Host determinants of HIV-1 control in African Americans.

We performed a whole-genome association study of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) set point among a cohort of African Americans (n = 515), and an intronic single-nucleotide polymorphism (SNP) in the HLA-B gene showed one of the strongest associations. We use a subset of patients to demonstrate that this SNP reflects the effect of the HLA-B*5703 allele, which shows a genome-wide statistically significant association with viral load set point (P = 5.6 x 10(-10)). These analyses therefore confirm a member of the HLA-B*57 group of alleles as the most important common variant that influences viral load variation in African Americans, which is consistent with what has been observed for individuals of European ancestry, among whom the most important common variant is HLA-B*5701.

Determinants of protection among HIV‐exposed seronegative persons: an overview.

Both clinical experience and a growing medical literature indicate that some persons who have been exposed to human immunodeficiency virus (HIV) infection remain uninfected. Although in some instances this may represent good fortune, cohorts of uninfected persons have been reported who are considered at high risk for infection. In these cohorts a variety of characteristics have been proposed as mediating protection, but to date only the 32–base pair deletion in the chemokine (C‐C motif) receptor 5 gene, which results in complete failure of cell surface expression of this coreceptor, has been associated with high‐level protection from HIV infection. With this in mind, there are probably many other factors that may individually or in combination provide some level of protection from acquisition of HIV infection. Because some of these factors are probably incompletely protective or inconsistently active, identifying them with confidence will be difficult. Nonetheless, clarifying the determinants of protection against HIV infection is a high priority that will require careful selection of high‐risk uninfected cohorts, who should undergo targeted studies of plausible mediators and broad screening for unexpected determinants of protection.

Environmental and genetic determinants of colony morphology in yeast.

Nutrient stresses trigger a variety of developmental switches in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae. One of the least understood of such responses is the development of complex colony morphology, characterized by intricate, organized, and strain-specific patterns of colony growth and architecture. The genetic bases of this phenotype and the key environmental signals involved in its induction have heretofore remained poorly understood. By surveying multiple strain backgrounds and a large number of growth conditions, we show that limitation for fermentable carbon sources coupled with a rich nitrogen source is the primary trigger for the colony morphology response in budding yeast. Using knockout mutants and transposon-mediated mutagenesis, we demonstrate that two key signaling networks regulating this response are the filamentous growth MAP kinase cascade and the Ras-cAMP-PKA pathway. We further show synergistic epistasis between Rim15, a kinase involved in integration of nutrient signals, and other genes in these pathways. Ploidy, mating-type, and genotype-by-environment interactions also appear to play a role in the controlling colony morphology. Our study highlights the high degree of network reuse in this model eukaryote; yeast use the same core signaling pathways in multiple contexts to integrate information about environmental and physiological states and generate diverse developmental outputs.

Multifactorial determinants of the neurocognitive effects of electroconvulsive therapy.

For many patients with neuropsychiatric illnesses, standard psychiatric treatments with mono or combination pharmacotherapy, psychotherapy, and transcranial magnetic stimulation are ineffective. For these patients with treatment-resistant neuropsychiatric illnesses, a main therapeutic option is electroconvulsive therapy (ECT). Decades of research have found ECT to be highly effective; however, it can also result in adverse neurocognitive effects. Specifically, ECT results in disorientation after each session, anterograde amnesia for recently learned information, and retrograde amnesia for previously learned information. Unfortunately, the neurocognitive effects and underlying mechanisms of action of ECT remain poorly understood. The purpose of this paper was to synthesize the multiple moderating and mediating factors that are thought to underlie the neurocognitive effects of ECT into a coherent model. Such factors include demographic and neuropsychological characteristics, neuropsychiatric symptoms, ECT technical parameters, and ECT-associated neurophysiological changes. Future research is warranted to evaluate and test this model, so that these findings may support the development of more refined clinical seizure therapy delivery approaches and efficacious cognitive remediation strategies to improve the use of this important and widely used intervention tool for neuropsychiatric diseases.

Live Imaging of Host-Parasite Interactions in a Zebrafish Infection Model Reveals Cryptococcal Determinants of Virulence and Central Nervous System Invasion.

UNLABELLED: The human fungal pathogen Cryptococcus neoformans is capable of infecting a broad range of hosts, from invertebrates like amoebas and nematodes to standard vertebrate models such as mice and rabbits. Here we have taken advantage of a zebrafish model to investigate host-pathogen interactions of Cryptococcus with the zebrafish innate immune system, which shares a highly conserved framework with that of mammals. Through live-imaging observations and genetic knockdown, we establish that macrophages are the primary immune cells responsible for responding to and containing acute cryptococcal infections. By interrogating survival and cryptococcal burden following infection with a panel of Cryptococcus mutants, we find that virulence factors initially identified as important in causing disease in mice are also necessary for pathogenesis in zebrafish larvae. Live imaging of the cranial blood vessels of infected larvae reveals that C. neoformans is able to penetrate the zebrafish brain following intravenous infection. By studying a C. neoformans FNX1 gene mutant, we find that blood-brain barrier invasion is dependent on a known cryptococcal invasion-promoting pathway previously identified in a murine model of central nervous system invasion. The zebrafish-C. neoformans platform provides a visually and genetically accessible vertebrate model system for cryptococcal pathogenesis with many of the advantages of small invertebrates. This model is well suited for higher-throughput screening of mutants, mechanistic dissection of cryptococcal pathogenesis in live animals, and use in the evaluation of therapeutic agents. IMPORTANCE: Cryptococcus neoformans is an important opportunistic pathogen that is estimated to be responsible for more than 600,000 deaths worldwide annually. Existing mammalian models of cryptococcal pathogenesis are costly, and the analysis of important pathogenic processes such as meningitis is laborious and remains a challenge to visualize. Conversely, although invertebrate models of cryptococcal infection allow high-throughput assays, they fail to replicate the anatomical complexity found in vertebrates and, specifically, cryptococcal stages of disease. Here we have utilized larval zebrafish as a platform that overcomes many of these limitations. We demonstrate that the pathogenesis of C. neoformans infection in zebrafish involves factors identical to those in mammalian and invertebrate infections. We then utilize the live-imaging capacity of zebrafish larvae to follow the progression of cryptococcal infection in real time and establish a relevant model of the critical central nervous system infection phase of disease in a nonmammalian model.

Multifactorial determinants of the neurocognitive effects of electroconvulsive therapy

For many patients with neuropsychiatric illnesses, standard psychiatric treatments with mono or combination pharmacotherapy, psychotherapy, and transcranial magnetic stimulation are ineffective. For these patients with treatment-resistant neuropsychiatric illnesses, a main therapeutic option is electroconvulsive therapy (ECT). Decades of research have found ECT to be highly effective; however, it can also result in adverse neurocognitive effects. Specifically, ECT results in disorientation after each session, anterograde amnesia for recently learned information, and retrograde amnesia for previously learned information. Unfortunately, the neurocognitive effects and underlying mechanisms of action of ECT remain poorly understood. The purpose of this paper was to synthesize the multiple moderating and mediating factors that are thought to underlie the neurocognitive effects of ECT into a coherent model. Such factors include demographic and neuropsychological characteristics, neuropsychiatric symptoms, ECT technical parameters, and ECT-associated neurophysiological changes. Future research is warranted to evaluate and test this model, so that these findings may support the development of more refined clinical seizure therapy delivery approaches and efficacious cognitive remediation strategies to improve the use of this important and widely used intervention tool for neuropsychiatric diseases. Copyright © 2014 by Lippincott Williams & Wilkins.

El ambiente lumínico en plantaciones intensivas de olivo (Olea europaea L.) y su efecto sobre los determinantes y componentes del rendimiento en aceite

Maximizar la productividad en las plantaciones densas de olivo requiere de un manejo apropiado de la iluminación del canopeo. Pero el limitado conocimiento acerca de la respuesta del rendimiento a la radiación fotosintéticamente activa (PAR) dificulta su logro. Además, los periodos potencialmente críticos, donde el rendimiento sería sensible al sombreado, y el efecto de la poda sobre la respuesta a la PAR, han sido escasamente estudiados. Esta tesis se centró sobre las relaciones entre los determinantes y componentes del rendimiento, y la PAR, utilizando dos aproximaciones. En primer lugar, se caracterizó el ambiente lumínico en distintas posiciones de un seto en dos estaciones de crecimiento y se estableció su relación con los determinantes y componentes del rendimiento. Las yemas axilares e inflorescencias respondieron bilinealmente a la PAR aunque la poda alteró esta respuesta. El peso seco del fruto y la concentración de aceite respondieron linealmente a la irradiancia. En segundo lugar, se manipuló directamente el nivel de PAR (3 a 70 de PAR incidente) con redes mediasombra en árboles semi-aislados, focalizando las mediciones en una posición externa de la copa. Combinando ambos enfoques, se contrastaron las funciones de respuestas derivadas de distintas posiciones en el seto (primera aproximación) con aquellas obtenidas en una posición externa de la copa (segunda aproximación). Utilizando la segunda aproximación se demostró que la inducción floral, el cuaje y llenado del fruto son periodos críticos para el rendimiento bajo PAR limitante. También fue posible establecer que los frutos evidenciaron una mejor capacidad de recuperación después de retirar los tratamientos, cuando el periodo de post-sombreo precedió y/o aconteció durante la división celular del fruto. La información aquí generada podría mejorar el modelado de la estructura óptima del canopeo, que asegura una óptima intercepción de la PAR y un alto rendimiento.

La lixiviación de nitratos en la Región Pampeana : análisis de procesos y factores determinantes

La fertilización nitrogenada es esencial para satisfacer la demanda global de alimentos, pero es uno de los principales causantes de contaminación de acuíferos subterráneos con nitratos a nivel mundial y nacional. El objetivo de esta tesis fue determinar los principales factores condicionantes de la distribución y lixiviación de nitratos en suelos de la Pampa Ondulada y analizar los destinos del nitrógeno (N) de los fertilizantes. Se determinó a campo el contenido de nitratos en suelos en diferentes situaciones productivas y se realizaron experimentos a campo e invernáculo con fertilizantes marcados isotópicamente (15N) para evaluar los destinos del mismo. Se utilizó el modelo NLEAP para simular la acumulación y lixiviación de nitratos en diferentes suelos. La precipitación pluvial fue el principal factor que determinó la lixiviación de nitratos en maíz, regulando la absorción de N por el cultivo y su desplazamiento vertical. La dinámica de los nitratos presentó pulsos de acumulación en el perfil o salida del mismo, cuando las precipitaciones fueron escasas o elevadas, respectivamente. La materia orgánica del suelo fue el principal destino del fertilizante ante un estrés hídrico en maíz, seguido por su acumulación en las plantas. Lo inverso ocurrió cuando no existió estrés hídrico. El N lixiviado, derivado del fertilizante aplicado en una determinada campaña agrícola fue mínimo, en relación a las pérdidas del N de fuentes preexistente en el suelo. Los Argiudoles (texturas más finas) fueron más susceptibles a sufrir pérdidas por lixiviación que los Hapludoles (texturas más gruesas). De acuerdo con el modelo utilizado, el período crítico para la ocurrencia de lixiviación de nitratos fue entre dos cultivos de verano. La inclusión de un cultivo de cobertura en dicho período redujo las pérdidas por lixiviación, incrementando la disponibilidad de N para un cultivo posterior. La retención del N del fertilizante en los residuos del cultivo de cobertura y en la materia orgánica del suelo podría atenuar la lixiviación de nitratos sólo en un corto plazo. El modelo de simulación utilizado fue apto para estimar situaciones de pérdidas de N, cuando las dosis de fertilización fueron las normales en la región.

Análisis genético de la respuesta de los caracteres ecofisiológicos determinantes del rendimiento en grano a la disponibilidad de nitrógeno en maíz (Zea mays L.)

Un entendimiento del tipo de control genético subyacente a la expresión del rendimiento en grano por planta (RGP) en híbridos de maíz (Zea mays L.) cultivados en condiciones de baja disponibilidad de nitrógeno (N) es crucial para la selección y el desarrollo de genotipos más eficientes en el uso de N. El objetivo de esta tesis fue el estudio de los componentes de la variabilidad genética para componentes numéricos y ecofisiológicos del RGP con atención especial a la expresión de heterosis, tipo de acción génica, y sus interacciones con el ambiente. El estudio consistió de un dialélico completo conducido en condiciones contrastantes de N y disponibilidad de agua para evaluar 25 atributos ecofisiológicos de 6 lineas endocriadas y todos los posibles híbridos simples. Los resultados permitieron (i) demostrar una disminución de la expresión de heterosis en condiciones de restricciones abióticas con efecto predominante sobre la expansión de tejidos, tal como estrés de N o hídrico durante el periodo de crecimiento vegetativo previo a floración; (ii) identificar atributos ecofisiológicos asociados con heterosis para RGP en condiciones de baja pero no de alta disponibilidad de N (i.e. peso grano); (iii) modelar la respuesta de heterosis para RGP a índice ambiental como una relación linear-plateau, identificando un valor umbral por sobre el cual no se observa incremento de heterosis para RGP; (iv) determinar la magnitud y tipo de acción génica de caracteres ecofisiológicos, identificando a la tasa de crecimiento de la espiga durante el periodo crítico como un carácter secundario promisorio dado su fuerte control genético aditivo y asociación con el RGP, así como el índice de área foliar a madurez fisiológica y el peso de grano en condiciones de baja disponibilidad de N. La integración de un modelo genético y ecofisiológico con la finalidad de explorar las relaciones genotipo a fenotipo utilizando los paisajes de adaptación sugiere que atributos tales como la tasa de removilización de N foliar y el N foliar específico podrían ser útiles para la identificación de loci importantes para el control de caracteres cuantitativos en condiciones de baja disponibilidad de N.

El ambiente lumínico en plantaciones intensivas de olivo (Olea europaea L.)y su efecto sobre los determinantes y componentes del rendimiento en aceite

Maximizar la productividad en las plantaciones densas de olivo requiere de un manejo apropiado de la iluminación del canopeo. Pero el limitado conocimiento acerca de la respuesta del rendimiento a la radiación fotosintéticamente activa (PAR)dificulta su logro. Además, los periodos potencialmente críticos, donde el rendimiento sería sensible al sombreado, y el efecto de la poda sobre la respuesta a la PAR, han sido escasamente estudiados. Esta tesis se centró sobre las relaciones entre los determinantes y componentes del rendimiento, y la PAR, utilizando dos aproximaciones. En primer lugar, se caracterizó el ambiente lumínico en distintas posiciones de un seto en dos estaciones de crecimiento y se estableció su relación con los determinantes y componentes del rendimiento. Las yemas axilares e inflorescencias respondieron bilinealmente a la PAR aunque la poda alteró esta respuesta. El peso seco del fruto y la concentración de aceite respondieron linealmente a la irradiancia. En segundo lugar, se manipuló directamente el nivel de PAR (3 a 70 de PAR incidente)con redes mediasombra en árboles semi-aislados, focalizando las mediciones en una posición externa de la copa. Combinando ambos enfoques, se contrastaron las funciones de respuestas derivadas de distintas posiciones en el seto (primera aproximación)con aquellas obtenidas en una posición externa de la copa (segunda aproximación). Utilizando la segunda aproximación se demostró que la inducción floral, el cuaje y llenado del fruto son periodos críticos para el rendimiento bajo PAR limitante. También fue posible establecer que los frutos evidenciaron una mejor capacidad de recuperación después de retirar los tratamientos, cuando el periodo de post-sombreo precedió y/o aconteció durante la división celular del fruto. La información aquí generada podría mejorar el modelado de la estructura óptima del canopeo, que asegura una óptima intercepción de la PAR y un alto rendimiento.

The determinants of business performance of estate agency in England and Wales

Purpose: This paper seeks to investigate the factors influencing the business performance of estate agency in England and Wales. Design/methodology/approach: The paper investigates the effect of housing market, company size and pricing policy on business performance in the estate agency sector in England and Wales. The analysis uses the survey data of Woolwich Cost of Moving Survey (a survey of transactions costs sponsored by the Woolwich/Barclays Bank) from 2003 to 2005 to test the hypothesis that the business performance of estate agency is affected by industry characteristics and firm factors. Findings: The empirical analysis indicates that the business performance of estate agency is subject to market environment volatility such as market uncertainty, housing market liquidity and house price changes. The firm factors such as firm size and the level of agency fee have no explanatory power in explaining business performance. The level of agency fee is positively associated with firm size, market environment and liquidity. Research limitations/implications: The research is limited to the data received and is based on a research project on transaction costs designed prior to this analysis. Originality/value: There is little other research that investigates the factors determining the business performance of estate agency, using consecutive data of three years across England and Wales. The findings are useful for practitioners and/or managers to allocate resources and adjust their business strategy to enhance business performance in the estate agency sector.

Biologging, Remotely-Sensed Oceanography and the Continuous Plankton Recorder Reveal the Environmental Determinants of a Seabird Wintering Hotspot

Marine environments are greatly affected by climate change, and understanding how this perturbation affects marine vertebrates is a major issue. In this context, it is essential to identify the environmental drivers of animal distribution. Here, we focused on the little auk (Alle alle), one of the world’s most numerous seabirds and a major component in Arctic food webs. Using a multidisciplinary approach, we show how little auks adopt specific migratory strategies and balance environmental constraints to optimize their energy budgets. Miniature electronic loggers indicate that after breeding, birds from East Greenland migrate .2000 km to overwinter in a restricted area off Newfoundland. Synoptic data available from the Continuous Plankton Recorder (CPR) indicate that this region harbours some of the highest densities of the copepod Calanus finmarchicus found in the North Atlantic during winter. Examination of large-scale climatic and oceanographic data suggests that little auks favour patches of high copepod abundance in areas where air temperature ranges from 0uC to 5uC. These results greatly advance our understanding of animal responses to extreme environmental constraints, and highlight that information on habitat preference is key to identifying critical areas for marine conservation.