Species accumulation curves and their applications in parasite ecology

Species accumulation curves (SACs) chart the increase in recovery of new species as a function of some measure of sampling effort. Studies of parasite diversity can benefit from the application of SACs, both as empirical tools to guide sampling efforts and predict richness, and because their properties are informative about community patterns and the structure of parasite diversity. SACs can be used to infer interactivity in parasite infra-communities, to partition species richness into contributions from different spatial scales and different levels of the host hierarchy (individuals, populations and communities) or to identify modes of community assembly (niche versus dispersal). A historical tendency to treat individual hosts as statistically equivalent replicates (quadrats) seemingly satisfies the sample-based subgroup of SACs but care is required in this because of the inequality of hosts as sampling units. Knowledge of the true distribution of parasite richness over multiple host-derived and spatial scales is far from complete but SACs can improve the understanding of diversity patterns in parasite assemblages.

Precision-recall operating characteristic (P-ROC) curves in imprecise environments

Traditionally, machine learning algorithms have been evaluated in applications where assumptions can be reliably made about class priors and/or misclassification costs. In this paper, we consider the case of imprecise environments, where little may be known about these factors and they may well vary significantly when the system is applied. Specifically, the use of precision-recall analysis is investigated and compared to the more well known performance measures such as error-rate and the receiver operating characteristic (ROC). We argue that while ROC analysis is invariant to variations in class priors, this invariance in fact hides an important factor of the evaluation in imprecise environments. Therefore, we develop a generalised precision-recall analysis methodology in which variation due to prior class probabilities is incorporated into a multi-way analysis of variance (ANOVA). The increased sensitivity and reliability of this approach is demonstrated in a remote sensing application.

Ensino social da CNBB : crítica ao capitalismo neoliberal e ilusão transcendental

A práxis religiosa dos cristãos na América Latina está profundamente associada aos debates de superação da exclusão social na busca de uma sociedade mais justa e solidária. Desde o pós-guerra os cristãos são fundamentais nas ações de transformação da sociedade. Nesta tradição, a CNBB propõe orientações pastorais sobre as diversas realidades da sociedade, também a economia. Entre 1995 e 2004, os documentos oficiais da CNBB apresentam uma contundente crítica ao sistema de globalização neoliberal, apresentando a exigência dos cristãos trabalharem na superação desta ideologia econômica em busca de uma sociedade mais justa e igualitária. É importante perceber as contribuições específicas do cristianismo deste discurso teológico-pastoral. Esta crítica levada a sua radicalidade teológica deve ser capaz de desvelar a ilusão transcendental, criticando a ingenuidade utópica que absolutiza projetos históricos gerando sacrifícios de vidas humanas. Para isto, é necessário contínuo discernimento a partir da liberdade cristã que se constitui em um critério ético fundamental de diiscernimento a partir da vida das vítimas. Neste sentido, os textos sociais da CNBB são apresentados no contexto do discurso social católico no Brasil, em sua lógica crítica ao neoliberalismo e na análise da ilusão transcendental às vezes reproduzida nas propostas de superação da sociedade atual (AU).

ANTROPOLOGIA TRANSCENDENTAL E CORRELAÇÃO : KARL RAHNER E PAUL TILLICH EM DIALOGO - UMA LEITURA INTERCONFESSIONAL DE MÉTODOS TEOLÓGICOS A PARTIR DA ONTOLOGIA EXISTENCIAL DE MARTIN HEIDEGGER

Esta tese de Doutorado procura estudar os métodos teológicos em diálogo, antropologiatranscendental de Karl Rahner e correlação de Paul Tillich, a partir da sistematização da ontologia existencial elaborada pelo jovem Heidegger em Sein und Zeit. Tanto num, como noutro método, o que se discute é a profundidade do ser, na sua possibilidade de aproximação em superação ao que não pode ser dito. Nesse caso, tanto a metafísica tomista, resgatada por Rahner, quanto a secularização protestante e o abismo do ser, enfatizado por Tillich, assumem a impossibilidade de se dizer o conteúdo do sagrado, exatamente por se situarem ou no inconceito da raiz ontológica (Rahner), ou no excesso de sentido do Ultimate Concern (Tillich). Dessas impossibilades, independente se um antes e depois (Rahner), ou se um depois e um antes em profundidade (Tillich), o que se tem é a pergunta ontológica como possibilidade da abertura do ser, nos dois casos sem conteúdo, para que a resposta , que também não responde, seja dada como (im)possibilidade do deslocamento do ser. No resgate da metafísica tomista, em Rahner, há um deslocamento a partir de um sentido, de certo modo linear , daí antropologia-transcendental. Já na leitura protestante de Tillich, o deslocamento se dá por uma dialética , o ser ameaçado pelo não-ser, como uma unidade rompida, daí correlação. A tese é apresentada em quatro capítulos. No primeiro há uma leitura de Heidegger, pela perspectiva da hermenêutica da compreensão. Já no segundo a reflexão se dá em busca da possibilidade da compreensão pela racionalidade ontológica na correlação, Paul Tillich, pela mediação do simbólico. No terceiro, seguindo as mesmas preocupações, se faz a leitura da epistemologia na racionalidade ontológica na antropologia -transcendental, Karl Rahner, pela mediação da pré-apreensão. O quarto capítulo apresenta temas decorrentes, e tradicionais da teologia, em diálogo a partir dos métodos.(AU)

ENSINO SOCIAL DA CNBB : crítica ao capitalismo neoliberal e ilusão transcendental

A práxis religiosa dos cristãos na América Latina está profundamente associada aos debates de superação da exclusão social na busca de uma sociedade mais justa e solidária. Desde o pós-guerra os cristãos são fundamentais nas ações de transformação da sociedade. Nesta tradição, a CNBB propõe orientações pastorais sobre as diversas realidades da sociedade, também a economia. Entre 1995 e 2004, os documentos oficiais da CNBB apresentam uma contundente crítica ao sistema de globalização neoliberal, apresentando a exigência dos cristãos trabalharem na superação desta ideologia econômica em busca de uma sociedade mais justa e igualitária. É importante perceber as contribuições específicas do cristianismo deste discurso teológico-pastoral. Esta crítica levada a sua radicalidade teológica deve ser capaz de desvelar a ilusão transcendental, criticando a ingenuidade utópica que absolutiza projetos históricos gerando sacrifícios de vidas humanas. Para isto, é necessário contínuo discernimento a partir da liberdade cristã que se constitui em um critério ético fundamental de discernimento a partir da vida das vítimas. Neste sentido, os textos sociais da CNBB são apresentados no contexto do discurso social católico no Brasil, em sua lógica crítica ao neoliberalismo e na análise da ilusão transcendental às vezes reproduzida nas propostas de superação da sociedade atual.

Learning curves for Gaussian processes models: fluctuations and universality

Based on a statistical mechanics approach, we develop a method for approximately computing average case learning curves and their sample fluctuations for Gaussian process regression models. We give examples for the Wiener process and show that universal relations (that are independent of the input distribution) between error measures can be derived.

A variational approach to learning curves

We combine the replica approach from statistical physics with a variational approach to analyze learning curves analytically. We apply the method to Gaussian process regression. As a main result we derive approximative relations between empirical error measures, the generalization error and the posterior variance.

Growth curves of four crustose lichens

The growth curves of four common species of crustose lichens, viz., Buellia aethalea (Ach.) Th. Fr., Lecidea tumida Massai., Rhizocarpon geographicum (L.) DC., and Rhizocarpon reductum Th. Fr. were studied at a site in south Gwynedd, north Wales, UK. Radial growth rates (RGR, mm 1.5 yr-1) were greatest in thalli of R. reductum and least in R. geographicum. Variation in RGR between thalli was greater in B. aethalea and L. tumida than in the species of Rhizocarpon. The relationship between growth rate and thallus diameter was not asymptotic; RGR increasing in smaller thalli to a maximum and then declining in larger diameter thalli. A polynomial curve was fitted to the data; the growth curves being fitted best by a second-order (quadratic) curve, the best fit to this model being shown by B. aethalea. A significant linear regression with a negative slope was also fitted to the growth of the larger thalli of each species. The data suggest that the growth curves of the four crustose lichens differ significantly from the asymptotic curves of foliose lichen species. A phase of declining RGR in larger thalli appears to be characteristic of crustose lichens and is consistent with data from lichenometric studies.

Optimizing measurement of subjective amplitude of accommodation with defocus curves

PURPOSE: To determine whether letter sequences and/or lens-presentation order should be randomized when measuring defocus curves and to assess the most appropriate criterion for calculating the subjective amplitude of accommodation (AoA) from defocus curves. SETTING: Eye Clinic, School of Life & Health Sciences, Aston University, Birmingham, United Kingdom. METHODS: Defocus curves (from +3.00 diopters [D] to -3.00 D in 0.50 D steps) for 6 possible combinations of randomized or nonrandomized letter sequences and/or lens-presentation order were measured in a random order in 20 presbyopic subjects. Subjective AoA was calculated from the defocus curves by curve fitting using various published criteria, and each was correlated to subjective push-up AoA. Objective AoA was measured for comparison of blur tolerance and pupil size. RESULTS: Randomization of lens-presentation order and/or letter sequences, or lack of, did not affect the measured defocus curves (P>.05, analysis of variance). The range of defocus that maintains highest achievable visual acuity (allowing for variability of repeated measurement) was better correlated to (r = 0.84) and agreed best with ( 0.50 D) subjective push-up AoA than any other relative or absolute acuity criterion used in previous studies. CONCLUSIONS: Nonrandomized letters and lens presentation on their own did not affect subjective AoA measured by defocus curves, although their combination should be avoided. Quantification of subjective AoA from defocus curves should be standardized to the range of defocus that maintains the best achievable visual acuity.

Multifocal intraocular lens differentiation using defocus curves

Purpose: To determine the most appropriate analysis technique for the differentiation of multifocal intraocular lens (MIOL) designs using defocus curve assessment of visual capability.Methods:Four groups of fifteen subjects were implanted bilaterally with either monofocal intraocular lenses, refractive MIOLs, diffractive MIOLs, or a combination of refractive and diffractive MIOLs. Defocus curves between -5.0D and +1.5D were evaluated using an absolute and relative depth-of-focus method, the direct comparison method and a new 'Area-of-focus' metric. The results were correlated with a subjective perception of near and intermediate vision. Results:Neither depth-of-focus method of analysis were sensitive enough to differentiate between MIOL groups (p>0.05). The direct comparison method indicated that the refractive MIOL group performed better at +1.00, -1.00 and -1.50 D and worse at -3.00, -3.50, -4.00 and -5.00D compared to the diffractive MIOL group (p