Automatic segmentation and classification of human intestinal parasites from microscopy images

Human intestinal parasites constitute a problem in most tropical countries, causing death or physical and mental disorders. Their diagnosis usually relies on the visual analysis of microscopy images, with error rates that may range from moderate to high. The problem has been addressed via computational image analysis, but only for a few species and images free of fecal impurities. In routine, fecal impurities are a real challenge for automatic image analysis. We have circumvented this problem by a method that can segment and classify, from bright field microscopy images with fecal impurities, the 15 most common species of protozoan cysts, helminth eggs, and larvae in Brazil. Our approach exploits ellipse matching and image foresting transform for image segmentation, multiple object descriptors and their optimum combination by genetic programming for object representation, and the optimum-path forest classifier for object recognition. The results indicate that our method is a promising approach toward the fully automation of the enteroparasitosis diagnosis. © 2012 IEEE.

Anthelmintic efficacy of an oral formulation of Aurixazol against gastrointestinal nematodes of naturally and experimentally infected sheep

As a result of the need to develop new active principles for the control of endoparasites in ruminants, the present in vivo study evaluated a formulation containing 24% Aurixazol (48 mg/kg), a parasiticide molecule based on disophenolate of levamisole. Two experiments were conducted: one evaluating the anthelmintic efficacy of 24% Aurixazol (48 mg/kg) against gastrointestinal nematodes in naturally infected sheep, compared to an association of ivermectin (0.2 mg/kg) + albendazole (5.0 mg/kg) + levamisole (7.5 mg/kg) (IAL), and a second one which evaluated the persistent efficacy of the same formulation against immature stages (L4) and adults of Haemonchus contortus in experimentally infected animals. In experiment I, against H. contortus, the formulation of Aurixazol and the IAL association reached efficacies (arithmetic means) of 99.32% and 96.11%, respectively. For Trichostrongylus colubriformis, the efficacy values were 88.92% and 98.08% for Aurixazol and the IAL association, respectively. Both formulations were totally effective against Oesophagostomum columbianum (100%). The results of the statistical analysis demonstrated that the mean parasitic burden of treated animals was significantly different (P ≤ 0.05) compared to the average number of helminths diagnosed in animals from the control group for H. contortus, T. colubriformis and O. columbianum. Comparing only the treated groups, it was possible to verify that the average number of H. contortus recovered from animals treated with Aurixazol was different (P ≤ 0.05) when compared to the mean amount recovered from sheep treated with the IAL association. When evaluating the prevention of H. contortus infection in experiment II, Aurixazol did not present preventive efficacy. Up until 21 days after treatment the groups treated with Aurixazol contained less adults and L4 of H. contortus (P ≤ 0.05) when compared to the non-medicated control group. However, future studies will be necessary to assess the effectiveness of Aurixazol against nematode strains resistant to levamisole and disophenol, but the efficacy results described in this study allow to state that Aurixazol can, associated with other measures, become an important tool in the control of sheep nematodes. © 2013.

Efeitos cardiorrespiratórios e motilidade gastrointestinal da infusão contínua de butorfanol em equinos anestesiados pelo isofluorano

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Intervenção nutricional do estudo do envelhecimento do trato gastrointestinal em cães

Pós-graduação em Medicina Veterinária - FCAV

Helmintos parasitos de mocós (Kerodon rupestris Wied, 1820), de vida livre e de cativeiro, criados no semi-árido nordestino

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Suplementação com gordura protegida na infecção por nematódeos gastrintestinais em ovelhas Santa Inês

Pós-graduação em Ciência Animal - FMVA

Efeito antinociceptivo, gastrointestinal e na atividade locomotora espontânea da administração intravenosa e metadona em equinos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Eficácia anti-helmíntica comparativa da associação albendazole, levamisole e ivermectina à moxidectina 1% em ovinos naturalmente infectados por nematódeos gastrintestinais

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Desnutrição em pacientes com câncer gastrointestinal: efetividade de diferentes métodos de diagnóstico

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Modelo de estudo da motilidade gastrointestinal utilizando a eletromiografia (EMG) e a biosusceptometria AC (BAC) em ratos normais, desnutridos e diabéticos induzidas pela aloxana

Pós-graduação em Bases Gerais da Cirurgia - FMB

Comparação da resistência natural a endoparasitas e ectoparasitas em bovinos das raças Criola Lageana e Angus

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Atividade endectocida, segurança clínica e farmacocinética de resíduos de uma nova alternativa terapêutica (Fluazuron + Abamectina) em bovinos

Pós-graduação em Medicina Veterinária - FCAV

Câncer gastrointestinal: dificuldades para o acesso ao diagnóstico e tratamento

O câncer do trato gastrointestinal tem sua importância no perfil de mortalidade do Brasil, estando entre os dez mais incidentes do país. A detecção precoce garante uma melhor qualidade de vida para os doentes oncológicos, porém frequentemente estes chegam aos centros de tratamento em fase avançada da doença. O estudo objetiva investigar as dificuldades de acesso ao diagnóstico e tratamento para os pacientes com câncer gastrointestinal atendidos pelo Sistema Único de Saúde. Com este intuito, realizou-se uma pesquisa observacional descritiva e sob a forma de um questionário foram coletados dados de pacientes em tratamento em dois hospitais públicos de Belém, no período de março a junho de 2013. Preencheram os critérios de inclusão 122 pacientes que foram agrupados em diferentes trajetórias de atendimento. Além disso, foram também obtidas informações registradas nos prontuários desses pacientes. A análise dos dados demonstrou que o diagnóstico da doença em 68,1% foi realizado pelo médico generalista; a maior dificuldade, nessa fase, foi o acesso ao diagnóstico gerando gastos com exames, pois a maioria dos pacientes (68,9%) não realizou exames especializados através do Sistema Único de Saúde, mas com recursos próprios. Nos centros/ unidades de referência em oncologia, as dificuldades relatadas por 56 pacientes começam com a marcação da consulta médica, ocorrendo demora do agendamento pela instituição para 94,6% desses doentes. A falta de leito para internação foi apontada como o maior entrave (54.4%) para iniciar a terapêutica cirúrgica, particularmente para o câncer gástrico e de cólon e reto. A análise das trajetórias percorridas pelos doentes, desde o inicio dos sintomas até o atendimento na unidade de referência, revela que o diagnóstico da doença em 50% dos pacientes ocorreu somente após 10 meses do inicio dos sintomas, e o tratamento iniciou só depois de 90 dias do diagnóstico. O tempo que os pacientes permanecem sintomáticos sem um diagnóstico impacta negativamente no prognóstico. Nesta pesquisa, os casos de câncer gástrico e de cólon e reto foram diagnosticados tardiamente (estádio IV e IIIB) e, por conseguinte o tratamento não ocorreu no prazo desejável.

Janaúba (Himatanthus Willd. Ex. Schult.) – Apocynaceae no controle de nematódeos gastrintestinais em ovinos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Avaliação do polimorfismo INDEL no gene TYMS em associação a resposta quanto ao uso de fluoropirimidinas em pacientes portadores de neoplasias do trato gastrointestinal

Introdução: O câncer consiste em um problema de saúde publica mundial, com estimativa de 27 milhões de casos novos e 17 milhões de mortes por câncer no ano de 2030. No Brasil, as estimativas para o câncer no ano de 2014, apontam a ocorrência de aproximadamente 580 mil casos novos. As fluoropirimidinas são usadas nos principais esquemas quimioterápicos direcionados a tumores do trato gastrointestinal. Nos últimos anos muito se tem investigado sobre causas de respostas individuais diferenciadas em relação ao tratamento quimioterápico; dessa forma têm-se buscado uma terapia individualizada que possa maximizar a eficácia dos medicamentos e minimizar os efeitos adversos associados aos fármacos. Objetivamos buscar a associação do INDEL (rs16430) do gene TYMS com o padrão de resposta ao tratamento oncológico de fármacos com base em fluoropirimidinas, de maneira a contribuir para o desenvolvimento da medicina personalizada. Material: Estudadas 151 amostras de sangue periférico de pacientes oncológicos tratados com fluoropirimidinas, da população da região amazônica brasileira com elevado grau de mistura interétinica. Foi genotipado um polimorfismo INDEL (rs16430) no gene TYMS envolvido na resposta ao tratamento com uso de fluoropirimidinas. Resultados: A investigação relatou que a maioria dos pacientes tinha doença avançada no momento do diagnóstico; 32,7% receberam tratamento com intenção paliativa; e 22,8% tratamento neoadjuvante. Nossos resultados evidenciam que o polimorfismo INDEL no gene TYMS demonstrou ter um efeito de proteção à progressão tumoral (p=0,033). Pacientes tratados com fluoropirimidinas que eram homozigotos selvagens (INS/INS) apresentaram uma proteção à progressão tumoral de 24% comparado com outros genótipos desse polimorfismo. As estimativas de ancestralidade genômica global da amostra investigada foram: 62,4% europeia; 25,2% nativo americana e 12,4% africana. Foi possível estabelecer uma correlação inversa entre o aumento da ancestralidade ameríndia e a presença de metástase (p=0,024). Conclusão: Estudos farmacogenéticos podem proporcionar uma terapia personalizada reduzindo mortalidade por toxicidades e aumentando a eficácia terapêutica, desta forma proporcionando um tratamento oncológico com melhores resultados clínicos.