Estrutura populacional e parâmetros genéticos de uma população de bovinos Guzerá

Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV

Vigilância de fatores de risco para doenças crônicas por inquérito telefônico nas capitais dos 26 estados brasileiros e no Distrito Federal (2006)

OBJETIVO: Descrever métodos e resultados iniciais do Sistema de Vigilância de Fatores de Risco e Proteção para Doenças Crônicas não Transmissíveis por Inquérito Telefônico – VIGITEL implantado no Brasil em 2006. MÉTODOS: O VIGITEL estudou amostras probabilísticas da população com 18 ou mais anos de idade residente em domicílios conectados à rede de telefonia fixa de cada uma das capitais dos 26 Estados brasileiros e do Distrito Federal (54.369 indivíduos no total, sendo pelo menos 2.000 por cidade). A amostragem foi realizada a partir de cadastros eletrônicos completos das linhas residenciais fixas de cada cidade, envolvendo sorteio de linhas (domicílios) e sorteio de um morador por linha para ser entrevistado. O questionário aplicado investigou características demográficas e socioeconômicas, padrão de alimentação e de atividade física, consumo de cigarros e de bebidas alcoólicas, e peso e altura recordados, entre outros quesitos. Estimativas sobre a freqüência de fatores de risco selecionados, estratificadas por sexo e acompanhadas de Intervalo de Confiança de 95%, foram calculadas para a população adulta de cada cidade empregando-se fatores de ponderação que igualam a composição sociodemográfica da amostra em cada cidade àquela observada no Censo Demográfico de 2000. Estimativas para o conjunto das cidades empregam fator de ponderação adicional que leva em conta a população de adultos de cada cidade. RESULTADOS: Os cinco fatores de risco selecionados (tabagismo, consumo abusivo de bebidas alcoólicas, excesso de peso, consumo de carnes com excesso de gordura e sedentarismo) tenderam a ser mais freqüentes em homens do que em mulheres. Dentre os fatores de proteção, o consumo regular de frutas e hortaliças foi mais freqüente em mulheres do que em homens, observando-se situação inversa no caso da atividade física de lazer. Diferenças substanciais na freqüência dos fatores de risco e proteção foram observadas entre as cidades, com padrões de distribuição regional diferenciados por fator. DISCUSSÃO: O desempenho do sistema, avaliado a partir da qualidade dos cadastros telefônicos e de taxas de resposta e de recusas, mostrou-se adequado e, de modo geral, superior ao encontrado em sistemas equivalentes existentes em países desenvolvidos. O custo do sistema de R$ 31,15 por entrevista realizada, foi a metade do custo observado no sistema americano de vigilância de fatores de risco para doenças crônicas por inquérito telefônico e um quinto do custo estimado em inquérito domiciliar tradicional realizado recentemente no Brasil.

Efeitos de fragmentação de hábitat sobre a prevalência de parasitoses intestinais em alouatta belzebul (Primates, Platyrrhini) na Amazônia Oriental

Estudos parasitológicos em populações naturais de primatas neotropicais são relativamente raros, existindo poucos dados disponíveis sobre o guariba-de-mão-ruiva, Alouatta belzebul. No presente estudo, populações de A. belzebul foram amostradas em cinco locais na área do reservatório da Usina Hidrelétrica de Tucuruí no sudeste da Amazônia Brasileira, correspondendo à margem direita do Rio Tocantins. As áreas de coleta incluíram a floresta contínua e fragmentos de hábitats em ilhas, com tamanhos que variaram de 180 a 484 hectares. O principal objetivo deste estudo foi a avaliação dos efeitos da perturbação do hábitat sobre os padrões de infestação por endoparasitas. A densidade populacional foi estimada para cada ponto de coleta usando o método de transecção linear, que variou de 100-108 km percorridos por ponto. Amostras fecais foram coletadas de seis a quatorze grupos em cada local, com um total de 40-46 amostras por ponto (n = 212). As amostras fecais foram fixadas em MIF e observadas através de microscópio óptico, com aumentos de até 400x. A densidade populacional variou entre 66,4 e 191,5 indivíduos por km2. No total, 76,4% das amostras foram positivas para pelo menos uma espécie de endoparasita. Foram identificadas doze táxons de endoparasitas, oito de helmintos e cinco de protozoários. Amostras individuais apresentaram até cinco diferentes espécies de endoparasitas. Em cada local de coleta, o número de espécies identificadas variou entre seis e doze e as taxas de infecção ficaram entre 67,5% e 86%. Não foram encontrados padrões sistemáticos na diversidade de parasitas ou nas taxas de infecção em relação a variáveis como, tamanho de população, densidade ou fragmentação de hábitat. A diversidade e as taxas de infecção variaram mais entre os dois pontos de floresta contínua que nos locais fragmentados e, no geral, foram menores nos locais com menor densidade populacional. A única exceção foi o Trypanoxyuris mirtutus, um oxiurídeo bastante comum transmitido através do contato direto, para o qual foi encontrada uma correlação forte entre as taxas de infecção e a densidade populacional. No geral, foram encontradas poucas evidências capazes de sustentar a hipótese de que a fragmentação do hábitat tem um efeito sistemático nos padrões de infestação em A. belzebul. Contudo, recomenda-se a realização de mais estudos detalhados antes de se estabelecer conclusões definitivas.

Estudo da comunidade de pequenos mamíferos não-voadores, sob efeito do fogo e da borda, em área de floresta de transição Amazônia-Cerrado, Querência, MT

O desmatamento da Amazônia, causado pelas atividades pecuárias e pela agroindústria no norte do Estado do Mato Grosso, tem comprometido as chamadas Florestas de Transição Amazônia-Cerrado, antes que a biodiversidade destas áreas seja conhecida pelos pesquisadores. A fauna de pequenos mamíferos não-voadores faz parte dos grupos pouco conhecidos na região, e podem estar sofrendo impactos das ações antrópicas, principalmente efeito do fogo, usado para limpeza dos pastos e desmatamento para plantios da soja. Este trabalho caracterizou a diversidade de pequenos mamíferos não voadores em uma área de floresta de transição Amazônia-Cerrado, no norte do Estado do Mato Grosso e investigou o efeito do fogo e o efeito de borda sobre este grupo da fauna. Duas áreas de 150 hectares foram amostradas, uma preservada e outra sob impacto do fogo, com 183 armadilhas do tipo live-trap durante três anos em duas estação (seca e chuvosa). O método utilizado foi de captura-marcação-recaptura. O esforço amostral foi 23.424 armadilhas-noite. Capturaram-se 390 indivíduos, portanto, com sucesso de captura de 1,66 %. No total foram capturados 11 espécies, sendo 6 roedores e 5 marsupiais. Hylaeamys megacephalus foi a espécie mais abundante. A diversidade de pequenos mamíferos da área estudada foi mais relacionada com o bioma Cerrado do que com a Amazônia. Em relação ao fogo, a riqueza de espécies não foi estatisticamente diferente, porém a abundância foi significativamente maior nas transecções localizadas em área sem fogo. Dois grupos distintos de transecções foram característicos em função da presença ou não do fogo basedo na composição de pequenos mamíferos. A abundância de Hylaeamys megacephalus foi significativamente maior nas transecções que não sofreram impacto do fogo. Em relação ao efeito de borda, na Área 2, apesar da riqueza de espécies não ter sido significativamente diferente, a abundância foi signicativamente maior em relação a distância da borda com maiores abundâncias no interior das florestas. Já na Área 1, nem riqueza nem abundância foi estatísticamente diferente em relação a distância da borda. Este fato pode estar sendo mascarado tanto pelo efeito direto quanto indireto (na vegetação) do fogo experimental sobre os pequenos mamíferos. Quando analisados em conjunto fogo e distância da borda, o relacionamento entre ambos ficou mais claro, visto que todas as transecções amostradas sob efeito do fogo tiveram menores abundâncias. O tamanho populacional de Hylaemys megacephalus foi calculado ao longo de cinco estações na área sem influencia do fogo experiental, sendo que a estação chuvosa de 2006 foi estatisticamente diferente as demais e o pico desse crescimento pode ser explicado pelo “Efeito de Alle”. Não houve diferenças estatísticas significativas na estrutura da comunidade de pequenos mamíferos não-voadores entre as estações secas e chuvosas. Este trabalho de pesquisa contribuiu para o conhecimento da mastofauna desta região bastante ameaçada por pressões antrópicas.

Genética de populações de pirarucus (Arapaima gigas) da Reserva Mamirauá e considerações sobre estrutura genética para a espécie

O pirarucu (Arapaima gigas) é um importante recurso pesqueiro da região amazônica, que vem sendo explorado desde o século XIX, havendo indícios de diminuição do tamanho populacional em algumas localidades ao longo da sua distribuição. O manejo da pesca vem sendo uma das estratégias adotadas para manter essa atividade pesqueira associada a conservação da espécie. Neste trabalho avaliamos aspectos populacionais de pirarucus de duas localidades da Reserva Mamirauá (Jarauá e Maraã), e comparamos estas com as populações já analisadas de Santarém e Tucuruí, verificando suas variabilidade e estrutura genética. Para isso foram utilizados sete locos microssatélites genotipados para 463 pirarucus da Reserva Mamirauá coletados ao longo de cinco anos. Nossos resultados encontraram uma maior diversidade genética para esta população em comparação as encontradas em Santarém e Tucuruí. As análises indicam que o manejo esta sendo ecologicamente eficiente, não tendo havido alterações significantes ao longo dos cinco anos de estudo. A migração lateral, associada a um possível padrão de retorno ao lago sem fidelidade espacial, parece ter grande importância na homogeneização genética local. Entretanto, este fator é espacialmente limitado, sendo observada uma pequena diferenciação entre os pirarucus do Jarauá e do Maraã. Entre localidades mais distantes, a diferenciação é maior, apesar de somente a distância não ser capaz de explicar esse fenômeno. Acreditamos que a diminuição populacional em localidades intermediárias, provavelmente causada por sobre-pesca, pode estar influenciando a conectividade ao longo dos pontos estudados.

Diversidade genética, sistema de reprodução e fluxo de pólen e sementes em uma população fragmentada de Myracrodruon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) para fins de conservação genética

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Metodologia para utilização de algoritmos genéticos em modelos de simulação computacional em ambientes de manufatura

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

History, structure, and genetic diversity of Brazilian Gir cattle

The Gir cattle breed (Bos indicus) is an important genetic resource for milk production throughout the tropics. The small number of Gir animals introduced in Brazil, rapid dissemination of this breed recently, and the intensification of selection practices could contribute to increase of inbreeding level and reduce genetic diversity in this population. The population was analyzed in terms of pedigree completeness level, inbreeding coefficient, coancestry, generation interval, effective population size, effective number of founders and ancestors, among others. Despite the low mean inbreeding (around 2%), minor problems were identified in the population structure of the Brazilian Gir cattle, e.g., trend of narrower bottlenecks in the pedigree in recent years. The effective population sizes based on inbreeding (94) or coancestry (165.9) as well as the effective number of ancestors (76) and founders (143) were relativity high. The major subdivision of the Gir breed was observed between 1993 and 2002 (dairy and dual-purpose herds, wide use of within-herd matings). In this period the level of inbreeding remained at a higher level, there was a small increase in coancestry and the number of equivalent subpopulations was approximately 6. After 2002, there was genetic exchange between subpopulations, reduction in the average inbreeding, pronounced increase in the average coancestry, and the number of equivalent subpopulations was about 2. Furthermore, it was found that the mean generation interval of the population tended to increase in recent years (around 9 years). About 23% of genetic diversity has been lost since the first generation of founders. Based on the effective population size, number of equivalent subpopulations, inbreeding, coancestry, and loss of genetic diversity, the Gir population is still highly structured, but there is ample room for artificial selection. The results regarding the effective number of founders and ancestors in the present population demonstrate the existence of bottlenecks in the pedigree and indicate the need for population structure monitoring. Nevertheless, the Brazilian Gir breed can perfectly face a breeding program with high selection intensity. (C) 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.

Influence of Apis mellifera L. (Hymenoptera: Apidae) on the Use of the Most Abundant and Attractive Floral Resources in a Plant Community

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Rarity as an indicator of endangerment in neotropical frogs

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

A new probabilistic canopy dynamics model (SLCD) that is suitable for evergreen and deciduous forest ecosystems

There are strong uncertainties regarding LAI dynamics in forest ecosystems in response to climate change. While empirical growth & yield models (G&YMs) provide good estimations of tree growth at the stand level on a yearly to decennial scale, process-based models (PBMs) use LAI dynamics as a key variable for enabling the accurate prediction of tree growth over short time scales. Bridging the gap between PBMs and G&YMs could improve the prediction of forest growth and, therefore, carbon, water and nutrient fluxes by combining modeling approaches at the stand level.Our study aimed to estimate monthly changes of leaf area in response to climate variations from sparse measurements of foliage area and biomass. A leaf population probabilistic model (SLCD) was designed to simulate foliage renewal. The leaf population was distributed in monthly cohorts, and the total population size was limited depending on forest age and productivity. Foliage dynamics were driven by a foliation function and the probabilities ruling leaf aging or fall. Their formulation depends on the forest environment.The model was applied to three tree species growing under contrasting climates and soil types. In tropical Brazilian evergreen broadleaf eucalypt plantations, the phenology was described using 8 parameters. A multi-objective evolutionary algorithm method (MOEA) was used to fit the model parameters on litterfall and LAI data over an entire stand rotation. Field measurements from a second eucalypt stand were used to validate the model. Seasonal LAI changes were accurately rendered for both sites (R-2 = 0.898 adjustment, R-2 = 0.698 validation). Litterfall production was correctly simulated (R-2 = 0.562, R-2 = 0.4018 validation) and may be improved by using additional validation data in future work. In two French temperate deciduous forests (beech and oak), we adapted phenological sub-modules of the CASTANEA model to simulate canopy dynamics, and SLCD was validated using LAI measurements. The phenological patterns were simulated with good accuracy in the two cases studied. However, IA/max was not accurately simulated in the beech forest, and further improvement is required.Our probabilistic approach is expected to contribute to improving predictions of LAI dynamics. The model formalism is general and suitable to broadleaf forests for a large range of ecological conditions. (C) 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.

Análise temporal da dinâmica populacional de Aedes aegypti

Dengue virus is a major public health problem worldwide. Aedes (Stegomyia) aegypti is the main dengue vector. Since there is no specific treatment or effective vaccine, control measure is focused on vector control. It is believed that population density is higher in the warmer/rainy season than in cold/dry. The study aimed to genetically characterize population dynamics of Ae. aegypti during climatic variations. Collections were performed at least once in both periods over five years by oviposition traps at Botucatu city. The technique of TaqMan allelic discrimination was used for genetic analysis, in which SNPs from nine genes distributed on three chromosomes of the mosquito were genotyped. Bayesian analysis did not show variance on population structure over the five year period. The percentage of variation among samples in statistical analysis was low (Fst = 0.0028, p = 0.7634), furthermore the allele frequencies were constant. The results show that despite wide variation in the density of adults, population size does not vary. Therefore, there is variation in the prevalence of the species life stages: adults in warmer/rainy, and possibly eggs in cold/dry, resulting in different control strategies for each period. Moreover, estimation of population size should not consider only winged adults, but all other found life stages forms

Genetic variation in Aechmea winkleri, a bromeliad from an inland Atlantic rainforest fragment in Southern Brazil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Low levels of taurine introgression in the current Brazilian Nelore and Gir indicine cattle populations

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Contemporary and historic factors influence differently genetic differentiation and diversity in a tropical palm

Population genetics theory predicts loss in genetic variability because of drift and inbreeding in isolated plant populations; however, it has been argued that long-distance pollination and seed dispersal may be able to maintain gene flow, even in highly fragmented landscapes. We tested how historical effective population size, historical migration and contemporary landscape structure, such as forest cover, patch isolation and matrix resistance, affect genetic variability and differentiation of seedlings in a tropical palm (Euterpe edulis) in a human-modified rainforest. We sampled 16 sites within five landscapes in the Brazilian Atlantic forest and assessed genetic variability and differentiation using eight microsatellite loci. Using a model selection approach, none of the covariates explained the variation observed in inbreeding coefficients among populations. The variation in genetic diversity among sites was best explained by historical effective population size. Allelic richness was best explained by historical effective population size and matrix resistance, whereas genetic differentiation was explained by matrix resistance. Coalescence analysis revealed high historical migration between sites within landscapes and constant historical population sizes, showing that the genetic differentiation is most likely due to recent changes caused by habitat loss and fragmentation. Overall, recent landscape changes have a greater influence on among-population genetic variation than historical gene flow process. As immediate restoration actions in landscapes with low forest amount, the development of more permeable matrices to allow the movement of pollinators and seed dispersers may be an effective strategy to maintain microevolutionary processes.