Avaliação de falhas na brotação da cana-de-açúcar em função da disponibilidade hídrica

The sugarcane is a crop of annual cycle, where its large water demand is not always full, causing stand gaps in the sprouting of ratoons. Thus, this study aimed to assess the stand gaps in the first and second ratoon sugarcane under seven levels of water deficit. The experiment was conducted in the Center of Agricultural Sciences of the Federal University of Alagoas in the period of 22 February 2010 to 20 February 2012. The stand gaps depending on water depths ranged from 11.2 (25% ETo) to 16.8% (100% ETo) in the first ratoon and from 24.8 (0% ETo) to 32.8% (100% ETo) on second ratoon. The average size of stand gaps ranged from 0.60 to 0.68 m in the first ratoon and from 0.70 to 0.74 m on second ratoon. The average distance to find a stand gap ranged from 16.8 to 29.5 m in the first ratoon and from 6.5 to 10.9 m in the second ratoon. The percentage of gaps and the average size of the gaps in the sprouting of ratoon increase with the age of the sugarcane plantation and the average distance between gaps decreases. The use of irrigation in the culture of sugarcane increase the percentage of gaps, but because these spaces are filled with culms of other sugarcane clumps and were irrigated with larger water depths, the agricultural productivity of the culture increases. The depths of irrigation decreases the average distance between gaps with more intensity in the first than in the second ratoon.

Analysis of expressed sequence tags from the agarophyte Gracilaria tenuistipitata (Rhodophyta)

A total of 3,631 expressed sequence tags (ESTs) were established from two size-selected cDNA libraries made from the tetrasporophytic phase of the agarophytic red alga Gracilaria tenuistipitata. The average sizes of the inserts in the two libraries were 1,600 bp and 600 bp, with an average length of the edited sequences of 850 bp. Clustering gave 2,387 assembled sequences with a redundancy of 53%. Of the ESTs, 65% had significant matches to sequences deposited in public databases, 11% to proteins without known function, and 35% were novel. The most represented ESTs were a Na/K-transporting ATPase, a hedgehog-like protein, a glycine dehydrogenase and an actin. Most of the identified genes were involved in primary metabolism and housekeeping. The largest functional group was thus genes involved in metabolism with 14% of the ESTs; other large functional categories included energy, transcription, and protein synthesis and destination. The codon usage was examined using a subset of the data, and the codon bias was found to be limited with all codon combinations used.

The rapid atmospheric monitoring system of the Pierre Auger Observatory

The Pierre Auger Observatory is a facility built to detect air showers produced by cosmic rays above 10(17) eV. During clear nights with a low illuminated moon fraction, the UV fluorescence light produced by air showers is recorded by optical telescopes at the Observatory. To correct the observations for variations in atmospheric conditions, atmospheric monitoring is performed at regular intervals ranging from several minutes (for cloud identification) to several hours (for aerosol conditions) to several days (for vertical profiles of temperature, pressure, and humidity). In 2009, the monitoring program was upgraded to allow for additional targeted measurements of atmospheric conditions shortly after the detection of air showers of special interest, e. g., showers produced by very high-energy cosmic rays or showers with atypical longitudinal profiles. The former events are of particular importance for the determination of the energy scale of the Observatory, and the latter are characteristic of unusual air shower physics or exotic primary particle types. The purpose of targeted (or "rapid") monitoring is to improve the resolution of the atmospheric measurements for such events. In this paper, we report on the implementation of the rapid monitoring program and its current status. The rapid monitoring data have been analyzed and applied to the reconstruction of air showers of high interest, and indicate that the air fluorescence measurements affected by clouds and aerosols are effectively corrected using measurements from the regular atmospheric monitoring program. We find that the rapid monitoring program has potential for supporting dedicated physics analyses beyond the standard event reconstruction.

Genetic diversity of Leishmania amazonensis strains isolated in northeastern Brazil as revealed by DNA sequencing, PCR-based analyses and molecular karyotyping

Abstract Background Leishmania (Leishmania) amazonensis infection in man results in a clinical spectrum of disease manifestations ranging from cutaneous to mucosal or visceral involvement. In the present study, we have investigated the genetic variability of 18 L. amazonensis strains isolated in northeastern Brazil from patients with different clinical manifestations of leishmaniasis. Parasite DNA was analyzed by sequencing of the ITS flanking the 5.8 S subunit of the ribosomal RNA genes, by RAPD and SSR-PCR and by PFGE followed by hybridization with gene-specific probes. Results ITS sequencing and PCR-based methods revealed genetic heterogeneity among the L. amazonensis isolates examined and molecular karyotyping also showed variation in the chromosome size of different isolates. Unrooted genetic trees separated strains into different groups. Conclusion These results indicate that L. amazonensis strains isolated from leishmaniasis patients from northeastern Brazil are genetically diverse, however, no correlation between genetic polymorphism and phenotype were found.

Transcriptional effects of 1,25 dihydroxyvitamin D3 physiological and supra-physiological concentrations in breast cancer organotypic culture

Background Vitamin D transcriptional effects were linked to tumor growth control, however, the hormone targets were determined in cell cultures exposed to supra physiological concentrations of 1,25(OH)2D3 (50-100nM). Our aim was to evaluate the transcriptional effects of 1,25(OH)2D3 in a more physiological model of breast cancer, consisting of fresh tumor slices exposed to 1,25(OH)2D3 at concentrations that can be attained in vivo. Methods Tumor samples from post-menopausal breast cancer patients were sliced and cultured for 24 hours with or without 1,25(OH)2D3 0.5nM or 100nM. Gene expression was analyzed by microarray (SAM paired analysis, FDR≤0.1) or RT-qPCR (p≤0.05, Friedman/Wilcoxon test). Expression of candidate genes was then evaluated in mammary epithelial/breast cancer lineages and cancer associated fibroblasts (CAFs), exposed or not to 1,25(OH)2D3 0.5nM, using RT-qPCR, western blot or immunocytochemistry. Results 1,25(OH)2D3 0.5nM or 100nM effects were evaluated in five tumor samples by microarray and seven and 136 genes, respectively, were up-regulated. There was an enrichment of genes containing transcription factor binding sites for the vitamin D receptor (VDR) in samples exposed to 1,25(OH)2D3 near physiological concentration. Genes up-modulated by both 1,25(OH)2D3 concentrations were CYP24A1, DPP4, CA2, EFTUD1, TKTL1, KCNK3. Expression of candidate genes was subsequently evaluated in another 16 samples by RT-qPCR and up-regulation of CYP24A1, DPP4 and CA2 by 1,25(OH)2D3 was confirmed. To evaluate whether the transcripitonal targets of 1,25(OH)2D3 0.5nM were restricted to the epithelial or stromal compartments, gene expression was examined in HB4A, C5.4, SKBR3, MDA-MB231, MCF-7 lineages and CAFs, using RT-qPCR. In epithelial cells, there was a clear induction of CYP24A1, CA2, CD14 and IL1RL1. In fibroblasts, in addition to CYP24A1 induction, there was a trend towards up-regulation of CA2, IL1RL1, and DPP4. A higher protein expression of CD14 in epithelial cells and CA2 and DPP4 in CAFs exposed to 1,25(OH)2D3 0.5nM was detected. Conclusions In breast cancer specimens a short period of 1,25(OH)2D3 exposure at near physiological concentration modestly activates the hormone transcriptional pathway. Induction of CYP24A1, CA2, DPP4, IL1RL1 expression appears to reflect 1,25(OH)2D3 effects in epithelial as well as stromal cells, however, induction of CD14 expression is likely restricted to the epithelial compartment.

Transient transfection of serum-free suspension HEK 293 cell culture for efficient production of human rFVIII

Abstract Background Hemophilia A is a bleeding disorder caused by deficiency in coagulation factor VIII. Recombinant factor VIII (rFVIII) is an alternative to plasma-derived FVIII for the treatment of hemophilia A. However, commercial manufacturing of rFVIII products is inefficient and costly and is associated to high prices and product shortage, even in economically privileged countries. This situation may be solved by adopting more efficient production methods. Here, we evaluated the potential of transient transfection in producing rFVIII in serum-free suspension HEK 293 cell cultures and investigated the effects of different DNA concentration (0.4, 0.6 and 0.8 μg/106 cells) and repeated transfections done at 34° and 37°C. Results We observed a decrease in cell growth when high DNA concentrations were used, but no significant differences in transfection efficiency and in the biological activity of the rFVIII were noticed. The best condition for rFVIII production was obtained with repeated transfections at 34°C using 0.4 μg DNA/106 cells through which almost 50 IU of active rFVIII was produced six days post-transfection. Conclusion Serum-free suspension transient transfection is thus a viable option for high-yield-rFVIII production. Work is in progress to further optimize the process and validate its scalability.

Diferenciação in vitro de células-tronco mesenquimais da medula óssea de cães em precursores osteogênicos

O objetivo principal da nossa pesquisa foi avaliar o potencial de diferenciação osteogênica de células-tronco mesenquimais (MSC) obtidas da medula óssea do cão. As MSC foram separadas pelo método Ficoll e cultivadas sob duas condições distintas: DMEM baixa glicose ou DMEM/F12, ambos contendo L-glutamina, 20% de SFB e antibióticos. Marcadores de MSC foram testados, confirmando células CD44+ e CD34- através da citometria de fluxo. Para a diferenciação osteogênica, as células foram submetidas a quatro diferentes condições: Grupo 1, as mesmas condições utilizadas para a cultura de células primárias com os meios DMEM baixa glicose suplementado; Grupo 2, as mesmas condições do Grupo 1, mais os indutores de diferenciação dexametasona, ácido ascórbico e b-glicerolfosfato; Grupo 3, células cultivadas com meios DMEM/F12 suplementado; e Grupo 4, nas mesmas condições que no Grupo 3, mais indutores de diferenciação de dexametasona, ácido ascórbico e b-glicerolfosfato. A diferenciação celular foi confirmada através da coloração com alizarin red e da imunomarcação com o anticorpo SP7/Osterix. Nós observamos através da coloração com alizarin red que o depósito de cálcio foi mais evidente nas células cultivadas em DMEM/F12. Além disso, usando a imunomarcação com o anticorpo SP/7Osterix obtivemos positividade em 1:6 células para o Meio DMEM/F12 comparada com 1:12 para o meio DMEM-baixa glicose. Com base nos nossos resultados concluímos que o meio DMEM/F12 é mais eficiente para a indução da diferenciação de células-tronco mesenquimais caninas em promotores osteogênicos. Este efeito provavelmente ocorre em decorrência da maior quantidade de glicose neste meio, bem como da presença de diversos aminoácidos.

Interspecific variation of the bacterial community structure in the phyllosphere of the three major plant components of mangrove forests

Mangrove forests encompass a group of trees species that inhabit the intertidal zones, where soil is characterized by the high salinity and low availability of oxygen. The phyllosphere of these trees represent the habitat provided on the aboveground parts of plants, supporting in a global scale, a large and complex microbial community. The structure of phyllosphere communities reflects immigration, survival and growth of microbial colonizers, which is influenced by numerous environmental factors in addition to leaf physical and chemical properties. Here, a combination of culture-base methods with PCR-DGGE was applied to test whether local or plant specific factors shape the bacterial community of the phyllosphere from three plant species (Avicenia shaueriana, Laguncularia racemosa and Rhizophora mangle), found in two mangroves. The number of bacteria in the phyllosphere of these plants varied between 3.62 x 10(4) in A. schaeriana and 6.26 x 10³ in R. mangle. The results obtained by PCR-DGGE and isolation approaches were congruent and demonstrated that each plant species harbor specific bacterial communities in their leaves surfaces. Moreover, the ordination of environmental factors (mangrove and plant species), by redundancy analysis (RDA), also indicated that the selection exerted by plant species is higher than mangrove location on bacterial communities at phyllosphere.

RELIGIÃO E SERTÃO: A VIDA, A PALAVRA E O SAGRADO COMO VEREDAS DE LEITURA TEOLÓGICOLITERÁRIA PARA A OBRA DE JOÃO GUIMARÃES ROSA

A presente tese, de título: Religião e Sertão, é uma tentativa de ler, a partir do viés do diálogo entre religião, teologia e literatura, e do método da correspondência de Antonio Carlos de Melo Magalhães, a obra do literato mineiro João Guimarães Rosa. Para tanto, a tese segue por meio de três grandes correspondências encontradas não só na obra rosiana como também, de forma comum e constante, em quase todas as pesquisas que seguem a interface teologia e literatura: palavra, vida e sagrado. Vida como processo de existência a travessia do homem humana, palavra como meio de manifestação dessa existência e sagrado como forma de explicação para essa existência. Desse modo, os quatro capítulos da tese seguem essas correspondências: o primeiro, com uma discussão sobre o próprio diálogo: religião, teologia e literatura, seguido dos outros três, como veredas de leitura: vida, palavra e sagrado.(AU)

RELIGIÃO E SERTÃO: A VIDA, A PALAVRA E O SAGRADO COMO VEREDAS DE LEITURA TEOLÓGICOLITERÁRIA PARA A OBRA DE JOÃO GUIMARÃES ROSA

A presente tese, de título: Religião e Sertão, é uma tentativa de ler, a partir do viés do diálogo entre religião, teologia e literatura, e do método da correspondência de Antonio Carlos de Melo Magalhães, a obra do literato mineiro João Guimarães Rosa. Para tanto, a tese segue por meio de três grandes correspondências encontradas não só na obra rosiana como também, de forma comum e constante, em quase todas as pesquisas que seguem a interface teologia e literatura: palavra, vida e sagrado. Vida como processo de existência a travessia do homem humana, palavra como meio de manifestação dessa existência e sagrado como forma de explicação para essa existência. Desse modo, os quatro capítulos da tese seguem essas correspondências: o primeiro, com uma discussão sobre o próprio diálogo: religião, teologia e literatura, seguido dos outros três, como veredas de leitura: vida, palavra e sagrado.(AU)

SABERES DOCENTES DOS PROFESSORES QUE ATUAM NOS ANOS FINAIS DO ENSINO FUNDAMENTAL

O estudo busca conhecer o trabalho desenvolvido por professores de diferentes componentes curriculares dos anos finais do Ensino Fundamental da rede pública de ensino da cidade de São Paulo de modo a identificar e compreender suas percepções a respeito dos saberes docentes no contexto do processo ensino e aprendizagem. Assim discute-se os saberes que os professores adquirem e/ou reelaboram na prática pedagógica e que são por eles vistos como possibilidades de mudanças no processo ensino e aprendizagem que contemple um ensino de qualidade. O referencial adotado pauta-se em estudos sobre saberes docentes e sua prática, o conhecimento sobre os processos de ensino e aprendizagem e a formação dos professores que atuam nos anos finais do Ensino de Fundamental, tendo como autores principais, Tardif, Garrido, Gatti e Luckesi. Para tanto, procede-se à análise de documentos oficiais e à aplicação de um questionário a doze professores dos anos finais do Ensino Fundamental com o objetivo de conhecer aspectos da vida profissional, bem como as articulações que eles fazem entre saberes docentes, práticas profissionais e processo ensino e aprendizagem. Os resultados demonstram os saberes desenvolvidos pelos docentes, e as práticas pedagógicas que construíram ao longo de seu exercício profissional frente as dificuldades evidenciadas em alguns grupos de alunos. Por fim, os dados revelam a necessidade de se garantir discussões sobre o currículo das turmas dos anos finais do Ensino Fundamental de forma a se perceber que a evolução que os educadores almejam com todos os envolvidos no processo ensino e aprendizagem se ressignificam na prática do conhecimento.

DESENVOLVIMENTO E JUSTIÇA NA MISSÃO INTEGRAL: UMA ANÁLISE CRÍTICA DA PRESENÇA DA TEOLOGIA E PRÁXIS DA MISSÃO INTEGRAL NO SOLO PAULISTANO - Estudo da PIBSP.

No presente estudo sobre o tema: “Desenvolvimento e Justiça na Missão Integral: Uma análise crítica da presença da Teologia e Práxis da Missão Integral no Solo Paulistano” procura-se analisar a presença do conceito de desenvolvimento e justiça da Missão Integral no solo paulistano. Para tal análise tomou-se como sujeito de pesquisa a Primeira Igreja Batista de São Paulo. Esta dissertação foi desenvolvida no Programa de Pós- Graduação em Ciências da Religião, e pertence à linha de pesquisa “Religião, Sociedade e Cultura”. A metodologia adotada na coleta de dados foi de uma revisão bibliográfica e pesquisa de campo por meio de um roteiro de entrevista. Os questionamentos que nortearam a pesquisa foram: O que é desenvolvimento e Justiça na Missão Integral? É possível notar a presença desses conceitos na práxis e na teologia da Primeira Igreja Batista de São Paulo? Após uma análise da Missão Integral e da Igreja pesquisada, foi possível verificar as aproximações e distanciamentos, assim como hipóteses que justificassem esses fatos. No primeiro capítulo foi apresentada a Missão Integral, sua história, teologia e método. No segundo capítulo os conceitos de desenvolvimento e justiça foram trabalhados. O último capítulo apresentou a Primeira Igreja Batista de São Paulo; buscou estabelecer diálogo entre o conceito de Desenvolvimento e Justiça da Missão Integral e a teologia e práxis da Primeira Igreja Batista de São Paulo.