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Angiogenesis, the formation of new blood vessels sprouting from existing ones, occurs in several situations like wound healing, tissue remodeling, and near growing tumors. Under hypoxic conditions, tumor cells secrete growth factors, including VEGF. VEGF activates endothelial cells (ECs) in nearby vessels, leading to the migration of ECs out of the vessel and the formation of growing sprouts. A key process in angiogenesis is cellular self-organization, and previous modeling studies have identified mechanisms for producing networks and sprouts. Most theoretical studies of cellular self-organization during angiogenesis have ignored the interactions of ECs with the extra-cellular matrix (ECM), the jelly or hard materials that cells live in. Apart from providing structural support to cells, the ECM may play a key role in the coordination of cellular motility during angiogenesis. For example, by modifying the ECM, ECs can affect the motility of other ECs, long after they have left. Here, we present an explorative study of the cellular self-organization resulting from such ECM-coordinated cell migration. We show that a set of biologically-motivated, cell behavioral rules, including chemotaxis, haptotaxis, haptokinesis, and ECM-guided proliferation suffice for forming sprouts and branching vascular trees.
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SUMMARY: Large sets of data, such as expression profiles from many samples, require analytic tools to reduce their complexity. The Iterative Signature Algorithm (ISA) is a biclustering algorithm. It was designed to decompose a large set of data into so-called 'modules'. In the context of gene expression data, these modules consist of subsets of genes that exhibit a coherent expression profile only over a subset of microarray experiments. Genes and arrays may be attributed to multiple modules and the level of required coherence can be varied resulting in different 'resolutions' of the modular mapping. In this short note, we introduce two BioConductor software packages written in GNU R: The isa2 package includes an optimized implementation of the ISA and the eisa package provides a convenient interface to run the ISA, visualize its output and put the biclusters into biological context. Potential users of these packages are all R and BioConductor users dealing with tabular (e.g. gene expression) data. AVAILABILITY: http://www.unil.ch/cbg/ISA CONTACT: sven.bergmann@unil.ch
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Amoxicillin, a low-molecular-weight compound, is able to interact with dendritic cells inducing semi-maturation in vitro. Specific antigens and TLR ligands can synergistically interact with dendritic cells (DC), leading to complete maturation and more efficient T-cell stimulation. The aim of the study was to evaluate the synergistic effect of amoxicillin and the TLR2, 4 and 7/8 agonists (PAM, LPS and R848, respectively) in TLR expression, DC maturation and specific T-cell response in patients with delayed-type hypersensitivity (DTH) reactions to amoxicillin. Monocyte-derived DC from 15 patients with DTH to amoxicillin and 15 controls were cultured with amoxicillin in the presence or absence of TLR2, 4 and 7/8 agonists (PAM, LPS and R848, respectively). We studied TLR1-9 gene expression by RT-qPCR, and DC maturation, lymphocyte proliferation and cytokine production by flow cytometry. DC from both patients and controls expressed all TLRs except TLR9. The amoxicillin plus TLR2/4 or TLR7/8 ligands showed significant differences, mainly in patients: AX+PAM+LPS induced a decrease in TLR2 and AX+R848 in TLR2, 4, 7 and 8 mRNA levels. AX+PAM+LPS significantly increased the percentage of maturation in patients (75%) vs. controls (40%) (p=0.036) and T-cell proliferation (80.7% vs. 27.3% of cases; p=0.001). Moreover, the combinations AX+PAM+LPS and AX+R848 produced a significant increase in IL-12p70 during both DC maturation and T-cell proliferation. These results indicate that in amoxicillin-induced maculopapular exanthema, the presence of different TLR agonists could be critical for the induction of the innate and adaptive immune responses and this should be taken into account when evaluating allergic reactions to these drugs.
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Methods are presented to map complex fiber architectures in tissues by imaging the 3D spectra of tissue water diffusion with MR. First, theoretical considerations show why and under what conditions diffusion contrast is positive. Using this result, spin displacement spectra that are conventionally phase-encoded can be accurately reconstructed by a Fourier transform of the measured signal's modulus. Second, studies of in vitro and in vivo samples demonstrate correspondence between the orientational maxima of the diffusion spectrum and those of the fiber orientation density at each location. In specimens with complex muscular tissue, such as the tongue, diffusion spectrum images show characteristic local heterogeneities of fiber architectures, including angular dispersion and intersection. Cerebral diffusion spectra acquired in normal human subjects resolve known white matter tracts and tract intersections. Finally, the relation between the presented model-free imaging technique and other available diffusion MRI schemes is discussed.
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Between September 1979 and December 1982, 56 St Jude Medical valvular prostheses were implanted in 54 patients over 65 years of age. Surgery consisted in simple aortic valve replacement (35 cases), simple mitral valve replacement (12 cases), double aortic and mitral valve replacement (2 cases), valve replacement and coronary artery bypass surgery (3 cases), aortic valve replacement and replacement of the ascending aorta (1 case) and mitral valve replacement and tricuspid annuloplasty (1 case). The operative mortality (within 30 days of surgery) was 3.5% (2 cases). Patients were assessed by clinical examination, ECG, chest X-ray, echocardiogram and laboratory investigations on average 19 months after surgery. There were 3 late deaths (1 endocarditis, 1 cardiac failure and 1 subdural haematoma). No cases of significant haemolysis were observed. There were no cases of thrombosis of the valve or any deaths directly related to the valve. Four patients had cerebral embolism (4.9% per patient/year). None were fatal and only 1 patient had sequellae. Clinical improvement was very significant; 96% of the patients are now in the NYHA Classes I and II whilst 80% were in Class III or IV before surgery. The cardiothoracic ratio decreased significantly from 0.56 to 0.51 (p less than 0.01). The authors conclude that elderly patients may derive great benefits from valvular cardiac surgery and that age in itself is not a contraindication to this type of surgery. The St Jude Medical prosthesis is an excellent prosthesis but thromboembolism remains a major problem as with other mechanical prostheses. Anticoagulation for life is essential.
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Contient : Titres de la Jugie ; N° 623 (1) Contrat de mariage de Jacques de la Jugie et de Guillemette de la Borgayrie (23 juillet 1313) ; copie du 18 mars 1314 a. st ; N° 624 (2) Contrat de mariage de Pierre de la Jugie et de Jeanne Pebeyre (août1316) ; restes de sceau sur simple queue ; N° 625 (3) Testament de Geraud de Rajaut, de Tulle, damoiseau (9 août 1329) ; N° 626 (4) Contrat de mariage de Gui Aimoin de Puydeval et d'Hélie de la Jugie (14 décembre 1339) ; N° 627 (5) Donation de biens faite par Guillemette de la Limosnie à Gui de Puydeval, son oncle (30 janvier 1351) ; copie du XVIIe siècle ; N° 628 (6) Accord entre Archambaud, vicomte de Comborn, et Gui de Puydeval (24 mai 1351) ; copie contemporaine ; N° 629 (7) Contrat de mariage de Raimond de Bossac et de Marie de Puydeval (2 août 1352) ; N° 630 (8) Testament de Gui de Puydeval (26 janvier 1371 a. st.) ; copie du XVIIe siècle ; N° 631 (9) Testament de Nicolas de la Jugie, seigneur de Levinerie (26 mars 1374 a. st.) ; vidimus du 18 mai 1402 ; N° 632 (10) Testament de Guillaume de la Jugie, alias de Puydeval (20 août 1397) ; N° 633 (11) Testament d'Aelis de la Jugie (19 juillet 1409) ; N° 634 (12) Décisions prises par divers seigneurs du Limousin, relativement à l'expédition contre les Anglais, pour la levée du siège d'Auberoche (4 septembre 1419) ; N° 635 (13) Contrat de mariage d'Aimar de Puydeval et de Marguerite de Gimel (12 juillet 1426) ; N° 636 (14) Testament d'Hélène de Puydeval, veuve de Jean « de Sadone » (2 juin 1436) ; N° 637 (15) Testament de Jean de la Jugie, alias de Puydeval (7 décembre 1461) ; N° 638 (16) Contrat de mariage de Jean de Sourries, seigneur de Vaur, et d'Anne de Puydeval (29 janvier 1492 a. st.) ; copie, papier ; N° 639 (17) Testament d'Antoine de Puydeval (9 octobre 1495) ; copie du 28 mars 1502, a. st ; N° 640 (18) Contrat de mariage de Pons de Gourdon, seigneur de La Roque, et de Françoise de Puydeval (20 janvier 1497 a. st.) ; copie du 23 août 1579 ; N° 641 (19) Quittance générale donnée par Blanche de Malesec, veuve d'Antoine de Puydeval, à Gilles de Malesec, son frère (23 juin 1512) ; N° 642 (20) Testament de Gabrielle de Puydeval, dame de Miremont (20 mars 1516-1517) ; copie du XVIe siècle ; N° 643 (21) Testament de Denis de Puydeval (18 août 1523) ; copie du XVIe siècle ; N° 644 (22) Quittance générale donnée à Géraud de Puydeval par Pierre de Rajaut et Anne de Puydeval sa femme, 2 août 1534 ; N° 645 (23) Contrat de mariage de Rigaut de Saint-Martial, baron de Conros, et de Françoise de Puydeval (18 juin 1559) ; copie du 22 juillet 1583 ; N° 646 (24) Testament de Géraud de Puydeval (20 mai 1563) ; N° 647 (25) Procès-verbal de visite de bois faite par les arbitres choisis par les seigneurs de Puydeval et de Vaur (5 janvier 1564) ; N° 648 (26) Accord entre Géraud de Puydeval et Bonaventure de Sourries, seigneur de Vaur, au sujet du lieu de La Reynie (21 novembre 1560) ; N° 649 (27) Accord entre Anne de Puydeval, veuve de Jean de Sourries, seigneur de Vaur, et Bonaventure de Sourries (27 septembre 1559) ; N° 650 (28) Testament d'Anne de Puydeval, veuve de Jean [de Sourries, seigneur de] Vaur (8 septembre 1555) ; N° 651 (29) Testament de Jean de Puydeval, doyen de l'église de Tulle ; N° 652 (30) Testament de Françoise de Puydeval, veuve de Rigaut de Saint-Marsal, baron de Conros (16 juin 1601) ; N° 653 (31) Autre testament de ladite dame (22 août 1604) ; N° 654 Copie du précédent testament ; N° 655 (32) Accord entre Josias de Cosnac, seigneur d'Assy, et sa soeur, Marie de Cosnac, femme de Henry de Puydeval, baron de Conros (31 mars 1623 ; N° 656 (33) Contrat de mariage de Pierre de Soudeilles et d'Anne de Puydeval (s. d.) ; N° 657 (33 bis) Copie de la pièce précédente ; Mélanges ; N° 658 (1) Accord entre Guillaume, évêque de Paris, et son chapitre, d'une part, et Philippe-Auguste, de l'autre, au sujet des droits de l'église de Paris (décembre 1222) ; N° 659 (2) Accord entre Philippe le Bel et l'église de Paris pour l'affectation de certaines redevances à la réparation des ponts de la Seine (mars 1296-1297) ; N° 660 (3) Décret de l'Université de Paris établissant des règlements pour le collège de Narbonne, à Paris (4 octobre 1377) ; N° 661 (4) Sentence rendue par Jean, abbé de Saint-Taurin d'Evreux, sur le procès entre Jacques Sacquespée, docteur en médecine, et Jean Daigny, chanoine de la Sainte-Chapelle de Paris (15 mai 1428) ; N° 662 (15) Articles de la Ligue (s. d. [1586 (?)]) ; N° 663 (6) Privilèges accordés par Louis, comte de Flandre, aux marchands castillans trafiquant en Flandre (15 avril 1366) ; copie du XVe siècle ; N° 664 (7) Serment prêté au duc d'Alençon par le chapitre de Cambrai (20 août 1580) ; N° 665 (8) Serment prêté au même personnage par les échevins de la ville de Cambrai (même date) ; N° 666 (9) Aveu rendu à Henri, comte de Rodez, par Pierre de Panat, pour divers fiefs, (juillet 1280) ; N° 667 (10) Aveu rendu par Bernard, comte d'Armagnac et de Rodez, à Guillaume, évêque de Mende, pour les fiefs tenus par ledit comte dans ce diocèse (2 mai 1309) ; N° 668 (11) Autorisation donnée par l'archevêque Michel et le chapitre d'Arles à Jean [de Matha], fondateur de l'Ordre de la Trinité, d'établir une église et un cimetière dans la ville d'Arles (novembre 1203) ; N° 669 (12) Charte de G[uillaume], comte de Forcalquier, abandonnant divers droits à l'église de Ganagobie (10 juin 1206) ; à la suite est transcrite une lettre de A., prieur du dit lieu, à G[uillaume], abbé de Cluny, relative à la donation précédente ; N° 670 (13) Lettres de Charles II, roi de Sicile, comte de Provence, chargeant Hugues de Voisines, senéchal de Provence, de faire sortir du royaume de France la somme de 50.000 livres autorisée par le Roi (24 mars 1297) ; N° 671 (14) Lettres de l'empereur Henri VII, autorisant Gaillard, archevêque d'Arles, à poursuivre la révocation des aliénations de biens ecclésiastiques consenties par ses prédécesseurs (9 juillet 1312) ; N° 672 (15) Lettres de Jean de Clermont, cardinal-évêque de Tusculum, légat du pape dans les provinces de Vienne, Aix, etc., chargeant Jean Ferrier, archevêque d'Arles, de l'assister dans ses fonctions (9 juillet 1533) ; N° 673 (16) Lettres de Raoul de Sendelay, trésorier d'Angleterre, portant donation de terres près de Rouen à Michel de Paris, son ancien serviteur (3 janvier 1445-1446) ; N° 674 (17) Lettre de l'empereur Ferdinand au pape Urbain VIII (28 avril 1635) ; N° 675 (18) Aveu rendu à Bernard, abbé de Charroux, par Jean de Rochefort, pour le château de Saint-Angel (18 mai 1393) ; copie du 17 juillet 1407 ; N° 676 (19) Lettres de l'Université d'Avignon conférant à Pierre Charpin le titre de docteur en droit canon (16 septembre 1405) ; N° 677 (20) Contrat de mariage de Charles d'Apchon, vicomte de Mirmont, et de Lucrèce de Gadaigne (3 août 1579) ; N° 678 (21) Procuration donnée par Philippe de Commynes à Baude Talboein, son secrétaire (9 mars 1474) ; signature autographe ; N° 679 (22) Ratification par Galéas-Marie Sforza du traité conclu en son nom à Amboise entre Tristan Sforza et Louis XI (21 avril 1468) ; N° 680 (23) Lettres d'Etat accordées par le roi Charles VI à Lermite, seigneur de La Faye, son chambellan, envoyé en Angleterre (28 octobre 1407) ; copie du 4 novembre 1407 ; papier ; N° 681 (24) « Plaintes sur le trépas du sage et vertueux chevalier... Jean de La Roche-Aymon ; » pièce de vers (s. d. [1522]) ; miniature en tête ; N° 682 (25) Lettres de Raimond « de Poioliis », archidiacre de Périgueux, recteur du duché de Spolète, pour le paiement de la compagnie de Guillaume de Primat ; N° 683 (26) Lettres de l'Université d'Orléans accordant à Hugues Berthelot le titre de bachelier en droit canon (28 juillet 1409) ; N° 684 (27) Lettres de l'Université d'Orléans au prieur de Marcigny, pour faire pourvoir d'un bénéfice Raoul « Druci », prêtre, licencié en décret (2 septembre 1460 ; N° 685 (28) Lettres de l'Université de Paris à l'abbé de Cluny, pour faire pourvoir d'un bénéfice Jean de Mont, maître ès arts et bachelier en théologie (3 mars 1478-1479) ; N° 686 (29) Lettres de l'Université de Paris à l'abbé de Cluny pour faire pourvoir d'un bénéfice Jean Paulain, maître ès arts (21 février 1538-1539) ; N° 687 (30) Testament de Jacques de Plaigne, seigneur dudit lieu (5 mars 1551-1552) ; copie contemporaine ; N° 688 (31) Contrat de mariage de Pierre de Guasquet et de Marguerite d'Henry (31 mars 1581) ; copie contemporaine ; N° 689 (32) Testament d'Antoine de Guasquet, seigneur de Paramelle (30 août 1585) ; copie contemporaine ; N° 690 (33) Testament de Jean Chantois, sieur de Laumosnerie (30 septembre 1617) ; copie contemporaine ; N° 691 (34) Testament de Claude des Rozières, seigneur de Cherouac (octobre 1623) ; copie contemporaine ; N° 692 (35) Délibération de l'assemblée du clergé de la ville de Reims au sujet de la répartition des deniers à lever sur ledit clergé (30 mars 1585) ; N° 693 (36) Lettre de J[ean de] C[andida] à [Denis Briçonnet], évêque de Saint-Malo (16 novembre, s. d.)
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BACKGROUND AND OBJECTIVES: Donor cytomegalovirus seropositivity was reported to improve leukemia outcomes in HLA-A2 identical hematopoietic cell transplant (HCT) recipients, due to a possible cross-reactivity of donor HLA-A2-restricted CMV-specific T cells with minor histocompatibility (H) antigen of recipient cells. This study analyzed the role of donor CMV serostatus and HLA-A2 status on leukemia outcomes in a large population of HLA-identical HCT recipients. DESIGN AND METHODS: Leukemia patients transplanted between 1992 and 2003 at the Fred Hutchinson Cancer Research Center were categorized as standard risk [leukemia first remission, chronic myeloid leukemia in chronic phase (CML-CP)] and high risk (advanced disease) patients. Time-to-event analysis was used to evaluate the risk of relapse and death associated with HLA-A2 status and donor CMV serostatus. RESULTS: In standard risk patients, acute leukemia (p<0.001) and sex mismatch (female to male, p=0.004)) independently increased the risk of death, while acute leukemia increased the risk of relapse (p<0.001). In high risk patients acute leukemia (p=0.01), recipient age > or = 40 (p=0.005) and herpes simplex virus (HSV) seropositivity (p<0.001) significantly increased the risk death; HSV seropositivity (p=0.006) increased the risk of relapse. Donor CMV serostatus had no significant effect on mortality or relapse in any HLA group. INTERPRETATION AND CONCLUSION: This epidemiological study did not confirm the previously reported effect of donor CMV serostatus on the outcomes of leukemia in HLA-A2-identical HCT recipients. Addressing the question of cross-reactivity of HLA-A2-restricted CMV-specific T cells with minor H antigens in a clinical study would require knowledge of the patient's minor H antigen genotype. However, because of the unbalanced distribution of HLA-A2-restricted minor H antigens in the population and their incomplete identification, this question might be more appropriately evaluated in in vitro experiments than in a clinical study.
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Polyploidy is often assumed to increase the spread and thus the success of alien plant species, but few empirical studies exist. We tested this hypothesis with Centaurea maculosa Lam., a species native to Europe and introduced into North America approximately 120 years ago where it became highly invasive. We analyzed the ploidy level of more than 2000 plants from 93 native and 48 invasive C. maculosa populations and found a pronounced shift in the relative frequency of diploid and tetraploid cytotypes. In Europe diploid populations occur in higher frequencies than tetraploids and only four populations had both cytotypes, while in North America diploid plants were found in only one mixed population and thus tetraploids clearly dominated. Our results showed a pronounced shift in the climatic niche between tetraploid populations in the native and introduced range toward drier climate in North America and a similar albeit smaller shift between diploids and tetraploids in the native range. The field data indicate that diploids have a predominately monocarpic life cycle, while tetraploids are often polycarpic. Additionally, the polycarpic life-form seems to be more prevalent among tetraploids in the introduced range than among tetraploids in the native range. Our study suggests that both ploidy types of C. maculosa were introduced into North America, but tetraploids became the dominant cytotype with invasion. We suggest that the invasive success of C. maculosa is partly due to preadaptation of the tetraploid cytotype in Europe to drier climate and possibly further adaptation to these conditions in the introduced range. The potential for earlier and longer seed production associated with the polycarpic life cycle constitutes an additional factor that may have led to the dominance of tetraploids over diploids in the introduced range.