From molecules to organs : Microscopy and multi-scale nature of development

Morphogenesis is a phenomenon of intricate balance and dynamic interplay between processes occurring at a wide range of scales (spatial, temporal and energetic). During development, a variety of physical mechanisms are employed by tissues to simultaneously pattern, move, and differentiate based on information exchange between constituent cells, perhaps more than at any other time during an organism's life. To fully understand such events, a combined theoretical and experimental framework is required to assist in deciphering the correlations at both structural and functional levels at scales that include the intracellular and tissue levels as well as organs and organ systems. Microscopy, especially diffraction-limited light microscopy, has emerged as a central tool to capture the spatio-temporal context of life processes. Imaging has the unique advantage of watching biological events as they unfold over time at single-cell resolution in the intact animal. In this work I present a range of problems in morphogenesis, each unique in its requirements for novel quantitative imaging both in terms of the technique and analysis. Understanding the molecular basis for a developmental process involves investigating how genes and their products- mRNA and proteins-function in the context of a cell. Structural information holds the key to insights into mechanisms and imaging fixed specimens paves the first step towards deciphering gene function. The work presented in this thesis starts with the demonstration that the fluorescent signal from the challenging environment of whole-mount imaging, obtained by in situ hybridization chain reaction (HCR), scales linearly with the number of copies of target mRNA to provide quantitative sub-cellular mapping of mRNA expression within intact vertebrate embryos. The work then progresses to address aspects of imaging live embryonic development in a number of species. While processes such as avian cartilage growth require high spatial resolution and lower time resolution, dynamic events during zebrafish somitogenesis require higher time resolution to capture the protein localization as the somites mature. The requirements on imaging are even more stringent in case of the embryonic zebrafish heart that beats with a frequency of ~ 2-2.5 Hz, thereby requiring very fast imaging techniques based on two-photon light sheet microscope to capture its dynamics. In each of the hitherto-mentioned cases, ranging from the level of molecules to organs, an imaging framework is developed, both in terms of technique and analysis to allow quantitative assessment of the process in vivo. Overall the work presented in this thesis combines new quantitative tools with novel microscopy for the precise understanding of processes in embryonic development.

Comparison of permanent and temporary streams of calcareous Provence [Translation from: Annales de Limnologie 9(3) 273-292, 1973]

The rainfall regime and the karstic nature of the subsoil determines the alternation of a period of flow and a period of drought for a large number of Mediterranean streams. Amongst this type of stream it is possible to distinguish temporary streams, characterised by a period of flow for several months permitting the establishment of the principal groups of aquatic insects; and ephemeral streams whose very brief period of flow permits the establishment of a community reduced to a few species of Diptera. This paper aims to study the structure of the communities which colonise this particular type of stream and the ecology of the principal species which constitute these communities. Four French temporary streams were examined and temperature regimes, dissolved oxygen, calcium and magnesium measured. Samples of fauna were taken regularly and the biotic composition established. The analysis of similarities between the three permanent streams are discussed and compared with permanent streams.

Nature of the radical intermediates in a substituted cyclopropylcarbiny-allylcarbinyl system

We have sought to determine the nature of the free-radical precursors to ring-opened hydrocarbon 5 and ring-closed hydrocarbon 6. Reasonable alternative formulations involve the postulation of hydrogen abstraction (a) by a pair of rapidly equilibrating classical radicals (the ring-opened allylcarbinyl-type radical 3 and the ring-closed cyclopropylcarbinyl-type 4), or (b) by a nonclassical radical such as homoallylic radical 7.

[Figure not reproduced.]

Entry to the radical system is gained via degassed thermal decomposition of peresters having the ring-opened and the ring-closed structures. The ratio of 6:5 is essentially independent of the hydrogen donor concentration for decomposition of the former at 125° in the presence of triethyltin hydrdride. A deuterium labeling study showed that the α and β methylene groups in 3 (or the equivalent) are rapidly interchanged under these conditions.

Existence of two (or more) product-forming intermediates is indicated (a) by dependence of the ratio 6:5 on the tin hydride concentration for decomposition of the ring-closed perester at 10 and 35°, and (b) by formation of cage products having largely or wholly the structure (ring-opened or ring-closed) of the starting perester.

Relative rates of hydrogen abstraction by 3 could be inferred by comparison of ratios of rate constants for hydrogen abstraction and ortho-ring cyclization:

[Figure not reproduced.]

At 100° values of k_a/k_r are 0.14 for hydrogen abstraction from 1,4-cyclohexadiene and 7 for abstraction from triethyltin hydride. The ratio 6:5 at the same temperature is ~0.0035 for hydrogen abstraction from 1,4-cyclohexadiene, ~0.078 for abstraction from the tin hydride, and ≥ 5 for abstraction from cyclohexadienyl radicals. These data indicate that abstraction of hydrogen from triethyltin hydride is more rapid than from 1,4-cyclohexadiene by a factor of ~1000 for 4, but only ~50 for 3.

Measurements of product ratios at several temperatures allowed the construction of an approximate energy-level scheme. A major inference is that isomerization of 3 to 4 is exothermic by 8 ± 3 kcal/mole, in good agreement with expectations based on bond dissociation energies. Absolute rate-constant estimates are also given.

The results are nicely compatible with a classical-radical mechanism, but attempted interpretation in terms of a nonclassical radical precursor of product ratios formed even from equilibrated radical intermediates leads, it is argued, to serious difficulties.

The roles played by hydrogen abstraction from 1,4,-cyclohexadiene and from the derived cyclohexadienyl radicals were probed by fitting observed ratios of 6:5 and 5:10 in the sense of least-squares to expressions derived for a complex mechanistic scheme. Some 30 to 40 measurements on each product ratio, obtained under a variety of experimental conditions, could be fit with an average deviation of ~6%. Significant systematic deviations were found, but these could largely be redressed by assuming (a) that the rate constant for reaction of 4 with cyclohexadienyl radical is inversely proportional to the viscosity of the medium (i.e., is diffusion-controlled), and (b) that k_a/k_r for hydrogen abstraction from 1,4-cyclohexadiene depends slightly on the composition of the medium. An average deviation of 4.4% was thereby attained.

Degassed thermal decomposition of the ring-opened perester in the presence of the triethyltin hydride occurs primarily by attack on perester of triethyltin radicals, presumably at the –O-O- bond, even at 0.01 M tin hydride at 100 and 125°. Tin ester and tin ether are apparently formed in closely similar amounts under these conditions, but the tin ester predominates at room temperature in the companion air-induced decomposition, indicating that attack on perester to give the tin ether requires an activation energy approximately 5 kcal/mole in excess of that for the formation of tin ester.

I. The effect of N,N,N',N' -tetramethylethylenediamine on the Schlenk Equilibrium. II. The nature of the Di-Grignard reagent

I. The influence of N,N,N’,N’-tetramethylethylenediamine on the Schlenk equilibrium

The equilibrium between ethylmagnesium bromide, diethylmagnesium, and magnesium bromide has been studied by nuclear magnetic resonance spectroscopy. The interconversion of the species is very fast on the nmr time scale, and only an averaged spectrum is observed for the ethyl species. When N,N,N’,N’-tetramethylethylenediamine is added to solutions of these reagents in tetrahydrofuran, the rate of interconversion is reduced. At temperatures near -50°, two ethylmagnesium species have been observed. These are attributed to the different ethyl groups in ethylmagnesium bromide and diethylmagnesium, two of the species involved in the Schlenk equilibrium of Grignard reagents.

II. The nature of di-Grignard reagents

Di-Grignard reagents have been examined by nuclear magnetic resonance spectroscopy in an attempt to prove that dialkylmagnesium reagents are in equilibrium with alkylmagnesium halides. The di-Grignard reagents of compounds such as 1,4-dibromobutane have been investigated. The dialkylmagnesium form of this di-Grignard reagent can exist as an intramolecular cyclic species, tetramethylene-magnesium. This cyclic form would give an nmr spectrum different from that of the classical alkylmagnesium halide di-Grignard reagent. In dimethyl ether-tetrahydrofuran solutions of di-Grignard reagents containing N N,N,N’,N’-Tetramethylethylenediamine, evidence has been found for the existence of an intramolecular dialkylmagnesium species. This species is rapidly equilibrating with other forms, but at low temperatures, the rates of interconversion are reduced. Two species can be seen in the nmr spectrum at -50°. One is the cyclic species; the other is an open form.

Inversion of the carbon at the carbon-magnesium bond in di-Grignard reagents has also been studied. This process is much faster than in corresponding monofunctional Grignard reagents.

A eloquência do mundo: a heteronímia como potência retórica impessoal

A partir da suspeita de que o pensamento e sua expressão não se limitam a uma única forma, o presente trabalho investiga de que modo podemos pensar, a partir de Fernando Pessoa, uma relação possível entre filosofia e literatura. Quais os pressupostos que permitem considerar o fenômeno heteronímico pessoano como um expediente trágico que diz respeito ao próprio pensamento, ou ainda, como entrever, no projeto pessoano, o lugar de embate trágico, por excelência entre aquilo que somos, enquanto sujeitos, e os processos que franqueiam à escrita a constituição de uma subjetividade outra? Desdobrada em heterônimos, a obra de Pessoa comportaria em si a justaposição de formas diversas de ver e compreender o mundo, mas o processo pelo qual este desdobramento se dá poderia ser tomado como anterior às formas constituídas das personalidades particulares, apresentando-se como uma disposição anti-dialética do pensamento. Privilegiando como ponto de partida os escritos do heterônimo louco e filósofo de Fernando Pessoa, António Mora, nosso intuito é analisar de que modo sua crítica à tradição metafísica ocidental, em ressonância com a filosofia francesa contemporânea de inspiração nietzschiana, pode se constituir como um intercessor capaz de dar a ver uma potência impessoal atuando entre a filosofia e a literatura, representada pelo verso de Alberto Caeiro: a natureza é partes sem um todo"

Why brush up your Shakespeare and your theory?: an Angela Carter companion to myths

Essa dissertação visa estudar a formação do que veio a ser conhecido como o mito Shakespeariano e sua relação com a produção literária contemporânea, exemplificada pelo romance Wise Children, da romancista inglesa Angela Carter. Tal objetivo pretende ser alcançado por meio uma revisão teórica de elementos relacionados à concepção de mito desenvolvida pelo filósofo francês Roland Barthes, tais quais a concepção tradicional de mito, o Estruturalismo, o Pós-estruturalismo, a crítica ideológica marxista e os Estudos Culturais. Um estudo dos processos históricos que deram origem ao e ajudaram a propagar o mito Shakespeariano também é levado a cabo nessa dissertação: a apropriação da figura e da obra de William Shakespeare feita pelos pré-românticos e pelos românticos em geral; a associação da figura de Shakespeare com a identidade nacional do Império Britânico; o advento da industria Shakespeariana e o papel das adaptações das peças de Shakespeare na propagação do mito Shakespeariano

Monica Alis Brick Lane: A tale of two cities or How Nazneen left her fate

O objetivo desta dissertação é analisar o romance Brick Lane (2003), da escritora Monica Ali, focalizando o processo de empoderamento da protagonista Nazneen. Usando os conceitos de lugar e não-lugar propostos por Marc Augé, pretendo examinar passagens do romance que caracterizem a sensação de não-pertencimento vivida pela personagem. Nazneen recorre às memórias de sua infância com a irmã Hasina em Bangladesh para tentar se distanciar do espaço físico de Brick Lane (a comunidade onde reside em Londres), que se constitui em um não-lugar, pois ali não é possível reconstruir sua identidade fragmentada pelo deslocamento de uma cultura para outra. Considerando aspectos históricos e culturais de Bangladesh, terra natal de Nazneen, este trabalho pretende discutir as experiências da protagonista e de outros sujeitos diaspóricos do romance, além de analisar o papel crucial que Hasina (e suas cartas) desempenham na narrativa. O atual contexto multicultural e cosmopolita da cidade de Londres também será investigado, com a discussão de situações que afetam os imigrantes e suas representações no romance. Esta dissertação também considera o caráter gendrado dos movimentos migratórios contemporâneos que possibilitam novas perspectivas acerca das consequências da diáspora. A análise de passagens selecionadas do romance ratifica o processo gradual de autonomia de Nazneen que, por fim, consegue se sentir em casa novamente

The microbiological quality of water: the nature of the problem

Improvements in methods for the detection and enumeration of microbes in water, particularly the application of techniques of molecular biology, have highlighted shortcomings in the ”standard methods” for assessing water quality. Higher expectations from the consumer and increased publicity associated with pollution incidents can lead to an uncoupling of the cycle which links methodological development with standard-setting and legislation. The new methodology has also highlighted problems within the water cycle, related to the introduction, growth and metabolism of microbes. A greater understanding of the true diversity of the microbial community and the ability to transmit genetic information within aquatic systems ensures that the subject of this symposium and volume provides an ideal forum to discuss the problems encountered by both researcher and practitioner.

Of angels and demons: Virginia Woolfs homicidal legacy in Sylvia Plaths: The bell jar.

Esta dissertação é um estudo comparativo do legado vitoriano deixado para as escritoras do século XX, Virginia Woolf e Sylvia Plath. Primeiro discutem-se as agências controladoras do corpo feminino na era vitoriana e a formação de um ideal de feminilidade que chamamos de Anjo do Lar. Em seguida, discute-se como Virginia Woolf apreende essa imagem e a subverte, criando seu duplo, que chamamos de Demônio do Lar. Por fim, promovemos o diálogo entre Sylvia Plath e Virginia Woolf. Plath parece escrever aos moldes de Woolf, criando uma literatura de morte, feita para assassinar o Anjo do Lar. Usamos para tal estudo o conceito de écriture féminine, criado pelas francófonas Hélène Cixous, Luce Irigaray, e Julia Kristeva, entre outras, para traçar os paralelos entre um lugar para o feminino na escrita e a busca de uma tradição por Woolf. A abjeção de Kristeva, a dinâmica de poder entre alma e corpo de Foucault e o conceito de duplo de Otto Rank nos ajudarão, por fim, a entender como se dá a morte do Anjo na literatura, especificamente no romance A redoma de vidro (1963) de Sylvia Plath

Romance policial, psicanálise e cultura contemporânea em Luiz Alfredo Garcia-Roza e Dennis Lehane

Esta tese traça um estudo comparativo entre o Romance policial contemporâneo e o discurso psicanalítico na produção ficcional de Luiz Alfredo Garcia-Roza (1936-) e Dennis Lehane (1963-), tomando, por base, relações de aproximação entre os métodos investigativos na literatura e na psicanálise. Para isso, o corpus constitui-se dos romances O silêncio da chuva (1996) e Espinosa sem saída (2006), ambos do escritor brasileiro e Sagrado [Sacred] (2004) e Paciente 67 [Shttter Island] (2005), do ficcionista norte-americano. A análise destas narrativas revela pontos de aproximação entre os dois discursos inseridos no cenário cultural caótico e desajustado. E questiona a emergência deste novo contexto sociocultural, onde personagens sem identidade definida, sendo o principal deles, o detetive, realizam sua flânerie através de deslocamentos constantes associados à paisagem e em busca do desvendamento do crime urbano. Como seres de ficção perdidos, estes private eyes precisam encontrar os desajustes psíquicos de toda espécie de criminosos daí a representação da cidade, que ora se converte no solo para a flânerie dos investigadores, ora contribui para o apagamento e/ou ocultamento das subjetividades criminais. A relação entre os discursos policial e psicanalítico aponta para a associação entre a obscuridade do texto literário e o da cultura onde estamos inseridos sem falar do mal-estar de um e de outro campo, que tem a ver com as transformações da esfera da sociedade contemporânea

O desenvolvimento da competência leitora do público infanto-juvenil: uma proposta de estudo de As aventuras do Capitão Cueca: um romance épico

Esta dissertação tem por objetivo o estudo da narrativa dedicada ao público infanto-juvenil através de seus sumários e das estratégias textuais e discursivas que levaram a coleção ao grande recorde de venda no período de 2007. Trata-se de uma narrativa, de autoria a Dav Pilkey, intitulada As Aventuras do Capitão Cueca. Fazem parte deste corpus os quatro volumes iniciais da coleção e seus respectivos sumários analisados dentro da teoria laboviana sobre as narrativas. O estudo proposto analisa o tipo de texto e que estruturas podem justificar o porquê de os volumes serem considerados um romance épico. Analisa-se, a importância das construções metafóricas e referenciais para a construção dos personagens e para a progressão textual. Postulam-se três tipos de metáforas - a do poder, a da ação e a da aventura, que, participam na superestrutura textual, construindo a história como um conjunto de elementos composto, tanto pelos referentes quanto pelas escolhas lexicais, já que, por meio do léxico, são delineadas as pistas necessárias à progressão textual o que, consequentemente, propicia um texto com articulação e suspense, o que torna a leitura mais próxima do público que a coleção deseja atingir. Mostrou-se necessário, também, um estudo mais acurado do gênero e da tipologia textual, visto que, nesse momento, nos utilizamos da própria denominação do subtítulo da coleção: romance épico. A organização da microestrutura do texto na perspectiva da relação metáfora e referentes permitiu o reconhecimento de uma tríade na organização da macroestrutura da narrativa, justificando a referência à narrativa épica e às peripécias vividas pelos personagens. É essa complexidade textual que torna a coleção tão singular e atrativa aos olhos do público a que se destina, confirmando a essência do processo de interação entre texto/ leitor/ produtor, em um processo dialógico. Embasam esse estudo as teorias sócio-cognitivas de Lakoff e Johnson (2002) e Sardinha (2007), Koch (2002), Cavalcante (2011), Marcuschi (2008). Concluí-se que a arquitetura do texto pode, de fato, interferir no processo de desenvolvimento da competência de leitura dos estudantes, prendendo seu interesse, o que faz com que haja uma construção de interação. Essa possibilidade, por analogia, pode ser, de um lado, um ponto de desvendamento para o sucesso de alguns livros publicados e que se tornam absoluto sucesso em um dado tempo entre os jovens; de outro lado, pode colocar o professor e a escola do século XXI à frente de novos desafios não só no que tange ao desenvolvimento das diferentes habilidades de leitura, mas também frente ao que é importante do ponto de vista discursivo para o incentivo à leitura, em um mundo marcado semioticamente pela imagem

O laboratório analítico: a psicologia de C.G. Jung examinada pela teoria do ator-rede

O psiquiatra suíço Carl Gustav Jung (1875-1961) é um dos principais nomes da psicologia e da psicoterapia do século XX. Algumas de suas maiores contribuições teórico-metodológicas são as idéias de realidade psíquica, complexo, arquétipo (inconsciente coletivo), processo de individuação, método dialético, método construtivo e imaginação ativa. A psicologia analítica de Jung, ao longo de sua formação, foi influenciada por diversas disciplinas, dentre elas a etnologia (ciências sociais). Este trabalho buscou dar continuidade a este processo de construção epistêmica, mediante exame das concepções de Jung por intermédio da teoria do ator-rede (TAR), uma importante corrente da sociologia contemporânea. Pretendeu-se também saber se a psicologia analítica se mantém atual ou se já é uma teoria e prática clínica anacrônicas. O principal autor relacionado à TAR a quem se recorreu neste trabalho foi o sociólogo francês Bruno Latour. De sua perspectiva, o acordo moderno, disjuntor de Natureza e Cultura, é insuficiente para explicar a complicação inerente às entidades que compõem a realidade. Para escapar das armadilhas conceptuais da modernidade, Latour opera com constructos tais como coletivo (social), ator-rede, proposição, vínculo e plasma. Além do pensamento de Latour, este trabalho valeu-se das idéias sociológicas de Gabriel Tarde e da influenciologia etnopsicanalítica de Tobie Nathan, aproveitando-se da afinidade teórica que compartilham com Latour. Nathan, por desenvolver uma prática em psicoterapia, permitiu propor à psicologia clínica de Jung determinadas questões que o enfoque mais estritamente sociológico de Latour não possibilitava. Uma vez expostas as concepções de Latour, Tarde e Nathan, apresentaram-se os elementos da psicologia analítica com os quais se esperava que elas fossem compatíveis. Concluiu-se que, apesar das diferenças, muitas aproximações são plausíveis entre psicologia analítica e TAR. Constatou-se que a concepção de Jung de um psiquismo multifacetado, em devir, cujos componentes se relacionam de diferentes maneiras, é comparável à noção de ator-rede trabalhada por Latour e à monadologia de Tarde. Verificou-se também que a abordagem pragmática e construtiva identificada na psicoterapia junguiana é em muitos aspectos análoga à prática da etnopsicanálise. Assim, foi possível afirmar que a TAR e a psicologia analítica podem formar aliança.

Leitura mítico-metáforica do romance Vinte e zinco

Este trabalho tem como objetivo principal analisar a ocorrência do mito no romance Vinte e Zinco, de Mia Couto, publicado pela primeira vez em 1999, em Lisboa. Nesse romance, o autor aborda os aspectos sociais e culturais da população moçambicana durante a colonização portuguesa. Através de uma linguagem que insere os mitos africanos no contexto social e histórico moçambicano, o autor denuncia os horrores da colonização durante a Guerra Colonial, metaforizados entre os dias 19 e 30 de abril de 1974. No entanto, o fim da guerra ainda não representa a liberdade completa dos moçambicanos. Eles terão de esperar até o dia 25 de junho de 1975, quando presenciarão a Independência de Moçambique. A constituição dos mitos vai além do registro das crenças e lendas africanas, pois o romance é construído através de uma linguagem que se reconfigura a partir das denúncias implícitas nas falas das personagens. Essa é uma das principais características do mito, que se apropria da linguagem como objeto principal de sua veiculação. Por isso, o mito em Vinte e Zinco pode ser entendido como fala ou mensagem que precisa ser decifrada para ser compreendida. Nossa intenção é perceber onde e como essas mensagens (mitos) se apresentam no romance

História e ficção no romance português contemporâneo: uma leitura de A costa dos murmúrios

A presente dissertação discute a representação do passado em A Costa dos Murmúrios. Analisa-se a maneira pela qual o período colonial é retratado na obra, investigando as estratégias utilizadas por Lídia Jorge, para conceber um registro diferenciado desse tempo histórico. A história de Portugal é reavaliada criticamente, provocando uma ruptura com os padrões ideologicamente estabelecidos. Versões até então negligenciadas, passam a contribuir fortemente para um conhecimento pluralista do passado lusitano. O estudo revela a desconstrução do discurso oficial efetuada pelo romance, que relativiza as verdades propagadas pelo cânone. O trabalho verifica de que forma a narrativa de Jorge promove a articulação entre história e ficção, problematizando a tradicional distinção entre elas. Além disso, procura-se identificar como o romance A Costa dos Murmúrios dialoga com as inovadoras teses de Hayden White, Walter Benjamin, Linda Hutcheon, entre outras, surgidas no clima de renovação epistemológica que se instalou a partir de meados do século XX