MicroRNA signatures differentiate preserved from reduced ejection fraction heart failure

AIMS: Differentiation of heart failure with reduced (HFrEF) or preserved (HFpEF) ejection fraction independent of echocardiography is challenging in the community. Diagnostic strategies based on monitoring circulating microRNA (miRNA) levels may prove to be of clinical value in the near future. The aim of this study was to identify a novel miRNA signature that could be a useful HF diagnostic tool and provide valuable clinical information on whether a patient has HFrEF or HFpEF.

METHODS AND RESULTS: MiRNA biomarker discovery was carried out on three patient cohorts, no heart failure (no-HF), HFrEF, and HFpEF, using Taqman miRNA arrays. The top five miRNA candidates were selected based on differential expression in HFpEF and HFrEF (miR-30c, -146a, -221, -328, and -375), and their expression levels were also different between HF and no-HF. These selected miRNAs were further verified and validated in an independent cohort consisting of 225 patients. The discriminative value of BNP as a HF diagnostic could be improved by use in combination with any of the miRNA candidates alone or in a panel. Combinations of two or more miRNA candidates with BNP had the ability to improve significantly predictive models to distinguish HFpEF from HFrEF compared with using BNP alone (area under the receiver operating characteristic curve >0.82).

CONCLUSION: This study has shown for the first time that various miRNA combinations are useful biomarkers for HF, and also in the differentiation of HFpEF from HFrEF. The utility of these biomarker combinations can be altered by inclusion of natriuretic peptide. MiRNA biomarkers may support diagnostic strategies in subpopulations of patients with HF.

Prognostic role of the LCS6 KRAS variant in locally advanced rectal cancer: results of the EXPERT-C trial.

Background: Lethal-7 (let-7) is a tumour suppressor miRNA which acts by down-regulating several oncogenes including KRAS. A single-nucleotide polymorphism (rs61764370, T > G base substitution) in the let-7 complementary site 6 (LCS-6) of KRAS mRNA has been shown to predict prognosis in early-stage colorectal cancer (CRC) and benefit from anti-epidermal growth factor receptor monoclonal antibodies in metastatic CRC. Patients and methods: We analysed rs61764370 in EXPERT-C, a randomised phase II trial of neoadjuvant CAPOX followed by chemoradiotherapy, surgery and adjuvant CAPOX plus or minus cetuximab in locally advanced rectal cancer. DNA was isolated from formalin-fixed paraffin-embedded tumour tissue and genotyped using a PCR-based commercially available assay. Kaplan–Meier method and Cox regression analysis were used to calculate survival estimates and compare treatment arms. Results: A total of 155/164 (94.5%) patients were successfully analysed, of whom 123 (79.4%) and 32 (20.6%) had the LCS-6 TT and LCS-6 TG genotype, respectively. Carriers of the G allele were found to have a statistically significantly higher rate of complete response (CR) after neoadjuvant therapy (28.1% versus 10.6%; P = 0.020) and a trend for better 5-year progression-free survival (PFS) [77.4% versus 64.5%: hazard ratio (HR) 0.56; P = 0.152] and overall survival (OS) rates (80.3% versus 71.9%: HR 0.59; P = 0.234). Both CR and survival outcomes were independent of the use of cetuximab. The negative prognostic effect associated with KRAS mutation appeared to be stronger in patients with the LCS-6 TT genotype (HR PFS 1.70, P = 0.078; HR OS 1.79, P = 0.082) compared with those with the LCS-6 TG genotype (HR PFS 1.33, P = 0.713; HR OS 1.01, P = 0.995). Conclusion: This analysis suggests that rs61764370 may be a biomarker of response to neoadjuvant treatment and an indicator of favourable outcome in locally advanced rectal cancer possibly by mitigating the poor prognosis of KRAS mutation. In this setting, however, this polymorphism does not appear to predict cetuximab benefit.

Mechanismen kleiner regulatorischer RNAs in Dictyostelium discoideum: Charakterisierung und Anwendung

Die RNA-Interferenz (RNAi) ist ein in Eukaryoten weit verbreiteter Mechanismus, der die transkriptionelle oder posttranskriptionelle Stilllegung von Genen beschreibt. Die Spezifität wird dabei durch die Sequenz einer kleinen, nicht-kodierenden RNA gewährleistet. Diese RNA leitet einen Effektorkomplex, dessen Zentrum immer von einem Argonautenprotein gebildet wird, üblicherweise zu einer komplementären mRNA. In der Folge kommt es zum Abbau des Transkripts oder zur Inhibierung der Translation. Aktuelle Veröffentlichungen konnten zudem das Aktivitätsprofil der Argonautenproteine beträchtlich erweitern: Im Zellkern vorkommende Argonautenproteine wurden beispielsweise mit Spleißvorgängen, der Promotorkontrolle von Genen und der DNA-Reparatur in Verbindung gebracht. In den letzten Jahren konnten weitreichende Kenntnisse bezüglich der Kontrolle einiger transposabler Elemente durch RNAi sowie der Biogenese kleiner regulatorischer RNAs in Dictyostelium discoideum und anderen Organismen gewonnen werden. Ein Fokus dieser Arbeit lag zunächst auf der Charakterisierung des Argonautenproteins AgnB und der Identifikation von Interaktionspartnern. Es konnte gezeigt werden, dass AgnB zumindest partiell im Zellkern der Amöbe lokalisiert und dort vermutlich regulatorische Aufgaben wahrnimmt. Gestützt wurde diese Annahme durch die massenspektrometrische und Western Blot basierte Detektion nukleärer Bindungspartner. Weiterführende Analysen konnten AgnB zudem als positiven Regulator für drei entwicklungsregulierte Gene beschreiben und so die Verbindung zum Prozess der RNA activation in der Amöbe herstellen. Identifizierte posttranslationale Modifikationen könnten diesbezüglich die Aktivität des Argonauten steuern. Mit Hilfe von Crosslink-RNA-Immunopräzipitation und anschließender Hochdurchsatz-sequenzierung oder der Northern Blot basierten Auswertung konnte eine Assoziation von AgnB und der Class I RNAs gezeigt werden. Diese Klasse umfasst nicht-kodierende RNAs mit einer Länge von etwa 42 bis 65 Nukleotiden und wurde bisher nicht als Substrat für die RNAi-Maschinerie in D. discoideum angesehen. Ein weiterer Teil dieser Arbeit beschäftigte sich mit dem Einfluss von AgnA und AgnB auf die Promotorbereiche des D. discoideum Retrotransposons DIRS-1. Im Verlauf der Untersuchungen konnte beobachtet werden, dass die Anordnung entgegengesetzt operierender DIRS-1 Promotor-sequenzen für die Stilllegung eines Reportergens ausreichend war. Darauf aufbauend konnte ein DIRS-1 basiertes knockdown System etabliert werden. Mit Hilfe dieses Systems konnten die Proteinmengen ausgewählter Zielgene so effektiv reduziert werden, dass die entsprechenden Stämme den Phänotyp des korrespondierenden knockout Stammes zeigten. Darüber hinaus war es möglich die Proteinreduktion zu modulieren, um so beispielsweise dosisabhängige Effekte zu registrieren. Vorangegangene Arbeiten zur Biogenese von micro (mi)RNAs konnten das RNA-bindende Protein RbdB als eine Hauptkomponente für die Prozessierung maturer miRNAs identifizieren. Der miRNA defiziente RbdB- Stamm wurde in dieser Arbeit zur Identifikation putativer miRNA Ziele genutzt. Dazu wurde sowohl das Transkriptom des D. discoideum Wildtyps als auch des rbdB knockout Stammes in hohem Durchsatz sequenziert, um so differentiell exprimierte Gene zu detektieren. Vielversprechende Kandidaten wurden mittels qRT-PCR verifiziert. Dabei wurde unter anderem ein putativer Transkriptionsfaktor als miRNA target identifiziert, der eine Vielzahl weiterer Gene regulieren könnte. Abschließend konnte in dieser Arbeit gezeigt werden, dass RbdB ebenfalls für die Generierung von small interfering (si)RNAs aus strukturierten Loci von Bedeutung ist. Dies weist auf mindestens zwei unterschiedliche Mechanismen zur siRNA Prozessierung in D. discoideum hin.

miRNAs as therapeutic agents in neurodegeneration, a pilot study

L’échec des différents essais cliniques souligne la nécessité de développer des nouvelles thérapies pour la maladie d’Alzheimer (MA), la cause la plus commune de démence. Les microARNs (miARNs) sont les ARNs non-codants les plus étudiés et ils jouent un rôle important dans la modulation de l’expression des gènes et de multiples voies de signalisation. Des études antérieures, dont celles de mon laboratoire d’accueil, ont permis de développer l’hypothèse que certains membres de la famille miR-15/107 (c.-à-d. miR-15ab, miR-16, miR-195, miR-424, and miR-497) pourraient être utilisés comme agents thérapeutiques dans MA. En effet, cette famille avait le potentiel de réguler de multiples gènes associés à MA, tels que la protéine précurseur de l’amyloïde (APP), la β-secrétase (BACE1), et la protéine Tau. Tel que démontré dans ce projet de thèse, j’ai choisi miR-16 comme cible thérapeutique potentielle pour MA parmi tous les membres de la famille. L’essai luciférase dans ce projet confirme que miR-16 peut réguler simultanément APP et BACE1, directement par une interaction avec la région non-codante en 3’ de l’ARNm). Notamment, nous observons aussi une réduction de la production des peptides amyloïdes et de la phosphorylation de Tau après une augmentation de miR-16 en cellule. J’ai ensuite validé mes résultats in vivo dans la souris en utilisant une méthode de livraison de miR-16 via une pompe osmotique implanté dans le cerveau. Dans ce cas, l’expression des protéines d’intérêts (APP, BACE1, Tau) a été mesurée par immunobuvardage et PCR à temps réel. Après validation, ces résultats ont été complémentés par une étude protéomique (iTRAQ) du tronc cérébral et de l’hippocampe, deux régions associées à la maladie. Ces données m’ont permis d’identifier d’autres protéines régulées par miR-16 in vivo, incluant α-Synucléine, Transferrine receptor1, et SRm300. Une autre observation intéressante : les voies régulées par miR-16 in vivo sont directement en lien avec le stress oxydatif et la neurodégénération. En résumé, ce travail démontre l’efficacité et la faisabilité d’utiliser un miARN comme outil thérapeutique pour la maladie d’Alzheimer. Ces résultats rentrent dans un cadre plus vaste de découvrir de nouvelles cibles pour MA, et en particulier la forme sporadique de la maladie qui représente plus de 95% de tous les cas. Évidemment, la découverte d’une molécule pouvant cibler simultanément les deux pathologies de la maladie (plaques amyloïdes et hyper phosphorylation de tau) est nouvelle et intéressante, et ce domaine de recherche ouvre la porte aux autres petits ARNs non-codants dans MA et les maladies neurodégénératives connexes.

MicroRNA-induced polarization of microglia and macrophages after focal cerebral ischemia

Der ischämische Schlaganfall ist nicht nur die zweithäufigste Todesursache weltweit, sondern auch eine der Hauptursachen für körperliche Beeinträchtigungen im Erwachsenenalter. Das Ausmaß der durch den Schlaganfall hervorgerufenen Gewebeschädigung ist stark durch das Immunsystem geprägt. Die im Zentralnervensystem (ZNS) ansässigen Mikroglia und die aus dem Blutsystem infiltrierenden Makrophagen sind die Schlüsselzellen der lokalen und systemischen Entzündungsantwort nach dem ischämischen Schlaganfall. Sowohl Mikroglia als auch Makrophagen spielen in der Entwicklung der Gewebeschädigung eine duale Rolle. Zum einen phagozytieren sie Zelltrümmer und unterstützen neuroregenerative Prozesse, zum anderen sind diese Zellen in der Lage den Zustand der Gewebsschädigung zu verschlimmern und einer Regeneration des ZNS entgegenzuwirken. Die Polarisierung der Mikroglia/Makrophagen hin zu verschiedenen Phänotypen ist abhängig von der jeweiligen Phase der Gewebeschädigung. Der destruktive, proinflammatorische Phänotyp (M1) steht dabei dem protektiven, antiinflammatorischen Phänotyp (M2) gegenüber. Die Notwendigkeit einer zielgerichteten Regulierung der polarisierten Mikroglia/Makrophagen zum protektiven M2-Phänotyp wurde bereits mehrfach im Zusammenhang mit der Behandlung von neurodegenerativen Erkrankungen erwähnt. In der vorliegenden Dissertation soll die immunregulierende und neuroprotektive Wirkung der microRibonukleinsäure-124 (miRNA-124) in Bezug auf die Polarisierung von Mikroglia/Makrophagen zu verschiedenen Zeitpunkten nach Verschluss der Arteria cerebri media (ACM) im Gehirn von Mäusen gezeigt werden. Zu diesem Zweck wurde die liposomierte miRNA-124 zu einem frühen Zeitpunkt (Tag 2) und zu einem späten Zeitpunkt (Tag 10) nach Verschluss der ACM verabreicht. Die Behandlung mit der miRNA-124 zu einem frühen Zeitpunkt resultierte dabei in einem signifikanten Anstieg in der Anzahl der M2-positiven Mikroglia/Makrophagen im Vergleich zur Kontrollgruppe. Gleichzeitig nahm die Anzahl der M1-positiven Mikroglia/Makrophagen signifikant ab. Im Wesentlichen resultierte die Behandlung mit der miRNA-124 zu beiden Zeitpunkten in einem geringeren Verhältnis von proinflammatorischen (M1) zu antiinflammatorischen (M2) Mikroglia/Makrophagen. Zu den weiteren Erkenntnissen einer frühzeitigen Behandlung im Rahmen dieser Dissertation gehören: (i) eine signifikante Zunahme des neuronalen Überlebens, das zudem positiv mit der Anzahl der M2-positiven Mikroglia/Makrophagen korreliert, (ii) eine verbesserte funktionelle Erholung, welche in Verbindung mit den veränderten neuroinflammatorischen Ereignissen steht und (iii) ein signifikant verkleinertes Läsionsareal, welches durch reaktive Astrozyten zum gesunden Gewebe hin abgegrenzt wird. Die Ergebnisse dieser Dissertation zeigen, dass die Verabreichung von miRNA-124 eine neue Möglichkeit zur Regulierung der Immunantwort und der Neuroprotektion im Rahmen der Behandlung des ischämischen Schlaganfalls darstellt.

Cross-regulation between cytokine and microRNA pathways in T cells

microRNA (miRNA) mediated regulation of protein expression has emerged as an important mechanism in T-cell physiology, from development and survival to activation, proliferation, and differentiation. One of the major classes of proteins involved in these processes are cytokines, which are both key input signals and major products of T-cell function. Here, we summarize the current data on the molecular cross-talk between cytokines and miRNAs: how cytokines regulate miRNA expression, and how specific miRNAs control cytokine production in T cells. We also describe the inflammatory consequences of deregulating the miRNA/cytokine axis in mice and humans. We believe this topical area will have key implications for immune modulation and treatment of autoimmune pathology.

Generation and Characterisation of a Canine EGFP-HMGA2 Prostate Cancer In Vitro Model

The architectural transcription factor HMGA2 is abundantly expressed during embryonic development. In several malignant neoplasias including prostate cancer, high re-expression of HMGA2 is correlated with malignancy and poor prognosis. The let-7 miRNA family is described to regulate HMGA2 negatively. The balance of let-7 and HMGA2 is discussed to play a major role in tumour aetiology. To further analyse the role of HMGA2 in prostate cancer a stable and highly reproducible in vitro model system is precondition. Herein we established a canine CT1258-EGFP-HMGA2 prostate cancer cell line stably overexpressing HMGA2 linked to EGFP and in addition the reference cell line CT1258-EGFP expressing solely EGFP to exclude EGFP-induced effects. Both recombinant cell lines were characterised by fluorescence microscopy, flow cytometry and immunocytochemistry. The proliferative effect of ectopically overexpressed HMGA2 was determined via BrdU assays. Comparative karyotyping of the derived and the initial CT1258 cell lines was performed to analyse chromosome consistency. The impact of the ectopic HMGA2 expression on its regulator let-7a was analysed by quantitative real-time PCR. Fluorescence microscopy and immunocytochemistry detected successful expression of the EGFP-HMGA2 fusion protein exclusively accumulating in the nucleus. Gene expression analyses confirmed HMGA2 overexpression in CT1258-EGFP-HMGA2 in comparison to CT1258-EGFP and native cells. Significantly higher let-7a expression levels were found in CT1258-EGFP-HMGA2 and CT1258-EGFP. The BrdU assays detected an increased proliferation of CT1258-HMGA2-EGFP cells compared to CT1258-EGFP and native CT1258. The cytogenetic analyses of CT1258-EGFP and CT1258-EGFP-HMGA2 resulted in a comparable hyperdiploid karyotype as described for native CT1258 cells. To further investigate the impact of recombinant overexpressed HMGA2 on CT1258 cells, other selected targets described to underlie HMGA2 regulation were screened in addition. The new fluorescent CT1258-EGFP-HMGA2 cell line is a stable tool enabling in vitro and in vivo analyses of the HMGA2-mediated effects on cells and the development and pathogenesis of prostate cancer.

Producción de microtubérculos de papa (Solanum tuberosum L.), cultivar Burren en biorreactores económicos de inmersión temporal

El estudio de microtuberización del cultivar de papa Burren se realizó en el Laboratorio de Cultivo de Tejidos de la Universidad Nacional Agraria entre los meses de junio a diciembre del 2015. Se estudiaron las fases de multiplicación y formación de microtubérculos en Biorreactores Económicos de Inmersión Temporal (BEIT). En la fase de multiplicación se evaluó la formación de plantas completas cuando se sembraron 70 microesquejes en cinco variantes de medios de cultivo. Se empleó un diseño de Bloques Completos al Azar con arreglo unifactorial con réplicas conformadas por 2 BEIT, y para definir las diferencias estadísticas entre las medias (ANDEVA) de los tratamientos se realizó la prueba de rangos múltiples de Duncan-Waller ( = 0.05). En la formación de plantas se evaluaron la longitud de plantas, número de hojas y número de brotes que se les realizó la prueba de medias de diferencia mínima significativa con α = 0.05, se calculó el porcentaje de supervivencia. Como resultado se obtuvo en las variantes de medios de cultivo que contenían 0.20 mg l-1 de GA3 con 0.50 mg l-1 de BAP y 0.10 mg l-1 de GA3 con 1 mg l-1 de BAP, se obtuvieron medias respectivas en número de entrenudos de 6.32-5.7 y en número de hojas por planta de 7.37-6.93. Adiciones de sacarosa de 80 g l-1 y 110 g l-1 favorecieron la formación de microtubérculos de peso fresco con medias entre 0.69-0.75 gramos. La adición de sacarosa entre 80 g l-1 y 120 g l-1 no se registró diferencias estadísticas significativas entre las medias de las variables diámetro y longitud de microtubérculos. Con microtubérculos con diámetro mayor a los 10 mm se obtuvieron medias en longitud de planta, número de hojas y número de brotes de 21, 16.35 y 5.65 cm respectivamente y con diámetros entre 8-10 mm las medias respectivas fueron de 16.37, 11.35 y 5.35 cm.

The role of miRNAs in stroke

Stroke is currently one of the leading causes of death and disability worldwide. Despite recent advances in the treatment of stroke there is a major unmet clinical need for novel therapeutics for intervention. miRNAs are small coding RNAs which act to post-transcriptionally inhibit expression of genes. Emerging evidence has supported the view that miRNAs play an important role in the development and progression of ischaemic stroke, although understanding remains relatively poor. This research uses several models to investigate the effects of miRNAs in the context of stroke in vivo and in vitro, as well as assessment of patient serum samples in order to identify biomarkers for stroke. miR-29b was found to be significantly upregulated in SHRSP rat brain peri-infarct at 72h following stroke, and downregulated in ischaemic core at 24h and 72h following stroke, whilst miR-29c was significantly downregulated in remainder tissue at 24h following stroke and in infarct at 72h following stroke. The upreglation of miR-29b at 72h corresponded to a significant downregulation of miR-29 target genes MMP2, MMP9 and TGF-β1 in peri-infarct tissue at 72h following stroke. Modulation of miR-29b and miR-29c was achieved in a rat neuronal cell line but suppression of genes of interest was not observed following oxygen glucose deprivation. Several candidate miRNAs were then identified by microRNA Openarray analysis in stroke patient serum samples. Validation of these miRNAs was not demonstrated in the population studied, but assessment of these miRNAs in rat serum and isolated exosomes demonstrated that several of these miRNAs were significantly altered in SHRSP rats following stroke. Finally miR-21 was demonstrated to be significantly upregulated in SHRSP rat peri-infarct following stroke. This was associated with a change in miR-21 localization as determined by in situ hybridization. Modulation of miR-21 via the use of CAG-miR-21 mice demonstrated no difference in infarct size as measured by T2 -weighted MRI scan nor was any difference present in behavioural tests versus wild type. KO of miR-21 resulted in a reduction of survival rate compared with wild type. This thesis demonstrates that miR-29 and miR-21 are modulated following stroke in animal models, and these are potential candidates for therapeutic intervention in the future. Analysis of clinical samples has illustrated difficulties in the identification of serum miRNA profiles and suggests that looking at the exosomal component of serum may provide better information regarding miRNA profiles after stroke.

Neuropsychiatric disease (NPD) clustering in families with Autism Spectrum Disorder (ASD): genetic, epigenetic and environmental issues

Autism Spectrum Disorder (ASD) is a neurodevelopmental disorder characterized by deficits in social communication/interaction and by unusual repetitive and restricted behaviors and interests. ASD often co-occurs in the same families with other neuropsychiatric diseases (NPD), such as intellectual disability, schizophrenia, epilepsy, depression and attention deficit hyperactivity disorder. Genetic factors have an important role in ASD etiology. Multiple copy number variants (CNVs) and single nucleotide variants (SNVs) in candidate genes have been associated with an increased risk to develop ASD. Nevertheless, recent heritability estimates and the high genotypic and phenotypic heterogeneity characteristic of ASD indicate a role of environmental and epigenetic factors, such as long noncoding RNA (lncRNA) and microRNA (miRNA), as modulators of genetic expression and further clinical presentation. Both miRNA and lncRNA are functional RNA molecules that are transcribed from DNA but not translated into proteins, instead they act as powerful regulators of gene expression. While miRNA are small noncoding RNAs with 22-25 nucleotides in length that act at the post-transcriptional level of gene expression, the lncRNA are bigger molecules (>200 nucleotides in length) that are capped, spliced, and polyadenylated, similar to messenger RNA. Although few lncRNA were well characterized until date, there is a great evidence that they are implicated in several levels of gene expression (transcription/post-transcription/post-translation, organization of protein complexes, cell– cell signaling as well as recombination) as shown in figure 1.

Les microARNs

International audience

Resultados del trasplante renal en los pacientes con insuficiencia renal crónica entre las edades de 7 a 18 años atendidos en el Hospital Nacional de Niños Benjamín Bloom durante el periodo de Enero de 2000 a Diciembre de 2008

La insuficiencia renal crónica es un síndrome clínico complejo que resulta del deterioro progresivo de la estructura anatómica renal. El trasplante renal constituye el tratamiento de elección para este tipo de pacientes lo cual permite corregir muchas de las complicaciones urémicas, mejora y corrige el crecimiento, la maduración sexual, el estado cognitivo y aumenta la expectativa de vida. Objetivo. El objetivo del presente estudio es conocer cuáles son los resultados del trasplante renal en los niños con insuficiencia renal crónica estadío V, que fueron sometidos a este tipo de tratamiento en el Hospital Nacional de Niños Benjamín Bloom. Así como determinar las etiologías más frecuentes que ocasionan la insuficiencia renal crónica y conocer la evolución posterior al trasplante renal. Metodología. Se realizó un reporte de tres casos, analizando los datos contenidos en los expedientes clínicos de los niños que recibieron trasplante renal en el periodo de enero de 2000 a diciembre de 2008 en el HNNBB. Se tabularon y analizaron los datos en una matriz utilizando el programa Excel. Resultados. Durante el período del estudio se realizaron 25 trasplantes renales, pero solamente se encontraron diez expedientes, de los cuales solo tres cumplían con los criterios de inclusión, por lo que se realizó un reporte de casos. En dos de los pacientes se encontró como causa de insuficiencia renal crónica la glomerulonefritis y en uno de ellos la nefropatía obstructiva (valvas de uretra posterior). Los tres pacientes del estudio recibieron terapia de sustitución renal en la modalidad de diálisis peritoneal, y uno de ellos además hemodiálisis. No hubo complicaciones en el acto quirúrgico, no se presentó rechazo hiperagudo, ni fue necesaria la hemodiálisis inmediatamente posterior al trasplante. Las complicaciones más frecuentes fueron las infecciosas y dentro de estas dos de los pacientes presentaron infección del tracto urinario y un tercero neumonía bacteriana y episodios diarreicos. Dentro de las complicaciones no infecciosas más frecuentes se encontró la hipertensión arterial. Los tres pacientes presentaron rechazo al injerto, dos rechazo agudo y uno rechazo crónico. Al final del período también se observa una mejoría de la tasa de filtración glomerular, lo cual contribuye a mejorar la calidad de vida. En cuanto al peso y la talla se observó ganancia de estas medidas antropométricas, sin embargo no recuperaron el peso, en cuanto a la talla solamente un paciente mostró recuperación en este parámetro antropométrico. De los veinticinco pacientes trasplantados, en los registros del Departamento de Nefrología se reportaron cinco fallecidos posterior al trasplante, sin embargo se desconocen los datos si las causas se debieron al propio trasplante, secundaria a complicaciones o debido a otra causa. A los cinco años posteriores al trasplante los tres pacientes del estudio se encontraban con vida, con mejoría de la función renal; sin embargo en este estudio no se logró estimar la curva de sobrevida por la pobre representación estadística de la muestra. Conclusiones. En este estudio el trasplante renal fue el tratamiento de elección pues los pacientes lograron mejorar la función renal, presentaron las complicaciones esperadas acorde a otros estudios, como lo es la infección del tracto urinario, infección por citomegalovirus, neumonía. No lograron recuperar el peso y la talla, lo que en otros estudios se logra evidenciar un aumento de 1DS que contribuye a mejorar la calidad de vida de estos pacientes.

Alternate Conformations Regulate Ribosomal Recoding in a Positive-sense RNA Virus

Positive-sense RNA viruses are important animal, plant, insect and bacteria pathogens and constitute the largest group of RNA viruses. Due to the relatively small size of their genomes, these viruses have evolved a variety of non-canonical translation mechanisms to optimize coding capacity expanding their proteome diversity. One such strategy is codon redefinition or recoding. First described in viruses, recoding is a programmed translation event in which codon alterations are context dependent. Recoding takes place in a subset of messenger RNA (mRNAs) with some products reflecting new, and some reflecting standard, meanings. The ratio between the two is both critical and highly regulated. While a variety of recoding mechanisms have been documented, (ribosome shunting, stop-carry on, termination-reinitiation, and translational bypassing), the two most extensively employed by RNA viruses are Programmed Ribosomal Frameshifting (PRF) and Programmed Ribosomal Readthrough (PRT). While both PRT and PRF subvert normal decoding for expression of C-terminal extension products, the former involves an alteration of reading frame, and the latter requires decoding of a non-sense codon. Both processes occur at a low but defined frequency, and both require Recoding Stimulatory Elements (RSE) for regulation and optimum functionality. These stimulatory signals can be embedded in the RNA in the form of sequence or secondary structure, or trans-acting factors outside the mRNA such as proteins or micro RNAs (miRNA). Despite 40+ years of study, the precise mechanisms by which viral RSE mediate ribosome recoding for the synthesis of their proteins, or how the ratio of these products is maintained, is poorly defined. This study reveals that in addition to a long distance RNA:RNA interaction, three alternate conformations and a phylogenetically conserved pseudoknot regulate PRT in the carmovirus Turnip crinkle virus (TCV).

Linfócitos T : uma análise do perfil diferencial da expressão gênica na imunorregulação

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2016.

Identifying cancer-related microRNAs based on gene expression data

International audience