metabolism, cellular processes, transport, structural components and information pathways. We made a quantitative analysis of a large number of genes involved in the biosynthesis of cellulose, pectin, hemicellulose and lignin. Our findings provide insight into the expression of functionally related genes involved in juvenile wood formation in young fast-growing E. grandis trees.

Coordinated regulation of follicle development by germ and somatic cells

The continuum of folliculogenesis begins in the fetal ovary with the differentiation of the oogonia and their isolation within the primordial follicles. Primordial follicle activation is an enigmatic process, whereby some follicles enter the growing pool to become primary follicles, thereby embarking on an irreversible progression towards ovulation or atresia. This process is under the coordinated regulation of factors from the oocyte itself, as well as from the somatic cells of the ovary, in particular the theca and granulosa cells, which are structural components of the follicle. These two influences provide the principal stimuli for the growth of the follicle to the late preantral or early antral stage of development. The endocrine effects of the gonadotrophins FSH and LH are essential to the continued progression of the follicle and most atresia can be attributed to the failure to receive or process the gonadotrophin signals. The peri-ovulatory state has received intensive investigation recently, demonstrating a coordinated role for gonadotrophins, steroids, epidermal growth factor family proteins and prostaglandins. Thus, a complex programme of coordinated interaction of governing elements from both germ and somatic cell sources is required for successful follicle development.

The Role of Toll-Like Receptor 2 in the Recognition of Aggregatibacter actinomycetemcomitans

Background: Aggregatibacter actinomycetemcomitans (previously Actinobacillus actinomycetemcomitans) is a Gram-negative bacterium present in the oral cavity and is usually associated with localized aggressive periodontitis. Isolated antigens from A. actinomycetemcomitans can activate innate immune cells through Toll-like receptors (TLRs), which are molecules that recognize structural components conserved among microorganisms. In this study, we evaluate the role of TLR2 in the recognition of A. actinomycetemcomitans. Methods: Macrophages and neutrophils from knockout mice with targeted disruption of TLR2 (TLR2(-/-) mice) and wild-type mice were collected and used for the subsequent assays. The production of cytokines and chemokines was evaluated by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and the presence of apoptotic cells was determined by flow cytometry. In addition, the mechanisms that modulate the outcome of A. actinomycetemcomitans-induced periodontal disease in TLR2(-/-) mice were examined. Results: The results show that TLR2-deficient mice developed more severe periodontitis after A. actinomycetemcomitans infection, characterized by significantly higher bone loss and inflammatory cell migration to periodontal tissues. The inflammatory cell influx into the peritoneal cavities of TLR2(-/-) mice was three-fold lower than that observed for the littermate controls. A significantly diminished production of the cytokines tumor necrosis factor-alpha and interleukin-1 beta as well as the chemokine CC-ligand-5 in the peritoneal cavities of TLR2(-/-) mice was observed. In addition, a high frequency of apoptotic cells in the inflammatory exudates from TLR2(-/-) mice was observed. Phagocytosis and nitric oxide production was diminished in cells from TLR2(-/-) mice, facilitating the dissemination of the pathogen to the spleen. Conclusion: The results of this study highlight the involvement of TLR2 in recognizing A. actinomycetemcomitans and its essential role in controlling A. actinomycetemcomitans infection. J Periodontot 2009,80:2070-2019.

SOX9 enhances aggrecan gene promoter/enhancer activity and is up-regulated by retinoic acid in a cartilage-derived cell line, TC6

SOX9 is a transcription factor that plays a key role in chondrogenesis, Aggrecan is one of the major structural components in cartilage; however, the molecular mechanism of aggrecan gene regulation has not yet been fully elucidated, TC6 is a clonal chondrocytic cell line derived from articular cartilage, The purpose of this study was to examine whether SOX9 modulates aggrecan gene expression and to further identify molecules that regulate Sox9 expression in TC6 cells. SOX9 overexpression in TC6 cells enhanced by similar to 3-fold the transcriptional activity of the AgCAT-8 construct containing S-kilobase (kb) promoter/first exon/first intron fragments of the aggrecan gene. SOX9 enhancement of aggrecan promoter activity was lost when we deleted a 4.5-kb fragment from the 3'-end of the 8-kb fragment corresponding to the region including the first intron, In TC6 cells, SOX9 enhanced the transcriptional activity of a reporter construct containing the Sry/Sox consensus sequence >10-fold. SOX9 enhancement of aggrecan gene promoter activity and SOX9 transactivation through the Sry/Sox consensus sequence were not observed in osteoblastic osteosarcoma cells (ROS17/2.8), indicating the dependence on the cellular background. Northern blot analysis indicated that TC6 cells constitutively express Sox9 mRNA at relatively low levels. To examine regulation of Sox9 gene expression, we investigated the effects of calciotropic hormones and cytokines, Among these, retinoic acid (RA) specifically enhanced Sox9 mRNA expression in TC6 cells. The basal levels of Sox9 expression and its enhancement by RA were observed similarly at both permissive (33 degrees C) and nonpermissive (39 degrees C) temperatures. Furthermore, RA treatment enhanced the transcriptional activity of a reporter construct containing the Sry/Sox consensus sequence in TC6 cells. Moreover, RA treatment also enhanced the transcriptional activity of another reporter construct containing the enhancer region of the type II procollagen gene in TC6 cells. These observations indicate that SOX9 enhances aggrecan promoter activity and that its expression is up-regulated by RA in TC6 cells.

Cold-water coral communities in the Azores : diversity, habitat and conservation

Tese de Doutoramento, Ciências do Mar (especialidade em Ecologia Marinha), 11 de Setembro de 2015, Universidade dos Açores.

Establishing the main Guidelines for Cast Steel to Produce Truck Parts

Este trabalho foi realizado na Scania CV AB e teve como principal objectivo estabelecer uma diretriz sobre a possível utilização de aços vazados. Existe uma grande necessidade na realização deste trabalho, de forma a apoiar os engenheiros de projecto no seu processo de selecção dos materiais mais adequados, para produzir componentes mais leves e de elevado desempenho. Esta diretriz apresenta informação relacionada com propriedades mecânicas, processos de fundição, vazabilidade, tipologia de defeitos, tratamentos térmicos, soldabilidade e tratamentos superficiais dos aços vazados. Este trabalho foi limitado, na seleção de materiais para componentes do camião, a aços vazados que poderiam ser aplicados em dois componentes específicos: um componente estrutural da carroçaria sujeito a esforços de fadiga e a um colector de gases de combustão, sujeito a fluência, oxidação, fadiga por corrosão, fadiga-térmica e fadiga-mecânica. Foi realizado um benchmark focado nestes dois componentes de forma a saber que materiais são utilizados de momento por outras empresas concorrentes. Foi realizada ainda uma análise sobre possíveis materiais que possam ser aplicados em cada componente referido. Foi conduzida uma caracterização no estado bruto de fundição de um aço inoxidável vazado usado para produzir um protótipo do colector de gases. Esta caracterização consistiu numa análise microestrutural e medição de macro e microdurezas. Além da caracterização inicial, foram aplicados um conjunto de tratamentos térmicos, de forma a estudar a possibilidade de eliminar os carbonetos presentes inicialmente nas fronteiras de grão. As principais conclusões deste trabalho são que o aço vazado apresenta potencial para ser uma escolha válida em diversas aplicações, devido a um leque alargado de propriedades apresentadas tipicamente por este material. Relativamente a aplicações estruturais, o aço vazado é vantajoso comparativamente ao ferro fundido, quando são requeridos, por exemplo, soldabilidade e elevada resistência, combinada com elevada tenacidade à fractura. Para componentes sujeitos a elevadas temperaturas de serviço, o aço inoxidável vazado é vantajoso quando usado a temperaturas superiores a 750°C, apesar do seu elevado custo. O tratamento térmico composto por um recozimento de solubilização seguido de envelhecimento, elimina quase na totalidade os carbonetos presentes nas fronteiras de grão e verifica-se um aumento de dureza através de uma precipitação de carbonetos finamente dispersos na matriz, que poderão também aumentar a resistência à fluência.

Avaliação do comportamento e reforço da Ponte de Maçaínhas sob a ação do tráfego ferroviário

A presente dissertação tem como principal objetivo a avaliação do estado de conservação de uma ponte ferroviária metálica centenária para posteriormente se efetuar o reforço desta. O objeto de estudo foi a Ponte de Maçaínhas, uma ponte metálica treliçada que se situa na linha da Beira Baixa permitindo a ligação entre a Guarda e a Covilhã. Este trabalho envolveu um estudo profundo de vários conteúdos normativos relativos a ações em pontes ferroviárias e ações ambientais. Este estudo estende-se ainda ao campo das verificações regulamentares e critérios de segurança estrutural adequadas ao presente contexto. A operação de reforço começou numa rigorosa análise dos componentes estruturais da ponte, através do estudo de plantas e de um extenso registo fotográfico, para posteriormente se conceber um modelo numérico que traduzisse a situação real. Ao modelo concebido foram aplicadas as cargas regulamentares adequadas por forma a entender o comportamento que a ponte apresenta perante estas e se as suas secções transversais apresentam capacidade resistente suficiente. Caso estas não apresentem capacidade resistente suficiente teriam de ser intervencionadas. Concluído o processo de avaliação estrutural e de reforço, procedeu-se à verificação do comportamento da estrutura reforçada perante as ações de projeto. Com isto pretende-se avaliar se os esforços se distribuem da mesma maneira ou se a operação de reforço teve algum efeito na distribuição destes. Por último, para avaliar o comportamento da estrutura perante a passagem de tráfego real, realizaram-se análises dinâmicas que tiveram por base um grupo de veículos que habitualmente circulam na linha da Beira Baixa e um comboio de alta velocidade. Estas análises foram realizadas tanto para a situação pré reforço como pós reforço. Desta forma conseguiu-se fazer um paralelo entre ambas as condições e perceber se a operação de reforço foi bem-sucedida.

Comparação dos métodos ENF e 4-ENF para determinação da tenacidade ao corte de juntas adesivas

Ao longo destes últimos anos as ligações adesivas têm vindo a verificar um aumento progressivo em aplicações estruturais em detrimento das ligações mecânicas convencionais. Esta alteração de paradigma deve-se às vantagens que as juntas adesivas possuem relativamente aos outros métodos de ligação. A mecânica da fratura e os Modelos de Dano Coesivo (MDC) são critérios comuns para prever a resistência em juntas adesivas e usam como parâmetros fundamentais as taxas de libertação de energia. Pelo facto do ensaio 4-Point End Notched Flexure (4-ENF), aplicado em juntas adesivas, ainda estar pouco estudado é de grande relevância um estudo acerca da sua viabilidade para a determinação da taxa crítica de libertação de energia de deformação ao corte (GIIc). Esta dissertação tem como objetivo principal efetuar uma comparação entre os métodos End- Notched Flexure (ENF) e 4-ENF na determinação de GIIc em juntas adesivas. Para tal foram utilizados 3 adesivos: Araldite® AV138, Araldite® 2015 e SikaForce® 7752. O trabalho experimental passou pela conceção e fabrico de uma ferramenta para realização do ensaio 4-ENF, seguindo-se o fabrico e a preparação dos provetes para os ensaios. Pelo facto do ensaio 4-ENF ainda se encontrar pouco divulgado em juntas adesivas, e não se encontrar normalizado, uma parte importante do trabalho passou pela pesquisa e análise em trabalhos de investigação e artigos científicos. A análise dos resultados foi realizada por comparação direta dos valores de GIIc com os resultados obtidos no ensaio ENF, sendo realizada por série de adesivo, através da comparação das curvas P-δ e curvas-R. Como resultado verificou-se que o ensaio 4-ENF em ligações adesivas não é o mais versátil para a determinação do valor de GIIc, e que apenas um método de obtenção de GIIc é viável. Este método é baseado na medição do comprimento de fenda (a). Ficou evidenciado que o ensaio ENF, devido a ser um ensaio normalizado, por apresentar um setup mais simples e por apresentar uma maior disponibilidade de métodos para a determinação do valor de GIIc, é o mais recomendado. Conclui-se assim que o ensaio 4-ENF, embora sendo uma alternativa ao ensaio ENF, tem aplicação mais limitada.

Empirical models for quantification of machining damage in composite materials

Dissertação para obtenção do Grau de Doutor em Engenharia Mecânica

Reducing seismic vulnerablity: Retrofitting historic buildings

The value of preserving historic buildings is increasingly accepted by society, which not only recognizes built cultural heritage as a part of its identity but is also more cognizant of its economic value. In Europe, for example, tourism accounts for 10 percent of the GDP in the EU and 12 percent of employment.1 Built cultural heritage is a fundamental element of what draws tourists to European destinations. To a great extent, the value of historic buildings rests in the integrity of their components as unique products of the technology of their time and place. Unfortunately, cultural heritage buildings are particularly vulnerable to disasters, for a variety of reasons. They are often damaged or in a state of deterioration; they were built with materials with low resistance; they are heavy; and the connections among their various structural components are frequently insufficient. The main causes of damage are lack of maintenance, water-induced deterioration (from rain or rising damp), soil settlement, and extreme events such as earthquakes. Earthquakes have caused hundreds of thousands of deaths in the last decade, in addition to the tremendous losses in built cultural heritage.

Projecto de componentes estruturais recorrendo a soluções avançadas em aços de alta resistência

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Mecânica

Desenvolvimento de modelos numéricos e análise experimental de subestruturas soldadas de transformadores de potência, sujeitas a forças de curto-circuito em regime transitório

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Mecânica

Desenvolvimento de materiais auxéticos para aplicações estruturais

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Civil

Estudo da ligação entre componentes estruturais de GFRP (glass fiber reinforced polymer) e componentes estruturais em betão

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Civil

Patterns of serologic response to human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) in brazilians with different clinical forms of HIV infection

In order to investigate the IgG HIV-1 antibodies rectivity to structural components of the virus, 85 sera from infected Brazilians, comprising the total spectrum of HIV infection, were analysed by Western blot assay. The sera were confirmed as being positive to HIV with enzyme linked immuno assay (ELISA) and indirect immunofluorescence (IIF). Although the sera from patients reacted less intensively to the gag polypeptide of 55KDa, no distinctive antigen reaction patterns were observed between sera patients with different clinical forms. Because of the higher frequency of reactivity to the gag p24 in AIDS patients, the patterns of anti-HIV IgG responses are similar to those observed in their African counterparts.