Deletions within COL11A1 in Type 2 Stickler Syndrome Detected by Multiplex Ligation - Syndrome Detected by Multiplex Ligation Dependent Probe Amplification (MLPA)

Background: COL11A1 is a large complex gene around 250 kb in length and consisting of 68 exons. Pathogenic mutations in the gene can result in Stickler syndrome, Marshall syndrome or Fibrochondrogenesis. Many of the mutations resulting in either Stickler or Marshall syndrome alter splice sites and result in exon skipping, which because of the exon structure of collagen genes usually leaves the message in-frame. The mutant protein then exerts a dominant negative effect as it co-assembles with other collagen gene products. To date only one large deletion of 40 kb in the COL11A1, which was detected by RT-PCR, has been characterized. However, commonly used screening protocols, utilizing genomic amplification and exon sequencing, are unlikely to detect such large deletions. Consequently the frequency of this type of mutation is unknown. Case presentations: We have used Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MLPA) in conjunction with exon amplification and sequencing, to analyze patients with clinical features of Stickler syndrome, and have detected six novel deletions that were not found by exon sequencing alone. Conclusion: Exon deletions appear to represent a significant proportion of type 2 Stickler syndrome. This observation was previously unknown and so diagnostic screening of COL11A1 should include assays capable of detecting both large and small deletions, in addition to exon sequencing.

Information flow analysis using data-dependent logical propositions

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Engenharia Informática

Long-Term and Concentration-Dependent Beneficial Effect of Efavirenz on HDL-Cholesterol in HIV-Infected Patients

AIMS: To investigate the long-term effects of efavirenz on cholesterol (TC), high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C), low-density lipoprotein (LDL-C) and triglycerides (TG). METHODS: Thirty-four HIV-infected patients who commenced efavirenz therapy were monitored for 36 months. RESULTS: In patients with baseline HDL-C<40 mg.dL-1 an increase in HDL-C from 31+/-1 mg.dL-1 to 44+/-2 mg.dL-1 (95% confidence interval 5.9, 21.9, P<0.01) was observed and remained throughout the follow-up period. Median efavirenz plasma concentration was 1.98 mg.L-1 and a direct correlation between percentage of HDL-C variation or TC/HDL-C ratio and efavirenz plasma concentrations was found. CONCLUSIONS: There is evidence of a long-term and concentration-dependent beneficial effect of efavirenz on HDL-C in HIV-infected patients.

The mechanism of formate oxidation by metal-dependent formate dehydrogenases

J Biol Inorg Chem (2011) 16:1255–1268 DOI 10.1007/s00775-011-0813-8

SEROVARS AND ANTIMICROBIAL RESISTANCE OF Salmonella spp. ISOLATED FROM TURKEY AND BROILER CARCASSES IN SOUTHERN BRAZIL BETWEEN 2004 AND 2006

Salmonella spp. causes diseases in fowls, when species-specific serovars (Salmonella Pullorum and S.Gallinarum) are present in flocks, and public health problems, when non-typhoid serovars are isolated, as well as possible bacterial resistance induced by the preventive and therapeutic use of antimicrobials in animal production. This study describes the serovars and bacterial resistance of 280Salmonella spp. strains isolated from turkey and broiler carcasses in Southern Brazil between 2004 and 2006. SalmonellaEnteritidis was the most prevalent serovar (55.7%), followed by Heidelberg (5.0%), Agona (4.3%), Bredeney (3.9%), Hadar (3.2%), and Typhimurium (2.9%). Tennessee and S. Enterica subspecies enterica(O: 4.5) were isolated only in turkeys, and Hadar (18.6%) was the most prevalent serovar in this species. Antimicrobial susceptibility tests were performed in 178 isolates (43 from turkeys and 135 from broilers). All isolates were sensitive to amoxicillin + clavulanic acid, polymyxin B, ciprofloxacin, and norfloxacin, and were resistant to bacitracin and penicillin. Broiler carcass isolates showed resistance to nalidixic acid (48.9%), nitrofurantoin (34.3%), neomycin (9.6%), tetracycline (5.2%), and kanamycin (8.9%); and turkey carcass isolates were resistant to nalidixic acid (62.8%), tetracycline (34.9%), and neomycin (30.2%), with a significant difference in turkeys when compared to broiler carcass isolates. These results indicate the need for judicious use of antimicrobials in livestock production, given that the serovars identified are potential causes of food poisoning.

Níveis de sensibilidade de enterobactérias, em particular Salmonella typhi, a rifamicina S.V.

Em face à predominante eliminação biliar da rifamicina S.V. atingindo concentrações muitas vêzes superiores aos níveis séricos obtidos com as doses terapêuticas, e pelo possível interêsse dessa verificação para o tratamento dos portadores biliares crônicos de Salmonella typhi determinou-se a concentração mínima inibitória de 165 estirpes de enterobactérias, incluindo 77 amostras de S. typhi. Foi verificado que a maioria das cepas de Escherichia coli, Shigella e Proteus mirabilis correspondiam a uma concentração inibitória mínima entre 33 a 65 μg/ml. Entre 65 e 128 μg/ml foram determinadas as concetrações inibitórias mínimas da maioria das outras espécies de Proteus, de Providencia e de Klebsiella. Para Salmonella e Enterobacter o limite mínino de sensibilidade foi, em regra, igual ou superior a 128 μg/ml. Diferenças mais acentuadas de comportamento entre as enterobactérias foram observadas quanto à ação bactericida da rifamicidas S.V. De uma maneira geral, para E. coli e Shigella, as concentrações inibitórias mínimas já referidas. Para as espécies de Proteus e Providencia houve variação maior de comportamento, mas tendência a que o efeito bactericidas fôsse encontrado em concentrações que correspondiam a 4 vêzes as bacteriostáticas para as mesmas espécies. Finalmente, de modo pouco feliz para os propósitos visados, em Salmonella, com a inclusão de S. typhi, não foi atingido um efeito bactericida, com as mais altas concentrações usadas as quais corresponderam em média a 6 vêzes as concentrações bacteriostáticas para esse gênero.

Tipos bioquímicos de Salmonella typhi de algumas regiões do Brasil

Foram estudadas 813 amostras de Salmonella typhi provenientes dos estados da Bahia, Guanabara, Pará, Pernambuco e S. Paulo, quanto ao seu comportamento diante da arabinose e xilose. Revelaram os resultados que 472 culturas (58,05%) caracterizaram-se como tipo fermentativo I (acidificando apenas a xilose), 334 amostras (41,08%) per­tencei am ao biotipo II (ausência de fermentação em arabinose e xilose), tendo apenas 7 culturas (0,86%) representando o biotipo III (fermentam a arabino­se e xilose).

Atividade «in vitro» da ampicilina e hetacilina sobre amostras de Salmonella typhi

Os autores, utilizando a técnica da diluição seriada em meio líquido, determinaram as concentrações mínimas inibitórias da ampicüina e da hetacilina em 150 amostras de Salmonella typhi, isoladas em sua totalidade a partir de hemoculturas, no Estado da Guanabara. Obteve-se como média das concentrações bacteriostáticas, 0,545 mcg/ml para ampicilina e 0,720 mcg/ml, no caso da hetacilina.

Inatividade "in vitro" do Hycanthone relativamente a bactérias do gênero Salmonella

Verificaram os autores que, "in vitro", concentrações de "Hycanthone" variáveis de 0,39 a 400 mcg/ml não impediram o desenvolvimento de Salmonella anatum, S. derby, S. typhi e S. typhimurium. Essa concentração pode, sem dúvida, representar apoio à hipótese segundo a qual, na salmonelose de curso prolongado, há carreamento das bactérias pelos helmintos, uma vez que Macêdo & cols. curaram, recentemente, a um só tempo, a esquistossomíase mansônica e a infecção bacteriana de pacientes acometidos pelo citado e intrigante problema da patologia regional brasileira.

Implicações para a saúde pública de amostras de Salmonella com resistência múltipla infecciosa a drogas isoladas de animais

Com a finalidade de verificar se a ocorrência de Salmonelas isoladas de animais, com resistência múltipla infecciosa a drogas, influencia a situação epidemiológica no homem, testaram-se 136 amostras de Salmonella isoladas de suínos normas. Das culturas testadas, 18,3% foram portadoras desse tipo de resistência, em evidente oposição aos dados encontrados entre as amostras de origem humana, em que num total de 70 amostras (67,1%) apresentaram resistência a uma e a várias drogas.

Isolamento de Salmonella typhimurium fermentadora de lactose, em caso autoctone no Rio de Janeiro

Relata-se o primeiro isolamento no Rio de Janeiro, a partir de um caso de gastroenterite infantil, da variante de Salmonella typhimurium, que se tornou prevalente na cidade de São Paulo. O mesmo padrão de resistência múltipla a agentes antibacterianos foi observado, com sensibilidade à gentamicina, colimicina e a associação sulfametaxazol-trimetoprim. Discutem-se características bacteriológicas das amostras de mesmo comportamento, enfatizando-se a necessidade de adaptação das técnicas bacterio­lógicas visando a sua detecção, que provavelmente vem passando desapercebida pelas técnicas tradicionais.

Gastroenterite Aguda por Salmonella Não Tifoide em Crianças: Revisão de 10 Anos

Introdução: A Salmonella não tifoide é o agente mais frequente das toxinfeções alimentares nos países desenvolvidos. Em Portugal, são notificados em média 450 casos por ano, 80% dos quais em crianças. Métodos: Revisão casuística dos casos confirmados por coprocultura, internados num hospital do grupo I, na região de Lisboa e Vale do Tejo, entre 1999 e 2008. Análise estatística no programa SPSS® v16.0, com aplicação do teste de Spearman e significância estatística para p< 0,05. Resultados: Identificaram-se 213 internamentos. A mediana anual foi de 21 internamentos, 39% ocorrendo no verão. A mediana das idades foi de 4,2 anos, com doze casos em lactentes até aos três meses. Houve um predomínio no sexo masculino (57%). A mediana do total de leucócitos foi de 9300/mL e da proteína C reativa de 8,8 mg/dL, não se relacionando com a ocorrência de bacteriemia. A duração média do internamento foi de 5,2 dias. As principais complicações foram desidratação (117/213), bacteriemia (8/213), convulsão febril (6/213), síndrome de Mallory-Weiss (5/213) e apendicite aguda (3/213). Os serotipos mais isolados foram: S. Enteritidis (76%), S. Typhimurium (19%), outros (S. O4,5:i-, S. Derby, S. Hayfa, S. Menden, S. Rissen) (5%). Encontraram-se 27% de resistências à ampicilina e 15% ao trimetoprim-sulfametoxazol, sem resistências ao ceftriaxone. Conclusões: Nos 10 anos estudados, o número de casos manteve-se elevado, com morbilidade relevante e resistências significativas aos antibióticos de primeira linha.

Triple Regimen with Rituximab, Plasmapheresis and Intravenous Immunoglobulin in the Treatment of Dialysis Dependent Acute Humoral-Mediated Rejection in Kidney Grafts

Introduction: The clinical importance of humoral-mediated acute rejection has been progressively recognised. Early recognition and treatment with plasmapheresis and intravenous immunoglobulin have recently improved short term prognosis. Case report: In this report we describe the clinical features of three 2nd transplant patients developing severe acute humoral rejection during the first week post-transplant while on anti-thymocyte globulin therapy. Treatment with plasmapheresis/ intravenous immunoglobulin/rituximab resulted in rapid reversal of oliguria,and recovery of renal function within the 1st week of treatment in 2/3 patients. Diagnosis was confirmed by graft biopsies revealing peritubular neutrophiles and C4d deposits. Sequential graft biopsies in all three patients revealed complete histological recovery within two weeks. One patient never recovered renal function, and one patient lost his graft at three months following hemorrhagic shock. After 2 years follow up, the remaining patient maintains a serum creatinine of 1.1mg/dl. Conclusion: The regimen using plasmapheresis plus intravenous immunoglobulin and rituximab was effective in rapidly reversing severe acute humoral rejection.

Estudo da ação "in vitro" da Oxamniquine sobre bactérias do gênero Salmonella

Os autores estudaram a ação "in vitro" da oxamniquine sobre dez espécies de salmonelas. Verificaram que diluições de 1,56 a 400 mcg/ml não exerceram qualquer efeito no crescimento bacteriano. Estas observações têm implicações no tratamento da salmonelose de curso prolongado, assim como nos estudos da sua patogenia.

Infecção por Salmonella typhimurium de origem hídrica em garça gigante (Casmerodius albus egretta), em sua vida livre no Estado do Rio de Janeiro

De uma mortandade de garças de vida livre, no Estado do Rio de Janeiro, Brasil, foi isolada Salmonella typhimurium por hemocultura de material proveniente de uma ave que se mostrava enferma e que à necrópsia não apresentavam lesões a na tomopa tológicas. A Salmonella typhimurium foi também isolada de água de um lago existente no Jardim Zoológico do Rio de Janeiro, onde as aves tinham acesso permanente. Durante a mortandade das aves foi observada uma hepatite necrótica na qual havia colônias bacterianas, tesões atribuídas a esta salmonelose.