Structural studies of Helicase NS3 variants from Hepatitis C virus genotype 3 in virological sustained responder and non-responder patients

Background. About 130 million people are infected with the hepatitis C virus (HCV) worldwide, but effective treatment options are not yet available. One of the most promising targets for antiviral therapy is nonstructural protein 3 (NS3). To identify possible changes in the structure of NS3 associated with virological sustained response or non-response of patients, a model was constructed for each helicase NS3 protein coding sequence. From this, the goal was to verify the interaction between helicases variants and their ligands. Findings. Evidence was found that the NS3 helicase portion of non-responder patients contained substitutions in its ATP and RNA binding sites. K210E substitution can cause an imbalance in the distribution of loads, leading to a decrease in the number of ligations between the essential amino acids required for the hydrolysis of ATP. W501R substitution causes an imbalance in the distribution of loads, leading and forcing the RNA to interact with the amino acid Thr269, but not preventing binding of ribavirin inhibitor. Conclusions. Useful information is provided on the genetic profiling of the HCV genotype 3, specifically the coding region of the NS3 protein, improving our understanding of the viral genome and the regions of its protein catalytic site. © 2010 Rahal et al; licensee BioMed Central Ltd.

Allelic variants of XRCC1 and XRCC3 repair genes and susceptibility of oral cancer in Brazilian patients

Background: The capacity for DNA repair is essential in maintaining cellular functions and homeostasis; however, this capacity can be altered based on DNA sequence variations in DNA repair genes, which may contribute to the onset of cancer. Many single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in repair genes have been found to be associated with oral cancer. The aim of this study was to investigate the relationship between the presence of allelic variants Arg194Trp (rs:1799782) and Arg399Gln (rs: 25487) of XRCC1 gene and Thr241Met (rs: 861539) of XRCC3 gene and susceptibility to oral cancer. We also attempted to correlate the frequencies obtained for each of the SNPs to histopathological parameters. Methods: A case-control study was conducted with genomic DNA from 150 patients with oral squamous cell carcinomas and 150 controls. SNPs were genotyped by RFLP-PCR. Results: The presence of the polymorphic variants of the XRCC1 gene within codon 194 (OR 0.82, 95% CI: 0.44-1.51) and codon 399 (OR 0.94, 95% CI: 0.59-1.50) and within the XRCC3 gene (OR 0.72; 95% CI: 0.45-1.16) were not associated with an increased risk of oral cancer. A combinational analysis of SNPs in both genes indicated no association. The presence of the allelic variants of these two genes had no statistically significant effect on tumor differentiation, lymph node invasion or tumor size. Conclusions: These results suggest that allelic variants of XRCC1 and XRCC3 are not suitable markers for susceptibility to carcinomas of the oral cavity and are also not related to the later stages of such tumors. © 2012 John Wiley & Sons A/S.

Efeito antitumoral, genotóxico e mutagênico de nitensidina A em camundongos nude BALB/c com implante tumoral xenográfico de células imortalizadas com HPV-16 (SiHa)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Avaliação da atividade apoptótica de substância pura isolada de Cryptocarya mandioccanna em células de carcinoma cervical imortalizadas pelo papilomavirus humano (HPV)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Relação de infectividade entre Papilomavírus humano (HPV) e Chlamydia trachomatis em gestantes com lesões genitais sugestivas de doença HPV induzida

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Detecção do HPV por nPCR em carcinomas epidermóides de assoalho bucal e sua correlação com variáveis clínico-patológicas, fatores de risco e sobrevida

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Detecção do papilomavírus humano (HPV) em carcinoma epidermóide de lábio através da nested PCR e sua correlação com os fatores de risco, características clínicas, anatomopatológicas e de sobrevida

Pós-graduação em Odontologia - FOA

Antígenos leucocitários humanos não-clássicos HLA-G e HLA-E em lesões benignas, pré-malignas e malignas de laringe associadas à infecção pelo Papilomavirus Humano (HPV)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Identificação de marcadores moleculares de resposta à quimioterapia neoadjuvante e associação de radioterapia e quimioterapia em pacientes com carcinoma epidermóide de orofaringe

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Genotipagem de HPV e imunorreatividade da ciclina D1 em adenocarcinoma de colo do útero

Pós-graduação em Patologia - FMB

Prevenção e diagnóstico de lesões HPV induzidas e carcinoma anal em mulheres atendidas na rede básica de saúde da cidade de Botucatu pelo método escovado do canal anal

Pós-graduação em Bases Gerais da Cirurgia - FMB

Expressão imunohistoquímica de moléculas HLA não clássicas (HLA-G E HLA-E) e receptores CD4, CD28 em lesões de mucosa oral, associada a infecção pelo papilomavírus humano (HPV)

Pós-graduação em Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia - FCFAR

Detecção de papilomavírus humano (HPV) em material biológico de pacientes com carcinoma epidermóide de orofaringe

Pós-graduação em Odontologia - FOA

Prevalência de infecção genital pelo HPV em populações urbana e rural da Amazônia Oriental Brasileira

Foram investigados a prevalência e os fatores associados à infecção genital pelo HPV em mulheres de população urbana e rural de duas regiões da Amazônia Oriental brasileira. Foi um estudo transversal com 444 mulheres submetidas ao rastreamento para câncer cervical, sendo 233 urbanas e 211 rurais, de janeiro de 2008 a março de 2010. Coletaram-se amostras da cérvice uterina para a pesquisa de DNA do HPV pela PCR. Todas responderam a um formulário epidemiológico. Análise bivariada e por regressão logística foram empregadas na investigação dos fatores associados ao HPV. A prevalência geral de HPV foi de 14,6%. Entre as populações, não houve diferença significativa, 15% urbana e 14,2% rural. O único fator de risco explorado no estudo significativamente associado ao HPV foi a situação conjugal de mulheres residentes na zona rural na faixa de 13 a 25 anos, com maior prevalência de infecção entre solteiras, separadas ou viúvas. Conclui-se que, apesar das prevalências entre as populações serem semelhantes, as estratégias preventivas a serem aplicadas seriam específicas para cada população.

Diagnóstico citológico e molecular da infecção pelo HPV em mulheres do município de Barcarena, Pará, Norte do Brasil

O HPV (Papilomavírus humano) foi apontado pela OMS (Organização Mundial de Saúde - WHO) como principal fator de risco para o desenvolvimento do câncer de colo uterino, tornando-se assim um importante e gravíssimo problema de saúde pública, especialmente nos países subdesenvolvidos ou em desenvolvimento. A precocidade das atividades sexuais, múltiplos parceiros e sexo casual, o tabagismo, a imunossupressão (por exemplo, na população de pacientes aidéticos), gravidez, doenças sexualmente transmissíveis prévias como herpes e clamídia, além do não cumprimento das medidas já adotadas como prevenção de Doenças Sexualmente Transmissíveis (DST), como por exemplo, o simples uso de preservativos, está reconhecidamente associado à incidência da infecção por HPV. Essa pesquisa teve como objetivo avaliar o desempenho diagnóstico das metodologias de citologia convencional (Exame de Papanicolau) em relação à citologia em base líquida, além de determinar a prevalência dos genótipos 16 e 18 do HPV em mulheres sem efeito citopático compatível com HPV e relacionar a presença de quadros inflamatórios, associados ou não ao HPV, com dados epidemiológicos como idade, escolaridade, condição sociocultural de mulheres provenientes do município de Barcarena – Pará – Brasil. Para tanto, participaram deste estudo, voluntariamente, 50 mulheres atendidas na Unidade de Saúde de Barcarena – Pará, através de campanha para coleta de Exame de Papanicolau como método de prevenção de câncer do colo do útero. Estas mulheres receberam informações referentes a todos os procedimentos realizados pelo corpo de saúde deste estudo e aos resultados desta pesquisa e somente após as voluntárias terem assinado o Termo de Consentimento Livre e Esclarecido, as mesmas foram incluídas para as coletas de amostras. As análises e os resultados dos testes de citologia de base líquida e convencional foram realizados segundo a Classificação de Bethesda e revisados cegamente por dois citopatologistas. Para a análise estatístca foi utilizado o teste exato de Fisher e o "Screening Test" visando determinar a especificidade/ sensibilidade dos métodos, considerando significativo o valor de p ≤ 0,05. Como resultado, observamos que o uso da citologia de base líquida tem demonstrado uma série de vantagens em relação à citologia convencional. No diagnóstico molecular (PCR) foram observadas ocorrências de HPV dos tipos 16 e 18 em 10% das mulheres atendidas. Dentre os casos que apresentaram PCR positivo para os tipos 16 ou 16/18 a maioria das mulheres tinham 27,4 anos de idade em média; com maior escolaridade; que exercem atividades domésticas e rurais; e com ocorrências de co-infecção por agentes infecciosos causadores de outras doenças sexualmente transmissíveis. Os resultados obtidos neste estudo reforçam a importância da manutenção de campanhas gratuitas de prevenção do câncer de colo do útero como uma medida preventiva no combate desta doença, principalmente no Estado do Pará onde, provavelmente, o perfil epidemiológico da doença está associado às grandes distâncias que as mulheres de comunidades ribeirinhas têm que percorrer para realizar este exame de forma gratuita; ao tipo de atividade econômica da região; ao preconceito local ainda existente com o exame; e ao grau de dificuldade de implementação de ações efetivas de retorno das pacientes às consultas médicas após a obtenção do resultado do exame e mesmo o encaminhamento para diagnóstico molecular dos casos positivos para lesões do tipo ASC-H e NIC I, II e III.