Sviluppo ed applicazione di tecniche di Multiple Kernel Learning per dati di neuroimaging

Questo lavoro di tesi riguarda lo studio e l’implementazione di un algoritmo di multiple kernel learning (MKL) per la classificazione e la regressione di dati di neuroimaging ed, in particolare, di grafi di connettività funzionale. Gli algoritmi di MKL impiegano una somma pesata di vari kernel (ovvero misure di similarità) e permettono di selezionare le features utili alla discriminazione delle istanze durante l’addestramento del classificatore/regressore stesso. L’aspetto innovativo introdotto in questa tesi è stato lo studio di un nuovo kernel tra grafi di connettività funzionale, con la particolare caratteristica di conservare l’informazione relativa all’importanza di ogni singola region of interest (ROI) ed impiegando la norma lp come metodo per l’aggiornamento dei pesi, al fine di ottenere soluzioni sparsificate. L’algoritmo è stato validato utilizzando mappe di connettività sintetiche ed è stato applicato ad un dataset formato da 32 pazienti affetti da deterioramento cognitivo lieve e malattia dei piccoli vasi, di cui 16 sottoposti a riabilitazione cognitiva tra un’esame di risonanza ma- gnetica funzionale di baseline e uno di follow-up. Le mappe di con- nettività sono state ottenute con il toolbox CONN. Il classificatore è riuscito a discriminare i due gruppi di pazienti in una configurazione leave-one-out annidata con un’accuratezza dell’87.5%. Questo lavoro di tesi è stato svolto durante un periodo di ricerca presso la School of Computer Science and Electronic Engineering dell’University of Essex (Colchester, UK).

Análise do contributo das acessibilidades rodoviárias para o desenvolvimento regional: o caso da Nut II do Centro

Trabalho Final de Mestrado para obtenção do grau de Mestre em Engenharia Civil na Área de Especialização em Vias de Comunicação e Transportes

Use of Fibres Obtained from the Cashew (Anacardium ocidentale, L) and Guava (Psidium guayava) Fruits for Enrichment of Food Products

OLIVEIRA, E. L. et al. Use of Fibres obtained from the Cashew (Anacardium ocidentale, L) and Guava (Psidium guayava) Fruits for Enrichment of Food Products. Brazilian Archives of Biology and Technology, Curitiba, PR, v. 48, p. 143-150, 2005.

Assessing nut germination protocols for macadamia cultivar 'Beaumont'

A rapid rate and high percentage of macadamia nut germination, together with production of vigorous seedlings, are required by nurseries and breeding programs. Germination of nuts is typically protracted, however, and rarely reaches 100%. Many studies have been conducted into macadamia germination, but most have assessed percent germination only. This study investigated the effects of various treatments on percent germination, germination rate, and plant, shoot and root dry weights. The treatments tested were combinations of: (i) soaking or not soaking seeds in a dilute fungicide solution prior to planting; (ii) four different planting media; and (iii) leaving seed trays open or placing them inside clear plastic bags. For freshly harvested nuts, sowing in potting mix under clear plastic and without soaking produced the highest percent germination and germination rate, the largest shoots, and longest lateral roots.

Bahadur representation of linear kernel quantile estimator of VaR under mixing assumptions

Bahadur representation and its applications have attracted a large number of publications and presentations on a wide variety of problems. Mixing dependency is weak enough to describe the dependent structure of random variables, including observations in time series and longitudinal studies. This note proves the Bahadur representation of sample quantiles for strongly mixing random variables (including ½-mixing and Á-mixing) under very weak mixing coe±cients. As application, the asymptotic normality is derived. These results greatly improves those recently reported in literature.

Diseño e implementación del kernel de xDEVS, versión distribuida

Para entender nuestro proyecto, debemos comprender DEVS. Dentro de los formalismos más populares de representación de sistemas de eventos discretos se encuentra DES. En la década de los 70, el matemático Bernard Zeigler propuso un formalismo general para la representación de dichos sistemas. Este formalismo denominado DEVS (Discrete EVent System Specification) es el formalismo más general para el tratamiento de DES. DEVS permite representar todos aquellos sistemas cuyo comportamiento pueda describirse mediante una secuencia de eventos discretos. Estos eventos se caracterizan por un tiempo base en el que solo un número de eventos finitos puede ocurrir. DEVS Modelado y Simulación tiene múltiples implementaciones en varios lenguajes de programación como por ejemplo en Java, C# o C++. Pero surge la necesidad de implementar una plataforma distribuida estable para proporcionar la mecánica de interoperabilidad e integrar modelos DEVS diversificados. En este proyecto, se nos dará como código base el core de xDEVS en java, aplicado de forma secuencial y paralelizada. Nuestro trabajo será implementar el core de manera distribuida de tal forma que se pueda dividir un sistema DEVS en diversas máquinas. Para esto hemos utilizado sockets de java para hacer la transmisión de datos lo más eficiente posible. En un principio deberemos especificar el número de máquinas que se conectarán al servidor. Una vez estas se hayan conectado se les enviará el trabajo específico que deberán simular. Cabe destacar que hay dos formas de dividir un sistema DEVS las cuales están implementadas en nuestro proyecto. La primera es dividirlo en módulos atómicos los cuales son subsistemas indivisibles en un sistema DEVS. Y la segunda es dividir las funciones de todos los subsistemas en grupos y repartirlos entre las máquinas. En resumen el funcionamiento de nuestro sistema distribuido será comenzar ejecutando el trabajo asignado al primer cliente, una vez finalizado actualizará la información del servidor y este mandara la orden al siguiente y así sucesivamente.

Spectrum-effect relationships between high performance liquid chromatography fingerprints and bioactivities of charred areca nut

Purpose: To investigate the spectrum-effect relationships between high performance liquid chromatography (HPLC) fingerprints and duodenum contractility of charred areca nut (CAN) on rats. Methods: An HPLC method was used to establish the fingerprint of charred areca nut (CAN). The promoting effect on contractility of intestinal smooth was carried out to evaluate the duodenum contractility of CAN in vitro. In addition, the spectrum-effect relationships between HPLC fingerprints and bioactivities of CAN were investigated using multiple linear regression analysis (backward method). Results: Fourteen common peaks were detected and peak 3 (5-Hydroxymethyl-2-furfural, 5-HMF) was selected as the reference peak to calculate the relative retention time of 13 other common peaks. In addition, the equation of spectrum-effect relationships {Y = 3.818 - 1.126X1 + 0.817X2 - 0.045X4 - 0.504X5 + 0.728X6 - 0.056X8 + 1.122X9 - 0.247X13 - 0.978X14 (p < 0.05, R2 = 1)} was established in the present study by the multiple linear regression analysis (backward method). According to the equation, the absolute value of the coefficient before X1, X2, X4, X5, X6, X8, X9, X13, X14 was the coefficient between the component and the parameter. Conclusion: The model presented in this study successfully unraveled the spectrum-effect relationship of CAN, which provides a promising strategy for screening effective constituents of areca nut.

SCALABLE APPROXIMATION OF KERNEL FUZZY C-MEANS

Virtually every sector of business and industry that uses computing, including financial analysis, search engines, and electronic commerce, incorporate Big Data analysis into their business model. Sophisticated clustering algorithms are popular for deducing the nature of data by assigning labels to unlabeled data. We address two main challenges in Big Data. First, by definition, the volume of Big Data is too large to be loaded into a computer’s memory (this volume changes based on the computer used or available, but there is always a data set that is too large for any computer). Second, in real-time applications, the velocity of new incoming data prevents historical data from being stored and future data from being accessed. Therefore, we propose our Streaming Kernel Fuzzy c-Means (stKFCM) algorithm, which reduces both computational complexity and space complexity significantly. The proposed stKFCM only requires O(n2) memory where n is the (predetermined) size of a data subset (or data chunk) at each time step, which makes this algorithm truly scalable (as n can be chosen based on the available memory). Furthermore, only 2n2 elements of the full N × N (where N >> n) kernel matrix need to be calculated at each time-step, thus reducing both the computation time in producing the kernel elements and also the complexity of the FCM algorithm. Empirical results show that stKFCM, even with relatively very small n, can provide clustering performance as accurately as kernel fuzzy c-means run on the entire data set while achieving a significant speedup.

Ingestive behavior of sheep fed Brazil nut cake in the diet.

Avaliou-se o comportamento ingestivo de ovinos alimentados com níveis de inclusão (0, 15, 30 e 60%) de torta de castanha-do-pará (TC) (Bertholletia excelsa Bonpl.), na dieta à base de silagem de milho. Foram utilizados 16 cordeiros, sem raça definida e peso médio de 33 ± 6.04 kg, distribuídos aleatoriamente nos quatro tratamentos. Os dados foram analisados quanto à normalidade, submetidos à análise de variância, ajustados em equações de regressão e ao teste de Williams, estimando-se o ponto W. Os consumos voluntários de matéria seca (MS) e fibra insolúvel em detergente neutro (FDN), reduziram linearmente (P=0,013 e P=0,002) em 5,0 g e 2,41 g dia-1, respectivamente, para cada 1% de TC inclusa na dieta. O tempo despendido em alimentação (288,75 min dia-1) não foi afetado significativamente, o tempo em ócio cresceu linearmente (P=0,002) em 3,10 minutos, e o tempo gasto em ruminação decresceu (P=0,001) em 2,62 minutos, para cada 1% de inclusão do coproduto. O número de bolos ruminados (NBR) sofreu efeito decrescente (P=0,004) em 4,61 nº dia-1. Quanto às mastigações merícicas, o tempo gasto por bolo (37,5 seg) e o número por bolo (56,14) não diferiram (P>0,05) entre os tratamentos, mas o tempo total de mastigação (TTM) reduziu linearmente (P=0,002) em 0,05 h dia-1 e o número de mastigações por dia apresentou efeito quadrático (P=0,008), com máximo estimado em 17,5% de TC. A eficiência de ruminação não diferiu entre os tratamentos (101,95 g MS h-1 e 36,76 g FDN h-1) e a eficiência de alimentação (EAL) sofreu redução linear (P=0,045) em 0,42 g FDN h-1, mas foi semelhante para g MS h-1 (172,5). Os consumos diários de MS e FDN apresentaram pontos W estimados em 51,96 e 30,67% de TC, respectivamente. As variáveis NBR, TTM e EAL (g FDN h-1) tiveram os pontos W estimados em 56,64, 56,19 e 56,33% de TC. A torta de castanha-do-pará, em níveis superiores a 56% da MS da dieta, afeta o comportamento ingestivo dos animais, principalmente em variáveis relacionadas à ruminação, sendo que a partir de 30,67% já passa a afetar o consumo de FDN, tendo como principais fatores o teor de extrato etéreo e a fonte de fibra das dietas.

Population fluctuation of Empoasca sp. (Hemiptera: cicadellidae) in a physic nut crop in Mato Grosso do Sul.

2016

Heat kernel and worldline path integrals for the Proca theory

In this thesis we study the heat kernel, a useful tool to analyze various properties of different quantum field theories. In particular, we focus on the study of the one-loop effective action and the application of worldline path integrals to derive perturbatively the heat kernel coefficients for the Proca theory of massive vector fields. It turns out that the worldline path integral method encounters some difficulties if the differential operator of the heat kernel is of non-minimal kind. More precisely, a direct recasting of the differential operator in terms of worldline path integrals, produces in the classical action a non-perturbative vertex and the path integral cannot be solved. In this work we wish to find ways to circumvent this issue and to give a suggestion to solve similar problems in other contexts.