Análise quantitativa e molecular de hemoglobina fetal em indivíduos da população brasileira

A hemoglobina fetal - Hb F, formada por duas cadeias gama e duas cadeias alfa, é característica do período fetal do desenvolvimento, tendo sua síntese diminuída no período pós-natal. em algumas alterações hereditárias, a Hb F permanece aumentada, como nas delta-beta talassemia, beta talassemia e persistência hereditária de Hb F (PHHF). A síntese da globina gama também pode ser estimulada por fatores externos como leucemias, transplantes de medula óssea, induções químicas, dentre outros. Através da observação de Hb F aumentada em doadores de sangue por procedimentos eletroforéticos objetivou-se avaliar a quantidade de Hb F em amostras de sangue de candidatos à doação, visando estabelecer seus limites de normalidade na população de São José do Rio Preto e região, por meio de desnaturação alcalina e cromatografia líquida de alta pressão (HPLC), comparar as metodologias aplicadas e, nos indivíduos com Hb F aumentada, realizar estudos moleculares para identificar as mutações que alteram a expressão dos genes gama. Foram analisadas 208 amostras de sangue, sendo 119 de candidatos à doação e 89 de indivíduos sem sintomas de anemia ou achados hematológicos e com Hb F aumentada como grupo comparativo. Das 119 amostras de candidatos à doação, 110 foram utilizadas para traçar o perfil de normalidade de Hb F, comparando-se as metodologias de desnaturação alcalina e HPLC, onde se obteve a média de 1,48% e de 0,6%, respectivamente. A análise estatística por regressão linear mostrou diferença significativa na comparação entre as duas metodologias aplicadas, sendo a HPLC mais precisa para a quantificação de Hb F. Foram observados nos testes de rastreamento de hemoglobinas anormais nestas 110 amostras de sangue: 16,4% de alfa talassemia, 0,9% com Hb F aumentada, 0,9% com beta talassemia e 0,9% com hemoglobina variante de cadeia delta. Os outros nove doadores de sangue apresentaram Hb F acima de 10% em eletroforese e observou-se média de 32,28% para desnaturação alcalina e de 26,4% para HPLC. As análises moleculares por PCR-ASO foram realizadas na tentativa de se identificar um defeito genético que pudesse explicar o aumento de Hb F, pelo rastreamento de 16 mutações que originam talassemias do tipo beta. Encontraram-se 5,3% de heterozigotos para mutação CD6-A e 1,75% para as mutações CD 39, IVS1:6, -87 e IVS2:654, todas em heterozigose. Os resultados encontrados neste estudo evidenciam a necessidade de melhor caracterização dos perfis de hemoglobina obtidos pelos métodos clássicos e a importância de sua caracterização molecular.

Caracterização de hemoglobina N-Baltimore em doador de sangue de São José do Rio Preto, SP

As alterações que envolvem as globinas devem-se a modificações em genes responsáveis pela seqüência e estrutura das cadeias polipeptídicas, bem como aos genes reguladores da síntese destas cadeias. Hemoglobinas variantes apresentam estrutura química diferente da hemoglobina normal correspondente, resultante de mutações em uma ou mais bases nitrogenadas, ocasionando a troca de aminoácidos nas globinas alfa, beta, delta ou gama. A hemoglobina N-Baltimore é uma variante de globina beta, com substituição da lisina, na posição 95, por ácido glutâmico, apresentando mobilidade eletroforética mais rápida que a hemoglobina A em pH alcalino. Nas análises eletroforéticas em pH alcalino realizadas em doadores de sangue do Hemocentro de São José do Rio Preto (SP) identificamos a presença de portador de hemoglobina rápida em heterozigose, posteriormente confirmada por focalização isoelétrica e cromatografia líquida de alta pressão (HPLC). Os estudos de hemoglobinas anormais em doadores de sangue permitem a identificação de variantes raras e possibilitam o aconselhamento genético adequado a cada caso com estudo familial.

Esterase profile in a pyrethroid-resistant Brazilian strain of the cattle tick Boophilus microplus (Acari, Ixodidae)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Association of matrix metalloproteinase-8 gene variation with breast cancer prognosis

Animal and cell studies indicate an inhibitory effect of matrix metalloproteinase-8 (MMP8) on tumorigenesis and metastasis. We investigated whether MMP8 gene variation was associated with breast cancer metastasis and prognosis in humans. We first studied nine tagging single nucleotide polymorphisms (SNP) in the MMP8 gene in 140 clinically and pathologically well-characterized breast cancer patients. Four of the SNPs were found to be associated with lymph node metastasis, the most pronounced being a promoter SNP (rs11225395) with its minor allele (T) associating with reduced susceptibility to lymph node metastasis (P = 0.02). This SNP was further evaluated for association with cancer relapse and survival among a cohort of similar to 1,100 breast cancer patients who had been followed for cancer recurrence and mortality for a median of 7.1 years. The T allele was associated with reduced cancer relapse and greater survival, particularly among patients with earlier stage cancer. Among patients of tumor-node-metastasis stage 0 to 11, the adjusted hazard ratio of disease-free survival was 0.7 [95% confidence interval (95% CI), 0.5-0.9] for patients carrying T allele compared with those homozygous for the C allele (P = 0.02). In vitro experiments showed that the T allele had higher promoter activity than the C allele in breast cancer cells. Electrophoretic mobility shift assays showed binding of nuclear proteins to the DNA sequence at the SNP site of the T allele but not that of the C allele. The data suggest that MMP8 gene variation may influence breast cancer prognosis and support the notion that MMP8 has an inhibitory effect on cancer metastasis.

Forward energy flow, central charged-particle multiplicities, and pseudorapidity gaps in W and Z boson events from pp collisions at root s=7 TeV

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

A systematic approach to identify STRE-binding proteins of the gsn glycogen synthase gene promoter in Neurospora crassa

The gene encoding glycogen synthase in Neurospora crassa (gsn) is transcriptionally down-regulated when mycelium is exposed to a heat shock from 30 to 45 degrees C. The gsn promoter has one stress response element (STRE) motif that is specifically bound by heat shock activated nuclear proteins. In this work, we used biochemical approaches together with mass spectrometric analysis to identify the proteins that bind to the STRE motif and could participate in the gsn transcription regulation during heat shock. Crude nuclear extract of heat-shocked mycelium was prepared and fractionated by affinity chromatography. The fractions exhibiting DNA-binding activity were identified by electrophoretic mobility shift assay (EMSA) using as probe a DNA fragment containing the STRE motif DNA-protein binding activity was confirmed by Southwestern analysis. The molecular mass (MM) of proteins was estimated by fractionating the crude nuclear extract by SDS-PAGE followed by EMSA analysis of the proteins corresponding to different MM intervals. Binding activity was detected at the 30-50 MM kDa interval. Fractionation of the crude nuclear proteins by IEF followed by EMSA analysis led to the identification of two active fractions belonging to the pIs intervals 3.54-4.08 and 6.77-7.31. The proteins comprising the MM and pI intervals previously identified were excised from a 2-DE gel, and subjected to mass spectrometric analysis (MALDI-TOF/TOF) after tryptic digestion. The proteins were identified by search against the MIPS and MIT N. crassa databases and five promising candidates were identified. Their structural characteristics and putative roles in the gsn transcription regulation are discussed.

Ferric iron uptake genes are differentially expressed in the presence of copper sulfides in Acidithiobacillus ferrooxidans strain LR

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

A Genome-wide Screen for Neurospora crassa Transcription Factors Regulating Glycogen Metabolism

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Colloidal particles: Spherical yttrium iron garnet

The purpose of this work is to obtain spherical particles YIG from micrometric to nanometric scales. The spherical particles were obtained from cation hydrolysis in acid medium by adding urea or ammonia in order to carry out a homogeneous nucleation process up to 90 degrees C. Different composition and morphology were achieved by changing reactant concentrations, precipitation agent and stabilizing agent. X-ray diffractometry, electrophoretic mobility, transmission and scanning electron microscopies were carried out on these particles to investigate the phase identification, mobility, morphology and particle size. Crystalline YIG, with spherical characteristics, was obtained. The surface potential presented different characteristics for different dispersion media.

Partículas nanométricas de ferritas de ítrio

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Thermal evaporation furnace with improved configuration for growing nanostructured inorganic materials

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Geranylation of benzoic acid derivatives by enzymatic extracts from Piper crassinervium (Piperaceae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Rastreamento de hemoglobinas variantes e talassemias com associação de métodos de diagnóstico

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Taxas de cruzamento em uma população natural de Cryptocarya Moschata Nees (Lauraceae)

O sistema de cruzamento da espécie arbórea de dossel da Mata Atlântica brasileira, Cryptocarya moschata, foi estudado a partir de material proveniente do Parque Estadual Carlos Botelho, São Miguel Arcanjo, São Paulo, Brasil. As taxas de cruzamento foram determinadas através de marcadores alozímicos obtidos de plântulas germinadas de coortes de sementes coletadas de 35 árvores. O valor médio da taxa de cruzamento de equilíbrio (estimador indireto) foi t^eq = 0.51. As estimativas das taxas de cruzamento uniloco e multilocos (estimadores diretos) foram t^s = 0.725± 0,041 e t^m = 0,884 ± 0,034, respectivamente, indicando um sistema de cruzamento predominantemente alogâmico. As taxas de cruzamento de árvores individuais variaram de 27 a 100 ( x¯ = 87,8) porcento, a partir de t^m calculado com as freqüências gênicas de pólen mantidas constantes ao nível populacional. A partir do modelo de par de irmãos (modelo de cruzamento correlacionado) de Ritland, a correlação entre duas progênies irmãs oriundas de autofecundação (r^s) e a correlação entre duas progênies irmãs oriundas de paternidade por exocruzamento (r^p) foram 35,7% e 99,0%, respectivamente. Esses resultados corroboram o fato de haver variação nas taxas de autocruzamento entre as diferentes árvores, podendo também indicar que quando há endogamia, a maior parte das sementes nas árvores são provavelmente irmãs-germanas.

Diagnóstico laboratorial de hemoglobinas semelhantes à HbS

A hemoglobina S (HbS) está presente na população brasileira com prevalência variável, dependente dos grupos raciais formadores de cada região. A migração eletroforética em pH alcalino apresenta similaridade com outras hemoglobinas, e estudos complementares para sua correta caracterização são necessários. No presente estudo objetivamos traçar um fluxograma com as metodologias disponíveis para a caracterização da hemoglobina S e das hemoglobinas que apresentam migração semelhante em pH alcalino. No período de janeiro a junho de 2000, analisamos amostras de sangue com suspeita de hemoglobina S encaminhadas ao Laboratório de Hemoglobinas da Unesp. Caracterizamos diferentes mutantes e formas interativas com hemoglobina S, por procedimentos eletroforéticos, em variados pH, análises citológicas e testes bioquímicos específicos. Os procedimentos de análise aplicados resultaram em orientação fornecida aos laboratórios de rotina sobre como proceder no diagnóstico laboratorial destas alterações de hemoglobina. Desta forma contribuímos para um melhor conhecimento sobre a variabilidade genética das hemoglobinas em nossa população, auxiliando no acompanhamento clínico e no aconselhamento genético das hemoglobinopatias com fisiopatologia relacionada à alteração.