Seawater carbonate chemistry and growth rate of Emiliania huxleyi in lab experiment

Predicting the impacts of environmental change on marine organisms, food webs, and biogeochemical cycles presently relies almost exclusively on short-term physiological studies, while the possibility of adaptive evolution is often ignored. Here, we assess adaptive evolution in the coccolithophore Emiliania huxleyi, a well-established model species in biological oceanography, in response to ocean acidification. We previously demonstrated that this globally important marine phytoplankton species adapts within 500 generations to elevated CO2. After 750 and 1000 generations, no further fitness increase occurred, and we observed phenotypic convergence between replicate populations. We then exposed adapted populations to two novel environments to investigate whether or not the underlying basis for high CO2-adaptation involves functional genetic divergence, assuming that different novel mutations become apparent via divergent pleiotropic effects. The novel environment "high light" did not reveal such genetic divergence whereas growth in a low-salinity environment revealed strong pleiotropic effects in high CO2 adapted populations, indicating divergent genetic bases for adaptation to high CO2. This suggests that pleiotropy plays an important role in adaptation of natural E. huxleyi populations to ocean acidification. Our study highlights the potential mutual benefits for oceanography and evolutionary biology of using ecologically important marine phytoplankton for microbial evolution experiments.

A plasticidade acústica de uma população de Boto - Cinza, Sotalia Guianensis (Van Banédén, 1864) (Cetacea, Delphinidae), na região Nordeste do Brasil

The environmental characteristics can modify the acoustics of a species due to habitat, time of day and year. Therefore, this study investigated the relationships between seasons, tide, daily cycle of tides, times of day and different habitat and noise emission of S. guianensis. Sound recordings occurred in the Curral’s Cove and Lagoon Complex of Guaraíras (CLG) in the municipality of Tibau do Sul/RN. Whistles are emitted with lower frequency during rainy season and spring tide while clicks are higher; whistles, clicks and calls have higher frequency during ebb tide. These modifications can be related with turbidity and prey availability. The whistles and clicks occurrence are higher at night probably because luminosity is lower. Furthermore, the whistles and clicks frequency reduction overnight allows the sound to travel longer distance and helps the view which is limited; but the minimum frequency increase was needed to catch the prey. The low occurrence of calls could be related to the small group size. The acoustic changes at night may be partly influenced by light levels as prey availability that is larger in this period. Whistle frequencies and click initial frequency are higher in CLG than Curral’s cove that permitted good precision. However, click central frequency is lower and may be connected to tracking the area. Several factors may be associated with such modifications as background noise, bottom and others. This study supports the hypothesis that S. guianensis presents an acoustic plasticity according to the local conditions where the species is embedded and adapts to the environmental changes.

A.A. Milne - When We Were Very Young : cycle éclectique de chansons pour enfants, chanté par des enfants

Les fichiers qui accompagnent mon document on été réalisés avec les logiciels Microsoft Word et Finale.

Évaluation des besoins et des ressources hospitalières en Afrique centrale

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Pathogen-Specific Adaptations to Conserved Signaling Pathways in Cryptococcus neoformans

Cryptococcus neoformans is an opportunistic fungal pathogen that causes significant disease worldwide. Even though this fungus has not evolved specifically to cause human disease, it has a remarkable ability to adapt to many different environments within its infected host. C. neoformans adapts by utilizing conserved eukaryotic and fungal-specific signaling pathways to sense and respond to stresses within the host. Upon infection, two of the most significant environmental changes this organism experiences are elevated temperature and high pH.

Conserved Rho and Ras family GTPases are central regulators of thermotolerance in C. neoformans. Many GTPases require prenylation to associate with cellular membranes and function properly. Using molecular genetic techniques, microscopy, and infection models, I demonstrated that the prenyltransferase, geranylgeranyl transferase I (GGTase I) is required for thermotolerance and pathogenesis. Using fluorescence microscopy, I found that only a subset of conserved GGTase I substrates requires this enzyme for membrane localization. Therefore, the C. neoformans GGTase I may recognize its substrate in a slightly different manner than other eukaryotic organisms.

The alkaline response transcription factor, Rim101, is a central regulator of stress-response genes important for adapting to the host environment. In particular, Rim101 regulates cell surface alterations involved in immune avoidance. In other fungi, Rim101 is activated by alkaline pH through a conserved signaling pathway, but this pathway had yet been characterized in C. neoformans. Using molecular genetic techniques, I identified and analyzed the conserved members of the Rim pathway. I found that it was only partially conserved in C. neoformans, missing the components that sense pH and initiate pathway activation. Using a genetic screen, I identified a novel Rim pathway component named Rra1. Structural prediction and genetic epistasis experiments suggest that Rra1 may serve as the Rim pathway pH sensor in C. neoformans and other related basidiomycete fungi.

To explore the relevance of Rim pathway signaling in the interaction of C neoformans with its host, I characterized the Rim101-regulated cell wall changes that prevent immune detection. Using HPLC, enzymatic degradation, and cell wall stains, I found that the rim101Δ mutation resulted in increased cell wall chitin exposure. In vitro co-culture assays demonstrated that increased chitin exposure is associated with enhanced activation of macrophages and dendritic cells. To further test this association, I demonstrated that other mutant strains with increased chitin exposure induce macrophage and dendritic cell responses similar to rim101Δ. We used primary macrophages from mutant mouse lines to demonstrate that members of both the Toll-like receptor and C-type lectin receptor families are involved in detecting strains with increased chitin exposure. Finally, in vivo immunological experiments demonstrated that the rim101Δ strain induced a global inflammatory immune response in infected mouse lungs, expanding upon our previous in vivo rim101Δ studies. These results demonstrate that cell wall organization largely determines how fungal cells are detected by the immune system.

The Didache and Traditioned Innovation: Shaping Christian Community in the First Century and the Twenty-First Century

Church leaders, both lay and clergy, shape Christian community. Among their central tasks are: building communal identity, nurturing Christian practices, and developing faithful structures. When it comes to understanding the approach of the earliest Christian communities to these tasks, the Didache might well be the most important text most twenty-first century church leaders have never read. The Didache innovated on tradition, shaping the second generation of Christians to meet the crises and challenges of a changing world.

Most likely composed in the second half of the first century, the Didache served as a training manual for gentile converts to Christianity, preparing them for life in Christian community. This brief document, roughly one third the length of Mark’s gospel, developed within early Jewish-Christian communities. It soon found wide usage throughout the Mediterranean region, and its influence endured throughout the patristic and into the medieval period.

The Didache outlines emerging Christian practices that were rooted in both Jewish tradition and early Jesus material, yet were reaching forward in innovative ways. The Didache adopts historical teachings and practices and then adapts them for an evolving context. In this respect, the writers of the Didache, as well as the community shaped by its message, exemplify the pattern of thinking described by Greg Jones as “traditioned innovation.”

The Didache invites reflection on the shape and content of Christian community and Christian leadership in the twenty-first century. As churches and church leaders engage a rapidly changing world, the Didache is an unlikely and yet important conversation partner from two millennia ago. A quick read through its pages – a task accomplished in less than half an hour – brings the reader face to face with a brand of Christianity both very familiar and strikingly dissimilar to modern Christianity. Such dissonance challenges current assumptions about the church and creates a space in which to re-imagine our situation in light of this ancient Christian tradition. The Didache provides a window through which we might re-examine current conceptualizations of Christian life, liturgy, and leadership.

This thesis begins with an exploration of the form and function of the Didache and an examination of a number of important background issues for the informed study of the Didache. The central chapters of this thesis exegete and explore select passages in each of the three primary sections of the Didache – the Two Ways (Didache 1-6), the liturgical section (Didache 7-10), and the church order (Didache 11-15). In each instance, the composers of the Didache reach back into a cherished and life-giving aspect of the community’s heritage and shape it anew into a fresh and faithful approach to living the Christian life in a drastically different context.

The thesis concludes with three suggestions of how the Didache may provide a resource for the way the Church in the present thinks about training disciples, shaping community, and developing leadership structures. These conversation starters offer beginning points for a richer, fuller discussion of traditioned innovation in our current church context. The Didache provides a source of wisdom from our spiritual forebears that modern Christian leaders would do well not to ignore. With a look through the first century window of the Didache, twenty-first century Christians can discover fresh insights for shaping Christian community in the present.

Occupant location prediction in smart buildings using association rule mining

Heating, ventilation, air conditioning (HVAC) systems are significant consumers of energy, however building management systems do not typically operate them in accordance with occupant movements. Due to the delayed response of HVAC systems, prediction of occupant locations is necessary to maximize energy efficiency. We present an approach to occupant location prediction based on association rule mining, allowing prediction based on historical occupant locations. Association rule mining is a machine learning technique designed to find any correlations which exist in a given dataset. Occupant location datasets have a number of properties which differentiate them from the market basket datasets that association rule mining was originally designed for. This thesis adapts the approach to suit such datasets, focusing the rule mining process on patterns which are useful for location prediction. This approach, named OccApriori, allows for the prediction of occupants’ next locations as well as their locations further in the future, and can take into account any available data, for example the day of the week, the recent movements of the occupant, and timetable data. By integrating an existing extension of association rule mining into the approach, it is able to make predictions based on general classes of locations as well as specific locations.

Les droits réels et personnels sur les titres détenus auprès d'un intermédiaire : analyse comparative en droit québécois interne et international privé

Les transactions sur les valeurs mobilières ainsi que leur mise en garantie se font bien au-delà des frontières nationales. Elles impliquent une multitude d’intervenants, tels que l’émetteur, un grand nombre d’intermédiaires disposés en structure pyramidale, un ou des investisseurs et, bien évidemment, les bénéficiaires desdites valeurs mobilières ou garanties. On peut aussi signaler l’existence de nombreux portefeuilles diversifiés contenant des titres émis par plusieurs émetteurs situés dans plusieurs états. Toute la difficulté d’une telle diversité d’acteurs, de composantes financières et juridiques, réside dans l’application de règles divergentes et souvent conflictuelles provenant de systèmes juridiques d’origines diverses (Common Law et civiliste). De nombreux juristes, de toutes nationalités confondues, ont pu constater ces dernières années que les règles de création, d’opposabilité et de réalisation des sûretés, ainsi que les règles de conflit de lois qui aident à déterminer la loi applicable à ces différentes questions, ne répondaient plus adéquatement aux exigences juridiques nationales dans un marché financier global, exponentiel et sans réelles frontières administratives. Afin de résoudre cette situation et accommoder le marché financier, de nombreux textes de loi ont été révisés et adaptés. Notre analyse du droit québécois est effectuée en fonction du droit américain et canadien, principales sources du législateur québécois, mais aussi du droit suisse qui est le plus proche de la tradition civiliste québécoise, le tout à la lueur de la 36e Convention de La Haye du 5 juillet 2006 sur la loi applicable à certains droits sur des titres détenus auprès d'un intermédiaire. Par exemple, les articles 8 et 9 du Uniform Commercial Code (UCC) américain ont proposé des solutions modernes et révolutionnaires qui s’éloignent considérablement des règles traditionnelles connues en matière de bien, de propriété, de sûreté et de conflits de lois. Plusieurs autres projets et instruments juridiques dédiés à ces sujets ont été adoptés, tels que : la Loi uniforme sur le transfert des valeurs mobilières (LUTVM) canadienne, qui a été intégrée au Québec par le biais de la Loi sur le transfert de valeurs mobilières et l’obtention de titres intermédiés, RLRQ, c.T-11.002 (LTVMQ) ; la 36e Convention de La Haye du 5 juillet 2006 sur la loi applicable à certains droits sur des titres détenus auprès d'un intermédiaire; la Loi fédérale sur le droit international privé (LDIP) suisse, ainsi que la Loi fédérale sur les titres intermédiés (LTI) suisse. L’analyse de ces textes de loi nous a permis de proposer une nouvelle version des règles de conflit de lois en matière de sûretés et de transfert des titres intermédiés en droit québécois. Cette étude devrait susciter une réflexion profonde du point de vue d’un juriste civiliste, sur l’efficacité des nouvelles règles québécoises de sûretés et de conflit de lois en matière de titres intermédiés, totalement inspirées des règles américaines de Common Law. Un choix qui semble totalement ignorer un pan du système juridique civiliste et sociétal.

Alaric : un barbare à l'habitus romain au tournant du 5e siècle

Cette thèse a comme objectif de démontrer combien Alaric et ses Goths étaient Romains dans pratiquement toutes les catégories connues sur leur compte. Pour ce faire, l’auteur a puisé dans les sciences sociales et a emprunté le champ conceptuel de l’éminent sociologue Pierre Bourdieu. À l’aide du concept d’habitus, entre autres choses, l’auteur a tenté de faire valoir à quel point les actions d’Alaric s’apparentaient à celles des généraux romains de son époque. Naturellement, il a fallu étaler le raisonnement au long de plusieurs chapitres et sur de nombreux niveaux. C’est-à-dire qu’il a fallu d’abord définir les concepts populaires en ce moment pour « faire » l’histoire des barbares durant l’Antiquité tardive. Pensons ici à des termes tels que l’ethnicité et l’ethnogenèse. L’auteur s’est distancé de ces concepts qu’il croyait mal adaptés à la réalité des Goths et d’Alaric. C’est qu’il fallait comprendre ces hommes dans une structure romaine, au lieu de leur octroyer une histoire et des traditions barbares. Il a ensuite fallu montrer que la thèse explorait des avenues restées peu empruntées jusqu’à aujourd’hui. Il a été question de remonter jusqu’à Gibbon pour ensuite promouvoir le fait que quelques érudits avaient autrefois effleuré la question d’Alaric comme étant un homme beaucoup moins barbare que ce que la tradition véhiculait à son sujet, tel que Fustel de Coulanges, Amédée Thierry ou encore Marcel Brion. Il s’agissait donc de valider l’angle de recherche en prenant appui d’abord sur ces anciens luminaires de la discipline. Vint ensuite l’apport majeur de cette thèse, c’est-à-dire essentiellement les sections B, C et D. La section B a analysé la logistique durant la carrière d’Alaric. Cette section a permis avant tout de démontrer clairement qu’on n’a pas affaire à une troupe de brigands révoltés; le voyage de 401-402 en Italie prouve à lui seul ce fait. L’analyse approfondie de l’itinéraire d’Alaric durant ses nombreux voyages a démontré que cette armée n’aurait pas pu effectuer tous ces déplacements sans l’appui de la cour orientale. En l’occurrence, Alaric et son armée étaient véritablement des soldats romains à ce moment précis, et non pas simplement les fédérés barbares de la tradition. La section C s’est concentrée sur les Goths d’Alaric, où on peut trouver deux chapitres qui analysent deux sujets distincts : origine/migration et comparaison. C’est dans cette section que l’auteur tente de valider l’hypothèse que les Goths d’Alaric n’étaient pas vraiment Goths, d’abord, et qu’ils étaient plutôt Romains, ensuite. Le chapitre sur la migration n’a comme but que de faire tomber les nombreuses présomptions sur la tradition gothe que des érudits comme Wolfram et Heather s’efforcent de défendre encore aujourd’hui. L’auteur argumente pour voir les Goths d’Alaric comme un groupe formé à partir d’éléments romains; qu’ils eurent été d’une origine barbare quelconque dans les faits n’a aucun impact sur le résultat final : ces hommes avaient vécu dans l’Empire durant toute leur vie (Alaric inclus) et leurs habitus ne pouvaient pas être autre chose que romain. Le dernier chapitre de la section C a aussi démontré que le groupe d’Alaric était d’abord profondément différent des Goths de 376-382, puis d’autres groupes que l’on dit barbares au tournant du 5e siècle, comme l’étaient les Vandales et les Alamans par exemple. Ensemble, ces trois chapitres couvrent la totalité de ce que l’on connait du groupe d’Alaric et en offre une nouvelle interprétation à la lumière des dernières tendances sociologiques. La section D analyse quant à elle en profondeur Alaric et sa place dans l’Empire romain. L’auteur a avant tout lancé l’idée, en s’appuyant sur les sources, qu’Alaric n’était pas un Goth ni un roi. Il a ensuite analysé le rôle d’Alaric dans la structure du pouvoir de l’Empire et en est venu à la conclusion qu’il était l’un des plus importants personnages de l’Empire d’Orient entre 397 et 408, tout en étant soumis irrémédiablement à cette structure. Sa carrière militaire était des plus normale et s’inscrivait dans l’habitus militaire romain de l’époque. Il a d’ailleurs montré que, par ses actions, Alaric était tout aussi Romain qu’un Stilicon. À dire le vrai, mis à part Claudien, rien ne pourrait nous indiquer qu’Alaric était un barbare et qu’il essayait d’anéantir l’Empire. La mauvaise image d’Alaric n’est en effet redevable qu’à Claudien : aucun auteur contemporain n’en a dressé un portrait aussi sombre. En découle que les auteurs subséquents qui firent d’Alaric le roi des Goths et le ravageur de la Grèce avaient sans doute été fortement influencés eux aussi par les textes de Claudien.

L’environnement intérieur et l’autisme : un Centre de jour pour adultes

Ce mémoire présente et discute d’une problématique importante qui s’inscrit dans un contexte actuel, autant sur le plan international que local, puisqu’elle touche 1 enfant sur 68 (CDC, 2010). On parle ici du trouble du spectre de l’autisme (TSA). Plus spécifiquement, cette recherche se concentre sur les jeunes adultes autistes, qui du jour au lendemain, se retrouvent face à une interruption de services. Elle suggère qu’une adaptation adéquate de l’environnement soit davantage explorée en vue d’offrir des centres de jour adaptés à cette clientèle. La question de recherche est la suivante : Quels sont les éléments du design intérieur qui peuvent améliorer la qualité de vie des adultes autistes? Il est essentiel de s’y attarder, puisque les personnes TSA sont entre autres caractérisées par leur hypersensibilité et leur hyposensibilité face à l’environnement. Bien que le sujet de l’autisme soit richement documenté par le domaine des sciences médicales, il est apparu qu’il l’est moins par celui de l’aménagement. La stratégie méthodologique de cette recherche repose sur des analyses de précédents, des observations participantes ainsi que la tenue d’entretiens semi-dirigés auprès de parents d’enfants autistes. Cette étude vise simultanément l’amélioration de la compréhension de la pratique émergente du design comme moyen d’intervention ainsi que l’identification des facteurs (éclairages, couleurs, matériaux, division de l’espace, etc.) pouvant améliorer le bien-être des adultes autistes. Sur la base des données collectées, il a été remarqué qu’effectivement, plusieurs moyens peuvent être entrepris pour concevoir des environnements améliorant le bien-être de ces adultes. Les résultats extraits du terrain mènent à des propositions d’aménagement claires : rendre l’abstrait le plus concret possible, aménager des zones de retrait social, offrir une variété d’ambiances, et finalement, offrir un encadrement sécuritaire.

Évaluation des besoins et des ressources hospitalières en Afrique centrale

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

Death Threat Letters: Allegories of American Authorship in the Age of Terrorism

This dissertation examines novels that use terrorism to allegorize the threatened position of the literary author in contemporary culture. Allegory is a term that has been differently understood over time, but which has consistently been used by writers to articulate and construct their roles as authors. In the novels I look at, the terrorist challenge to authorship results in multiple deployments of allegory, each differently illustrating the way that allegory is used and authorship constructed in the contemporary American novel. Don DeLillo’s Mao II (1991), first puts terrorists and authors in an oppositional pairing. The terrorist’s ability to traffic in spectacle is presented as indicative of the author’s fading importance in contemporary culture and it is one way that terrorism allegorizes threats to authorship. In Philip Roth’s Operation Shylock (1993), the allegorical pairing is between the text of the novel and outside texts – newspaper reports, legal cases, etc. – that the novel references and adapts in order to bolster its own narrative authority. Richard Powers’s Plowing the Dark (1999) pairs the story of an imprisoned hostage, craving a single book, with employees of a tech firm who are creating interactive, virtual reality artworks. Focusing on the reader’s experience, Powers’s novel posits a form of authorship that the reader can take into consideration, but which does not seek to control the experience of the text. Finally, I look at two of Paul Auster’s twenty-first century novels, Travels in the Scriptorium (2007) and Man in the Dark (2008), to suggest that the relationship between representations of authors and terrorists changed after 9/11. Auster’s author-figures forward an ethics of authorship whereby novels can use narrative to buffer readers against the portrayal of violent acts in a culture that is suffused with traumatizing imagery.

A novel framework for predicting patients at risk of readmission

Uncertainty in decision-making for patients’ risk of re-admission arises due to non-uniform data and lack of knowledge in health system variables. The knowledge of the impact of risk factors will provide clinicians better decision-making and in reducing the number of patients admitted to the hospital. Traditional approaches are not capable to account for the uncertain nature of risk of hospital re-admissions. More problems arise due to large amount of uncertain information. Patients can be at high, medium or low risk of re-admission, and these strata have ill-defined boundaries. We believe that our model that adapts fuzzy regression method will start a novel approach to handle uncertain data, uncertain relationships between health system variables and the risk of re-admission. Because of nature of ill-defined boundaries of risk bands, this approach does allow the clinicians to target individuals at boundaries. Targeting individuals at boundaries and providing them proper care may provide some ability to move patients from high risk to low risk band. In developing this algorithm, we aimed to help potential users to assess the patients for various risk score thresholds and avoid readmission of high risk patients with proper interventions. A model for predicting patients at high risk of re-admission will enable interventions to be targeted before costs have been incurred and health status have deteriorated. A risk score cut off level would flag patients and result in net savings where intervention costs are much higher per patient. Preventing hospital re-admissions is important for patients, and our algorithm may also impact hospital income.

AR-based Technoself Enhanced Learning Approach to Improving Student Engagement

The emerging technologies have expanded a new dimension of self – ‘technoself’ driven by socio-technical innovations and taken an important step forward in pervasive learning. Technology Enhanced Learning (TEL) research has increasingly focused on emergent technologies such as Augmented Reality (AR) for augmented learning, mobile learning, and game-based learning in order to improve self-motivation and self-engagement of the learners in enriched multimodal learning environments. These researches take advantage of technological innovations in hardware and software across different platforms and devices including tablets, phoneblets and even game consoles and their increasing popularity for pervasive learning with the significant development of personalization processes which place the student at the center of the learning process. In particular, augmented reality (AR) research has matured to a level to facilitate augmented learning, which is defined as an on-demand learning technique where the learning environment adapts to the needs and inputs from learners. In this paper we firstly study the role of Technology Acceptance Model (TAM) which is one of the most influential theories applied in TEL on how learners come to accept and use a new technology. Then we present the design methodology of the technoself approach for pervasive learning and introduce technoself enhanced learning as a novel pedagogical model to improve student engagement by shaping personal learning focus and setting. Furthermore we describe the design and development of an AR-based interactive digital interpretation system for augmented learning and discuss key features. By incorporating mobiles, game simulation, voice recognition, and multimodal interaction through Augmented Reality, the learning contents can be geared toward learner's needs and learners can stimulate discovery and gain greater understanding. The system demonstrates that Augmented Reality can provide rich contextual learning environment and contents tailored for individuals. Augment learning via AR can bridge this gap between the theoretical learning and practical learning, and focus on how the real and virtual can be combined together to fulfill different learning objectives, requirements, and even environments. Finally, we validate and evaluate the AR-based technoself enhanced learning approach to enhancing the student motivation and engagement in the learning process through experimental learning practices. It shows that Augmented Reality is well aligned with constructive learning strategies, as learners can control their own learning and manipulate objects that are not real in augmented environment to derive and acquire understanding and knowledge in a broad diversity of learning practices including constructive activities and analytical activities.

Adaptación del sector turístico al cambio climático en España. La importancia de las acciones a escala local y en empresas turísticas

El 5º Informe del IPCC (Panel Intergubernamental de Cambio Climático, 2014) señala que el turismo será una de las actividades económicas que mayores efectos negativos experimentará en las próximas décadas debido al calentamiento térmico del planeta. En España, el turismo es una fuente principal de ingresos y de creación de puestos de trabajo en su economía. De ahí que sea necesaria la puesta en marcha de medidas de adaptación a la nueva realidad climática que, en nuestro país, va a suponer cambios en el confort climático de los destinos e incremento de extremos atmosféricos. Frente a los planes de adaptación al cambio climático en la actividad turística, elaborados por los gobiernos estatal y regional, que apenas se han desarrollado en España, la escala local muestra interesantes ejemplos de acciones de adaptación al cambio climático, desarrolladas tanto por los municipios (energía, transporte, vivienda, planificación urbanística) como por la propia empresa turística (hoteles, campings, apartamentos). Medidas de ahorro de agua y luz, fomento del transporte público y de las energías limpias, creación de zonas verdes urbanas y adaptación a los extremos atmosféricos destacan como acciones de mitigación del cambio climático en los destinos turísticos principales de nuestro país.