La evaluación de los úrsidos en medios karsticos de la Cornisa Cantábrica

681 p.

Molecular cloning and expression characterization of ApoC-I in the orange-spotted grouper

Endogenous yolk nutrients are crucial for embryo and larval development in fish, but developmental behavior of the genes that control yolk utilization remains unknown. Apolipoproteins have been shown to play important roles in lipid transport and uptake through the circulation system. In this study, EcApoC-I, the first cloned ApoC-I in teleosts, has been screened from pituitary cDNA library of female orange-spotted grouper (Epinephelus coioides), and the deduced amino acid sequence shows 43.5% identity to one zebrafish (Danio rerio) hypothetical protein similar to ApoC-I, and 21.2%, 21.7%, 22.5%, 20%, and 22.5% identities to Apo C-I of human (Homo sapiens), house mouse (Mus musculus), common tree shrew (Tupaia glis), dog (Canis lupus familiaris) and hamadryas baboon (Papio hamadryas), respectively. Although the sequence identity is low, amphipathic alpha-helices with the potential to bind to lipid were predicted to exist in the EcApoC-I. RT-PCR analysis revealed that it was first transcribed in gastrula embryos and maintained a relatively stable expression level during the following embryogenesis. During embryonic and early larval development, a very high level of EcApoC-I expression was in the yolk syncytial layer, indicating that it plays a significant role in yolk degradation and transfers nutrition to the embryo and early larva. By the day 7 after hatching, EcApoC-I transcripts were observed in brain. In adult, EcApoC-I mRNA was detected abundantly in brain and gonad. In transitional gonads, the EcApoC-I expression is restricted to the germ cells. The data suggested that EcApoC-I might play an important role in brain and gonad morphogenesis and growth.

Influence of environmental variables on the predatory sucess of the iberian wolf in the north of Portugal

Tese de mestrado em Biologia da Conservação, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2016

Antropologia e conservação da natureza. O caso de uma possível reintrodução de espécies outrora emblemáticas no Parque Natural da Serra da Estrela (Portugal)

Dissertação apresentada para cumprimento dos requisitos necessários à obtenção do grau de Mestre em Antropologia - Área de especialização de Natureza e Conservação

Développement d’un modèle centré sur l’individu des déplacements du caribou, du loup et de l’orignal, et de leurs interactions, en forêt boréale aménagée

Le caribou forestier est une espèce menacée au Canada, la principale hypothèse au déclin des populations étant l’intensification de la prédation provoquée par les perturbations anthropiques du paysage. Afin de faire face à cette situation, il est nécessaire d’étudier et comprendre l’impact de l’environnement sur les interactions prédateur-proies entre le caribou et le loup, ainsi qu’avec l’orignal, qui est sa principale proie alternative. Pour cela, cette thèse présente la conception d’un modèle centré sur l’individu des déplacements de ces trois espèces en fonction de leur environnement, dont résulteront les interactions prédateur-proies. Afin de permettre l’application de ce modèle sur de longues périodes, et donc pour un environnement changeant, une méthodologie a été développée, qui s’articule atour de deux aspects principaux. Tout d’abord, la notion de niveaux d’émergence est introduite, permettant d’ordonner les comportements observables du système selon leurs interdépendances, afin de choisir comme trait du modèle un com- portement correspondant au domaine d’applicabilité visé. Ordonner les comportements selon leurs niveaux d’émergence permet également d’identifier la redondance entre les patrons, qui peut être à l’origine d’un phénomène de sur-apprentissage lorsqu’ils sont utilisés lors de la calibration. Dans un second temps, un nouveau protocole pour la calibration et la validation du ou des traits choisis à l’aide des niveaux d’émergence, nommé réplication de système basé sur l’individu (Individual Based System Replication - IBSRtion) est également présenté. Ce protocole met l’emphase sur la modélisation directe, contrairement au principal protocole existant, la modélisation orientée patrons (Pattern Oriented Modelling - POM), et permet une approche empirique en générant artificiellement des données non disponibles ou ne pouvant être récoltées par des études de terrains. IBSRtion a également l’avantage de pouvoir être intégrée dans POM, afin de contribuer à la création d’une méthodologie universelle pour la conception de modèles centrés sur l’individu. Le processus de conception de ce modèle aura entre autre permis de faire une synthèse des connaissances et d’identifier certaines lacunes. Une étude visant à palier le manque de connaissances satisfaisantes sur les réponses comportementales à court-terme des proies face au risque de prédation a notamment permis d’observer que celles-ci sont une combinaison de comportements chroniques et éphémères, et que les mécanismes qui en sont à l’origine sont complexes et non-linéaires. Le résultat de ce travail est un modèle complexe utilisant de nombreux sous-modèles, et calibré de façon empirique, applicable à une grande variété d’environnements. Ce modèle a permis de tester l’impact de l’enfeuillement sur les relations prédateur-proies. Des simulations ont été effectuées pour différentes quantités d’enfeuillement, suivant deux configurations spatiales différentes. Les résultats de simulation suggèrent que des plans d’aménagement considérant également l’habitat de l’orignal pourraient être bénéfiques pour le caribou forestier, car ils permettraient d’améliorer la ségrégation spatiale entre les deux espèces, et donc entre le caribou et le loup. En le couplant avec un module de naissances et de morts naturelles ainsi qu’un modèle d’évolution du paysage, ce modèle permettra par la suite d’évaluer l’impact de plans d’aménagement forestier sur la viabilité des populations de caribou forestier.

Modélisation de l'influence de la fragmentation des habitats sur le risque de prédation chez le caribou forestier

Les populations du caribou forestier (Rangifer tarandus caribou) sont en déclin sur l’ensemble de leur aire de répartition en Amérique du Nord. Il s’avère que la prédation, amplifiée par l’exploitation forestière, en est la principale cause. Ce projet consiste à mettre en place un outil d'aide à la décision, permettant de modéliser les changements du risque de prédation chez le caribou forestier durant la succession forestière, et ce, selon différents scénarios d'aménagement forestier simulés sur la Côte-Nord du Québec, Canada. Ces scénarios, simulés de 2000 à 2150, sont caractérisés par (i) des coupes limitées aux blocs de protection et de remplacement, (ii) des coupes étendues sur le paysage, et finalement (iii) par l'absence de coupe dès 2000. Un modèle basé sur l'individu (MBI) permet de modéliser les déplacements simultanés du caribou forestier, de l'orignal (Alces alces) et du loup gris (Canis lupus) afin d'évaluer le risque de prédation selon les scénarios. En général, le risque de prédation est plus important lorsque les coupes sont limitées aux blocs de protection et de remplacement. En effet, il semble que ces blocs augmentent les probabilités de rencontre entre les proies et leurs prédateurs. Toutefois, certains résultats ne reflètent pas la littérature, ce qui montre la nécessité d'améliorer le MBI. Certaines recommandations visent finalement à bonifier ce MBI pour permettre l'analyse de la viabilité à long terme du caribou forestier en fonction de différents scénarios d'aménagement forestier.

Liderazgo y poder: una aproximación desde la ecología

El trabajo de grado se desarrollará a partir del análisis del liderazgo y el poder como característica de éste, desde una visión ecológica, lo cual constituye un aspecto de gran importancia en los estudios de administración. Primero, se abordará el significado de liderazgo y la importancia que este representa dentro de las organizaciones, a través de la generación de procesos que llevan a la organización a su evolución y desarrollo. Posteriormente se abordará el tema de poder en relación con la comprensión del efecto que este puede tener sobre las interacciones que se dan entre las personas de la organización. Finalmente, se estudiará también desde la ecología, como el poder ejercido por los líderes puede influir en la forma en que estos agentes, es decir personas, procesos e interacciones, interactúan para movilizar a la organización. De esta forma, se asume el poder como un aspecto importante dentro del estudio del liderazgo, en cuanto éste puede afectar la forma en que las personas son lideradas al interior de la organización.

A GIS Suitability Analysis of Wolf Habitat in Maine

The range of the Gray Wolf (Canis lupus), once covering most of North America, has been drastically reduced by an estimated 95% due to habitat loss and extermination by humans. The wolf was extirpated from Maine in the 1800’s. Wolf reintroductions have been suggested for Maine, but there is some debate about how much land is suitable for wolves. I developed a wolf habitat suitability analysis using ArcGIS and data from the Maine Office of GIS and the United States National Atlas. The model incorporates land cover, presence of major roads and railways, conservation land, industrial, non-industrial, and public woodlot ownership, distance from major points of population, deer population, and slope. The model results show areas of high and low wolf suitability in Maine. The model suggests that the best potential habitat for wolves in Maine is situated in the northwest of the state. Possible future reintroductions or natural colonization from other areas would have the highest likelihood of survival in these areas.

Feasibility of the Reintroduction of Wolves in Maine: a GIS Study

The eastern timber wolf (Canis lupus lycaon) once inhabited Maine, as well as the rest of the eastern United States and southern Canada. As a result of human land use and widespread extermination campaigns, wolf numbers dramatically decreased, and by the early twentieth century, no wolves remained in Maine. As large carnivorous and territorial mammals, wolves require contiguous undeveloped areas with abundant prey. This project is a feasibility study that identifies the areas in Maine that are suitable for the reintroduction of wolves. We used GIS modeling to identify contiguous forested areas over 1,000 km2, calculate road and population density, and map the presence or absence of prey throughout the state. These variables were combined in a habitat suitability model to determine the location and amount of suitable wolf habitat in Maine. The northwestern part of the state appears most suitable for wolf reintroduction as it is relatively undeveloped with low road and population densities. There is also a smaller isolated area in Washington County that might be suitable, but further investigation is required.

MOLECULAR and SEROLOGICAL DETECTION of BABESIA SPP. IN NEOTROPICAL and EXOTIC CARNIVORES IN BRAZILIAN ZOOS

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Molecular detection of tick-borne bacterial agents in Brazilian and exotic captive carnivores

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Antibodies to Toxoplasma gondii and Neospora caninum in Captive Neotropical and Exotic Wild Canids and Felids

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Western blot analysis of tick antigens from a Rhipicephalus sanguineus unfed larval extract and identification of antigenic sites in tick sections using immunohistochemistry. A comparative study between resistant and susceptible host species

Most parasite-host relationships are characterized by the development of resistance by the host, thus limiting the number of parasites. However, some cases are very unusual. In the relationship of the domestic dog with the brown dog-tick Rhipicephalus sanguineus this does not occur, whereas guinea pigs develop efficient resistance. Sera from domestic dogs, crab-eating foxes and guinea pigs collected before and after infestation with R. sanguineus ticks, and after immunization with a whole tick adult or larval homogenate, were used in Western blot analysis to compare and identify potential important antigens from a tick larval homogenate. The same sera were tested in an indirect immunohistochemistry assay in an attempt to compare relevant antigenic sites on histological tick sections. The immunoblotting displayed antigens recognized only by the guinea pigs, as well as several shared antigens between host species, depending on the kind of immunization. Immunohistochemistry revealed probable antigenic sites on the cells and tissues of ticks, which varied depending on the kind of immunization (infestation or vaccination) and the animal species involved.

Ticks (Acari: Ixodidae) associated with domestic dogs in Franca region, São Paulo, Brazil

Ticks on 140 domestic dogs from both urban and rural areas of Franca region in São Paulo state were identified with 102 dogs from urban areas and 38 from rural areas. Of urban dogs, 27.5% were infested exclusively by Rhipicephalus sanguineus ticks. Of the rural dogs, 36.8% were infested with the following tick species: R. sanguineus, Boophilus microplus, Amblyomma ovale and A. cajennense. Mixed infestations included a dog hosting A. cajennense and A. ovale and another with B. microplus and R. sanguineus. The most intense infestations were detected on urban dogs. Hemolymph tests of these ticks performed to detect rickettsial or Borrelia bacteria yielded negative results.

Bartonella clarridgeiae and Bartonella vinsonii subsp berkhoffii exposure in captive wild canids in Brazil

Wild canids are potential hosts for numerous species of Bartonella, yet little research has been done to quantify their infection rates in South America. We sought to investigate Bartonella seroprevalence in captive wild canids from 19 zoos in São Paulo and Mato Grosso states, Brazil. Blood samples were collected from 97 wild canids belonging to four different native species and three European wolves (Canis lupus). Indirect immunofluorescent antibody testing was performed to detect the presence of B. henselae, B. vinsonii subsp. berkhoffii, B. clarridgeiae, and B. rochalimae. Overall, Bartonella antibodies were detected in 11 of the canids, including five (12·8%) of 39 crab-eating foxes (Cerdocyon thous), three (11·1%) of 27 bush dogs (Speothos venaticus), two (8·7%) of 23 maned wolves (Chrysocyon brachyurus) and one (12·5%) of eight hoary foxes (Lycalopex vetulus), with titres ranging from 1:64 to 1:512. Knowing that many species of canids make excellent reservoir hosts for Bartonella, and that there is zoonotic potential for all Bartonella spp. tested for, it will be important to conduct further research in non-captive wild canids to gain an accurate understanding of Bartonella infection in free-ranging wild canids in South America.