A SNP-based consensus genetic map for synteny-based trait targeting in faba bean (Vicia faba L.)

Faba bean (Vicia faba L.) is a globally important nitrogen-fixing legume, which is widely grown in a diverse range of environments. In this work, we mine and validate a set of 845 SNPs from the aligned transcriptomes of two contrasting inbred lines. Each V. faba SNP is assigned by BLAST analysis to a single Medicago orthologue. This set of syntenically anchored polymorphisms were then validated as individual KASP assays, classified according to their informativeness and performance on a panel of 37 inbred lines, and the best performing 757 markers used to genotype six mapping populations. The six resulting linkage maps were merged into a single consensus map on which 687 SNPs were placed on six linkage groups, each presumed to correspond to one of the six V. faba chromosomes. This sequence-based consensus map was used to explore synteny with the most closely-related crop species, lentil, and the most closely related fully sequenced genome, Medicago. Large tracts of uninterrupted colinearity were found between faba bean and Medicago, making it relatively straightforward to predict gene content and order in mapped genetic interval. As a demonstration of this, we mapped a flower colour gene to a 2 cM interval of Vf chromosome 2 which was highly collinear with Mt3. The obvious candidate gene from 77 gene models in the collinear Medicago chromosome segment was the previously characterized MtWD40-1 gene (Mt3g092830, Mt3g092840) controlling anthocyanin production in Medicago and re-sequencing of the Vf orthologue showed a putative causative deletion of the entire 5’ end of the gene.

The Mystery of Privity: Grand Trunk Railway Company of Canada v Robinson (1915)

This article examines a little known decision of the Judicial Committee of the Privy Council: Grand Trunk Railway Company of Canada v Robinson (1915). The examination is historical and it provides a different insight into the understanding of privity of contract, a doctrine central to contract law. The examination reveals a process of trans-Atlantic legal migration in which English law was applied to resolve an Ontario case. The nature of the resolution is surprising because it appears to conflict with the better known decision of the House of Lords, Dunlop Pneumatic Tyre Company, Limited v Selfridge and Company, Limited, which a similarly constituted panel delivered in the same week. This article argues that there was a greater malleability in the resolution of cases concerned with privity than was thought to have existed. It is also argued that the power of Canadian railway capitalism is a significant factor in understanding the legal resolution of the case. Finally, it the article considers the use of English and American precedents relevant to the case. The application of English precedents to the case led to a resolution not entirely befitting Canadian conditions.

Local adaptation in migrated interior Douglas-fir seedlings is mediated by ectomycorrhizas and other soil factors

Separating edaphic impacts on tree distributions from those of climate and geography is notoriously difficult. Aboveground and belowground factors play important roles, and determining their relative contribution to tree success will greatly assist in refining predictive models and forestry strategies in a changing climate. In a common glasshouse, seedlings of interior Douglas-fir (Pseudotsuga menziesii var. glauca) from multiple populations were grown in multiple forest soils. Fungicide was applied to half of the seedlings to separate soil fungal and nonfungal impacts on seedling performance. Soils of varying geographic and climatic distance from seed origin were compared, using a transfer function approach. Seedling height and biomass were optimized following seed transfer into drier soils, whereas survival was optimized when elevation transfer was minimised. Fungicide application reduced ectomycorrhizal root colonization by c. 50%, with treated seedlings exhibiting greater survival but reduced biomass. Local adaptation of Douglas-fir populations to soils was mediated by soil fungi to some extent in 56% of soil origin by response variable combinations. Mediation by edaphic factors in general occurred in 81% of combinations. Soil biota, hitherto unaccounted for in climate models, interacts with biogeography to influence plant ranges in a changing climate.

A Plant Needs Ants like a Dog Needs Fleas: Myrmelachista schumanni Ants Gall Many Tree Species to Create Housing

Hundreds of tropical plant species house ant colonies in specialized chambers called domatia. When, in 1873, Richard Spruce likened plant-ants to fleas and asserted that domatia are ant-created galls, he incited a debate that lasted almost a century. Although we now know that domatia are not galls and that most ant-plant interactions are mutualisms and not parasitisms, we revisit Spruce`s suggestion that ants can gall in light of our observations of the plant-ant Myrmelachista schumanni, which creates clearings in the Amazonian rain forest called ""supay-chakras,"" or ""devil`s gardens."" We observed swollen scars on the trunks of nonmyrmecophytic canopy trees surrounding supay-chakras, and within these swellings, we found networks of cavities inhabited by M. schumanni. Here, we summarize the evidence supporting the hypothesis that M. schumanni ants make these galls, and we hypothesize that the adaptive benefit of galling is to increase the amount of nesting space available to M. schumanni colonies.

Olycksfall i arbetet : En kartläggning över olycksfall vid Falu Koppargruva 1906-1915 samt åtgärder för en säkrare arbetsmiljö

Hur farligt var gruvarbete i början av 1900-talet? I denna uppsats undersöks de olycksfall som inträffade i Falu koppargruva mellan åren 1906-1915. Uppsatsen behandlar totalt 387 st arbetsrelaterade olyckor i och kring gruvan. I uppsatsen framkommer att gruvarbetarna var de som löpte störst risk att råka ut för skador. Sjukskrivningarnas längd varierade kraftigt, men de flesta olyckor medförde en sjukskrivningstid på mindre än 20 dagar. Krosskador, kontusioner, sårskador och ögonskador var de vanligaste följderna av olyckorna. Händer och fötter var de mest utsatta kroppsdelarna, och de flesta olyckorna var följden av fallande stenar eller olyckor i samband med användandet av maskiner och verktyg. Under den undersökta perioden inträffade fyra dödsfall, där tre var direkt arbetsrelaterade medan ett skedde under eftervården av en olycka. De vanligast förekommande skyddsåtgärderna var att installera någon form av skydd kring maskiner eller att mana till försiktighet vid riskabla arbetsmoment.

Det regionala i det nationella : Svenska turistföreningens syn på landskapen 1915-1919

Syftet med detta arbete är att utforska hur Svenska Turistföreningen, i sina årsböcker mellan 1915-1919, förhåller sig i sina utsagor om människorna och landskapen till det regionala och det nationella. De frågeställningar som använts har varit: Vilka rumsligt anknutna utsagor finns om befolkningen i de olika landskapen och om landskapen som sådana? I vilken ut-sträckning bär dessa utsagor en regional eller nationell prägel? Sätts det regionala i kontrast till det nationella, eller ses det regionala som en del av det nationella? Hur talrika är dessa utsagor? Finns det en tendens att vissa landskapsskildringar innehåller fler eller färre av dessa utsagor? Finns det en förändring i dessa utsagor under den tid som undersökts? Källmaterialet har utgjorts av Svenska Turistföreningens årsskrifter mellan 1915-1919. Dessa behandlar Uppland, Småland, Bohuslän, Västmanland samt Skåne i den ordningen. För att uppnå syftet har en kvalitativ textanalys använts. Resultatet pekar på att det finns rumsligt anknutna utsa-gor i alla böcker men mängden och arten varierar kraftigt. Det finns alltså landskap som ges en starkare regionalitet, men i dessa fall knyter man detta landskap till nationen genom att t.ex. hävda att det regionala i landskapet är något utmärkande för hela landet.

Om du vill ha fred, förbered dig på krig : en studie i den militära styrkans betydelse

Denna uppsats kretsar kring att pröva hur en av de främsta företrädarna för den realistiska skolan, förklarar de amerikanska anfallen mot Afghanistan (2001) och Irak (2003). Hans namn är Robert Kagan och uppsatsen syftar till ge en realists tolkning till varför USA handlade som man gjorde. Man måste därför försöka uppfatta världen utifrån USA:s horisont och försöka tolka samt sätta sig in i den amerikanska positionen på den internationella arenan. Problemformuleringarna kretsar kring att få insikt i grundstenarna i Kagans teori, samt hur Kagans grundsyn skiljer sig gentemot den idealistiska. Vidare hur USA:s militära styrka, enligt Kagan, påverkar dess beteende på den internationella arenan, men även hur Kagan ser på USA:s kommande globala engagemang. Robert Kagans bok Om paradiset och makten USA och Europa i den nya världsordningen kommer att utgöra fundamentet i studien. I boken kretsar bl.a. Kagans resonemang kring att USA och Europa distanserar från varandra, men även kring militär styrka. Därför ger boken oss en väldigt bra bild av USA:s position på den internationella arenan. Kagans resonemang vävs sedan ihop med kritik, realism, idealism och geopolitik. Slutsatsen blir att grundstenarna i Kagans resonemang återfinns i den s.k. realismteorin, men även till viss del i geopolitiken. Han sätter stor vikt vid militära medel och ser staterna som de mest betydelsefulla aktörerna, samt ser världen som allmänt hotfull. Han realistiska resonemang grundas på amerikanska spelregler och ledarskap på den internationella arenan. Skillnaden mellan Kagans grundsyn och den idealistiska bottnar främst i idealisternas fokusering på integration mellan stater. Vidare att de sätter tilltro till internationell rätt, samt har ett mer multilateralt förhållningssätt till omvärlden. Kagan menar vidare att starka stater är mer villiga att använda tvång och hot i internationella relationer. De bedömer dessutom hot och risker annorlunda jämfört med svagare stater. Enligt Kagan beter sig USA som en internationell sheriff på den globala arenan och beteendet bottnar i militär styrka. Vidare anser Kagan att USA har haft samma kurs i flera århundraden. USA har expanderat in i Europa och Asien och aldrig dragit sig tillbaka. Man hade redan före den 11 september 2001 fokuserat på Kina som motspelare. Dessutom, menar Kagan, att USA varit villiga att satsa på ny militär teknik, vilken kan förändra krigföringen. Han skriver även att både Clinton och Bushadministrationen varit grundade på att USA är en nödvändig nation, samt att amerikaner vill beskydda och sprida det liberala systemet i världen.

Fred: An approach to generating real, correct, reusable programs from proofs

In this paper we describe our system for automatically extracting "correct" programs from proofs using a development of the Curry-Howard process. Although program extraction has been developed by many authors, our system has a number of novel features designed to make it very easy to use and as close as possible to ordinary mathematical terminology and practice. These features include 1. the use of Henkin's technique to reduce higher-order logic to many-sorted (first-order) logic; 2. the free use of new rules for induction subject to certain conditions; 3. the extensive use of previously programmed (total, recursive) functions; 4. the use of templates to make the reasoning much closer to normal mathematical proofs and 5. a conceptual distinction between the computational type theory (for representing programs)and the logical type theory (for reasoning about programs). As an example of our system we give a constructive proof of the well known theorem that every graph of even parity, which is non-trivial in the sense that it does not consist of isolated vertices, has a cycle. Given such a graph as input, the extracted program produces a cycle as promised.