Comparison of Contemporary Protocols for High-speed Data Transport via 10 Gbps WAN Connections

This work is dedicated to comparison of open source as well as proprietary transport protocols for highspeed data transmission via IP networks. The contemporary common TCP needs significant improvement since it was developed as general-purpose transport protocol and firstly introduced four decades ago. In nowadays networks, TCP fits not all communication needs that society has. Caused of it another transport protocols have been developed and successfully used for e.g. Big Data movement. In scope of this research the following protocols have been investigated for its efficiency on 10Gbps links: UDT, RBUDP, MTP and RWTP. The protocols were tested under different impairments such as Round Trip Time up to 400 ms and packet losses up to 2%. Investigated parameters are the data rate under different conditions of the network, the CPU load by sender andreceiver during the experiments, size of feedback data, CPU usage per Gbps and the amount of feedback data per GiByte of effectively transmitted data. The best performance and fair resources consumption was observed by RWTP. From the opensource projects, the best behavior is showed by RBUDP.

Selecting control genes for RT-QPCR using public microarray data.

Background: Gene expression analysis has emerged as a major biological research area, with real-time quantitative reverse transcription PCR (RT-QPCR) being one of the most accurate and widely used techniques for expression profiling of selected genes. In order to obtain results that are comparable across assays, a stable normalization strategy is required. In general, the normalization of PCR measurements between different samples uses one to several control genes (e. g. housekeeping genes), from which a baseline reference level is constructed. Thus, the choice of the control genes is of utmost importance, yet there is not a generally accepted standard technique for screening a large number of candidates and identifying the best ones. Results: We propose a novel approach for scoring and ranking candidate genes for their suitability as control genes. Our approach relies on publicly available microarray data and allows the combination of multiple data sets originating from different platforms and/or representing different pathologies. The use of microarray data allows the screening of tens of thousands of genes, producing very comprehensive lists of candidates. We also provide two lists of candidate control genes: one which is breast cancer-specific and one with more general applicability. Two genes from the breast cancer list which had not been previously used as control genes are identified and validated by RT-QPCR. Open source R functions are available at http://www.isrec.isb-sib.ch/similar to vpopovic/research/ Conclusion: We proposed a new method for identifying candidate control genes for RT-QPCR which was able to rank thousands of genes according to some predefined suitability criteria and we applied it to the case of breast cancer. We also empirically showed that translating the results from microarray to PCR platform was achievable.

Implantación de una solución SIG para la ayuda a la toma dedecisiones para la explotación de recursos del subsuelo

L'objectiu és una aplicació que permeti realitzar el càlcul del volum de terres disponibles en el subsòl d'un àrea seleccionada. L'objectiu final del projecte serà crear un Sistema d'Informació Geogràfica SIG que ajudi a valorar quines parcel¿les de l'àrea seleccionada són les que disposen de més volum de terres per iniciar la seva explotació. Per a això, es disposa del programari gvSIG i les seves extensions (SEXTANTE) i de tota la informació que es pugui obtenir sobre els SIG, Cartografia, Geodèsia... Per dur a terme aquest projecte es necessita tenir experiència en Bases de dades, Programació Orientada a Objectes i seria recomanable tenir coneixements sobre Enginyeria del Programador. El projecte se centrarà en la utilització de gvSIG, com un exemple concret de programari SIG de lliure accés, solució desenvolupada per la ¿Conselleria d%o2019Obris Publiquis de la Generalitat Valenciana¿. Una part d'aquest projecte consistirà a avaluar aquest programari. El resultat final serà l'obtenció dels coneixements necessaris per poder treballar amb dades espacials a més d'una aplicació SIG per al càlcul del volum de terres d'un àrea seleccionada.

Comparació de SIG basats en codi lliure i SIG comercials

El present document presenta una valoració comparativa de dos sistemes d'informació geogràfica (SIG) desenvolupats sobre filosofies ben diferents, per un costat un producte comercial de desenvolupament propietari, GeoMedia Professional, i per l'altre un sistema desenvolupat sota les condicions del programari lliure, gvSIG. L'objectiu a assolir és descriure en quina situació es troba el producte de codi lliure vers el seu equivalent comercial pel fet d'haver estat desenvolupat més recentment.

Eina que permet, en temps real, poder saber l'estock de terminals de telèfons mòbils existents en un determinat magatzem.

El projecte es desenvoluparà en format web i seguint l'estàndar J2EE, dins del què podríem anomenar MVC1, de manera que la seva consulta es pugui fer en línia aprofitant les noves tecnologies i l'accés a internet.

Desenvolupament d'una aplicació que realitzi de forma automatitzada lainserció de referències bibliogràfiques en un document OpenOffice.

Desenvolupament d'una aplicació que realitzi de forma automatitzada lainserció de referències bibliogràfiques en un document OpenOffice. Aquestes referències formaran part d¿un document extern que serà validat per una DTD, per tant, de forma implícita s¿estudiarà el format XML per a l¿elaboració estructuradad¿informació i el format DTD per la seva validació.

Gestión académica de un centro de formación

Aquesta aplicació tindrà com a principal objectiu l'automatització de certes tasques pròpies d'un centre educatiu. S'ha escollit com a model per a l'especificació de JEE (JEE 6) el framework Open Source Jboss SIGUEM, creat per Jboss MiddelWare.

Diseño y desarrollo de un cliente WPS en el entorno GVSIG

Extensió per gvSIG anomenada extWPS, que permet executar processos a través de Web Processing Service (wps), el protocol promogut per l'Open Geospatial Consortium (OGC). El programari, elaborat en Java, es basa en el conjunt de llibreries de la iniciativa 52north i té llicència GPL. Fa possible, una vegada instal lat sobre gvSIG, connectar-se a un servidor wps, veure els geoprocesos disponibles a ell i executar de manera remota.

A DVD authoring tool for GNU/Linuxdesktop systems

Projecte denominat Mistelix, una eina d'autoria de DVD en codi obert per a sistemes GNU / Linux.

Desenvolupament d'edició geogràfica segons l'estàndard WFS-T sobre l'API de Google Maps

El present treball tractarà d'aprofitar Google Maps i les eines lliures disponibles, per construir unes llibreries Javascript d'ús obert que permetin afegir serveis de persistència als serveis de cartografia ja disponibles.

Diseño y Desarrollo de herramientas devalidación topológica en el entorno gvSIG

La solució software desenvolupada en l'àmbit del projecte és una extensió per a gvSIG. Aquesta solució permet realitzar validacions topològiques per a xarxes d'aigua en aquesta plataforma. A més, el treball realitzat posa les bases per el desenvolupament d'eines de validació topològica de caràcter més general.

Construcció d'una eina automàtica per extreure informació d'un document OpenOffice

Aquest Projecte de Final de Carrera consisteix en estudiar el format dels fitxers OpenOffice i extreure'n certa informació continguda en els documents per satisfer una necessitat plantejada per la recentment constituïda Agencia Catalana de Seguretat, mitjançant una eina de software creada per a tal fi.

Gestió de projectes informàtics

Aquesta aplicació es l¿evolució d¿un programa existent, realitzat amb una base de dades d¿escriptori amb capacitats de programació i creació d¿interfícies d¿usuari, que per executar-la cal una llicencia i que ha de funcionar sobre un sistema operatiu privatiu (també amb llicencia). Evoluciona cap a un entorn realitzat sobre programari lliure, que funciona sobre qualsevol sistema operatiu i no es necessari pagar cap llicencia per a fer-lo servir, ni en la part servidora ni en la part client.

VoWiFi & IM : Comunicaciones móviles en la red global

El principal objectiu d'aquest projecte és l'estudi de la tecnologia ViWiFi tant des del punt de vista de la seva base tècnica com de les seves possibles aplicacions actuals i futures, especialment referent a la integració de serveis addicionals com la missatgeria instantània. Una vegada analitzats els conceptes teòrics es realitza un estudi de les principals eines de codi obert que permeten implementar aquest tipus de plataformes, per a finalment concloure amb la instal·lació pràctica d'una plataforma de laboratori.