Caracterização imunoquímica da ACC (ácido 1-carboxílico-1-aminociclopropano) oxidase em frutos climatéricos

Com o objetivo de caracterizar, por via imunoquímica, a enzima ACC (ácido 1-carboxílico-1-aminociclopropano) oxidase em frutos climatéricos, foram preparados anticorpos policlonais específicos para esta proteína. Utilizou-se, como antígeno, uma proteína recombinante, produzida em Escherichia coli K38/pGP1,2, contendo o vetor de expressão pT7-7A4 no qual foi inserido um clone de DNA da ACC oxidase. A especificidade dos anticorpos foi demonstrada pela técnica de "Western blot", a partir de extratos protéicos de maçãs e tomates em diferentes estágios de maturação. Verificou-se que o aumento da produção de etileno, quando os frutos passaram do estágio pré-climatérico para o climatérico, está diretamente correlacionada com o aumento da síntese da ACC oxidase. Em estágios de maturação mais avançados houve uma redução da produção de etileno e da atividade ACC oxidase, mas esta proteína continuava presente. Quando o "Western blot" foi realizado com tomates transgênicos, onde a produção de etileno e a síntese da ACC oxidase foram inibidos em mais de 95%, nenhuma reação imunoquímica foi detectada. O conjunto de resultados obtidos indica que os anticorpos detectam especificamente ACC oxidase.

Inibição da síntese da ACC (ácido 1-carboxílico-1-aminociclopropano) oxidase em maçãs frigoconservadas em atmosfera controlada

Foi estudada a expressão da ACC oxidase em maçãs, cv. Jonagold, colhidas no estádio pré-climatérico e armazenadas sob refrigeração em atmosfera normal (0ºC, 95% UR - AN) e controlada (0ºC, 95% UR, 1,5% O2 e 2,5% CO2 - AC), durante 180 dias. Na instalação do experimento, aos 90 e aos 120 dias, foram coletadas amostras para a determinação da firmeza de polpa, da acidez total titulável, dos sólidos solúveis totais, da produção de etileno, da atividade ACC oxidase e para a detecção imunoquímica das isoformas desta enzima. A dosagem da atividade ACC oxidase foi realizada por cromatografia gasosa a partir de extrato protéico solúvel acrescido de 250µM de ACC, 10µL de sulfato ferroso e 30µL de ascorbato de sódio. Para a detecção imunoquímica utilizou-se a técnica "western blot", com anticorpos policlonais anti-ACC oxidase de maçã, após separação das proteínas em eletroforese e isoeletrofocalização. Não foi detectada ACC oxidase em maçãs pré-climatéricas. Porém, após 120 horas em condições ambientais, houve a síntese dessa enzima e um incremento na produção de etileno. A refrigeração não exerceu controle na síntese da ACC oxidase e produção de etileno, resultando em significativas perdas físico-químicas nas frutas armazenadas em AN. Já a utilização de AC permitiu controlar a via de biossíntese do etileno, pela inibição da síntese da ACC oxidase, mantendo o material com boa qualidade para o consumo in natura. A adição de ACC e dos cofatores aumentou a atividade ACC oxidase e alterou o pI da ACC oxidase.

Chansons françaises du 16e siècle / Garnier, Gentian, Sermisy... [et al.], comp. ; Marcelle Gerar, S ; acc. de violes, flûte et guit.

Comprend : Resveillez-moi / Garnier, comp. ; Marcelle Gerar, S ; acc. de violes, flûte et guit. ; La loy d'honneur / Gentian, comp. ; Marcelle Gerar, S ; acc. de violes, flûte et guit. ; En entrant en ung jardin / Sermisy, comp. ; Marcelle Gerar, S ; acc. de violes, flûte et guit. ; Jehan de Lagny / Berchem, comp. ; Marcelle Gerar, S ; acc. de violes, flûte et guit. ; Que feu craintif / Berchem, comp. ; Marcelle Gerar, S ; acc. de violes, flûte et guit. ; Gros Jehan menoit hors de Paris / N. René, comp. ; Marcelle Gerar, S ; acc. de violes, flûte et guit.

Anouche. Partzer Sarer / [Armen Tigranian, comp.]. Ousdi goukas / Sayat Nova, comp. ; H. Serïdarian, chant ; acc. piano et violon

Comprend : Anouche ; Ousdi goukas

Dzov hoknadz : [la mer fatiguée] ; Antzir sev amb : [Passe le sombre nuage] / T. Babikian, T ; acc. piano et violon

[Traditions. Asie. Arménie]

Top-down and Bottom-up influences on ACC activation: Evaluation of a proposed model of the feedback-related negativity

The Feedback-Related Negativity (FRN) is thought to reflect the dopaminergic prediction error signal from the subcortical areas to the ACC (i.e., a bottom-up signal). Two studies were conducted in order to test a new model of FRN generation, which includes direct modulating influences of medial PFC (i.e., top-down signals) on the ACC at the time of the FRN. Study 1 examined the effects of one’s sense of control (top-down) and of informative cues (bottom-up) on the FRN measures. In Study 2, sense of control and instruction-based (top-down) and probability-based expectations (bottom-up) were manipulated to test the proposed model. The results suggest that any influences of medial PFC on the activity of the ACC that occur in the context of incentive tasks are not direct. The FRN was shown to be sensitive to salient stimulus characteristics. The results of this dissertation partially support the reinforcement learning theory, in that the FRN is a marker for prediction error signal from subcortical areas. However, the pattern of results outlined here suggests that prediction errors are based on salient stimulus characteristics and are not reward specific. A second goal of this dissertation was to examine whether ACC activity, measured through the FRN, is altered in individuals at-risk for problem-gambling behaviour (PG). Individuals in this group were more sensitive to the valence of the outcome in a gambling task compared to not at-risk individuals, suggesting that gambling contexts increase the sensitivity of the reward system to valence of the outcome in individuals at risk for PG. Furthermore, at-risk participants showed an increased sensitivity to reward characteristics and a decreased response to loss outcomes. This contrasts with those not at risk whose FRNs were sensitive to losses. As the results did not replicate previous research showing attenuated FRNs in pathological gamblers, it is likely that the size and time of the FRN does not change gradually with increasing risk of maladaptive behaviour. Instead, changes in ACC activity reflected by the FRN in general can be observed only after behaviour becomes clinically maladaptive or through comparison between different types of gain/loss outcomes.

Caractérisation de la voie de signalisation AMPK/ACC dans le foie et l’intestin du Psammomys obesus, un modèle animal de résistance à l’insuline et de diabète de type 2

L’expansion des maladies métaboliques dans les sociétés modernes exige plus d’activités de recherche afin d’augmenter notre compréhension des mécanismes et l’identification de nouvelles cibles d’interventions cliniques. L’obésité, la résistance à l’insuline (RI) et la dyslipidémie, en particulier sont tous des facteurs de risque associés à la pathogenèse du diabète de type 2 (DT2) et des maladies cardiovasculaires. Ainsi, la dyslipidémie postprandiale, notamment la surproduction des lipoprotéines hépatiques et intestinales, contribue d’une façon significative à l’hypertriglycéridémie. Quoique plusieurs études cliniques et fondamentales chez l’homme et les modèles animaux aient mis en évidence les rôles importants joués par le foie et l’intestin dans la dyslipidémie, les mécanismes moléculaires en cause ne sont pas bien élucidés. L’une des voies principales régulant le métabolisme lipidique est la voie de la protéine kinase AMPK. L’épuisement de l’ATP intracellulaire entraîne une activation de l’AMPK qui va œuvrer pour rétablir l’équilibre énergétique en stimulant des voies génératrices d’ATP et en inhibant des voies anaboliques consommatrices d’ATP. Les effets positifs de l’activation de l’AMPK comprennent l’augmentation de la sensibilité à l’insuline dans les tissus périphériques, la réduction de l’hyperglycémie et la réduction de la lipogenèse, d’où son importance dans les interventions cliniques pour la correction des dérangements métaboliques. Il est à souligner que le rôle de l’AMPK dans le foie et l’intestin semble plus complexe et mal compris. Ainsi, la voie de signalisation de l’AMPK n’est pas bien élucidée dans les situations pathologiques telles que le DT2, la RI et l’obésité. Dans le présent projet, notre objectif consiste à caractériser le rôle de cette voie de signalisation dans la lipogenèse hépatique et dans le métabolisme des lipides dans l’intestin chez le Psammomys obesus, un modèle animal d’obésité, de RI et de DT2. À cette fin, 3 groupes d’animaux sont étudiés (i.e. contrôle, RI et DT2). En caractérisant la voie de signalisation de l’AMPK/ACC dans le foie, nous avons constaté une augmentation de l’expression génique des enzymes clés de la lipogenèse (ACC, FAS, SCD-1 et mGPAT) et des facteurs de transcription (ChREBP, SREBP-1) qui modulent leur niveau d’expression. Nos analyses détaillées ont révélé, par la suite, une nette augmentation de l’expression de l’isoforme cytosolique de l’ACC, ACC1 (impliqué dans la lipogenèse de novo) concomitante avec une invariabilité de l’expression de l’isoforme mitochondrial ACC2 (impliqué dans la régulation négative de la β-oxydation). En dépit d’un état adaptatif caractérisé par une expression protéique et une phosphorylation (activation) élevées de l’AMPKα, l’activité de la kinase qui phosphoryle et inhibe l’ACC reste très élevée chez les animaux RI et DT2. Au niveau de l’intestin grêle des animaux RI et DT2, nous avons démontré que l’augmentation de la lipogenèse intestinale est principalement associée avec une diminution de la voie de signalisation de l’AMPK (i.e. expression protéique et phosphorylation/activation réduites des deux isoformes AMPKα1 et AMPKα2). La principale conséquence de la diminution de l’activité AMPK est la réduction de la phosphorylation de l’ACC. Étant donné que le niveau d’expression totale d’ACC reste inchangé, nos résultats suggèrent donc une augmentation de l’activité des deux isoformes ACC1 et ACC2. En parallèle, nous avons observé une réduction de l’expression protéique et génique de la CPT1 [enzyme clé de la β-oxydation des acides gras (AG)]. L’ensemble de ces résultats suggère une inhibition de l’oxydation des AG concomitante avec une stimulation de la lipogenèse de novo. Enfin, nous avons démontré que l’intestin grêle est un organe sensible à l’action de l’insuline et que le développement de la résistance à l’insuline pourrait altérer les deux voies de signalisation (i.e. Akt/GSK3 et p38MAPK) essentielles dans plusieurs processus métaboliques. En conclusion, nos résultats indiquent que l’augmentation de la lipogenèse qui contribue pour une grande partie à la dyslipidémie dans la résistance à l’insuline et le diabète serait due, en partie, à des défauts de signalisation par l’AMPK. Nos observations illustrent donc le rôle crucial du système AMPK au niveau hépatique et intestinal, ce qui valide l’approche thérapeutique consistant à activer l’AMPK pour traiter les maladies métaboliques.

Active nuclear import and cytoplasmic retention of activation-induced deaminase

The enzyme activation-induced deaminase (AID) triggers antibody diversification in B cells by catalyzing deamination and consequently mutation of immunoglobulin genes. To minimize off-target deamination, AID is restrained by several regulatory mechanisms including nuclear exclusion, thought to be mediated exclusively by active nuclear export. Here we identify two other mechanisms involved in controlling AID subcellular localization. AID is unable to passively diffuse into the nucleus, despite its small size, and its nuclear entry requires active import mediated by a conformational nuclear localization signal. We also identify in its C terminus a determinant for AID cytoplasmic retention, which hampers diffusion to the nucleus, competes with nuclear import and is crucial for maintaining the predominantly cytoplasmic localization of AID in steady-state conditions. Blocking nuclear import alters the balance between these processes in favor of cytoplasmic retention, resulting in reduced isotype class switching.

Dissecting cell cycle protein complexes using the pptimized yeast cytosine deaminase protein-fragment complementation assay “You too can play with an edge”

Les protéines sont les produits finaux de la machinerie génétique. Elles jouent des rôles essentiels dans la définition de la structure, de l'intégrité et de la dynamique de la cellule afin de promouvoir les diverses transformations chimiques requises dans le métabolisme et dans la transmission des signaux biochimique. Nous savons que la doctrine centrale de la biologie moléculaire: un gène = un ARN messager = une protéine, est une simplification grossière du système biologique. En effet, plusieurs ARN messagers peuvent provenir d’un seul gène grâce à l’épissage alternatif. De plus, une protéine peut adopter plusieurs fonctions au courant de sa vie selon son état de modification post-traductionelle, sa conformation et son interaction avec d’autres protéines. La formation de complexes protéiques peut, en elle-même, être déterminée par l’état de modifications des protéines influencées par le contexte génétique, les compartiments subcellulaires, les conditions environmentales ou être intrinsèque à la croissance et la division cellulaire. Les complexes protéiques impliqués dans la régulation du cycle cellulaire sont particulièrement difficiles à disséquer car ils ne se forment qu’au cours de phases spécifiques du cycle cellulaire, ils sont fortement régulés par les modifications post-traductionnelles et peuvent se produire dans tous les compartiments subcellulaires. À ce jour, aucune méthode générale n’a été développée pour permettre une dissection fine de ces complexes macromoléculaires. L'objectif de cette thèse est d'établir et de démontrer une nouvelle stratégie pour disséquer les complexes protéines formés lors du cycle cellulaire de la levure Saccharomyces cerevisiae (S. cerevisiae). Dans cette thèse, je décris le développement et l'optimisation d'une stratégie simple de sélection basée sur un essai de complémentation de fragments protéiques en utilisant la cytosine déaminase de la levure comme sonde (PCA OyCD). En outre, je décris une série d'études de validation du PCA OyCD afin de l’utiliser pour disséquer les mécanismes d'activation des facteurs de transcription et des interactions protéine-protéines (IPPs) entre les régulateurs du cycle cellulaire. Une caractéristique clé du PCA OyCD est qu'il peut être utilisé pour détecter à la fois la formation et la dissociation des IPPs et émettre un signal détectable (la croissance des cellules) pour les deux types de sélections. J'ai appliqué le PCA OyCD pour disséquer les interactions entre SBF et MBF, deux facteurs de transcription clés régulant la transition de la phase G1 à la phase S. SBF et MBF sont deux facteurs de transcription hétérodimériques composés de deux sous-unités : une protéine qui peut lier directement l’ADN (Swi4 ou Mbp1, respectivement) et une protéine commune contenant un domain d’activation de la transcription appelée Swi6. J'ai appliqué le PCA OyCD afin de générer un mutant de Swi6 qui restreint ses activités transcriptionnelles à SBF, abolissant l’activité MBF. Nous avons isolé des souches portant des mutations dans le domaine C-terminal de Swi6, préalablement identifié comme responsable dans la formation de l’interaction avec Swi4 et Mbp1, et également important pour les activités de SBF et MBF. Nos résultats appuient un modèle où Swi6 subit un changement conformationnel lors de la liaison à Swi4 ou Mbp1. De plus, ce mutant de Swi6 a été utilisé pour disséquer le mécanisme de régulation de l’entrée de la cellule dans un nouveau cycle de division cellulaire appelé « START ». Nous avons constaté que le répresseur de SBF et MBF nommé Whi5 se lie directement au domaine C-terminal de Swi6. Finalement, j'ai appliqué le PCA OyCD afin de disséquer les complexes protéiques de la kinase cycline-dépendante de la levure nommé Cdk1. Cdk1 est la kinase essentielle qui régule la progression du cycle cellulaire et peut phosphoryler un grand nombre de substrats différents en s'associant à l'une des neuf protéines cycline régulatrice (Cln1-3, Clb1-6). Je décris une stratégie à haut débit, voir à une échelle génomique, visant à identifier les partenaires d'interaction de Cdk1 et d’y associer la cycline appropriée(s) requise(s) à l’observation d’une interaction en utilisant le PCA OyCD et des souches délétées pour chacune des cyclines. Mes résultats nous permettent d’identifier la phase(s) du cycle cellulaire où Cdk1 peut phosphoryler un substrat particulier et la fonction potentielle ou connue de Cdk1 pendant cette phase. Par exemple, nous avons identifié que l’interaction entre Cdk1 et la γ-tubuline (Tub4) est dépendante de Clb3. Ce résultat est conforme au rôle de Tub4 dans la nucléation et la croissance des faisceaux mitotiques émanant des centromères. Cette stratégie peut également être appliquée à l’étude d'autres IPPs qui sont contrôlées par des sous-unités régulatrices.

Medusa ACC module

Test site

Molecular forms of porphobilinogen deaminase in acute intermittent porphyria. A study by Western immunoblotting

Acute intermittent porphyria is an inborn error of haem synthesis which is transmitted as a dominant character with variable phenotypic expression. The disorder is caused by a partial deficiency of porphobilinogen deaminase in all tissues so far studied. The nature of the enzymatic deficiency of porphobilinogen deaminase in haemolysates from patients with acute intermittent porphyria was examined by the use of monospecific antibody probes. In affected heterozygotes from three British pedigrees of diverse ancestry, the catalytic deficiency of porphobilinogen deaminase was accompanied by diminished enzyme protein, as determined by radial immunodiffusion. No evidence of functionally attenuated enzyme was demonstrable by kinetic studies. The molecular forms of the residual enzyme were investigated in red cell extracts and in lysed preparations of reticulocytes by a sensitive Western blotting procedure. This revealed the presence of reduced amounts of porphobilinogen deaminase polypeptide co-migrating with wild type enzyme (Mr approximately 40,000), and no evidence of variant forms in situ. The studies show that porphobilinogen deaminase deficiency in acute intermittent porphyria is commonly associated with a CRM-phenotype. The residual activity under these circumstances is thus related to expression of a single normal allele, since sensitive techniques detected neither aberrant nor degraded forms of the enzyme in erythroid tissues.

Trypanosoma evansi: Adenosine deaminase activity in the brain of infected rats

The study was undertaken to evaluate changes in the activity of adenosine deaminase (ADA) in brains of rats infected by Trypanosoma evansi. Each rat was intraperitoneally infected with 10(6) trypomastigotes either suspended in fresh (group A; n = 13) and cryopreserved blood (group B; n = 13). Thirteen animals were used as control (group C). ADA activity was estimated in the cerebellum, cerebral cortex, striatum and hippocampus. No differences (P > 0.05) in ADA activity were observed in the cerebellum between infected and non-infected animals. Significant (P < 0.05) reductions in ADA activity occurred in cerebral cortex in acutely (day 4 post-infection; PI) and chronically (day 20 PI) infected rats. ADA activity was significantly (P < 0.05) decreased in the hippocampus in acutely infected rats, but significantly (P < 0.05) increased in the chronically infected rats. Significant (P < 0.05) reductions in ADA activity occurred in the striatum of chronically infected rats. Parasites could be found in peripheral blood and brain tissue through microscopic examination and PCR assay, respectively, in acutely and chronically infected rats. The reduction of ADA activity in the brain was associated with high levels of parasitemia and anemia in acute infections. Alterations in ADA activity of the brain in T. evansi-infected rats may have implications for pathogenesis of the disease. (C) 2010 Elsevier Inc. All rights reserved.

Adenosina deaminase no diagnóstico de rejeição aguda após o transplante renal Ana Lúcia Livi

O transplante renal representa atualmente a melhor opção terapêutica e de reabilitação para o paciente com insuficiência renal crônica terminal. As rejeições são as principais causas de perda dos rins transplantados e, entre essas, as rejeições agudas são as que apresentam maior relevância clínica. Desta maneira, a monitorização do transplante renal com vistas ao diagnóstico precoce da rejeição e seu rápido tratamento é de grande relevância no manejo adequado desses pacientes. Como a rejeição celular aguda é mediada predominantemente por linfócitos T e, visto que, a enzima adenosina deaminase (ADA) é encontrada principalmente, a nível de sangue periférico, em linfócitos, objetivou-se com esse estudo, verificar a possível associação entre atividade sérica da ADA e a rejeição aguda do enxerto renal. Buscou-se, também, determinar a sua utilidade como método diagnóstico de rejeição celular aguda. Foram acompanhados até 1 mês de internação 35 pacientes transplantados renais. Dosagens da atividade de ADA sérica foram feitas cinco vezes por semana e sempre que houvesse suspeita clínica de rejeição aguda. O diagnóstico de rejeição aguda foi estabelecido por 2 nefrologistas, aos quais foram omitidos os resultados dos níveis séricos ADA. Estes médicos tinham todas informações clínicas e laboratoriais, incluindo valores séricos de creatinina e ciclosporina, cintilografias, ecografias, citologia aspirativa, punção biópsia renal quando esta era realizada e resposta aos diferentes tratamentos imunossupressores usados. A análise estatística foi feita utilizando-se testes de Mann-Whitney e Qui-quadrado. O nível p menor do que 0,05 foi considerado como significativo. A mediana dos episódios de rejeição celular aguda ficou entre o sexto e sétimo dia pós-transplante, havendo diferença estatisticamente significativa nos valores de ADA no sexto dia de seguimento entre os pacientes com rejeição (60.16), em relação aos que não tiveram rejeição celular aguda (24,55) (p=0,021 MW). Para se avaliar a eficácia da atividade sérica de ADA com método diagnóstico de rejeição aguda, empregou-se pontos de corte de valores de ADA>35,>40,>45, >50 e > que 30% dos valores do período pré-rejeição. Houve associação estatisticamente significativa entre ADA>30% e rejeição celular aguda (p=0.035 MW). Verificou-se, também, aumento significativos da atividade sérica de ADA em pacientes anti-HCV positivos e com necrose tubular aguda, sem interferência sobre os resultados dos episódios de rejeição celular aguda. Usando esses pontos de corte como parâmetros de diagnóstico para rejeição aguda observou-se: sensibilidade = 55,5%, especificidade = 82,3%, valor preditivo positivo = 76,9%, valor preditivo negativo = 63,6% e acurácia = 69,0%. Conclui-se que há um aumento significativo da atividade sérica da ADA durante os episódios de rejeição aguda de enxertos renais humanos, encontrando-se associação significativa entre o aumento de 30% dos valores de ADA pré-rejeição e o diagnóstico de rejeição celular aguda.

Adenosine deaminase activity as a biochemical marker of inflammatory response in goats infected by caprine arthritis-encephalitis virus

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Structure and catalytic mechanism of glucosamine 6-phosphate deaminase from Escherichia coli at 2.1 Å resolution

Background: Glucosamine 6-phosphate deaminase from Escherichia coli is an allosteric hexameric enzyme which catalyzes the reversible conversion of D-glucosamine 6-phosphate into D-fructose 6-phosphate and ammonium ion and is activated by N-acetyl-D-glucosamine 6-phosphate. Mechanistically, it belongs to the group of aldose-ketose isomerases, but its reaction also accomplishes a simultaneous amination/deamination. The determination of the structure of this protein provides fundamental knowledge for understanding its mode of action and the nature of allosteric conformational changes that regulate its function. Results: The crystal structure of glucosamine 6-phosphate deaminase with bound phosphate ions is presented at 2.1 Å resolution together with the refined structures of the enzyme in complexes with its allosteric activator and with a competitive inhibitor. The protein fold can be described as a modified NAD-binding domain. Conclusions: From the similarities between the three presented structures, it is concluded that these represent the enzymatically active R state conformer. A mechanism for the deaminase reaction is proposed. It comprises steps to open the pyranose ring of the substrate and a sequence of general base-catalyzed reactions to bring about isomerization and deamination, with Asp72 playing a key role as a proton exchanger.