Partial characterization of the cloned dihydrofolate reductase gene of Saccharomyces cerevisiae

The cloned dihydrofolate reductase gene of Saccharomyces cerevisiae (DFR 1) is expressed in Escherichia coli. Bacterial strain JF1754 transformed with plasmids containing DFR 1 is at least 5X more resistant to inhibition by the folate antagonist trimethoprim. Expression of yeast DFR 1 in E. coli suggests it is likely that the gene lacks intervening sequences. The 1.8 kbp DNA fragment encoding yeast dhfr activity probably has its own promotor, as the gene is expressed in both orientations in E. coli. Expression of the yeast dhfr gene cloned into M13 viral vectors allowed positive selection of DFR 1 - M13 bacterial transfectants in medium supplemented with trimethoprim. A series of nested deletions generated by nuclease Bal 31 digestion and by restriction endonuclease cleavage of plasmids containing DFR 1 physically mapped the gene to a 930 bp region between the Pst 1 and Sal 1 cut sites. This is consistent with the 21,000 molecular weight attributed to yeast dhfr in previous reports. From preliminary DNA sequence analysis of the dhfr DNA fragment the 3' terminus of DFR 1 was assigned to a position 27 nucleotides from the Eco Rl cut site on the Bam Hi - Eco Rl DNA segment. Several putative yeast transcription termination consensus sequences were identified 3' to the opal stop codon. DFR 1 is expressed in yeast and it confers resistance to the antifolate methotrexate when the gene is present in 2 - 10 copies per cell. Plasmid-dependent resistance to methotrexate is also observed in a rad 6 background although the effect is somewhat less than that conferred to wild-type or rad 18 cells. Integration of DFR 1 into the yeast genome showed an intermediate sensitivity to folate antagonists. This may suggest a gene dosage effect. No change in petite induction in these yeast strains was observed in transformed cells containing yeast dhfr plasmids. The sensitivity of rad 6 , rad 18 and wild-type cell populations to trimethoprim were unaffected by the presence of DFR 1 in transformants. Moreover, trimethoprim did not induce petites in any strain tested, which normally results if dhfr is inhibited by other antifolates such as methotrexate. This may suggest that the dhfr enzyme is not the only possible target of trimethoprim in yeast. rad 6 mutants showed a very low level of spontaneous petite formation. Methotrexate failed to induce respiratory deficient mutants in this strain which suggested that rad 6 might be an obligate grande. However, ethidium bromide induced petites to a level approximately 50% of that exhibited by wild-type and rad 18 strains.

Étude de l'influence de la perte de masse sur l'évolution d'étoiles de plusieurs types

Cette thèse a été réalisée en cotutelle. Pour la forme, Gérard Jasniewicz était mon codirecteur 'officiel' en France, bien que mon codirecteur était plutôt Olivier Richard qui m'a encadré lorsque j'étais en France.

Maygen: A Symbolic Debugger Generation System

With the development of high-level languages for new computer architectures comes the need for appropriate debugging tools as well. One method for meeting this need would be to develop, from scratch, a symbolic debugger with the introduction of each new language implementation for any given architecture. This, however, seems to require unnecessary duplication of effort among developers. This paper describes Maygen, a "debugger generation system," designed to efficiently provide the desired language-dependent and architecture-dependent debuggers. A prototype of the Maygen system has been implemented and is able to handle the semantically different languages of C and OPAL.

Adherencia a las guías de reanimación temprana dirigida por metas, en un hospital de Bogotá, Colombia

Introducción: El manejo temprano de los pacientes con sepsis severa y choque séptico en los servicios de urgencias bajo la “terapia temprana dirigida por metas”, propuesto por Rivers en su guía “Surviving Sepsis Campain”, parece relacionarce con la disminución de la mortalidad en los primeras 28 días posteriores a la atención médica. El presente estudio busca medir la adherencia a estas recomendaciones en un servicio de urgencias de un hospital de cuarto nivel. Metodología: Mediante un estudio observacional analítico de corte transversal, fueron revisadas las historias clínicas de un grupo de pacientes con sepsis severa y choque séptico, que ingresaron en el año 2013 al servicio de urgencias de un hospital de cuarto nivel de Bogotá, Colombia, con el fin de determinar la proporción de pacientes que recibió reanimación temprana guiada por metas de acuerdo a la guía internacional. Resultados: Se evaluaron 3000 registros clínicos, de los cuales fueron incluídos 130 pacientes. 15.4% recibió manejo de acuerdo a las guías internacionales de reanimación temprana. La mortalidad por sepsis severa y choque séptico fue del 10.7%. La mortalidad en pacientes atendidos de acuerdo a las guías fue del 15% comparada y del 10% en los no adherentes (p > 0.05). Conclusiones: El presente estudio muestra cifras bajas de adherencia a las recomendaciones internacionales propuestas por Rivers. Se deben realizar campañas de sensibilización y capacitación al personal médico y paramédico de los servicios de urgencias con el fin de mejorar la supervivencia en este grupo de pacientes.

Espeleotemas de ópalo y pseudocarst granítico

The amorphous silica (opal-A) speleothems associated to the open structural system of granitic rocks where the slow circulation of runoff is produced are mainly the result of the biological degradation of the rock. These speleothems are found in many different geographic, climatic and geological environments though always associated to granitoids. They show two different morphologies: cylindrical or long bodies and laminar or layered forms. They are internally formed by a mass of clasts and spheres of opal-Awith a porous texture that evolves to compact and massive due to the reiteration of the re-dissolution/re-precipitation of the amorphous opal by the water that circulates through it after each rainfall period. A final characteristic of each growth stage (end of rainy period) is the development of whiskers of minerals, normally gypsum, on the water output points of the speleothems. The dimensions of the speleothems are millimetric (length and/or thickness). In this paper their morphology and mineralogy are described based on their study by SEM, XRD and XRF, and there is established a new and more complete genetic hypothesis than the one that exists up to now to understand their formation

Sea-surface temperature records of Termination 1 in the Gulf of California: Challenges for seasonal and interannual analogues of tropical Pacific climate change

Centennial-scale records of sea-surface temperature and opal composition spanning the Last Glacial Maximum and Termination 1 (circa 25–6 ka) are presented here from Guaymas Basin in the Gulf of California. Through the application of two organic geochemistry proxies, the U37K′ index and the TEX86H index, we present evidence for rapid, stepped changes in temperatures during deglaciation. These occur in both temperature proxies at 13 ka (∼3°C increase in 270 years), 10.0 ka (∼2°C decrease over ∼250 years) and at 8.2 ka (3°C increase in <200 years). An additional rapid warming step is also observed in TEX86H at 11.5 ka. In comparing the two temperature proxies and opal content, we consider the potential for upwelling intensity to be recorded and link this millennial-scale variability to shifting Intertropical Convergence Zone position and variations in the strength of the Subtropical High. The onset of the deglacial warming from 17 to 18 ka is comparable to a “southern hemisphere” signal, although the opal record mimics the ice-rafting events of the north Atlantic (Heinrich events). Neither the modern seasonal cycle nor El Niño/Southern Oscillation patterns provide valid analogues for the trends we observe in comparison with other regional records. Fully coupled climate model simulations confirm this result, and in combination we question whether the seasonal or interannual climate variations of the modern climate are valid analogues for the glacial and deglacial tropical Pacific.

Períodos de interferência das plantas daninhas na cultura do algodoeiro (Gossypium hirsutum)

Com o objetivo de determinar os efeitos de períodos de controle e de convivência das plantas daninhas na produtividade da cultura do algodoeiro (Gossypium hirsutum), cultivar Delta-Opal, realizou-se um experimento que constou de dois grupos de tratamentos. No primeiro, a cultura permaneceu livre da competição das plantas daninhas desde a emergência até 7, 14, 21, 28, 35, 42, 49, 56, 63 dias e colheita (159 dias). No segundo, a cultura permaneceu em competição com a comunidade infestante desde a emergência até os mesmos períodos descritos para a primeira série de tratamentos. Dentre as espécies de plantas daninhas encontradas na área experimental, destacaram-se a tiririca (Cyperus rotundus), o fedegoso (Senna obtusifolia), a anileira (Indigofera hirsuta) e o capim-carrapicho (Cenchrus echinatus). Pelas condições edáficas, climáticas e florísticas sob as quais foi conduzida a cultura de algodão, o Período Anterior à Interferência (PAI) dessa comunidade que reduziu em 5% a produtividade da cultura foi de oito dias após a emergência da cultura (DAE); o Período Total de Prevenção da Interferência (PTPI) foi de 66 DAE; e o Período Crítico de Prevenção da Interferência (PCPI) foi dos 8 aos 66 DAE.

Efeito da densidade de tubérculos de tiririca (Cyperus rotundus) sobre o crescimento inicial de plantas de algodão

O objetivo deste trabalho foi avaliar a interferência de densidades de tubérculos de tiririca no crescimento inicial de plantas de algodão, cultivar Delta Opal. Para isso, utilizaram-se caixas de cimento-amianto (0,60 x 0,60 x 0,25 m) com Latossolo Vermelho Escuro, no centro das quais foram semeadas seis sementes de algodão, em linha, espaçadas de 0,10 m; em seguida, plantaram-se tubérculos de tiririca nas densidades de 0, 5, 10, 15, 25, 50, 75, 100, 125, 150, 175 e 200 tubérculos por caixa, que foram nestas distribuídos aleatoriamente. O delineamento experimental foi o de blocos casualizados, em quatro repetições. Aos 50 dias após a semeadura, foram determinados, nas plantas de algodão, a altura e o teor relativo de clorofila total. Ao término do período experimental (65 dias após a emergência do algodão), foram determinados: altura, teor relativo de clorofila total, área foliar e matéria seca do caule e das folhas. Nas plantas de tiririca foi feita a contagem do número final de plantas (partes aéreas) por caixa. A interferência da tiririca no crescimento inicial do algodoeiro iniciou-se a partir de 5 tubérculos/caixa, reduzindo em até 71% as características analisadas na mais alta densidade (200 tubérculos/caixa). A competição intra-específica na tiririca acentuou-se a partir de 75 tubérculos/caixa, quando obteve mais do que 1,86 brotação por tubérculo. As características avaliadas nas plantas de algodão mais sensíveis ao efeito dos tubérculos de tiririca foram: área foliar, massa seca de folhas, caule e altura das plantas, nesta ordem.

Reação de cultivares de algodoeiro a Ramularia areola

Dentre as doenças causadoras de manchas foliares em algodoeiro, a mancha de ramulária (Ramularia areola Atk) tem se tornado importante em virtude das condições climáticas favoráveis para o desenvolvimento do patógeno, aliadas ao uso de cultivares suscetíveis, plantio consecutivo e extenso. Neste trabalho avaliaram-se os cultivares Delta Opal, Acala 90, Makina, Delta Penta e Sure Grow 821 quanto à resistência a R. areola, em condições de campo na FCAV-UNESP, no ano de 2006. A severidade da doença, que ocorreu por infecção natural das plantas pelo fungo, foi avaliada semanalmente em trinta plantas devidamente marcadas, utilizando-se uma escala descritiva de notas: 1 = 0%, 2 = até 5%, 3 = de 5,1 a 25%, 4 = de 25,1 a 50% e 5 = acima de 50% de área foliar com sintomas. Foram elaboradas curvas de progresso da doença para os cinco cultivares e o modelo monomolecular foi o que melhor se ajustou aos dados, em comparação com o logístico, o exponencial e o modelo de Gompertz. A análise dos dados indicou que houve diferença significativa entre os genótipos, sendo que Delta Opal, Makina e Sure Grow 821 mostraram-se mais suscetíveis e Delta Penta e Acala 90 mais resistentes ao fungo.

Sensibilidade de cultivares de algodoeiro ao cloreto de mepiquat

O objetivo deste trabalho foi avaliar a sensibilidade de cultivares de algodoeiro ao cloreto de mepiquat e verificar se ela está relacionada ao ciclo ou à arquitetura da planta. Foi realizado um experimento em casa de vegetação com seis cultivares de algodoeiro - FiberMax 966, FiberMax 977, Delta Penta, Delta Opal, FMT 501 e FMT 701 - e quatro doses do regulador vegetal à base de cloreto de mepiquat - 0, 7,5, 15 e 22,5 g ha-1 de i.a. -, em delineamento de blocos ao acaso, com arranjo fatorial 6x4 e quatro repetições. As parcelas experimentais foram constituídas por vasos de 12 L com duas plantas em cada um. As doses do regulador vegetal foram aplicadas sem adjuvante, no estádio de aparecimento dos botões florais, aos 34 dias após a emergência das plântulas. Paralelamente ao experimento com doses, a retenção do regulador pelas folhas das cultivares foi quantificada. O crescimento em altura das plantas de algodoeiro é diminuído com a aplicação do regulador vegetal, e esse efeito se intensifica com o aumento da dosagem aplicada. Existe diferença entre as cultivares estudadas quanto à sensibilidade ao cloreto de mepiquat, sendo que as mais precoces são mais sensíveis. Além da sensibilidade diferenciada, a arquitetura das plantas pode possibilitar maior ou menor deposição do regulador sobre as folhas.

Vector and axial-vector correlators in a non-local chiral quark model

The behavior of the non-perturbative parts of the isovector-vector and isovector and isosinglet axial-vector correlators at Euclidean momenta is studied in the framework of a covariant chiral quark model with non-local quark-quark interactions. The gauge covariance is ensured with the help of the P-exponents, with the corresponding modification of the quark-current interaction vertices taken into account. The low- and high-momentum behavior of the correlators is compared with the chiral perturbation theory and with the QCD operator product expansion, respectively. The V-A combination of the correlators obtained in the model reproduces quantitatively the ALEPH and OPAL data on hadronic tau decays, transformed into the Euclidean domain via dispersion relations. The predictions for the electromagnetic pi(+/-) - pi(0) mass difference and for the pion electric polarizability are also in agreement with the experimental values. The topological susceptibility of the vacuum is evaluated as a function of the momentum, and its first moment is predicted to be chi'(0) approximate to (50 MeV)(2). In addition, the fulfillment of the Crewther theorem is demonstrated.

Síntese e caracterização de esferas monodispersas de látex e sua utilização no preparo de filmes de cristais coloidais tridimensionais

Esferas de poliestireno foram obtidas através da polimerização do estireno sem a presença de emulsificante. A suspensão foi caracterizada por Espalhamento de Luz e Microscopia Eletrônica de Transmissão apresentando monodispersidade com tamanho em torno de 463 nm. O método de deposição vertical foi utilizado para preparar filmes em substratos de vidro a partir da suspensão de esferas. Filmes de opalas de alta qualidade foram obtidos e caracterizados por Espectroscopia de Reflectância, Microscopia Eletrônica de Varredura e Microscopia Óptica.

Rainfall intensity and Mepiquat Chloride persistence in cotton

Em parte das regiões onde se encontram as maiores áreas de algodão no Brasil atualmente, o índice pluviométrico está ao redor de 2.000 mm anuais, existindo risco de ocorrer lavagem do Cloreto de Mepiquat (CM) das folhas do algodoeiro antes de ser absorvido pelas plantas. O objetivo deste trabalho foi avaliar a lavagem do CM aplicado no algodoeiro por diferentes laminas de chuva simulada. Os tratamentos constaram de três doses do regulador à base de cloreto de mepiquat: 0, 15.0 e 30.0 g ha-1 e quatro lâminas de chuva simulada: 5, 10, 20 e 40 mm, mais um tratamento sem chuva. Foram utilizados vasos de 12 litros de capacidade e a cultivar Delta Opal. Os parâmetros avaliados foram: altura de plantas, número de ramos reprodutivos, massa de matéria seca, retenção de estruturas reprodutivas e área foliar. Quanto maior a intensidade de chuva ocorrida após a aplicação do regulador maior foi o comprometimento da ação do produto, que repercutiu em interferência no crescimento das plantas. Chuvas de 5.0 mm, ocorridas 90 minutos após a aplicação do cloreto de mepiquat, já causaram prejuízo na ação do produto no crescimento do algodoeiro, sendo o efeito maior com o aumento da quantidade de chuva simulada.

Boron deficiency inhibits petiole and peduncle cell development and reduces growth of cotton

The effect of boron (B) on cotton growth and fruit shedding may be due not only to physiological or biochemical effects, but also to vascular tissue malformation. This experiment investigated petiole and floral peduncle anatomical alterations and growth of cotton supplied with deficient and sufficient B in nutrient solution. Cotton (Gossypium hirsutum cv. 'Delta Opal') plants were grown in solutions containing 0, 1.5, 3.0, 4.5, and 6.0 mu mol L-1 of B from 22 to 36 d after plant emergence (DAPE). From 36 to 51 DAPE, B was omitted from the nutrient solution. Petioles from young leaves and floral bud peduncles (first position of the first sympodial) were sampled and the cross-section anatomy observed under an optical microscope. The number of vascular bundles of the petiole was decreased in B-deficient plants and the xylem was disorganized. Phloem elements in the peduncle vascular cylinder of B-deficient plants did not show clear differentiation. The few xylem elements that were formed were also disorganized. Modifications caused by B deficiency may have impaired B and photosynthate translocation into new cotton growth. Boron accumulation in the shoot of B-deficient plants suggested that there was some B translocation within the plant. It could be inferred that cotton growth would be impaired by the decrease in carbohydrate translocation rather than by B deficiency in the tissue alone.

Off-diagonal helicity density matrix elements for vector mesons produced in polarized e+e- processes

Final-state qq̄ interactions give origin to nonzero values of the off-diagonal element ρ1,-1 of the helicity density matrix of vector mesons produced in e+e- annihilations, as has been confirmed by recent OPAL data on φ, D*, and K*. New predictions are given for ρ1,-1 of several mesons produced at large XE and small pT - i.e., collinear with the parent jet - in the annihilation of polarized e+ and e-; the results depend strongly on the elementary dynamics and allow further nontrivial tests of the standard model.