Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas.

Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o número não-balanceado de membros por classe. Para abordar esses desafios, apresenta-se uma metodologia para seleção de parâmetros, que combina recursos de matemática (ex: Transformada Discreta do Cosseno) e da estatística (ex:.g., correlação de variáveis e amostragem com reposição). A metodologia foi validada considerando-se os três principais métodos de classificação da literatura, a saber; árvore de decisão, classificação Bayesiana e redes neurais. Os experimentos demonstram que essa metodologia é simples, eficiente e alcança resultados semelhantes àqueles obtidos pelas principais técnicas para seleção de parâmetros na literatura.Termos para indexação classificação de enzimas,predição de função de proteínas, estruturas de proteínas, banco de dados de proteínas, seleção de parâmetros, métodos para classsificação de dados.

Traduzinho XML para o modelo relacional: experiência no SIGI.

Conversão de dados de banco de dados relacional para/de o formato XML. Arquitetura do SIGI. Bancos de dados relacional e XML. A experiência no SIGI: XML e Oracle 8i. Exemplos.

Entendendo e interpretando os parâmetros utilizados por BLAST.

O método BLAST para determinação de similaridades entre sequências biológicas. Score e matrizes de substituição. Determinação de matrizes de substituição BLOSUM. Determinação de matrizes de substituição PAM. Resultados da teoria Estatística de comparação local de sequências. O Algoritmo usado por BLAST. NCBI-BLAST. Exemplo de busca.

Migrando do Parodox para o Interbase: a experiência do AINFO.

O objetivo do trabalho é relatar a experiência na migração do sistema de automação das bibliotecas da Embrapa - AINFO, em Paradox para o interbase, versào gratuita com código aberto, disponibilizado pela Borland Software Corporation em setembro de 2000. O método utilizado foi o de estudar a viabilidade, performance e aplicação de componentes de acesso nativo Interbase Ex´press (IBX) e Interbase Objects (IBO) que dispensam a Borland Database Engine (BDE) para conexão do sistema ao banco de dados.

Utilização do software GRASP para gerar arquivo de coordenadas com valores de potencial eletrostático.

Com o intuito de disponibilizar um banco de dados de valores de potencial eletrostático para todas as estruturas de proteínas depositadas no PDB, foi utilizado o programa GRASP (Graphical Representation and Analysis of Structural Properties) (Nicholls et al., 1991) para geração deste banco de dados.

Estudo da influência de seqüências polipeptídicas e de códons na determinação da estrutura secundária de proteínas.

O propósito desse trabalho foi descrever e quantificar os casos de polipeptídicos idênticos em diferentes estruturas secundárias, encontrados em banco de dados de estrutura: Protein Data Bank (PDB).

Oracle Discoverer: guia do usuário.

Administration editon. Objetos e operações de uma área de negócios. Discoverer plus. Exportando folhas com o discoverer. Enviando folhas atráves de correio. eletrônico

Criação de um núcleo para a pesquisa e descrição dos serviços oferecidos na área de Bioinformática estrutural.

Instalação e oferta de ferramentas.Computacionais sting millennium suite. (SMS) através da interface web. Criação de novos algoritmos e programas. Para análise estrutural das proteínas. Oferta de banco de dados públicos. Estabelecimento de um ambiente para.Pesquisa e oferta de serviços na área. De bioinformática. Formação de recursos humanos. Organização de cursos e congresso. Projetos em colaboração.

Tradução de interfaces de aplicações para idiomas distintos.

Este documento apresenta o esquema de tradução proposto para as telas de entrada de dados do banco de dados de experimentos em manejo de fertilizantes para cana-de-açúcar.

Projeto físico de Data Warehouse no Oracle: um estudo de caso.

Este trabalho visa compartilhar a experiência no projeto físico de um DW desenvolvido pela Embrapa Informática Agropecuária utilizando o SGBD Oracle. São apresentadas algumas características do Oracle que favorecem a manutenção e o desempenho de consultas a um DW em geral, utilizando como exemplo o DW específico.

Uma introdução a tecnologia de reflexão Java.

Este documento tem por objetivo apresentar a tecnologia de reflexão existente na linguagem JAVA. Esta exposição será realizada a partir de uma implementação real de uma classe Java que fornece a funcionalidade de mapeamento entre objetos de um programa computacional e de um banco de dados relacional. Este mapeamento é também conhecido como camada de persistência.

AINFO - versão 5.0: manual on-line.

O AINFO é um sistema para automação de bibliotecas e recuperação de informação, desenvolvimento em padrão Windows, com arquitetura cliente/servidor baseada no sistema gerenciador de banco de dados relacional Firebird. Pemite o gerenciamento de informação técnico-científica, integrando bases de dados documentais, cadastrais e processos bibliográficos através do armazenamento, atualização, indexação e recuperação de informação de forma simples e rápida, utilizando não apenas recursos de um istema gerenciador de banco de dados, como controle de concorrência e manutenção de integridade das bases de dados, mas também oferecendo facilidades de recuperação de informação textual não disponíveis nesses sistemas.

Utilização de aplicativos Base e Calc do pacote BrOffice.org para criação de Sistema de Suporte à Decisão.

Neste trabalho, tem-se uma proposta de mostrar como se constrói um sistema de apoio à decisão de pequeno porte, usando-se os aplicativos Calc e Base. O aplicativo Base será usado para armazenar dados que estão em suas tabelas ou para importá-los a partir de uma outra fonte, isto é, a partir de um outro banco de dados (MySQL, PostgreSQL, etc.) ou de arquivos. Com os dados no aplicativo Base, o Calc irá acessá-los e manipulá-los para, finalmente, mostrar os resultados de apoio à decisão do usuário.

Sistema de mapa de telefonema interurbano pela Web (MTI) para acompanhamento de ligações telefônicas.

O objetivo deste trabalho é mostrar um sistema de MTI pela web, implementado na Embrapa Informática Agropecuária e pode, com algumas adaptações, servir para outras empresas.

Sistema de Informação de solos brasileiros.

Com o objetivo de possibilitar o armazenamento e a disponibilização das informações sobre os solos brasileiros, a Embrapa Informática Agropecuária e a Embrapa Solos investem no desenvolvimento de um Sistema de Informações de Solos. O sistema foi concebido para armazenar dados detalhados sobre este recurso natural, para que possam ser acessados pela internet, combinados e analisados sob vários pontos de vista. Seu banco de dados reunirá informações de solos coletados e analisados de todas as regiões do Brasil. A partir desta base de dados serão desenvolvidas aplicações para a tomada de decisões do agronegócio, em zoneamento agrícola, na estimativa da produtividade de culturas, no ensino e na pesquisa.