The bovine dilated cardiomyopathy locus maps to a 1.0-Mb interval on chromosome 18

Cardiomyopathies are myocardial diseases that lead to cardiac dysfunction, heart failure, arrhythmia, and sudden death. In human medicine, cardiomyopathies frequently warrant heart transplantation in children and adults. Bovine dilated cardiomyopathy (BDCMP) is a heart muscle disorder that has been observed during the last 30 years in cattle of Holstein-Friesian origin. In Switzerland BDCMP affects Swiss Fleckvieh and Red Holstein breeds. BDCMP is characterized by a cardiac enlargement with ventricular remodeling and chamber dilatation. The common symptoms in affected animals are subacute subcutaneous edema, congestion of the jugular veins, and tachycardia with gallop rhythm. A cardiomegaly with dilatation and hypertrophy of all heart chambers, myocardial degeneration, and fibrosis are typical postmortem findings. It was shown that all BDCMP cases reported worldwide traced back to a red factor-carrying Holstein-Friesian bull, ABC Reflection Sovereign. An autosomal recessive mode of inheritance was proposed for BDCMP. Recently, the disease locus was mapped to a 6.7-Mb interval MSBDCMP06-BMS2785 on bovine Chr 18 (BTA18). In the present study the BDCMP locus was fine mapped by using a combined strategy of homozygosity mapping and association study. A BAC contig of 2.9 Mb encompassing the crucial interval was constructed to establish the correct marker order on BTA18. We show that the disease locus is located in a gene-rich interval of 1.0 Mb and is flanked by the microsatellite markers DIK3006 and MSBDCMP51.

Arachnomelia in Brown Swiss cattle maps to chromosome 5

Arachnomelia in Brown Swiss cattle is a monogenic autosomal recessive inherited congenital disorder of the skeletal system giving affected calves a spidery look (OMIA ID 000059). Over a period of 20 years 15 cases were sampled in the Swiss and Italian Brown cattle population. Pedigree data revealed that all affected individuals trace back to a single acknowledged carrier founder sire. A genome scan using 240 microsatellites spanning the 29 bovine autosomes showed homozygosity at three adjacent microsatellite markers on bovine Chr 5 in all cases. Linkage analysis confirmed the localization of the arachnomelia mutation in the region of the marker ETH10. Fine-mapping and haplotype analysis using a total of 34 markers in this region refined the critical region of the arachnomelia locus to a 7.19-Mb interval on bovine Chr 5. The disease-associated IBD haplotype was shared by 36 proven carrier animals and allows marker-assisted selection. As the corresponding human and mouse chromosome segments do not contain any clear functional candidate genes for this disorder, the mutation causing arachnomelia in the Brown Swiss cattle might help to identify an unknown gene in bone development.

Landscape mosaics maps as a basis for spatial assessment and negotiation of ecosystem services and their trade-offs at the meso-scale: Examples from Laos, Madagascar and China

Mapping ecosystem services (ES) and their trade-offs is a key requirement for informed decision making for land use planning and management of natural resources that aim to move towards increasing the sustainability of landscapes. The negotiations of the purposes of landscapes and the services they should provide are difficult as there is an increasing number of stakeholders active at different levels with a variety of interests present on one particular landscape.Traditionally, land cover data is at the basis for mapping and spatial monitoring of ecosystem services. In light of complex landscapes it is however questionable whether land cover per se and as a spatial base unit is suitable for monitoring and management at the meso-scale. Often the characteristics of a landscape are defined by prevalence, composition and specific spatial and temporal patterns of different land cover types. The spatial delineation of shifting cultivation agriculture represents a prominent example of a land use system with its different land use intensities that requires alternative methodologies that go beyond the common remote sensing approaches of pixel-based land cover analysis due to the spatial and temporal dynamics of rotating cultivated and fallow fields.Against this background we advocate that adopting a landscape perspective to spatial planning and decision making offers new space for negotiation and collaboration, taking into account the needs of local resource users, and of the global community. For this purpose we introduce landscape mosaicsdefined as new spatial unit describing generalized land use types. Landscape mosaics have allowed us to chart different land use systems and land use intensities and permitted us to delineate changes in these land use systems based on changes of external claims on these landscapes. The underlying idea behindthe landscape mosaics is to use land cover data typically derived from remote sensing data and to analyse and classify spatial patterns of this land cover data using a moving window approach. We developed the landscape mosaics approach in tropical, forest dominated landscapesparticularly shifting cultivation areas and present examples ofour work from northern Laos, eastern Madagascarand Yunnan Province in China.

Urban expansion and its impact on urban agriculture – remote sensing based change analysis of Kizinga and Mzinga Valley – Dar Es Salaam, Tanzania

Urban agriculture is a phenomenon that can be observed world-wide, particularly in cities of devel-oping countries. It is contributing significantly to food security and food safety and has sustained livelihood of the urban and peri-urban low income dwellers in developing countries for many years. Population increase due to rural-urban migration and natural, coupled with formal as well as infor-mal urbanization are competing with urban farming for available space and scarce water resources. A multitemporal multisensoral urban change analysis over the period of 25 years (1982-2007) was performed in order to measure and visualize the urban expansion along the Kizinga and Mzinga valley in the South of Dar es Salaam. Airphotos and VHR satellite data were analyzed by using a combination of a composition of anisotropic textural measures and spectral information. The study revealed that unplanned built-up area is expanding continuously and vegetation covers and agricultural lands decline at a fast rate. The validation showed that the overall classification accuracy varied depending on the database. The extracted built-up areas were used for visual in-terpretation mapping purposes and served as information source for another research project. The maps visualize an urban congestion and expansion of nearly 18% of the total analyzed area that had taken place in the Kizinga valley between 1982 and 2007. The same development can be ob-served in the less developed and more remote Mzinga valley between 1981 and 2002. Both areas underwent fast changes where land prices still tend to go up and an influx of people both from rural and urban areas continuously increase density with the consequence of increasing multiple land use interests.

Composición y distribución del ensamble de Orthoptera (Insecta) en una cuenca árida del norte-centro de Chile

La cuenca del valle del río Elqui (Región de Coquimbo, Chile) es un importante foco de actividad agrofrutícola y turística dentro de la zona norte-centro de Chile cuyas condiciones climáticas se caracterizan por el aumento de la temperatura y la disminución de la precipitación. En el contexto del calentamiento global es esperable que la hoya hidrográfica del río Elqui experimente una tendencia ascendente en la aridez, alteraciones en la fenología de plantas y artrópodos y cambios en la riqueza y biodiversidad local de los ecosistemas. En este sentido, en el presente trabajo, mediante colectas manuales en sectores de secano y cultivo de las localidades de Marquesa, Diaguitas y Pisco Elqui en el valle de Elqui, se documentó la composición taxonómica y abundancia del ensamble de Orthoptera (Insecta) en la cuenca del valle del Elqui, se analizó la distribución espacial de las especies constituyentes del ensamble mediante SIG y se documentó la importancia de Orthoptera como potenciales plagas dentro de esta cuenca árida del norte-centro de Chile. Se capturó un total de 204 ejemplares, correspondientes a cuatro familias y seis especies, de las cuales cinco especies fueron capturadas en sectores de secano y cultivo. Acrididae fue la familia más abundante y diversa dentro de los sitios de estudio (65,2% del total capturado) y Trimerotropis ochraceipennis la especie más abundante dentro del sitio de estudio. Las familias Gryllidae, Ommexechidae y Tristiridae estuvieron representadas por una sola especie. La presencia de estas especies en los sectores de secano puede constituir un factor de riesgo para la agricultura, al considerarse potenciales focos irruptivos frente a determinadas condiciones climáticas, y además ocasionar daños en cultivos agrícolas, plantaciones y pastizales. La relación entre la microdistribución del ensamble de Orthoptera presente en el valle de Elqui y el índice NDVI mostró una clara preferencia por la vegetación densa y poco densa (NDVI = 0,1 - 0,49). El presente trabajo es una primera aproximación al estudio de los ortópteros considerados plagas potenciales para el valle del Elqui.

Cambio de uso del suelo en los geosistemas de la cuenca costera del río Boroa (Chile) entre 1994 y 2004

Se analizaron los principales cambios de uso del suelo en las unidades de paisaje (geosistemas) de la cuenca hidrográfica del río Boroa entre 1994 y 2004. Para ello se planteó la hipótesis de que los cambios en la estructura del paisaje han sido conducidos fundamentalmente por acción antrópica generando importantes alteraciones en el paisaje ecológico. Se utilizaron mapas categóricos de uso/cobertura de suelo elaborados con material cartográfico y fotografías aéreas con su posterior corrección en terreno, información que fue complementada con el análisis geomorfológico y de unidades ambientales de la cuenca. Se comprobó una fuerte variación en la superficie de plantaciones forestales (principalmente Eucalyptus spp.), con una tasa de incremento anual que varió entre 3,2 y 28%, asociado principalmente a reconversión de uso y ocupación de cordones montañosos metamórficos. A su vez, se constató la expansión de zonas de humedales en terrenos anegadizos de llanuras, todo lo cual ha reducido la superficie total con destino agrícola en 61%, transformando el paisaje en un periodo de sólo diez años. Estos cambios se discuten sobre la base de una combinación de factores económicos, legales y ambientales, concluyendo que el factor humano ha sido el principal responsable de la conducción de los cambios de uso del suelo en la cuenca del río Boroa.

Dimensiones que caracterizan el consumo potencial de alimentos orgánicos en la Región del Maule, Chile

La demanda creciente por alimentos orgánicos presenta ventas por encima de los cinco mil millones de dólares por año a nivel mundial. Esta demanda también se extiende a los países en desarrollo como es el caso chileno, el cual exporta el 90% de su producción, generando un mercado interno poco desarrollado para este tipo de productos. La presente investigación intenta identificar los constructos que caracterizan los potenciales consumidores de alimentos orgánicos. Para el desarrollo del estudio se aplicó una encuesta a una muestra de 422 consumidores de la Región del Maule en Chile central (N. C. = 95,5%; e = 3,0%). La información posteriormente fue analizada a través de la técnica multivariante denominada análisis factorial de componentes principales. Los resultados de la investigación revelan la existencia de cuatro dimensiones o constructos: (1) beneficios de la agricultura orgánica; (2) alimentación sana; (3) estilos de vida y (4) atributos de los productos orgánicos. Estas dimensiones influyen en la actitud e intención de compra por parte de los consumidores hacia los alimentos orgánicos y son elementos clave para formular estrategias de comercialización para productos orgánicos.

Factores que influyen en la adopción de tecnologías de conservación de suelos en el secano interior de Chile Central

El desarrollo de sistemas agrícolas sustentables es un desafío en el contexto de políticas e incentivos tendientes a la conservación de los recursos naturales, especialmente en zonas de secano. El presente estudio examina variables demográficas y productivas que influyen en la adopción de tecnologías de conservación de suelos en 90 pequeños productores del secano interior de Chile Central, en las comunas de Pencahue y Curepto. Se utilizó un modelo de regresión Probit, el cual asocia la adopción de las tecnologías con las variables: edad del agricultor, tamaño familiar, superficie predial y forma de tenencia de la tierra; presencia de: plantaciones forestales, invernaderos, aboneras, animales mayores en el predio; experiencia en comercialización del productor y participación en actividades de capacitación. El modelo seleccionado tiene un alto poder de predicción, llegando a clasificar correctamente un 92,2% de las observaciones. Los resultados econométricos muestran que la participación en actividades de extensión, la superficie predial, la presencia de plantaciones forestales y el uso de aboneras, influyen de manera positiva y significativa sobre la adopción de tecnologías conservacionistas. Resulta relevante el impacto de la capacitación sobre la adopción de tecnologías de alto grado de inversión, así como la incorporación de prácticas de conservación de bajo nivel de inversión como las aboneras.

La Sociedad Nacional de Agricultura (SNA) y el desarrollo de la fruticultura en Chile, 1838-1933

A partir de su fundación, la Sociedad Nacional de Agricultura (1838) comenzó a publicar revistas sobre temas agrarios. Generó así un singular corpus documental, dentro del cual el presente trabajo examina los textos dedicados a fruticultura. Se detectaron cerca de 300 artículos sobre el tema, referidos, principalmente, a la forma de cultivar las plantas, enfermedades y plagas, conservación de frutas y exportación. Se detectan relaciones con publicaciones agrarias extranjeras, sobre todo de EE.UU. y Argentina. La influencia de la SNA contribuyó a cambiar el paisaje de la fruticultura en Chile, según se reflejó en el censo agrícola de 1936

Estimación y estructura de los ingresos de familias mapuches rurales de zonas periurbanas de Temuco, Chile

Hasta mediados del siglo XX, las familias campesinas mapuches obtenían la mayor parte de sus ingresos de la agricultura. Hoy las fuentes de ingresos se han diversificado, incorporando salarios, transferencias gubernamentales y actividades no agrarias. Con datos aportados por una encuesta de ingresos, se analizan las estrategias de generación de ingresos de familias mapuches localizadas en zonas peri-urbanas de la comuna de Temuco, relacionando la estructura de ingresos con características de las familias y de las fincas. Los resultados muestran la importancia que aún tiene la agricultura en familias cuya fuerza de trabajo sólo logra insertarse en empleos temporales de bajos salarios

La Sociedad Nacional de Agricultura (SNA) y el desarrollo de la fruticultura en Chile, 1838-1933

A partir de su fundación, la Sociedad Nacional de Agricultura (1838) comenzó a publicar revistas sobre temas agrarios. Generó así un singular corpus documental, dentro del cual el presente trabajo examina los textos dedicados a fruticultura. Se detectaron cerca de 300 artículos sobre el tema, referidos, principalmente, a la forma de cultivar las plantas, enfermedades y plagas, conservación de frutas y exportación. Se detectan relaciones con publicaciones agrarias extranjeras, sobre todo de EE.UU. y Argentina. La influencia de la SNA contribuyó a cambiar el paisaje de la fruticultura en Chile, según se reflejó en el censo agrícola de 1936

Estimación y estructura de los ingresos de familias mapuches rurales de zonas periurbanas de Temuco, Chile

Hasta mediados del siglo XX, las familias campesinas mapuches obtenían la mayor parte de sus ingresos de la agricultura. Hoy las fuentes de ingresos se han diversificado, incorporando salarios, transferencias gubernamentales y actividades no agrarias. Con datos aportados por una encuesta de ingresos, se analizan las estrategias de generación de ingresos de familias mapuches localizadas en zonas peri-urbanas de la comuna de Temuco, relacionando la estructura de ingresos con características de las familias y de las fincas. Los resultados muestran la importancia que aún tiene la agricultura en familias cuya fuerza de trabajo sólo logra insertarse en empleos temporales de bajos salarios

La Sociedad Nacional de Agricultura (SNA) y el desarrollo de la fruticultura en Chile, 1838-1933

A partir de su fundación, la Sociedad Nacional de Agricultura (1838) comenzó a publicar revistas sobre temas agrarios. Generó así un singular corpus documental, dentro del cual el presente trabajo examina los textos dedicados a fruticultura. Se detectaron cerca de 300 artículos sobre el tema, referidos, principalmente, a la forma de cultivar las plantas, enfermedades y plagas, conservación de frutas y exportación. Se detectan relaciones con publicaciones agrarias extranjeras, sobre todo de EE.UU. y Argentina. La influencia de la SNA contribuyó a cambiar el paisaje de la fruticultura en Chile, según se reflejó en el censo agrícola de 1936

Estimación y estructura de los ingresos de familias mapuches rurales de zonas periurbanas de Temuco, Chile

Hasta mediados del siglo XX, las familias campesinas mapuches obtenían la mayor parte de sus ingresos de la agricultura. Hoy las fuentes de ingresos se han diversificado, incorporando salarios, transferencias gubernamentales y actividades no agrarias. Con datos aportados por una encuesta de ingresos, se analizan las estrategias de generación de ingresos de familias mapuches localizadas en zonas peri-urbanas de la comuna de Temuco, relacionando la estructura de ingresos con características de las familias y de las fincas. Los resultados muestran la importancia que aún tiene la agricultura en familias cuya fuerza de trabajo sólo logra insertarse en empleos temporales de bajos salarios

On the acquisition of high-resolution maps with open source software and commercials off-the-shelf quad-rotors

Mosaics are high-resolution images obtained aerially and employed in several scientific research areas, such for example, in the field of environmental monitoring and precision agriculture. Although many high resolution maps are obtained by commercial demand, they can also be acquired with commercial aerial vehicles which provide more experimental autonomy and availability. For what regard to mosaicing-based aerial mission planners, there are not so many - if any - free of charge software. Therefore, in this paper is presented a framework designed with open source tools and libraries as an alternative to commercial tools to carry out mosaicing tasks.