Instrument for testing the impact response of different materials. Application to apples and pears

Based on two research projects, a device for testing the response to-impact of fruits and related materials has been designed and tested during the last three years. As it is not related directly to potatoes, this contribution focuses mainly on the principles of impact and static loading and on the description of the device, and the type of results obtained up to now in different fruits.

The TRANSPLANTA collection of Arabidopsis lines: a resource for functional analysis of transcription factors based on their conditional overexpression.

Los factores de transcripción (FTs) son reguladores clave de la expresión génica en todos los organismos. En eucariotas los FTs con frecuencia están representados por miembros funcionalmente redundantes de familias génicas de gran tamaño. La sobreexpresión de FTs puede representar una herramienta para revelar las funciones biológicas de FTs redundantes en plantas; sin embargo, la sobreexpresión constitutiva de FTs con frecuencia conlleva diversos defectos en el desarrollo, impidiendo su caracterización funcional. Sin embargo, aproximaciones de sobreexpresión condicional podrían ayudar a solventar este problema. En el consorcio TRANSPLANTA, en el que participan varios laboratorios del CBGP, hemos generado una colección de líneas transgénicas de Arabidopsis, cada una de las cuales expresa un FT bajo el control de un promotor inducible por ?estradiol. Hasta el momento se han generado 1636 líneas homocigotas independientes que corresponden a 634 FTs diferentes, lo que representa una media de 2,6 líneas por cada FT. Como confirmación de la utilidad de esta herramienta, el tratamiento con ?estradiol de líneas que expresaban condicionalmente FTs provoca alteraciones fenotípicas tales como proliferación de pelos radiculares, senescencia inducida por oscuridad, acumulación de antocianinas y enanismo, y que corroboran fenotipos previamente descritos debidos a la sobreexpresión de dichos FTs. Rastreos realizados posteriormente con otras líneas TRANSPLANTA han permitido la identificación de FTs implicados en diferentes procesos biológicos de plantas, confirmando que la colección es una herramienta valiosa para la caracterización funcional de FTs. Las semillas de las líneas TRANSPLANTA han sido depositadas en el Nottingham Arabidopsis Stock Centre para su distribución posterior.

William Pultney, earl of bath [Material gráfico] : in the collection of Lord Northnick

Resumen: Descripción: retrato de 3/4 de William Pultney sentado y de perfil

The TRANSPLANTA collection of Arabidopsis lines: a resource for functional analysis of transcription factors based on their conditional over-expression

Transcription factors (TFs) are key regulators of gene expression in all organisms. In eukaryotes, TFs are often represented by functionally redundant members of large gene families. Overexpression might prove a means to unveil the biological functions of redundant TFs; however, constitutive overexpression of TFs frequently causes severe developmental defects, preventing their functional characterization. Conditional overexpression strategies help to overcome this problem. Here, we report on the TRANSPLANTA collection of Arabidopsis lines, each expressing one of 949 TFs under the control of a β–estradiol-inducible promoter. Thus far, 1636 independent homozygous lines, representing an average of 2.6 lines for every TF, have been produced for the inducible expression of 634 TFs. Along with a GUS-GFP reporter, randomly selected TRANSPLANTA lines were tested and confirmed for conditional transgene expression upon β–estradiol treatment. As a proof of concept for the exploitation of this resource, β–estradiol-induced proliferation of root hairs, dark-induced senescence, anthocyanin accumulation and dwarfism were observed in lines conditionally expressing full-length cDNAs encoding RHD6, WRKY22, MYB123/TT2 and MYB26, respectively, in agreement with previously reported phenotypes conferred by these TFs. Further screening performed with other TRANSPLANTA lines allowed the identification of TFs involved in different plant biological processes, illustrating that the collection is a powerful resource for the functional characterization of TFs. For instance, ANAC058 and a TINY/AP2 TF were identified as modulators of ABA-mediated germination potential, and RAP2.10/DEAR4 was identified as a regulator of cell death in the hypocotyl–root transition zone. Seeds of TRANSPLANTA lines have been deposited at the Nottingham Arabidopsis Stock Centre for further distribution.

Determining the elastic-plastic properties of metallic materials through instrumented indentation

En los últimos años, y asociado al desarrollo de la tecnología MEMS, la técnica de indentación instrumentada se ha convertido en un método de ensayo no destructivo ampliamente utilizado para hallar las características elástico-plásticas de recubrimientos y capas delgadas, desde la escala macroscópica a la microscópica. Sin embargo, debido al complejo mecanismo de contacto debajo de la indentación, es urgente proponer un método más simple y conveniente para obtener unos resultados comparables con otras mediciones tradicionales. En este estudio, el objetivo es mejorar el procedimiento analítico para extraer las propiedades elástico-plásticas del material mediante la técnica de indentación instrumentada. La primera parte se centra en la metodología llevada a cabo para medir las propiedades elásticas de los materiales elásticos, presentándose una nueva metodología de indentación, basada en la evolución de la rigidez de contacto y en la curva fuerza-desplazamiento del ensayo de indentación. El método propuesto permite discriminar los valores de indentación experimental que pudieran estar afectados por el redondeo de la punta del indentador. Además, esta técnica parece ser robusta y permite obtener valores fiables del modulo elástico. La segunda parte se centra en el proceso analítico para determinar la curva tensión-deformación a partir del ensayo de indentación, empleando un indentador esférico. Para poder asemejar la curva tension-deformación de indentación con la que se obtendría de un ensayo de tracción, Tabor determinó empíricamente un factor de constricción de la tensión () y un factor de constricción de la deformación (). Sin embargo, la elección del valor de y  necesitan una derivación analítica. Se describió analíticamente una nueva visión de la relación entre los factores de constricción de tensión y la deformación basado en la deducción de la ecuación de Tabor. Un modelo de elementos finitos y un diseño experimental se realizan para evaluar estos factores de constricción. A partir de los resultados obtenidos, las curvas tension-deformación extraidas de los ensayos de indentación esférica, afectadas por los correspondientes factores de constricción de tension y deformación, se ajustaron a la curva nominal tensión-deformación obtenida de ensayos de tracción convencionales. En la última parte, se estudian las propiedades del revestimiento de cermet Inconel 625-Cr3C2 que es depositado en el medio de una aleación de acero mediante un láser. Las propiedades mecánicas de la matriz de cermet son estudiadas mediante la técnica de indentación instrumentada, haciendo uso de las metodologías propuestas en el presente trabajo. In recent years, along with the development of MEMS technology, instrumented indentation, as one type of a non-destructive measurement technique, is widely used to characterize the elastic and plastic properties of metallic materials from the macro to the micro scale. However, due to the complex contact mechanisms under the indentation tip, it is necessary to propose a more convenient and simple method of instrumented indention to obtain comparable results from other conventional measurements. In this study, the aim is to improve the analytical procedure for extracting the elastic plastic properties of metallic materials by instrumented indentation. The first part focuses on the methodology for measuring the elastic properties of metallic materials. An alternative instrumented indentation methodology is presented. Based on the evolution of the contact stiffness and indentation load versus the depth of penetration, the possibility of obtaining the actual elastic modulus of an elastic-plastic bulk material through instrumented sharp indentation tests has been explored. The proposed methodology allows correcting the effect of the rounding of the indenter tip on the experimental indentation data. Additionally, this technique does not seem too sensitive to the pile-up phenomenon and allows obtaining convincing values of the elastic modulus. In the second part, an analytical procedure is proposed to determine the representative stress-strain curve from the spherical indentation. Tabor has determined the stress constraint factor (stress CF), and strain constraint factor (strain CF), empirically but the choice of a value for and is debatable and lacks analytical derivation. A new insight into the relationship between stress and strain constraint factors is analytically described based on the formulation of Tabor’s equation. Finite element model and experimental tests have been carried out to evaluate these constraint factors. From the results, representative stress-strain curves using the proposed strain constraint factor fit better with the nominal stress-strain curve than those using Tabor’s constraint factors. In the last part, the mechanical properties of an Inconel 625-Cr3C2 cermet coating which is deposited onto a medium alloy steel by laser cladding has been studied. The elastic and plastic mechanical properties of the cermet matrix are studied using depth-sensing indentation (DSI) on the micro scale.

The SBASE protein domain library, release 8.0: a collection of annotated protein sequence segments

SBASE 8.0 is the eighth release of the SBASE library of protein domain sequences that contains 294 898 annotated structural, functional, ligand-binding and topogenic segments of proteins, cross-referenced to most major sequence databases and sequence pattern collections. The entries are clustered into over 2005 statistically validated domain groups (SBASE-A) and 595 non-validated groups (SBASE-B), provided with several WWW-based search and browsing facilities for online use. A domain-search facility was developed, based on non-parametric pattern recognition methods, including artificial neural networks. SBASE 8.0 is freely available by anonymous ‘ftp’ file transfer from ftp.icgeb.trieste.it. Automated searching of SBASE can be carried out with the WWW servers http://www.icgeb.trieste.it/sbase/ and http://sbase.abc.hu/sbase/.