EBV Type II latency relies on PARP1 activity and is essential for gastric epithelial cell transformation in EBV-associated Gastric Cancer (EBVaGC)

Epstein-Barr virus (EBV) establishes a lifelong asymptomatic infection by replicating its chromatinized genome, called episome, together with the host genome. EBV exhibits different latency-associated transcriptional repertoires that mirror its three-dimensional structures of the genome. CTCF, Cohesin and PARP1 are involved in maintaining viral latency and establishing episome architecture. Epstein-Barr virus-associated gastric cancer (EBVaGC) represents almost 10% of all gastric cancers globally. EBVaGC exhibit an intermediate viral transcription profile known as "Latency II", expressing specific viral genes and non-coding RNAs. In this study, we investigated the impact of PARP1 inhibition on CTCF/Cohesin binding in Type II latency. We observed a destabilization of the binding of both factors, leading to a disrupted three-dimensional architecture of the episomes and consequently, an altered viral gene expression. Despite sharing the same CTCF binding profile, Type I, II, and III latencies display different 3D episomal structures that correlate with variations in viral gene expression. Additionally, our analysis of H3K27ac-enriched chromatin interactions revealed differences between Type II latency episomes and a link to cellular transformation through docking of the EBV episomes at specific sites of the Human genome, thus promoting oncogene expression. Overall, this work provides insights into the role of PARP1 in maintaining active latency and novel mechanisms of EBV-induced cellular transformation.

Prevalência de hipertensão arterial em militares jovens e fatores associados

OBJETIVO: Estimar a prevalência de hipertensão arterial entre militares jovens e fatores associados. MÉTODOS: Estudo transversal realizado com amostra de 380 militares do sexo masculino de 19 e 35 anos de idade em uma unidade da Força Aérea Brasileira em São Paulo, SP, entre 2000 e 2001. Os pontos de corte para hipertensão foram: >140mmHg para pressão sistólica e > 90mmHg para pressão diastólica. As variáveis estudadas incluíram fatores de risco e de proteção para hipertensão, como características comportamentais e nutricionais. Para análise das associações, utilizou-se regressão linear generalizada múltipla, com família binomial e ligação logarítmica, obtendo-se razões de prevalências com intervalo de 90% de confiança e seleção hierarquizada das variáveis. RESULTADOS: A prevalência de hipertensão arterial foi de 22% (IC 90%: 21;29). No modelo final da regressão múltipla verificou-se prevalência de hipertensão 68% maior entre os ex-fumantes em relação aos não fumantes (IC 90%: 1,13;2,50). Entre os indivíduos com sobrepeso (índice de massa corporal - IMC de 25 a 29kg/m2) e com obesidade (IMC>29kg/m2) as prevalências foram, respectivamente, 75% (IC 90%: 1,23;2,50) e 178% (IC 90%: 1,82;4,25) maiores do que entre os eutróficos. Entre os que praticavam atividade física regular, comparado aos que não praticavam, a prevalência foi 52% menor (IC 90%: 0,30;0,90). CONCLUSÕES: Ser ex-fumante e ter sobrepeso ou obesidade foram situações de risco para hipertensão, enquanto que a prática regular de atividade física foi fator de proteção em militares jovens.

Modelo de suprimento sanguíneo do intestino grosso do tamanduá bandeira (Myrmecophaga tridactyla)

Em seis animais adultos Myrmecophaga tridactyla estudou-se o modelo de suprimento sanguíneo do intestino grosso, que é dependente das artérias mesentérica cranial (AMCr) e caudal (AMC). Os espécimes coletados conforme as normas do IBAMA (Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis) foram perfundidos com água (40 C), injetados com látex corado, fixados em formol e conservados em solução alcoólica (50%). O mesocólon está disposto na linha sagital mediana e fixa o intestino grosso à parede dorsal do abdome. Derivaram da AMC: a artéria retal cranial, sete a 14 artérias cólicas e uma ou duas artérias ileocólicas, que apresentaram anastomoses de irrigação com a AMCr. A AMC finaliza-se na borda mesocólica das alças intestinais, emitindo ramos cólicos retos a partir das arcadas justacólicas, que penetram na intimidade da musculatura longitudinal. Ao longo do trajeto da AMC foram observadas ilhas arteriais, e a região ileocólica apresentou maior densidade vascular.

The choice of the best among the shortest routes in transparent optical networks

This work introduces the problem of the best choice among M combinations of the shortest paths for dynamic provisioning of lightpaths in all-optical networks. To solve this problem in an optimized way (shortest path and load balance), a new fixed routing algorithm, named Best among the Shortest Routes (BSR), is proposed. The BSR`s performance is compared in terms of blocking probability and network utilization with Dijkstra`s shortest path algorithm and others algorithms proposed in the literature. The evaluated scenarios include several representative topologies for all-optical networking and different wavelength conversion architectures. For all studied scenarios, BSR achieved superior performance. (C) 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.

A Geometric Approach for Turbo Decoding of Reed-Solomon Codes in QAM Modulation Schemes

This work studies the turbo decoding of Reed-Solomon codes in QAM modulation schemes for additive white Gaussian noise channels (AWGN) by using a geometric approach. Considering the relations between the Galois field elements of the Reed-Solomon code and the symbols combined with their geometric dispositions in the QAM constellation, a turbo decoding algorithm, based on the work of Chase and Pyndiah, is developed. Simulation results show that the performance achieved is similar to the one obtained with the pragmatic approach with binary decomposition and analysis.

The nitric oxide-sensitive p21Ras-ERK pathway mediates S-nitrosoglutathione-induced apoptosis

p21Ras protein plays a critical role in cellular signaling that induces either cell cycle progression or apoptosis. Nitric oxide (NO) has been consistently reported to activate p21Ras through the redox sensitive cysteine residue (118). In this study, we demonstrated that the p21Ras-ERK pathway regulates THP-1 monocyte/macrophage apoptosis induced by S-nitrosoglutathione (SNOG). This was apparent from studies in THP-1 cells expressing NO-insensitive p21Ras (p21Ras(C118S)) where the pro-apoptotic action of SNOG was almost abrogated. Three major MAP kinase pathways (ERK, JNK, and p38) that are downstream to p21Ras were investigated. It was observed that only the activation of ERK1/2 MAP kinases by SNOG in THP-1 cells was attributable to p21Ras. The inhibition of the ERK pathway by PD98059 markedly attenuated apoptosis in SNOG-treated THP-1 cells, but had a marginal effect on SNOG-treated THP-1 cells expressing NO-inserisitive p21Ras. The inhibition of the JNK and p38 pathways by selective inhibitors had no marked effects on the percentage of apoptosis. The induction of p21Waf1 expression by SNOG was observed in THP-1 cells harboring mutant and wild-type p21Ras, however in cells expressing mutant Ras, the expression of p21Waf1 was significantly attenuated. The treatment of THP-1 cells expressing wild-type p21Ras with PD98059 resulted in significant attenuation of p21Waf1 expression. These results indicate that the redox sensitive p21Ras-ERK pathway plays a critical role in sensing and delivering the pro-apoptotic signaling mediated by SNOG. (C) 2008 Elsevier Inc. All rights reserved.

Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase from Y strain

Trypanosoma cruzi is the etiological agent of Chagas` disease, a pathogenesis that affects millions of people in Latin America. Here, we report the crystal structure of dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) from T cruzi strain Y solved at 2.2 angstrom resolution. DHODH is a flavin mononucleotide containing enzyme, which catalyses the oxidation Of L-dihydroorotate to orotate, the fourth step and only redox reaction in the de novo biosynthesis of pyrimidine nucleotides. Genetic studies have shown that DHODH is essential for T cruzi survival, validating the idea that this enzyme can be considered an attractive target for the development of antichagasic drugs. In our work, a detailed analysis of T cruzi DHODH crystal structure has allowed us to suggest potential sites to be further exploited for the design of highly specific inhibitors through the technology of structure-based drug design. (c) 2008 Elsevier Inc. All rights reserved.

The macrophage-derived neutrophil chemotactic factor, MNCF: A lectin with TNF-alpha-like activities on neutrophils

The macro phage-derived neutrophil chemotactic factor (MNCF) is an alpha-galactoside-binding lectin, known to induce dexamethasone-insensitive neutrophil recruitment. We further characterized MNCF effects on neutrophils and showed that it shares with TNF-alpha the ability to delay apoptosis and to trigger degranulation. MNCF and TNF-alpha effects show similar kinetics and involve Src kinases and MAPKinases dependent pathways. They were, however, clearly distinguished, since the soluble TNF-receptor etanercept prevented TNF but not MNCF effects, while melibiose disaccharide inhibited MNCF but not TNF effects. Absorption of MNCF on detoxi-gel did not alter its properties, precluding an LPS contamination effect. By contrast, galectin-3 required LPS to activate neutrophils. Specific antibodies allowed to further demonstrate that MNCF and galectin-3 are two distinct molecules. Finally, MNCF- and IL-8-induced neutrophil activation differed by their kinetic and sensitivity to pertussis toxin. In conclusion, MNCF is a distinct neutrophil agonist, with pro-inflammatory activities involving its carbohydrate recognition domain. (C) 2008 Elsevier Inc. All rights reserved.

The melatonin action on stromal stem cells within pericryptal area in colon cancer model under constant light

Constant light (LL) is associated with high incidence of colon cancer. MLT supplementation was related to the significant control of preneoplastic patterns. We sought to analyze preneoplastic patterns in colon tissue from animals exposed to LL environment (14 days; 300 lx), MLT-supplementation (10 mg/kg/day) and DMH-treatment (1,2 dimethylhydrazine; 125 mg/kg). Rodents were sacrificed and MLT serum levels were measured by radioimmunoassay. Our results indicated that LL induced ACF development (p < 0.001) with a great potential to increase the number of CD133(+) and CD68(+) cells (p < 0.05 and p < 0.001). LL also increased the proliferative process (PCNA-Li; p < 0.001) as well as decreased caspase-3 protein (p < 0.001), related to higher COX-2 protein expression (p < 0.001) within pericryptal colonic stroma (PCCS). However, MLT-supplementation controlled the development of dysplastic ACF (p < 0.001) diminishing preneoplastic patterns into PCCS as CD133 and CD68 (p < 0.05 and p < 0.001). These events were relative to decreased PCNA-Li index and higher expression of caspase-3 protein. Thus, MLT showed a great potential to control the preneoplastic patterns induced by LL. (C) 2011 Elsevier Inc. All rights reserved.

Orbitally induced oscillations in the East Antarctic ice sheet at the Oligocene/Miocene boundary

Between 34 and 15 million years (Myr) ago, when planetary temperatures were 3-4 degreesC warmer than at present and atmospheric CO2 concentrations were twice as high as today(1), the Antarctic ice sheets may have been unstable(2-7). Oxygen isotope records from deep-sea sediment cores suggest that during this time fluctuations in global temperatures and high-latitude continental ice volumes were influenced by orbital cycles(8-10). But it has hitherto not been possible to calibrate the inferred changes in ice volume with direct evidence for oscillations of the Antarctic ice sheets(11). Here we present sediment data from shallow marine cores in the western Ross Sea that exhibit well dated cyclic variations, and which link the extent of the East Antarctic ice sheet directly to orbital cycles during the Oligocene/Miocene transition (24.1-23.7 Myr ago). Three rapidly deposited glaci-marine sequences are constrained to a period of less than 450 kyr by our age model, suggesting that orbital influences at the frequencies of obliquity (40 kyr) and eccentricity (125 kyr) controlled the oscillations of the ice margin at that time. An erosional hiatus covering 250 kyr provides direct evidence for a major episode of global cooling and ice-sheet expansion about 23.7 Myr ago, which had previously been inferred from oxygen isotope data (Mil event(5)).

A beam-forming network for a circular switched-beam phased array antenna

This paper reports on the design and development of a dividing/phasing network for a compact switched-beam array antenna for Land-vehicle mobile satellite communications, The device is formed by a switched radial divider/combiner and 1-bit phase shifters and generates a sufficient number of beams for the proper satellite tracking.

Caracterização molecular de três espécies de Trachycephalus (Anura: Hylidae) : investigando potenciais híbridos interespecíficos

Animais híbridos representam um desafio à taxonomia e sistemática, pois correspondem a unidades evolutivas geralmente sem clara delimitação morfológica, comportamental e genética. Híbridos podem ser morfologicamente intermediários aos parentais ou, devido à introgressão e retrocruzamentos, suas características podem se misturar tornando difícil sua identificação. Uma das formas de identificação de híbridos é por meio de ferramentas de biologia molecular, que ao utilizarem marcadores de DNA mitocondrial (herança exclusiva materna) e DNA nuclear (herança materna e paterna), permitem a comparação entre informações genéticas. Além da hibridização existem outras fontes de conflito entre dados moleculares provenientes do DNA mitocondrial e DNA nuclear, como por exemplo a retenção de polimorfismos ancentrais. Em localidades do Espírito Santo, Brasil, foram coletados indivíduos de morfologia distinta de Trachycephalus mesophaeus e T. nigromaculatus, que são as únicas espécies do gênero conhecidas nesse estado. Porém, estudos piloto usando o gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (COI) agruparam esses espécimes com amostras de T. typhonius. Devido a estas incongruências, foram sequenciados fragmentos de dois genes mitocondriais - COI e Nicotinamida Desidrogenase subunidade 2 (ND2) e um exon nuclear (tirosinase) de 173 indivíduos de Trachycephalus, de forma a esclarecer as identificações taxonômicas e investigar a correspondência entre caracteres morfológicos e genéticos nesta linhagem, na sua área de ocorrência As filogenias moleculares, divergências genéticas, redes de haplótipos e polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) confirmaram as três espécies acima mencionadas como linhagens evolutivas distintas e revelaram mais sete indivíduos potencialmente híbridos, mas morfologicamente assinalados a T. mesophaeus, T. nigromaculatus ou T. typhonius.. Devido à taxa de evolução lenta da tirosinase, as espécies mais recentes T. typhonius e T. nigromaculatus parecem não terem sido sorteadas completamente nesse gene. Já T. mesophaeus, que é a espécie mais antiga das três, foi recuperada inequivocamente em todas as análises. De forma inédita, as análises moleculares evidenciaram a ocorrência de introgressão bidirecional entre T. nigromaculatus e T. typhonius e entre T. nigromaculatus e T. mesophaeus, sendo que há indícios de indivíduos F1 (cruzamentos entre espécies parentais puras gerando híbridos). A utilização do gene ND2 mostrou-se mais eficiente do que o gene COI nas filogenias e, apesar da tirosinase ser um gene nuclear de evolução lenta, contribuiu para a identificação de incongruências citonucleares. Nossos resultados mostram que a história filogenética de Trachycephalus é complexa e que o uso de marcadores nucleares de evolução mais rápida e ampliação dessas análises para outras espécies do gênero podem revelar mais eventos de hibridização.

A experiência de mulheres e a decisão pelo aborto provocado em uma região do Espírito Santo, Brasil

O escopo deste trabalho buscou compreender as percepções de mulheres que passaram pela decisão do aborto provocadona Microrregião de São Mateus (norte do estado do Espírito Santo, Brasil), a partir do percurso e das interações que se sustentaram nesse processo. Foram realizadas entrevistas com roteiro semiestruturado com sete mulheres sobre essa experiência no ambiente domiciliar dos sujeitos do presente estudo. Os dados foram colhidos em entrevistas abertas e foram analisados à luz do referencial teórico de autores que discorrem acerca do tema e também acerca da ciência bioética.O estudo apresenta seis categorias: O aborto na perspectiva da decisão íntima; o aborto como fonte de revelações de sentimentos; o contemplar peremptório da atitude;técnicas empregadas na intencionalidade e no ato de abortar; sustentando a decisão pelas relações comunitárias; e conteúdos e confidências femininas. A experiência das mulheres foi marcada poruma diversidade de sentimentos, como tristeza, culpa, arrependimento, desespero e dor emocional, todavia, também, pelo alívio com o fim da gravidez e do risco de morte. Angústia adicional foi condicionadaa partir da percepção de fatores contribuintes da decisão, como falta de condições financeiras, falta de apoio da família ou do parceiro e instabilidade no relacionamento com parceiro. Este estudo também sinalizou que o caráter cultural e histórico da gestação, no sentido da norma social, faz-se presente nas mulheres que vivenciam o aborto provocado; demonstrou que as mulheres do presente estudo encontram-se à margem das políticas públicas e de saúde; assinalou que os programas de planejamento familiar ou de saúde reprodutiva deveriam ser estruturados de forma a ajudar também a lidar com problemas de destituição social, econômica e educacional dessa população vulnerada, no sentido de que essas mulheres ultrapassem a proteção social básica e sejam amparadas por serviços de saúde, que constituam espaços equânimes de escuta, orientação e resolução.

O estresse ocupacional do professor do ensino superior: a relação entre os sintomas de estresse e a atividade docente em duas instituições de ensino superior da cidade de Teresina-pi

RESUMO: Com a globalização e as mudanças provenientes da mesma, o ser humano vem sofrendo com o estresse ao tentar se adaptar e acompanhar tais acontecimentos seja no âmbito familiar, social, afetivo e profissional. Para desempenhar as funções docentes do ensino superior, são exigidas diversas condições, e o professor sofre um desgaste físico e psicológico ao tentar suprir determinadas demandas, o que em muitos casos, ocasiona o estresse ocupacional. Com o propósito de aprofundar conhecimentos sobre a relação existente entre o estresse e a atividade docente, fizemos o seguinte questionamento: quais os sintomas de estresse apresentados em professores do ensino superior? Com Objetivo geral de estudar os sintomas e níveis de estresse, relacionando-os à carreira docente do ensino superior, com as variáveis: regime de trabalho, vínculo institucional, idade, sexo, tempo de trabalho, tipo de IES, em uma população específica pertencente a duas Instituições de Ensino Superior -IES da cidade de Teresina, Estado do Piauí- Brasil, sendo uma pública e uma privada. Visando atingir os objetivos propostos, utilizamos da metodologia de caráter exploratório e descritivo, com abordagem quantitativa dos dados recorrendo à estatística descritiva. O instrumento de coleta de dados utilizado foi o “Inventário de Sintomas de Stress Lipp – ISSL” da autora Marilda Lipp (2000), aplicado em uma amostra de cem (100) professores, com idade entre 22 e 55 anos de idade. Mediante a análise dos dados, pode-se verificar que apesar das diferenças existentes entre IES públicas e privadas, a maioria dos resultados foram semelhantes. Em ambas as IES houve presença de estresse nos docentes, prevalecendo a fase de alerta, logo após a fase de resistência, em seguida a fase de quase-exaustão,Houve um predomínio de sintomas psicológicos, onde na IES privada se destacam: aumento súbito de motivação e entusiasmo súbito. E como sintomas físicos: boca seca e nó no estômago. Na IES públicas os sintomas psicológicos foram: entusiasmo súbito e aumento súbito de motivação. E físicos: tensão muscular e nó no estômago. Em relação as co-variáveis que apresentaram maior relação com o estresse pode-se apresentar na IES privada o sexo masculino e feminino possuem a mesma representatividade, a faixa etária de 31 a 39 anos, estado civil casado, tempo de serviço de 7 a 13 anos, jornada de trabalho integral e vínculo efetivo. Já na IES pública verifica-se relação com o sexo feminino, idade variando de 31 a 39 anos, estado civil solteiro, tempo de serviço de 7 a 13 anos, jornada de trabalho parcial e vínculo substituto. De acordo com o que foi analisado, percebe-se que os docentes do ensino superior, independente do tipo de IES ao qual estão vinculados, estão sujeitos ao estresse e que estes não devem ser responsabilizados pelo mesmo, nem por adoção de medidas preventivas, visto que toda a IES sofre as conseqüências, e tem condições de auxiliar o professor com situações preventivas, de controle a partir do conhecimento, interpretação e mudança de hábitos do professor no ambiente universitário. ABSTRACT: With globalization and its changes, the human being has suffered from stress while trying to adapt and monitor such events, within family, social, emotional or professional scope. To play as teacher in higher education, they are required various conditions and the teacher suffers physical and psychological wear trying to meet certain demands, which in many cases leads to occupational stress.Aiming to deepen knowledge about the relationship between stress and teaching activities, we made the following question: what are the symptoms of stress presented by higher education teachers? With the general objective of study the symptoms and the stress levels, linking them to the teaching career in higher education, using the following variables: working regime, institutional link, age, sex, working time, type of HEI, in a specific population belongs to two Higher Education Institutions HEI - of Teresina, Piauí, Brazil, one public and one private. Aiming to achieve the proposed objectives, we used a exploratory - descriptive study, with quantitative approach of data using graphs and tables. The data collection instrument used was the "Lipp Stress Symptoms Inventory - ISSL" by the author Marilda Lipp (2000), applied to a sample of a hundred (100) teachers, between 22 and 55 years of age. Through data analysis, despite the differences between public and private HEIs, we can see that the most results were similar. In both HEIs, the results revealed that the alert phase of stress had prevailed, followed by resistance and almost-exhaustion phases. A small number presented stress in exhaustion phase and another group did not present stress. There was a predominance of psychological symptoms, which in private HEIs stands out: increase of motivation and enthusiasm suddenly. And as physical symptoms: dry mouth and stomached. In public HEI, psychological symptoms were sudden enthusiasm and increse of motivation. And physical symptoms: muscle tension and stomached. In relation to the co-variables that showed a greater relationship with stress, in private HEIs males and females have the same representation, between 31-39 years, married, working time of 7-13 years, full working day and effective link. Already in public HEIs, female, between 31-39 years, unmarried, working time of 7-13 years, partial working day and substitute link had prevailed. According to analysis, we find that teachers in higher education, regardless of the HEI to which they are linked, are subject to stress. And they should not be blamed for the onset of stress, neither by adopting preventive measures, since all the HEI suffers the consequences, and it is able to help teachers with preventive measures based on the knowledge, interpretation and change habits of the teacher in the university environment.

Sistema de contagem de tráfego e classificação automática de veículos, em tempo real e sem fios

Esta tese tem por objectivo o desenho e avaliação de um sistema de contagem e classificação de veículos automóveis em tempo-real e sem fios. Pretende, também, ser uma alternativa aos actuais equipamentos, muito intrusivos nas vias rodoviárias. Esta tese inclui um estudo sobre as comunicações sem fios adequadas a uma rede de equipamentos sensores rodoviários, um estudo sobre a utilização do campo magnético como meio físico de detecção e contagem de veículos e um estudo sobre a autonomia energética dos equipamentos inseridos na via, com recurso, entre outros, à energia solar. O projecto realizado no âmbito desta tese incorpora, entre outros, a digitalização em tempo real da assinatura magnética deixada pela passagem de um veículo, no campo magnético da Terra, o respectivo envio para servidor via rádio e WAN, Wide Area Network, e o desenvolvimento de software tendo por base a pilha de protocolos ZigBee. Foram desenvolvidas aplicações para o equipamento sensor, para o coordenador, para o painel de controlo e para a biblioteca de Interface de um futuro servidor aplicacional. O software desenvolvido para o equipamento sensor incorpora ciclos de detecção e digitalização, com pausas de adormecimento de baixo consumo, e a activação das comunicações rádio durante a fase de envio, assegurando assim uma estratégia de poupança energética. Os resultados obtidos confirmam a viabilidade desta tecnologia para a detecção e contagem de veículos, assim como para a captura de assinatura usando magnetoresistências. Permitiram ainda verificar o alcance das comunicações sem fios com equipamento sensor embebido no asfalto e confirmar o modelo de cálculo da superfície do painel solar bem como o modelo de consumo energético do equipamento sensor.