Assessing the Association between Receipt of Antimalarial Drugs and Adverse Pregnancy Outcomes using Pooled Data

Thesis (Ph.D.)--University of Washington, 2016-08

Development and application of sensitive genome-wide platforms to study the genetic and epigenetic (DNA methylation) makeup of gametes and early bovine embryos

Pour ce projet, nous avons développé une plateforme pour l’analyse pangénomique de la méthylation de l’ADN chez le bovin qui est compatible avec des échantillons de petites tailles. Cet outil est utilisé pour étudier les caractéristiques génétiques et épigénétiques (méthylation de l’ADN) des gamètes soumis aux procédures de procréation médicalement assisitée et des embryons précoces. Dans un premier temps, une plateforme d’analyse de biopuces spécifiques pour l’étude de la méthylation de l’ADN chez l’espèce bovine a été développée. Cette plateforme a ensuite été optimisée pour produire des analyses pangénomiques de méthylation de l’ADN fiables et reproductibles à partir d’échantillons de très petites tailles telle que les embryons précoces (≥ 10 ng d’ADN a été utilisé, ce qui correspond à 10 blastocystes en expansion). En outre, cet outil a permis d’évaluer de façon simultanée la méthylation de l’ADN et le transcriptome dans le même échantillon, fournissant ainsi une image complète des profils génétiques et épigénétiques (méthylation de l’ADN). Comme preuve de concept, les profils comparatifs de méthylation de l’ADN spermatique et de blastocystes bovins ont été analysés au niveau de l’ensemble du génome. Dans un deuxième temps, grâce à cette plateforme, les profils globaux de méthylation de l’ADN de taureaux jumeaux monozygotes (MZ) ont été analysés. Malgré qu’ils sont génétiquement identiques, les taureaux jumeaux MZ ont des descendants avec des performances différentes. Par conséquent, l’hypothèse que le profil de méthylation de l’ADN spermatique de taureaux jumeaux MZ est différent a été émise. Dans notre étude, des différences significatives entre les jumeaux MZ au niveau des caractéristiques de la semence ainsi que de la méthylation de l’ADN ont été trouvées, chacune pouvant contribuer à l’obtention de performances divergentes incongrues des filles engendrées par ces jumeaux MZ. Dans la troisième partie de ce projet, la même plateforme a été utilisée pour découvrir les impacts d’une supplémentation à forte concentration en donneur de méthyle universel sur les embryons précoces bovins. La supplémentation avec de grandes quantités d’acide folique (AF) a été largement utilisée et recommandée chez les femmes enceintes pour sa capacité bien établie à prévenir les malformations du tube neural chez les enfants. Cependant, plus récemment, plusieurs études ont rapporté des effets indésirables de l’AF utilisé à des concentrations élevées, non seulement sur le développement de l’embryon, mais aussi chez les adultes. Au niveau cellulaire, l’AF entre dans le métabolisme monocarboné, la seule voie de production de S-adénosyl méthionine (SAM), un donneur universel de groupements méthyles pour une grande variété de biomolécules, y compris l’ADN. Par conséquent, pour résoudre cette controverse, une forte dose de SAM a été utilisée pour traiter des embryons produits in vitro chez le bovin. Ceci a non seulement permis d’influencer le phénotype des embryons précoces, mais aussi d’avoir un impact sur le transcriptome et le méthylome de l’ADN. En somme, le projet en cours a permis le développement d’une plateforme d’analyse de la méthylation de l’ADN à l’échelle du génome entier chez le bovin à coût raisonnable et facile à utiliser qui est compatible avec les embryons précoces. De plus, puisque c’est l’une des premières études de ce genre en biologie de la reproduction bovine, ce projet avait trois objectifs qui a donné plusieurs nouveaux résultats, incluant les profils comparatifs de méthylation de l’ADN au niveau : i) blastocystes versus spermatozoïdes ; ii) semence de taureaux jumeaux MZ et iii) embryons précoces traités à de fortes doses de SAM versus des embryons précoces non traités.

Easy preoperative planning of deeply located brain lesions using external skin reference and 3-Dimensional surface MRI

Open skull surgery of deeply located intracerebral lesions requires precise determination of the treatment area in 3-dimensional (3-D) space. 3-D MRI can give important additional information in presurgical determination of the surgical approach to the target, taking into account highly functional brain areas and important vascular structures. The day before surgery, a grid composed of 9 tubings intersecting at 90° at 1 cm intervals and filled with a Q1SO4 solution is firmly attached to the skin of the patient’s head in the presumed region of the craniotomy. A 3-D turbo-FLASH sequence is then performed in the sagittal plane after intravenous Gd-DOTA injection on a IT Magnetom. 3-D surface reconstruction of the cortical gyri and sulci is performed. Once the gyri are identified, the 3-D program is then implemented in order to perform a color display of the cortical veins and of the tumor boundaries. The surgical access is then chosen by the surgeon, taking into account highly functional areas. Finally, the boundaries of the tumor are projected on the cortex reconstruction and on the external reference placed on the skin. The entry place for surgery as well as the size of craniotomy are drawn on the skin and the tubed grid is removed. The accuracy of this method tested in 9 patients with deeply located brain tumors or arteriovenous malformations was very satisfactory. In daily practice, this method is a valuable technique providing important clinical information in determining the shortest and safest way through the brain tissue, decreasing possible functional deficit and reducing craniotomy size in cases of difficult to access deep brain areas. Our method does not require a stereotactic frame permanently fixed to the head of the patient during surgery. © 1994 S. Karger AG, Basel.

Développement et pré-test d’un plan de soins de suivi pour des femmes atteintes du cancer de l’endomètre avec traitements adjuvants lors de la transition de la fin du traitement actif vers la survie au cancer

La fin du traitement actif et le début de la phase de survie correspondent à une période de transition qui présente de nombreux défis pour la personne survivante au cancer, les soignants et le système de santé. La phase de survie au cancer est une phase distincte mais négligée du continuum de soins. Pour faciliter la transition de la fin du traitement actif vers la survie et optimiser la coordination des soins de suivi, la mise en place d’un plan de soins de suivi (PSS) est proposée. Le but de cette recherche est de développer, de mettre en place et d’évaluer si un plan de soins de suivi (PSS) permet de répondre aux besoins globaux, de diminuer la détresse émotionnelle et de favoriser les comportements d’autogestion de santé de femmes atteintes du cancer de l’endomètre (FACE) lors de la transition de la fin du traitement actif vers la survie au cancer. Elle comprend deux phases distinctes. La première phase visait d’abord le développement d’un plan de soins de suivi (PSS) pour des femmes atteintes du cancer de l’endomètre avec traitements adjuvants. La sélection du contenu du PSS a été faite à partir de la recension des écrits et des données recueillies lors d’entrevues individuelles avec 19 FACE, 24 professionnels de la santé travaillant avec cette clientèle et quatre gestionnaires de proximité en oncologie. Cette première phase avait également pour but la validation du contenu du PSS auprès de dix professionnels de la santé impliqués dans l’étude. La seconde phase consistait à évaluer la faisabilité, l’acceptabilité du PSS et à en pré-tester l’utilité à répondre aux besoins globaux, à diminuer la détresse émotionnelle (peur de la récidive) et à favoriser l’autogestion de santé auprès d’un groupe de 18 femmes atteintes du cancer de l’endomètre avec traitements adjuvants à la fin du traitement actif vers la survie. Sur le plan de la faisabilité, les résultats suggèrent que la mise en place du PSS comporte des défis en termes de temps, de ressources et de coordination pour l’infirmière pivot en oncologie (IPO). Concernant l’acceptabilité du PSS, les FACE le perçoivent comme un outil d’information utile qui favorise la communication avec le médecin de famille ou d’autres professionnels de la santé. Les IPO soutiennent sa valeur ajoutée à la fin du traitement et soulignent que la discussion du contenu du PSS fait ressortir des éléments de surveillance et de suivi essentiels à prendre en compte pour la phase de survie et permet de mettre l’emphase sur l’autogestion de sa santé. Pour les médecins de famille, le PSS est un outil d’information pour les survivantes qui favorise la réassurance, la communication et la continuité des soins entre professionnels de la santé. Enfin, pour ce qui est de l’utilité du PSS à répondre aux besoins globaux, les résultats suggèrent que l’ensemble des besoins sont plus satisfaits trois mois après la fin des traitements pour le groupe ayant reçu un PSS. Bien que la peur de récidive du cancer (PRC) s’améliore au suivi de trois mois pour le groupe exposé au PSS, 55% des FACE conservent un score cliniquement significatif de 13 à la sous-échelle de sévérité de peur de récidive à la fin du traitement et 42% au suivi de trois mois. Les comportements d’autogestion de santé s’améliorent entre la fin du traitement et le suivi de trois mois pour le groupe exposé un PSS. Considérant ces résultats, la démarche soutient la pertinence de mettre en place un PSS à la fin du traitement actif pour les FACE pour répondre à des besoins d’information, favoriser la communication et la continuité des soins avec les professionnels de la santé et les comportements d’autogestion de santé dans la phase de survie. Cependant, des contraintes de temps, de ressources et de coordination doivent être prises en compte pour sa mise en place dans le milieu clinique. Mots-clés : Transition, fin du traitement actif, besoins, survie au cancer, plan de soins de suivi.

Diagnóstico laboratorial de casos de importação de infeções por vírus Zika

O vírus Zika (Flavivirus) é um arbovírus transmitido sobretudo por mosquitos, mas também, por transmissão materno-fetal e sexual. Existem evidências que as infeções por vírus Zika podem estar associadas à síndrome de Guillian-Barré e a casos congénitos de microcefalia e outras malformações do sistema nervoso central. As infeções por vírus Zika, Dengue e Chikungunya partilham, atualmente, os mosquitos vetores, a sintomatologia e a distribuição geográfica. O Centro de Estudos de Vetores e Doenças Infeciosas do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge no seu Laboratório Nacional de Referência de Vírus Transmitidos por Vetores tem desenvolvido o diagnóstico e estudos epidemiológicos de vírus transmitidos por artrópodes desde o princípio dos anos 90. O diagnóstico de Zika foi desenvolvido e padronizado em 2007. O laboratório desenvolveu testes de diagnóstico molecular e serológico tendo identificado vários casos de importação para o território português e feito o diagnóstico diferencial com Dengue e Chikungunya e o despiste de infeção em grávidas e em casos de transmissão sexual.

X-Linked Retinitis Pigmentosa 2 Is a Novel Maternal-Effect Gene Required for Left-Right Asymmetry in Zebrafish

Retinitis pigmentosa 2 (RP2) gene is responsible for up to 20% of X-linked retinitis pigmentosa, a severe heterogeneous genetic disorder resulting in progressive retinal degeneration in humans. In vertebrates, several bodies of evidence have clearly established the role of Rp2 protein in cilia genesis and/or function. Unexpectedly, some observations in zebrafish have suggested the oocyte-predominant expression of the rp2 gene, a typical feature of maternal-effect genes. In the present study, we investigate the maternal inheritance of rp2 gene products in zebrafish eggs in order to address whether rp2 could be a novel maternal-effect gene required for normal development. Although both rp2 mRNA and corresponding protein are expressed during oogenesis, rp2 mRNA is maternally inherited, in contrast to Rp2 protein. A knockdown of the protein transcribed from both rp2 maternal and zygotic mRNA results in delayed epiboly and severe developmental defects, including eye malformations, that were not observed when only the protein from zygotic origin was knocked down. Moreover, the knockdown of maternal and zygotic Rp2 revealed a high incidence of left-right asymmetry establishment defects compared to only zygotic knockdown. Here we show that rp2 is a novel maternal-effect gene exclusively expressed in oocytes within the zebrafish ovary and demonstrate that maternal rp2 mRNA is essential for successful embryonic development and thus contributes to egg developmental competence. Our observations also reveal that Rp2 protein translated from maternal mRNA is important to allow normal heart loop formation, thus providing evidence of a direct maternal contribution to left-right asymmetry establishment.

Clinical outcome after first and recurrent hemorrhage in patients with untreated brain arteriovenous malformation

Background and Purpose: The morbidity from spontaneous hemorrhage of untreated brain arteriovenous malformations (AVM) is not well described. Methods: The 241 consecutive AVM patients (mean age 3716 years, 52% women) from the prospective Columbia AVM Databank initially presenting with hemorrhage were evaluated using the Rankin Scale (RS) and the National Institute of Health Stroke Scale (NIHSS). From the 241 AVM patients, 29 (12%) had subsequent intracranial hemorrhage during follow-up. For further comparisons, 84 non-AVM patients with intracerebral hemorrhage from the Northern Manhattan Study (NOMAS) served as a control group. Results: In 241 AVM patients presenting with hemorrhage the median RS was 2 and the median NIHSS was 1 (49% RS 0 to 1, 61% NIHSS 2). The median time between hemorrhage and clinical evaluation was 11 days (mean 219 days). Recurrent AVM hemorrhage during follow-up resulted in no significant increase in morbidity (median RS 2, P0.004; median NIHSS 3, P0.322; time between hemorrhage and study evaluation: median 55 days, mean 657 days). Among AVM-hemorrhage subtypes, parenchymatous AVM hemorrhage was associated with higher stroke morbidity (odds ratio, 2.9; 95% CI, 1.5 to 5.8 for NIHSS 2) than nonparenchymatous hemorrhages. Parenchymatous AVM hemorrhage had a significantly better outcome (median NIHSS 1) than non-AVM related hemorrhage (median NIHSS 12; P0.0001). Conclusions: Hemorrhage, either at initial presentation or during follow-up of untreated AVM patients appears to carry

Metabolite profiling of somatic embryos of Cyclamen persicum in comparison to zygotic embryos, endosperm, and testa

Somatic embryogenesis has been shown to be an efficient in vitro plant regeneration system for many crops such as the important ornamental plant Cyclamen persicum, for which this regeneration pathway of somatic embryogenesis is of interest for the vegetative propagation of parental lines as well as elite plants. However, somatic embryogenesis is not commercially used in many crops due to several unsolved problems, such as malformations, asynchronous development, deficiencies in maturation and germination of somatic embryos. In contrast, zygotic embryos in seeds develop and germinate without abnormalities in most cases. Instead of time-consuming and labor-intensive experiments involving tests of different in vitro culture conditions and plant growth regulator supplements, we follow a more directed approach. Zygotic embryos served as a reference and were compared to somatic embryos in metabolomic analyses allowing the future optimization of the in vitro system. The aims of this study were to detect differences in the metabolite profiles of torpedo stage somatic and zygotic embryos of C. persicum. Moreover, major metabolites in endosperm and testa were identified and quantified. Two sets of extracts of two to four biological replicates each were analyzed. In total 52 metabolites were identified and quantified in the different tissues. One of the most significant differences between somatic and zygotic embryos was that the proline concentration in the zygotic embryos was about 40 times higher than that found in somatic embryos. Epicatechin, a scavenger for reactive oxygen species, was found in highest abundance in the testa. Sucrose, the most abundant metabolite was detected in significantly higher concentrations in zygotic embryos. Also, a yet unknown trisaccharide, was significantly enriched in zygotic embryos.

Hyperprolinemia as a clue in the diagnosis of a patient with a psychiatric disorder

Background: Over the last few years, microdeletions of the 22q11.2 region responsible for DiGeorge syndrome, or velocardiofacial syndrome, have been increasingly related to neuropsychiatric disorders including schizophrenia and bipolar disorders. These signs seem to be related to certain genes located in the hemideleted region as the proline dehydrogenase (PRODH) and the catecholo-methyltransferase (COMT) genes. The PRODH or proline oxidase deficiency is responsible for hyperprolinemia type 1 (HPI) also causing psychiatric manifestations. Case Report: We describe a 17 year old boy with previous mild psychomotor and speech delay, mild cognitive impairment, and obsessive behaviours who started his adolescent psychiatric care presenting irritablemood and aggressive behaviour with schizophrenia symptoms that scored a “severely ill” level PANSS assessment. Symptoms got worse when he was treated with valproic acid and plasma aminoacids showing increase in alanine and proline, suggested a mitochondrial involvement of the proline metabolic pathway. Results: Mild dysmorphia suggested a possible 22q11.2 deletion genetically confirmed involving both the PRODH and COMT regions. HPI that can present with psychiatric features is however a recessive disorder and therefore the symptoms could not be solely explained by this genetic deletion. Additional investigations also showed disclosed a p.L289m (c.1865 T > A) mutation in the PRODH gene. Discussion: We believe that the association of this mutation together with the 22q11.2 deletion would lead to a decrease of functional protein. Although it may be difficult to diagnosis chromosomal abnormalities in patients with no clear malformations and mild dysmorphic features as in this patient we emphasize need to investigate the aetiology in patients with psychiatric symptoms, especially if they have other systemic manifestations such as developmental delay or psychotic symptoms, as it may be important in the management of the patients.

Le diagnostic anténatal modifie-t-il la prise en charge néonatale et le devenir à 1 an des enfants suivis pour atrésie de l’œsophage de type III ?

International audience

Therapeutic failure with thalidomide in patients with recurrent intestinal bleeding due to angiodysplasias

Angiodysplasias are one of the reasons of gastrointestinal bleeding, whose origin is usually due to vascular malformations. There are different types of therapies for angiodysplasia such as endoscopic, angiographic and pharmacological techniques. Among the last ones, there is little variety of effective drugs to treat the disease. We describe the therapeutic failure with thalidomide in a male with recurrent gastrointestinal bleeding due to angiodysplasias. A thorough diagnostic work-up, including gastroscopy, enteroscopy, angiography and capsule endoscopy were performed. Despite treatment with high-dose somatostatin analogues and oral iron, the patient continued bleeding. The patient was administered then thalidomide for three months with no clinical response. Thalidomide had to be withdrawn owing to adverse effects.

Y nació en Antioquía un niño con un solo ojo’ (Barhebreo, Cron. 25b24-29)

En este trabajo nos ocupamos de una referencia en la Cronografía de Barhebreo sobre el nacimiento un niño con malformaciones físicas, su relación con las descripciones del Anticristo y la comparación con las versiones anteriores de esta leyenda recogidas por el patriarca Miguel el Sirio y el monje Teófanes Confesor, con el fin de mostrar las relaciones existentes en las tres redacciones y la posible fuente utilizada por los dos autores siriacos.

Zika virus damages the human placental barrier and presents marked fetal neurotropism

An unusually high incidence of microcephaly in newborns has recently been observed in Brazil. There is a temporal association between the increase in cases of microcephaly and the Zika virus (ZIKV) epidemic. Viral RNA has been detected in amniotic fluid samples, placental tissues and newborn and fetal brain tissues. However, much remains to be determined concerning the association between ZIKV infection and fetal malformations. In this study, we provide evidence of the transplacental transmission of ZIKV through the detection of viral proteins and viral RNA in placental tissue samples from expectant mothers infected at different stages of gestation. We observed chronic placentitis (TORCH type) with viral protein detection by immunohistochemistry in Hofbauer cells and some histiocytes in the intervillous spaces. We also demonstrated the neurotropism of the virus via the detection of viral proteins in glial cells and in some endothelial cells and the observation of scattered foci of microcalcifications in the brain tissues. Lesions were mainly located in the white matter. ZIKV RNA was also detected in these tissues by real-time-polymerase chain reaction. We believe that these findings will contribute to the body of knowledge of the mechanisms of ZIKV transmission, interactions between the virus and host cells and viral tropism.

Cuidados paliativo em crianças portadoras de malformações cerebrais

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Bioética, 2016.