X-chromosome genetic variation in São Paulo State (Brazil) population

As data on X-chromosomal short tandem repeats (X-STRs) for the Brazilian population are scarse, the aim of this study was to determine the allele frequencies of five X-STRs (DXS6854, DXS7424, DXS101, DXS6808 and DXS7132) in the São Paulo State, Brazil. No deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium were observed, with the exception of DXS101. The forensic efficiency parameters demonstrated that DXS101 was the most informative marker. Population comparisons revealed that the X-STR profile sampled in the state of São Paulo was more similar to European and African populations than Asiatic populations reported in this work.

Genotyping, serotyping and determination of mating-type of Cryptococcus neoformans clinical isolates from São Paulo State, Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Frequency of Blastocystis hominis and other intestinal parasites in stool samples examined at the Parasitology Laboratory of the School of Pharmaceutical Sciences at the São Paulo State University, Araraquara

Blastocystis hominis é um protozoário, causador de infecção intestinal denominada blastocistose humana, cujo diagnóstico é realizado pelo exame coproparasitológico e por meio de técnicas de coloração permanente. Este estudo foi desenvolvido para avaliar a freqüência da infecção por Blastocystis hominis em habitantes da região de Araraquara/SP, bem como comparar diferentes métodos para a pesquisa desse protozoário em amostras de fezes. Foram estudadas 503 amostras de fezes submetidas ao exame direto a fresco, às técnicas de Faust e cols, Lutz e de Rugai e cols, além das colorações pela hematoxilina férrica, tricrômio e de Kinyoun modificada. Entre as 503 amostras examinadas, 174 (34,6%) apresentaram-se positivas para a presença de parasitas intestinais. O protozoário e o helminto mais freqüentes foram Entamoeba coli (14,6%) e Strongyloides stercoralis (6,7%), respectivamente. Blastocystis hominis foi observado em 23 (4,6%) amostras fecais com consistência predominantemente pastosa, não caracterizando quadro diarréico. Apesar da baixa freqüência de Blastocystis hominis encontrada na região de Araraquara, comparativamente a outras regiões brasileiras, é importante a realização do diagnóstico laboratorial desse protozoário. O encontro de Blastocystis hominis em material fecal é indicativo de contaminação de alimentos e água de consumo, desde que se admita a rota de transmissão oral-fecal desse parasita, o que implica na orientação da população sobre as medidas de saneamento básico e higiene como meio para se controlar problemas de saúde ocasionados pelos enteroparasitas.

Organochlorine pesticides and polychlorinated biphenyls in soil and water samples in the northeastern part of São Paulo State, Brazil

Detailed analyses of persistent organic pollutants (POPs) such as organochlorine pesticides (OCPs), hexachlorocyclohexane (HCH) isomers (HCHs), dichlorodiphenyltrichloro ethane (DDT) and its metabolites (DDTs) and congeners of polychlorinated biphenyls (PCBs) in soil and surface water from the northeastern São Paulo, Brazil allowed the evaluation of the contamination status, distribution and possible pollution sources. The pesticides and PCBs demonstrated markedly different distributions, reflecting different agricultural, domestic and industrial usage in each region studied. The ranges of HCH, DDT, and PCBs concentrations in the soil samples were 0.05-0.92, 0.12-11.01, 0.02-0.25 ng g(-1) dry wt, respectively, and in the surface water samples were 0.02-0.6, 0.02-0.58 and 0.02-0.5 ng l(-1), respectively. Overall elevated levels of DDT and PCB were recorded in region 2, a site very close to melting, automotive batteries industries, and agricultural practice regions. High ratios of metabolites of DDT to DDT isomers revealed the recent use of DDT in this environment. The sources of contamination are closely related to human activities, such as domestic and industrial discharge, street runoff, agricultural pesticides and soil erosion, due to deforestation as well as atmospheric transport. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Incidence and prevalence rates of inflammatory bowel diseases, in midwestern of São Paulo State, Brazil

CONTEXTO: No Brasil, a incidência e prevalência populacionais das doenças inflamatórias intestinais são desconhecidas. OBJETIVO: Neste trabalho, estimou-se esses parâmetros na área que abrange a antiga região de saúde DIR 11, no centro-oeste do Estado de São Paulo. MÉTODOS: Usou-se um registro sequencial de 115 pacientes (>15 anos de idade) com doenças inflamatórias intestinais, residindo na área de estudo, atendidos durante período de 20 anos (1986-2005) em hospital de referência. Estimou-se, para quatro períodos consecutivos de 5 anos, as incidências e prevalências de acordo com os tipos de doença e do sexo de doentes. As suas inter-relações foram analisadas utilizando o modelo de regressão linear de Poisson. RESULTADOS: Na região, as doenças inflamatórias intestinais foram predominantes em mulheres jovens, da raça branca, residindo na zona urbana.A incidência da retocolite foi maior que a da doença de Crohn e das colites não classificadas, e diferentemente dessas duas ultimas, mostrou decréscimo no último período (2001-2005). Neste mesmo período, a taxa da incidência para a retocolite foi de 4,48 casos/100.000 habitantes, para a doença de Crohn atingiu 3,50 casos/100.000 habitantes e a das colites não classificadas foi de 1,75 casos/100.000 habitantes. As prevalências atingiram os valores de 14,81 casos/100.000 habitantes para a retocolite, 5,65 casos/100.000 habitantes para a doenças de Crohn e 2,14 casos/100.000 habitantes. Considerando todas as doenças inflamatórias a prevalência atingiu o valor de 22,61 casos/100.000 habitantes. CONCLUSÃO:A incidência dessas doenças inflamatórias intestinais nessa região é baixa, igualando-se aos países da América Latina e do sul da Europa e sua crescente prevalência justifica políticas de saúde para as suas abordagens.

Hematologic, serum biochemistry and urinary values for captive Crab-eating Fox (Cerdocyon thous) in São Paulo state, Brazil

A importância do estudo dos valores hematológicos, de bioquímica sérica e urinários de Cachorro-do-mato (Cerdocyon thous) baseia-se na necessidade de cuidados e manutenção da sanidade destas populações. Este estudo visou investigar os parâmetros fisiológicos hematológicos, de bioquímica sérica e urinários dos Cachorros-do-mato de cativeiro, comparando as possíveis diferenças sexuais e de faixa etária. Foram colhidas amostras de sangue de 52 animais, pertencentes a diversos Zoológicos do Estado de São Paulo, Brasil. Foram colhidos cerca de 7mL de sangue, que foram utilizados para se obter os valores hematológicos e o perfil de bioquímica sérica. Também foram colhidos 5mL de urina para realização da urinálise. Não se encontraram diferenças entre os valores obtidos para machos e fêmeas tanto na hematologia, quanto na bioquímica sérica. Alguns parâmetros hematológicos e de bioquímica sérica foram afetados pela idade, mostrando diferenças significativas. Os resultados da urinálise foram demonstrados apenas em forma descritiva. Os principais valores encontrados foram, hemácias 4,35+0,73 x 106 células /µL, leucócitos totais 7,72+3,66 x 103 células /µL (predomínio de neutrófilos segmentados), plaquetas 227,06+111,58 x 103 células /µL, ureia 43,06+14,28mg/dL e creatinina 1,03+0,24mg/dL. Os valores hematológicos, de bioquímica sérica e urinários obtidos neste estudo podem ser utilizados como valores fisiológicos de Cachorros-do-mato de cativeiro. Pode-se concluir que as espécies silvestres necessitam de seus próprios valores de referência com necessidade de se diferenciar animais em cativeiro de animais de vida livre.

Retrospective analysis of post-exposure to human anti-rabies treatment in Botucatu, São Paulo State, Brazil

This analysis aimed to identify characteristics of accidents that would, probably, provoke rabies infection. A total of 14,409 survey questionnaires for surveillance of human rabies from the Brazilian Information System for Disease Notification (SINAN), from 2000 to 2005, were analyzed. Regarding demographics, it was observed that 7,377 (51.5%) of the victims were white, 4,458 (30.93%) were children and 8,008 (55.58%) were males. Urban cases were prevalent (88.10%) while dogs were the animals most frequently involved in accidents, in 11,700 cases (81.19%). Bites (84.35%) and scratches (19.15%) were the most prevalent exposure types, and occurred predominantly on victims' extremities (38.79%). The prophylactic measure taken in 6,179 cases comprised anti-rabies vaccine; of these victims, 421 (2.92%) showed systemic reactions while 693 (4.80%) reported no response. The importance of developing awareness in professionals that should correctly report post-exposure immunoprophylaxis cases is emphasized given the high number of individuals who receive this type of treatment annually.

Envenomation caused by Latrodectus geometricus in São Paulo state, Brazil: a case report

Widow spiders (Latrodectus spp.), also known as "black widows", have a worldwide distribution and can cause latrodectism. To the best of our knowledge, in Brazil, only one case of Latrodectus geometricus (Koch, 1841) envenomation in a human has been reported. The aim of the present report is to describe a spider bite caused by Latrodectus geometricus in a patient who lives in Paranapanema, São Paulo state, Brazil.

Prevalence and Risk Factors of Chlamydia trachomatis Cervicitis in Pregnant Women at the Genital Tract Infection in Obstetrics Unit Care at Botucatu Medical School, São Paulo State University - UNESP, Brazil

Objective. To evaluate the prevalence of and risk factors for Chlamydia trachomatis cervicitis in pregnant women seen at the Genital Tract Infection in Obstetrics Unit Care in Botucatu Medical School, São Paulo State University - UNESP.Materials and Methods. Between June 2006 and February 2008, 101 pregnant women were included in this study. During the gynecologic examination, cervical secretions were collected using cytobrush Plus GT (CooperSurgical Inc) to assess C. trachomatis using polymerase chain reaction. Vaginal flora were examined by Gram stain, and socio-demographic data were extracted from medical records.Results. of the 101 patients, 26 (25.7%) were positive for C. trachomatis. The median age of the infected group was 24 years (range = 13-40 y), and 48.5% of them had abnormal vaginal flora. The presence of chlamydial infection was associated with smoking (odds ratio [OR] = 2.67, 95% confidence interval [CI] = 1.01-7.19), residing in a city with fewer than 100,000 inhabitants (OR = 2.86, 95% CI = 1.03-7.94), presence of condyloma acuminatum (p = .03), and presence of discreet inflammation on Pap smear (p = .02).Conclusions. The prevalence of C. trachomatis is high in pregnant women seen at the Genital Infection Unit Care, UNESP, and is related to many risk factors. Therefore, its screening is extremely important in reducing obstetrical and neonatal complications.

Toxic and essential elements in blood from delivering women in selected areas of São Paulo State, Brazil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Levels of selected persistent organic pollutants in blood from delivering women in seven selected areas of São Paulo State, Brazil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Cataract prevalence in Central-West region of São Paulo State, Brazil

OBJETIVO: A catarata é a principal causa tratável de cegueira e deficiência visual em países subdesenvolvidos. Este estudo foi realizado para avaliar se a catarata continua sendo uma importante causa de cegueira no centro-oeste do Estado de São Paulo. MÉTODOS: Um estudo transversal, de caráter observacional, realizado em cinco cidades da região centro-oeste do Estado de São Paulo, para as quais o centro de referência é a cidade de Botucatu. A amostra estabelecida para este estudo, de forma aleatória, seria composta por 5.555 indivíduos, sendo que foram examinados 4.229 indivíduos (8.458 olhos), ou seja, 78% da amostra pretendida. Os indivíduos foram submetidos a um exame oftalmológico completo que consistia em avaliação da acuidade visual (com e sem correção), tonometria, biomicroscopia, fundoscopia e exame refracional. O diagnóstico de catarata foi dado aos indivíduos que apresentassem opacidade de cristalino na biomicroscopia, de acordo com o Sistema de Classificação de Opacidade do Cristalino II (LOCS II). Olhos apresentando deficiência visual ou cegueira, com a melhor correção e causados por catarata, foram considerados após excluir outras patologias que pudessem causar baixa da acuidade visual (AV). Olhos com deficiência visual foram considerados quando 0,05 < AV < 0,3 e olhos cegos quando AV < 0,05. Indivíduos com deficiência visual foram considerados quando 0,05 < AV < 0,3 e indivíduos cegos quando AV < 0,3, no melhor olho com a melhor correção. Foi considerado o número de olhos com catarata, o número de olhos com deficiência visual e cegueira e o número de indivíduos com deficiência visual e cegueira. RESULTADOS: A prevalência de catarata na população estudada foi de 4,94% (209 indivíduos), afetando principalmente indivíduos com mais de 50 anos (92,34%) e do sexo feminino (61,11%). A catarata foi a causa de deficiência visual para 0,96% e a causa de cegueira para 0,52% de toda a população estudada. CONCLUSÃO: Nossos resultados mostraram que a prevalência de catarata na população estudada é semelhante aos índices de países desenvolvidos.

Metabolic syndrome in overweight children from the city of Botucatu - São Paulo State - Brazil: agreement among six diagnostic criteria

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Epstein-Barr virus infection and gastric carcinoma in São Paulo State, Brazil

Epstein-Barr virus (EBV) is a ubiquitous herpesvirus, and most people have serological evidence of previous viral infection at adult age. EBV is associated with infectious mononucleosis and human cancers, including some lymphomas and gastric carcinomas. Although EBV was first reported in lymphoepithelioma-like gastric carcinoma, the virus was also found in conventional adenocarcinomas. In the present study, 53 gastric carcinomas diagnosed in São Paulo State, Brazil, were evaluated for EBV infection by non-isotopic in situ hybridization with a biotinylated probe (Biotin-AGACACCGTCCTCACCACCC GGGACTTGTA) directed to the viral transcript EBER-I, which is actively expressed in EBV latently infected cells. EBV infection was found in 6 of 53 (11.32%) gastric carcinomas, mostly from male patients (66.7%), with a mean age of 59 years old. Most EBV-positive tumors were in gastric antrum. Two EBV-positive tumors (33.3%) were conventional adenocarcinomas, whereas four (66.7%) were classified as lymphoepithelioma-like carcinomas. EBV infection in gastric carcinomas was reported elsewhere in frequencies that range from 5.6% (Korea) up to 18% (Germany). In Brazil, a previous work found EBV infection in 4 of 80 (5%) gastric carcinomas, whereas another study found 4.7 and 11.2% of EBV-positive gastric carcinomas of Brazilians of Japanese origin or not, respectively. In the present study, the frequency of EBV-positive gastric carcinomas is similar to that reported in other series, and the clinicopathologic characteristics of these EBV-positive tumors are in agreement with the data in the literature.

Epidemiology of leptospirosis at Sorocaba Zoo, São Paulo state, Southeastern Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)