Evolutionary implications of multiple SINE insertions in an intronic region from diverse mammals

An analysis of the nuclear beta-fibrinogen intron 7 locus from 30 taxa representing 12 placental orders of mammals reveals the enriched occurrences of short interspersed clement (SINE) insertion events. Mammalian-wide interspersed repeats (MIRs) are present at orthologous sites of all examined species except those in the order Rodentia. The higher substitution rate in mouse and a rare MIR deletion from rat account for the absence of MIR in the rodents. A minimum of five lineage-specific SINE sequences are also found to have independently inserted into this intron in Carnivora, Artiodactyla and Lagomorpha. In the case of Carnivora, the unique amplification pattern of order-specific CAN SINE provides important evidence for the "pan-carnivore" hypothesis of this repeat element and reveals that the CAN SINE family may still be active today. Particularly interesting is the finding that all identified lineage-specific SINE elements show a strong tendency to insert within or in very close proximity to the preexisting MIRs for their efficient integrations, suggesting that the MIR clement is a hot spot for successive insertions of other SINEs. The unexpected MIR excision as a result of a random deletion in the rat intron locus and the non-random site targeting detected by this study indicate that SINEs actually have a greater insertional flexibility and regional specificity than had previously been recognized. Implications for SINE sequence evolution upon and following integration, as well as the fascinating interactions between retroposons and the host genomes are discussed.

Evolutionary implications of avian infectious Bronchitis Virus (AIBV) analysis

For developing efficient vaccines, it is essential to identify which amino acid changes are most important to the survival of the virus. We investigate the amino acid substitution features in the Avian Infectious Bronchitis Virus (AIBV) antigenic domain o

黄芩甙锌配合物药物用途

本发明公开了配合物黄芩甙锌在制备预防和治疗艾滋病的药物中的应用，其结构式见图1，分子式为ZnC23O13H20(1-3.5)H2O。黄芩甙与黄芩甙锌均能抑制HIV-1感染细胞与正常细胞间的融合，但黄芩甙锌的细胞毒性低于黄芩甙，对HIV-1的治疗指数(TI)高于黄芩甙，其治疗效果比黄芩甙好。

法落海的化学成分及抗HIV活性

下载PDF阅读器利用多种柱层析方法,从法落海(Angelica apaensis)95%乙醇提取物中分离得到8个化合物.经IR、MS、NMR等波谱数据鉴定为氧化前胡素(oxypeucedanin,1)、氧化前胡素水合物(oxypeucedanin hydrate,2)、异欧芹属乙素(isoimperatorin,3)、白当归脑(byakangelicin,4)、白当归素(byakangelicol,5)、3'-O-acetylhamaudol (6)、(+)-9(Z),17-octadecadiene-12,14-diyne-1,11,16-triol(7)和9,17-octadecadiene-12,14-diyne-1,11,16-triol,1-acetate(8),其中,化合物6-8是首次从该植物中分离得到.我们对所有得到的8个化合物进行抗HIV活性分析,化合物1具有明显的抗HIV活性,其抑制合胞体形成的半数有效浓度(EC50)为1.6 ms/L,治疗指数(TI)为17.59.

作物及热带作物病虫害数据库的研制和建立

通用的“作物病虫害数据库管理系统（ＰＥＳＴＢＡＳＥ２．１）”和用此系统建立的“热带作物病虫害数据库管理系统”的主要信息项有：各种寄主作物的种类、种植利用，各种病虫的分类地位、地理分布、检疫情况、生物学特性、危害症状、发生规律、天敌、防治方法和农药信息。所建热带作物病虫害数据库管理信息系统中已录用１０００余篇有关文献或专著中的相关信息，涉及的作物种类有：橡胶、咖啡、可可、胡椒、油棕、椰子、腰果、热带水果（芒果、荔枝、龙眼、菠萝、柑桔、油梨、木瓜等）、剑麻、槟榔、茶叶、木薯以及一些热带药用植物和热带花卉等４０余种热带作物；库中存入危害这些作物的病害４００余种、虫害近３００种、一些防治实例及农药信息。

灵长类动物模型在抗艾滋病毒药物研究中的应用

艾滋病(AIDS)灵长类动物模型广泛用于艾滋病毒(HIV)研究.较为常用的有猴免疫缺陷病毒(SIV)/猕猴模型和猴/人免疫缺陷嵌合病毒(SHIV)/猕猴模型,除了在发病机制和抗HIV疫苗研究中的重要作用外,这2种模型在抗HIV药物研究中同样显示出优越性和实用性,体现在药物疗效的研究、新药的开发、耐药性研究、机体免疫反应在药物治疗作用的研究中.通过这些体内抗病毒活性及机制的研究,可进一步揭示药物的抗HIV疗效,对AIDS的临床用药具有重要的指导作用,将使人们重新考虑抗HIV药物的用药原则和药效评价标准.

三碱基体的模型和能力学研究

三碱基体是形成三链DNA结构的基元, 对其进行模型能力学研究具有一定的意义. 该文在理论上给出了22种三碱基体, 其中有16种已见文献报道. 通过构型能量优化、进而作总能量和氢键能的计算, 比较了这些三碱基体的相对稳定性和氢键能。

抗HIV p24多肽单克隆抗体和抗血清的制备及初步应用

检测p2 4抗原的诊断试剂在AIDS研究和防治方面具有重要意义。为研制国产HIVp2 4抗原诊断试剂 ,根据国内外文献 ,合成了HIVp2 4抗原的六个肽段 :G -A 12 ,D -R 16 ,P -S 18,A -G 2 3(HIV - 2ROD) ,P -S 18,N -I 15以及D -C 2 2。六个肽段中 ,N -I 15肽和D -C 2 2肽用于制备McAb ,其余 4个用于制备山羊抗血清。除D -R 16肽的滴度较低 (1∶2 0 0 0 )外 ,其余三个肽的抗血清滴度都在 1∶10 0 0 0以上。McAb中 ,N -I 15肽的反应比D -C 2 2肽要强 ,但两者的腹水滴度相同 ,均为 1∶10 0 0。单抗铺板检测病毒 p2 4抗原的非特异性反应比较强。用山羊抗血清铺板 ,1∶80 0 0的稀释度检测效果最好。用我们研制的抗体检测不出裂解HIV - 1ⅢB中 p2 4 ,却能够测出Abbott公司p2 4抗原诊断试剂盒的阳性对照 (HIVAG - 1)。用北海道大学免疫科学研究所研制的单抗和人阳性血清做的交叉对照实验表明 ,可能是由于合成肽免疫产生的抗体与裂解病毒p2 4的亲和力较差引...

HIV-1慢性感染Jurkat细胞系的建立及其特性研究

目的　建立艾滋病病毒Ⅰ型( HIV21) 慢性感染J urkat 细胞系,研究其生物学特性。方法　参照文献方法改良,建立HIV21 ⅢB慢性感染J urkat 细胞系。其细胞系特性采用以下方法检测:光学显微镜观察细胞形态;流式细胞仪检测HIV21 ⅢB感染细胞的阳性率;噻唑蓝(MTT) 法检测抗病毒药物对慢性感染细胞的毒性作用;酶联免疫吸附试验( EL ISA) 检测药物对慢性感染细胞中病毒复制的影响;合胞体形成方法检测药物对HIV21 ⅢB慢性感染细胞与正常细胞融合的阻断作用。结果　成功建立了HIV21 慢性感染J urkat 细胞系(J urkat/ HIV21 ⅢB ) ,感染细胞阳性率> 90 %。检测影响病毒复制各周期的抗病毒药物对J urkat/ HIV21 ⅢB细胞的作用,发现J urkat/ HIV21 ⅢB细胞具有 HIV21 慢性感染细胞的生物学特征。结论　成功建立J urkat/ HIV21 ⅢB 细胞系,为抗HIV21 药物的研发和病毒感染机制研究提供了新的工具。

贵州汉族、苗族、布依族和水族人群线粒体DNA多态性研究

用16种限制性内切酶对150个样本进行了mtDNA的限制性片段长度多态性(RFLP)分析。共检测到31种限制性格局, 其中Hae Ⅱ-13型、EcoRV-3型和PstⅠ-型3种限制性格局 为新报道。综合这些限制性格局, 共得出28种mtDNA类型。运用UPG法和简约法分析了各mtDNA类型之间、各人群之间的聚类关系。结果表明: 水族人群的mtDNA变异度较大; 汉族和苗族的亲缘关系最近, 布依族和水族有着较远的亲缘关系。图4表4参28

人和猴T淋巴细胞表面TRBC受体及其配体不同于E2分子和CD2的配体

T淋巴细胞表面的TRBC受体不同介导E花结形成的E受体(CO_(2))和E2分子 。CD_(2)的配体, 人红细胞表面的CD58(LFA-3)和绵羊红细胞表面的T11TS, S42, S14及S110-220, 与TRBC受体的配体无关,TRBC玫瑰花结的形成是通过不同E 花结和人自身玫瑰花结的受体—配体相互作用来实现的, 进一步表明, 人和猴T 淋巴细胞表面和TRBC表面,可能都有独特的蛋白质分子介导TRBC玫瑰花结的形成 。表4参16

抗人体艾滋病毒的核糖体失活蛋白

核糖体失活蛋白是一类作用于真核细胞核糖体, 抑制蛋白质合成的毒蛋白。近年来, 发现核糖体失活蛋白能抑制急性感染的T细胞和慢性感染的单核巨噬细胞中HIV的复制和增殖, 其作用方式独特, 不产生耐药性。至少已知8种核糖体失活蛋白有抗HIV的作用。这些核糖体失活蛋白的序列有一定的同源性。

麂属动物陈旧皮张标本的DNA提取及PCR扩增

用改进的方法从保存于本单位标本中提取DNA, 所得DNA片段的分子量从100bp到1kb以上。利用线粒体DNA细胞色素b通用引物和PCR技术。从小麂、印度麂、贡山麂、费氏麂、黑麂DNA中扩增出307bp的 细胞色素b特异片段(加上两端引物后长度为364bp)。用28种限制性内切酶对 新鲜血样和从陈旧皮张标本中所得扩增片段进行酶切分析, 发现只有4个酶(DraⅠ、xbaⅠ、HaeⅢ、HpaⅡ)在这个片段上有切点, 其中HaeⅢ和HapⅡ的识别位点在各种麂中有所不同。 图3参10

Phylogeny of fireflies (Coleoptera : Lampyridae) inferred from mitochondrial 16S ribosomal DNA, with references to morphological and ethological traits

We sequenced partial mitochondrial 16S ribosomal DNA (16S rDNA) of 18 firefly species from Southwest of China. Combined with homologous sequences previously reported, phylogenetic trees including Japanese, Korean and Chinese species were reconstructed by