Descripción del análisis microbológico realizado mediante maldi-tof en muestras de la fundación santa fe de Bogotá.

Introducción: La rápida detección e identificación bacteriana es fundamental para el manejo de los pacientes críticos que presentan una patología infecciosa, esto requiere de métodos rápidos para el inicio de un correcto tratamiento. En Colombia se usan pruebas microbiología convencional. No hay estudios de espectrofotometría de masas en análisis de muestras de pacientes críticos en Colombia. Objetivo general: Describir la experiencia del análisis microbiológico mediante la tecnología MALDI-TOF MS en muestras tomadas en la Fundación Santa Fe de Bogotá. Materiales y Métodos: Entre junio y julio de 2013, se analizaron 147 aislamientos bacterianos de muestras clínicas, las cuales fueron procesadas previamente por medio del sistema VITEK II. Los aislamientos correspondieron a 88 hemocultivos (60%), 28 urocultivos (19%), y otros cultivos 31 (21%). Resultados: Se obtuvieron 147 aislamientos con identificación adecuada a nivel de género y/o especie así: en el 88.4% (130 muestras) a nivel de género y especie, con una concordancia del 100% comparado con el sistema VITEK II. El porcentaje de identificación fue de 66% en el grupo de bacilos gram negativos no fermentadores, 96% en enterobacterias, 100% en gérmenes fastidiosos, 92% en cocos gram positivos, 100% bacilos gram negativos móviles y 100% en levaduras. No se encontró ninguna concordancia en bacilos gram positivos y gérmenes del genero Aggregatibacter. Conclusiones: El MALDI-TOF es una prueba rápida para la identificación microbiológica de género y especie que concuerda con los resultados obtenidos de manera convencional. Faltan estudios para hacer del MALDI-TOF MS la prueba oro en identificación de gérmenes.

DETECTION OF SPORES AND HYPHAE OF ARTWORKS’ BIODETERIOGENIC FILAMENTOUS FUNGI BY RNA-FISH

Filamentous fungi are a threat to the conservation of Cultural Heritage. Thus, detection and identification of viable filamentous fungi are crucial for applying adequate Safeguard measures. RNA-FISH protocols have been previously applied with this aim in Cultural Heritage samples. However, only hyphae detection was reported in the literature, even if spores and conidia are not only a potential risk to Cultural Heritage but can also be harmful for the health of visitors, curators and restorers. Thus, the aim of this work was to evaluate various permeabilizing strategies for their application in the detection of spores/conidia and hyphae of artworks’ biodeteriogenic filamentous fungi by RNA-FISH. Besides of this, the influence of cell aging on the success of the technique and on the development of fungal autofluorescence (that could hamper the RNA-FISH signal detection) were also investigated. Five common biodeteriogenic filamentous fungi species isolated from biodegradated artworks were used as biological model: Aspergillus niger, Cladosporium sp, Fusarium sp, Penicillium sp. and Exophialia sp. Fungal autofluorescence was only detected in cells harvested from Fusarium sp, and Exophialia sp. old cultures, being aging-dependent. However, it was weak enough to allow autofluorescence/RNA-FISH signals distinction. Thus, autofluorescence was not a limitation for the application of RNA-FISH for detection of the taxa investigated. All the permeabilization strategies tested allowed to detect fungal cells from young cultures by RNA-FISH. However, only the combination of paraformaldehyde with Triton X-100 allowed the detection of conidia/spores and hyphae of old filamentous fungi. All the permeabilization strategies failed in the Aspergillus niger conidia/spores staining, which are known to be particularly difficult to permeabilize. But, even in spite of this, the application of this permeabilization method increased the analytical potential of RNA FISH in Cultural Heritage biodeterioration. Whereas much work is required to validate this RNA-FISH approach for its application in real samples from Cultural Heritage it could represent an important advance for the detection, not only of hyphae but also of spores and conidia of various filamentous fungi taxa by RNA-FISH.

Controle de fungos filamentosos deteriorantes de frutos por leveduras.

A microflora presente nos cachos de uva abriga microrganismos que podem promover a fermentação, conferir propriedades organolépticas agradáveis ao produto final e também impedir que outros agentes microbianos se desenvolvam na superfície das bagas, em especial, os fungos fitopatogênicos. Problemas fitopatológicos comprometem tanto aspectos econômicos quanto a qualidade do produto final. O objetivo deste trabalho foi avaliar o comportamento de leveduras killer com relação ao controle de fungos fitopatogênicos Botrytis cinerea, Glomerella cingulata e Penicillium expansum.

Isolamento e seleção de fungos filamentosos resistentes a atrazina.

Embora a toxicidade de alguns herbicidas tenha sido explorada em profundidade, seu destino no ambiente e sua transformação não são bem compreendidos. a fim de melhor avaliar os impactos da atrazina, e crucial que informações sobre sua biodegradação seja explorada. De solos agrícolas com repetidas aplicações deste herbicida, como também de solos enriquecidos, foram isolados 29 fungos com resistência a altas concentrações do produto 2.000 a 7.000 ppm. Destes fungos, 9 (nove) dos gêneros Penicillium sp. e Eupenicillium sp. mostraram-se capazes de degradação que varia de 26% a 92% dentro de 21 dias, em geral. Os fungos foram cultivados em meio de cultura liquido e incubados no escuro a 28.o C, sob agitação (180 rpm). A extração foi feita com acetato de etila e o consumo da atrazina, pelos fungos, avaliado através de Cromatografia Gasosa com Detecção Termoionica específica a nitrogênio e fósforo.

Fontes Fosfatadas, Ácidos Húmicos e Fungos Solubilizadores de Fosfato em Trigo

Este trabalho objetivou avaliar o efeito de fontes fosfatadas, ácidos húmicos e fungos solubilizadores de fosfato em trigo cultivado em solo de Cerrado. O experimento foi instalado em delineamento inteiramente casualizado com 7 tratamentos: 1) ácidos húmicos (30 kg ha-1); 2) ácidos húmicos + fosfato de Arad (800 kg ha-1); 3) ácidos húmicos + pó de basalto (526 kg ha-1); 4) fosfato de Arad; 5) pó de basalto; 6) FSF (108 UFC mL-1), 7) testemunha e 4 repetições. As espécies de fungo usadas foram: um isolado de Penicillium sp e um de Aspergillus sp. A combinação de fosfato de Arad e ácidos húmicos incrementou o desenvolvimento de trigo. A inoculação de FSF não se mostrou efetiva para beneficiar o desenvolvimento de trigo.