New roles of Rab GTPases on eye diseases: targeting VEGF secretion

RESUMO: A retina é composta, entre outras estruturas, pelo epitélio pigmentar da retina (EPR)e pela coróide. A região central da retina denomina-se mácula, e é a zona mais afetada na degenerescência macular relacionada com a idade, a forma mais comum de degenerescência da retina. Nesta doença, a secreção de fatores de crescimento pelo EPR é afetada, nomeadamente a do fator de crescimento vascular endotelial (VEGF), e pouco se sabe ainda sobre os mecanismos moleculares conducentes a esta condição. A família de proteínas Rab GTPases está envolvida nas vias intracelulares de sinalização e tráfego membranares, essenciais na transdução de sinais extracelulares em respostas biológicas. A sua crucial importância nestes mecanismos levou-nos a considerar o seu potencial envolvimento nas vias de secreção do VEGF, e a questionar-nos se teriam algum papel regulador sobre as mesmas. O principal objetivo deste trabalho é identificar Rab GTPases importantes para as vias de secreção e endocitose do VEGF no EPR. Essa identificação ajudará a esclarecer a patogénese da degenerescência macular da retina, e poderá servir para uma procura mais direcionada de novos agentes terapêuticos. A caracterização de dois modelos in vitro do EPR, células primárias isoladas de murganho e a linha celular B6-RPE07,levou-nos a concluir que são ambos semelhantes. Contudo, a linha celular foi escolhida como protótipo do EPR por permitir o acesso a um número ilimitado de células. No decurso deste trabalho, desenvolvemos e caracterizámos uma biblioteca de ferramentas moleculares que nos permitiram reduzir os níveis proteicos das proteínas Rab GTPases, com base na tecnologia de ácido ribonucleico (ARN) de interferência. O papel das proteínas Rab GTPases na secreção do VEGF no EPR foi estudado com base no silenciamento de apenas uma proteína, ou combinando várias, segundo a sua localização e funções intracelulares descritas. Este trabalho permitiu-nos concluir que as proteínas Rab GTPases são importantes intervenientes no processo de secreção de VEGF pelo EPR, e confirmar dados anteriores que relatam o envolvimento de algumas Rab GTPases endocíticas no processo. Propomos ainda um novo modelo para a interação destas proteínas no EPR, e sugerimos que a Rab10 e a Rab14 atuam negativamente sobre a Rab8, controlando o seu funcionamento. Os nossos resultados evidenciam a importância das proteínas Rab GTPases na secreção do VEGF pelas células do EPR, e servem de base a futuros estudos que melhor procurem compreender este mecanismo e de que modo a sua alteração se relaciona com a degenerescência da retina.--------ABSTRACT: Retinal pigment epithelium (RPE) and choroid are components of the mammalian retina, of which the central region is called macula. The most common form of retinaldegeneration, age-related macular degeneration (AMD), involves primarily deregulation of growth factors secretion by the RPE. Very little is known about the molecular mechanisms that lead to impairment of RPE’s homeostatic intracellular processes, namely the secretion of vascular endothelial growth factor (VEGF). Rab GTPases’ family regulates membrane targeting and traffic, being essential in the transduction of signal pathways. Given Rab proteins’ role in intracellular trafficking, we propose to identify key regulatory Rab proteins involved in either the secretory or the recycling pathways of VEGF in RPE. Understanding how Rab proteins’ function disruption could lead to retinal and choroidal pathology would ultimately contribute to find new therapeutic agents. Here, we characterized two mouse RPE in vitro cell models, primary cells and B6-RPE07 cell line, and concluded that both display important epithelial features as the RPE presents in vivo. Considering unlimited cell number and results reproducibility, we chose B6-RPE07 cells to further study Rab proteins’ function. To scrutinize the consequences of Rab proteins’ absence or diminished levels, we have developed novel molecular tools to achieve silencing of these key proteins using miRNA technology. We further addressed the effect of Rab proteins’ absence on VEGF secretion by performing an extensive screening where different Rab proteins were silenced, both individually and in multiple combinations considering their cellular/ compartment location. We conclude that Rab GTPases are important intervenients in VEGF secretion by RPE cells, confirming endocytic Rab proteins’ role in regulation of VEGF biology. We also propose a novel model for Rab proteins’ interaction in RPE. Our results suggest that Rab10 and Rab14 might influence Rab8 in a negative feedback mechanism, important for controlling VEGF secretion. Our achievements’ unravel Rab proteins’ role in VEGF secretion by RPE cells and are the basis for future studies to better understand RPE molecular secretory machinery.

Human parvovirus B19 infections among exanthematic diseases notified as measles

A total of 1397 sera collected from 1095 cases of exanthematic disease notified as measles in ES and RJ states during July 1992 to December 1994 were investigated. These sera were first tested for measles and rubella specific IgM. When they proved negative, they were tested for B19 specific IgM by an enzyme immunoassay. B19 infection was confirmed in 27 (2.5%) of these cases. Sera from 194 negative cases for measles and rubella IgM received from other Brazilian states were also investigated and B19 infection was confirmed for 11 of them. Sera from these 38 IgM positive cases for B19, were tested for anti-B19 IgG by an enzyme immunoassay and for B19 DNA by dot blot hybridization. Anti-B19 IgG antibodies were detected in most of the acute sera. B19 DNA was detected in the acute serum of one patient that had been splenectomized before. As the exanthem caused by human parvovirus infection may be clinically diagnosed as rubella, it could be important to diagnose B19 infection in Brazil since it is becoming prevalent as the cause of rash in countries where rubella is controlled by vaccination.

Detection of enteroviral sequence in endomyocardial tissues from patients with cardiac diseases in Northern Brazil

In the present report we describe the results from a pilot study aimed at detecting enterovirus sequence in cardiac tissues, obtained through endomyocardial biopsies, from patients suffering from cardiac diseases in the Amazon region. Six samples that were collected from three patients were analysed by RT-PCR showing 3 positive and 3 negative results. These preliminary findings suggest the participation of enteroviruses in the etiology of cardiac diseases, mainly myocarditis, and warrant further and broader local studies on this subject.

Retrospective histopathological classification of 1,108 skin biopsies from patients clinically suspected of having leprosy from Bahia, Northeast Brazil

We report a retrospective histopathological classification carried out under laboratory conditions by the method of Ridley & Jopling of 1,108 skin biopsies from patients clinically suspected of having leprosy from Bahia, Northeast Brazil.

Qualidade de vida relacionada com a saúde em doentes com lúpus eritematoso sistémico neuropsiquiátrico em Portugal

RESUMO - Este estudo tem como objetivo principal analisar o impacto do lúpus eritematoso sistémico (LES) na qualidade de vida relacionada com a saúde num grupo de doentes portugueses, através de instrumentos genéricos. Trata-se de um estudo transversal, onde os instrumentos de colheita de dados foram o EQ-5D-3L e o SF-36 v.2, aplicados no decorrer de 2012, sendo a população constituída por 116 doentes com LES-NP, inscritos na Unidade de Doenças Autoimunes do Hospital Curry Cabral, Lisboa. Todos os doentes preencheram os critérios revistos ACR de 97 para a classificação de LES. Dos 116 doentes, 104 eram mulheres (89,7%) e 12 homens (10,3%). A idade média da amostra é de 46 anos. Os indivíduos apresentam um critério ACR médio de 5,0, um índice SLICC/ACR (SDI) médio de 0,6 (± 1,1) e uma duração média de doença de 13 anos, onde 50% dos participantes indica ser portador de LES pelo menos há 11 anos. Os resultados obtidos evidenciaram que a qualidade de vida relacionada com a saúde no LES varia em função de determinadas características demográficas dos doentes como são o caso da idade e o sexo, relacionando-se também com a duração da doença e o índice de irreversibilidade de lesão, nalgumas dimensões do EQ-5D-3L e SF-36. Estes dois instrumentos genéricos apresentam forte associação em todas as suas dimensões. Um achado relevante, prende-se com o facto de o LES apresentar uma pior qualidade de vida relacionada com a saúde em relação a outras doenças crónicas comparáveis.

Longitudinal evaluation of hemorheological markers in acute inflammatory diseases

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Genética Molecular e Biomedicina

Exploratory analysis of OpenStreetMap for land use classification

In the last years, volunteers have been contributing massively to what we know nowadays as Volunteered Geographic Information. This huge amount of data might be hiding a vast geographical richness and therefore research needs to be conducted to explore their potential and use it in the solution of real world problems. In this study we conduct an exploratory analysis of data from the OpenStreetMap initiative. Using the Corine Land Cover database as reference and continental Portugal as the study area, we establish a possible correspondence between both classification nomenclatures, evaluate the quality of OpenStreetMap polygon features classification against Corine Land Cover classes from level 1 nomenclature, and analyze the spatial distribution of OpenStreetMap classes over continental Portugal. A global classification accuracy around 76% and interesting coverage areas’ values are remarkable and promising results that encourages us for future research on this topic.

Chagas' disease and ageing: the coexistence of other chronic diseases with Chagas' disease in elderly patients

This study aimed to identify the main comorbidities in elderly chagasic patients treated in a reference service and identify possible associations between the clinical form of Chagas' disease and chronic diseases. Ninety patients aged 60 years-old or over were interviewed and their clinical diagnoses recorded. The study population profile was: women (55.6%); median age (67 years); married (51.1%); retired (73.3%); up to four years' education (64.4%); and earning less than two minimum wages (67.8%). The predominant forms of Chagas' disease were the cardiac (46.7%) and mixed forms (30%). There was a greater proportion of mild cardiac dysfunction (84.1%), frequently in association with megaesophagus. The mean number of concurrent diseases was 2.856 ± 1.845, and 33% of the patients had four or more comorbidities. The most frequent were systemic arterial hypertension (56.7%), osteoporosis (23.3%), osteoarthritis (21.2%) and dyslipidemia (20%). Positive correlations were verified between sex and comorbidities and between age group and comorbidities.

Context classification for service robots

This dissertation presents a solution for environment sensing using sensor fusion techniques and a context/environment classification of the surroundings in a service robot, so it could change his behavior according to the different rea-soning outputs. As an example, if a robot knows he is outdoors, in a field environment, there can be a sandy ground, in which it should slow down. Contrariwise in indoor environments, that situation is statistically unlikely to happen (sandy ground). This simple assumption denotes the importance of context-aware in automated guided vehicles.

Infeção por Mycobacterium Tuberculosis em profissionais de saúde : metodologia de avaliação do risco e sua aplicação num hospital central

RESUMO - A Tuberculose surge, de acordo com o último relatório da Organização Mundial da Saúde, como a segunda principal causa de morte em todo o mundo, de entre as doenças infeciosas. Em 2012, 1.3 milhões de pessoas morreram devido a esta patologia e surgiram 8.6 milhões de novos casos. De entre os grupos de risco de infeção, surgem os profissionais de saúde. A dificuldade no diagnóstico da Tuberculose, o contacto próximo com os pacientes, as medidas de controlo de infeção por vezes inadequadas são algumas das razões que explicam o risco mais elevado de contrair Tuberculose no local de trabalho. Esta Dissertação de Mestrado pretende estabelecer uma nova classificação de risco de infeção por M. tuberculosis em estabelecimentos de saúde, com vista a promover a saúde destes profissionais, inovadora nos critérios de avaliação das medidas de controlo de infeção e de análise dos casos de exposição não protegida a Tuberculose ativa. Esta metodologia de avaliação foi o resultado de uma revisão bibliográfica sobre a temática, tendo sido aplicada num hospital para verificar a sua adequabilidade e mais-valia.