995 resultados para Novo Progresso - PA
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Contient : IYuan lin wu meng.Songe de midi dans le bosquet ; IIWei qi ma ju.L'chiquier ; IIIXi xiang zhe ju tou pu.Tableaux explicatifs des parties de ds du Xi xiang ji ; IVQian tang meng.Songe de Qian tang ; VHui zhen ji.Histoire du portrait ; VIalias Li zhuo wu xian sheng (alias tcho lao) pi dian xi xiang ji zhen ben.Le Xi xiang ji (Histoire du pavillon occidental), ponctu par Li Zhuo wu ; VIIXin jiao pi pa ji shi mo.Le Pi pa ji (Histoire du luth), dition revue
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A cabinet card believed to be of Mary Bell, photographed by F. Pfaff, Artistic Photographer, of Erie, Pennsylvania. A handwritten entry on the reverse of the photo lists the address "231 Duke St.", however, the company's logo identifies its address as 1011 State St., Ground Floor Gallery. This photograph was in the possession of Iris Sloman Bell, of St. Catharines, Ontario. The Sloman - Bell family includes relatives who are former Black slaves from the United States."Cabinet card photographs were first introduced in 1866. They were initially employed for landscapes rather than portraitures. Cabinet cards replaced Carte de visite photographs as the popular mode of photography. Cabinet cards became the standard for photographic portraits in 1870. Cabinet cards experienced their peak in popularity in the 1880's. Cabinet cards were still being produced in the United States until the early 1900's and continued to be produced in Europe even longer. The best way to describe a cabinet card is that it is a thin photograph that is mounted on a card that measures 4 1/4 by 6 1/2. Cabinet cards frequently have artistic logos and information on the bottom or the reverse of the card which advertised the photographer or the photography studio's services. " Source: http://cabinetcardgallery.wordpress.com/category/cabinet-card-history/
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DNA assembly is among the most fundamental and difficult problems in bioinformatics. Near optimal assembly solutions are available for bacterial and small genomes, however assembling large and complex genomes especially the human genome using Next-Generation-Sequencing (NGS) technologies is shown to be very difficult because of the highly repetitive and complex nature of the human genome, short read lengths, uneven data coverage and tools that are not specifically built for human genomes. Moreover, many algorithms are not even scalable to human genome datasets containing hundreds of millions of short reads. The DNA assembly problem is usually divided into several subproblems including DNA data error detection and correction, contig creation, scaffolding and contigs orientation; each can be seen as a distinct research area. This thesis specifically focuses on creating contigs from the short reads and combining them with outputs from other tools in order to obtain better results. Three different assemblers including SOAPdenovo [Li09], Velvet [ZB08] and Meraculous [CHS+11] are selected for comparative purposes in this thesis. Obtained results show that this thesis work produces comparable results to other assemblers and combining our contigs to outputs from other tools, produces the best results outperforming all other investigated assemblers.
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Tesis (Maestra en Ciencias , con especialidad en Botnica).U.A.N.L.
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La schizophrnie est une maladie psychiatrique grave qui affecte approximativement 1 % de la population. Il est clairement tabli que la maladie possde une composante gntique trs importante, mais jusqu prsent, les tudes ont t limites au niveau de lidentification de facteurs gntiques spcifiquement lis la maladie. Avec lavnement des nouvelles avances technologiques dans le domaine du squenage de lADN, il est maintenant possible deffectuer des tudes sur un type de variation gntique jusqu prsent laiss pour compte : les mutations de novo, c.--d. les nouvelles mutations non transmises de manire mendlienne par les parents. Ces mutations peuvent avoir deux origines distinctes : une origine germinale au niveau des gamtes chez les parents ou une origine somatique, donc au niveau embryonnaire directement chez lindividu. Lobjectif gnral de la prsente recherche est de mieux caractriser les mutations de novo dans la schizophrnie. Comme le rle de ces variations est peu connu, il sera galement ncessaire de les tudier dans un contexte global au niveau de la population humaine. La premire partie du projet consiste en une analyse exhaustive des mutations de novo dans la partie codante (exome) de patients atteints de schizophrnie. Nous avons pu constater que non seulement le taux de mutations tait plus lev quattendu, mais nous avons galement t en mesure de relever un nombre anormalement lev de mutations non-sens, ce qui suggre un profil pathognique. Ainsi, nous avons pu fortement suggrer que les mutations de novo sont des actrices importantes dans le mcanisme gntique de la schizophrnie. La deuxime partie du projet porte directement sur les gnes identifis lors de la premire partie. Nous avons squenc ces gnes dans une plus grande cohorte de cas et de contrles afin dtablir le profil des variations rares pour ces gnes. Nous avons ainsi conclu que lensemble des gnes identifis par les tudes de mutations de novo possde un profil pathognique, ce qui permet dtablir que la plupart de ces gnes ont un rle rel dans la maladie et ne sont pas des artfacts exprimentaux. De plus, nous avons pu tablir une association directe avec quelques gnes qui montrent un profil aberrant de variations rares. La troisime partie du projet se concentre sur leffet de lge paternel sur le taux de mutations de novo. En effet, pour la schizophrnie, il est dmontr que lge du pre est un facteur de risque important. Ainsi, nous avons tent de caractriser leffet de lge du pre chez des patients en sant. Nous avons observ une grande corrlation entre lge du pre et le taux de mutations germinales et nous avons ainsi pu rpertorier certaines zones avec un grand nombre de mutations de novo, ce qui suggre lexistence de zone chaude pour les mutations. Nos rsultats ont t parmi les premiers impliquant directement les mutations de novo dans le mcanisme gntique de la schizophrnie. Ils permettent de jeter un nouveau regard sur les rseaux biologiques lorigine de la schizophrnie en mettant sous les projecteurs un type de variations gntiques longtemps laiss pour compte.
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Les glucides constituent la classe de molcules organiques la plus abondante et ceux-ci jouent des rles cruciaux dans divers processus biologiques. De part leur importance mdicinale, la prparation des dsoxy-sucres, des C-glycosides et des C-disaccharides est devenue un sujet de pointe en synthse organique. De faon gnrale, cette thse dcrit une nouvelle synthse de novo des 4-dsoxy hexopyrannoses en plus de la prparation de C-glycosides biologiquement actifs. De plus, une attention particulire a t porte la prparation de novo de 4-dsoxy-C-disaccharides. Dans un premier temps, le catalyseur de Cr(III) de Jacobsen et un complexe binaphtol/titane ont t utiliss pour raliser des htro-Diels-Alder nantioslectives. Les dihydropyrannes ainsi gnrs ont t transforms en 4-dsoxy hexopyrannoses prsents dans la nature. De cette faon, un driv de lacide zoaminuroque, un prcurseur de la dsosamine et de la nosidomycine, a t prpar suivant cette approche de novo. De plus, titre comparatif, la nosidomycine a galement t fabrique selon une approche chiron, partir du mthyl alpha-D-mannopyrannoside. Finalement, une valuation biologique prliminaire de la nosidomycine a t effectue sur une la concanavaline-A (Chapitre 2). Dans un deuxime temps, une allylation stroslective sur un aldhyde li via des liens C-C une unit mannoside a permis de gnrer un alcool homoallylique. Cette dernire fonctionnalit a t transforme en 4-dsoxy hexopyrannose de configuration D ou L. De cette faon, la prparation de pseudo 4-dsoxy-C-disaccharides, de 4-dsoxy-C-disaccharides et de pseudo 4-dsoxy aza-C-disaccharides a facilement t ralise. Les rapports diastroisomriques de la raction dallylation ont t dtermins en plus de la configuration absolue des nouveaux centres strogniques forms. La transformation des alcools homoallyliques en pyrannes poly hydroxyls ou en lactames poly hydroxyls a t ralise, en plus de la dprotection de certains membres de cette famille pour une valuation biologique prliminaire sur la concanavaline-A (Chapitre 3). Finalement, la synthse de C-glycosides biologiquement actifs a t ralise selon deux volets: i) prparation de 3-C-mannopyrannosyl coumarines et ii) synthse de C-galactosides, inhibiteurs de la lectine PA-IL. Pour ce faire, le couplage de Heck a t utilis partir dun ester alpha,bta-insatur, attach une unit glycosidique via des liens C-C, pour gnrer un driv glycosyl cinnamate de mthyle. Cependant, lorsque le 2-iodophnol est utilis comme partenaire de Heck, la coumarine correspondante a t isole. Les drivs C-galactopyrannosyl cinnamates de mthyle reprsentent de bons inhibiteurs monovalents de la PA-IL avec un Kd aussi bas que 37 micro M (Chapitre 4).
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Le diabte est une maladie chronique de lhomostasie du glucose caractrise par une hyperglycmie non contrle qui est le rsultat dune dfaillance de la scrtion dinsuline en combinaison ou non avec une altration de laction de linsuline. La surnutrition et le manque dactivit physique chez des individus qui ont des prdispositions gntiques donnent lieu la rsistance linsuline. Pendant cette priode dite de compensation o la concentration dacides gras plasmatiques est leve, lhyperinsulinmie compense pleinement pour la rsistance linsuline des tissus cibles et la glycmie est normale. Le mtabolisme du glucose par la cellule pancratique bta entrane la scrtion dinsuline. Selon le modle classique de la scrtion dinsuline induite par le glucose, laugmentation du ratio ATP/ADP rsultant de la glycolyse et de loxydation du glucose, induit la fermeture des canaux KATP-dpendant modifiant ainsi le potentiel membranaire suivi dun influx de Ca2+. Cet influx de Ca2+ permet lexocytose des granules de scrtion contenant linsuline. Plusieurs nutriments comme les acides gras sont capables de potentialiser la scrtion dinsuline. Cependant, le modle classique ne permet pas dexpliquer cette potentialisation de la scrtion dinsuline par les acides gras. Pour expliquer leffet potentialisateur des acides gras, notre laboratoire a propos un modle complmentaire o le malonyl-CoA driv du mtabolisme anaplrotique du glucose inhibe la carnitine palmitoyltransfrase-1, lenzyme qui constitue ltape limitante de loxydation des acides gras favorisant ainsi leur estrification et donc la formation de drivs lipidiques signaltiques. Le modle anaplrotique/lipidique de la scrtion d'insuline induite par le glucose prdit que le malonyl-CoA driv du mtabolisme du glucose inhibe la bta-oxydation des acides gras et augmente la disponibilit des acyl-CoA ou des acides gras non-estrifis. Les molcules lipidiques agissant comme facteurs de couplage du mtabolisme des acides gras l'exocytose d'insuline sont encore inconnus. Des travaux raliss par notre laboratoire ont dmontr quen augmentant la rpartition des acides gras vers la bta-oxydation, la scrtion dinsuline induite par le glucose tait rduite suggrant quun des drivs de lestrification des acides gras est important pour la potentialisation sur la scrtion dinsuline. En effet, des concentrations leves de glucose, les acides gras peuvent tre estrifis dabord en acide lysophosphatidique (LPA), en acide phosphatidique (PA) et en diacylglycrol (DAG) et subsquemment en triglycrides (TG). La prsente tude a tabli limportance relative du processus destrification des acides gras dans la production de facteurs potentialisant la scrtion dinsuline. Nous avions mis lhypothse que des molcules drives des processus destrification des acides gras (ex : lacide lysophosphatidique (LPA) et le diacylglycerol (DAG)) agissent comme signaux mtaboliques et sont responsables de la modulation de la scrtion dinsuline en prsence dacides gras. Afin de vrifier celle-ci, nous avons modifi le niveau dexpression des enzymes cls contrlant le processus destrification par des approches de biologie molculaire afin de changer la rpartition des acides gras dans la cellule bta. Lexpression des diffrents isoformes de la glycrol-3-phosphate acyltransfrase (GPAT), qui catalyse la premire tape destrification des acides gras a t augment et inhib. Les effets de la modulation de lexpression des isoenzymes de GPAT sur les processus destrifications, sur la bta-oxydation et sur la scrtion dinsuline induite par le glucose ont t tudis. Les diffrentes approches que nous avons utilises ont chang les niveaux de DAG et de TG sans toutefois altrer la scrtion dinsuline induite par le glucose. Ainsi, les rsultats de cette tude nont pas associ de rle pour lestrification de novo des acides gras dans leur potentialisation de la scrtion dinsuline. Cependant, lestrification des acides gras fait partie intgrante dun cycle de TG/acides gras avec sa contrepartie lipolytique. Dailleurs, des tudes parallles la mienne menes par des collgues du laboratoire ont dmontr un rle pour la lipolyse et un cycle TG/acides gras dans la potentialisation de la scrtion dinsuline par les acides gras. Paralllement nos tudes des mcanismes de la scrtion dinsuline impliquant les acides gras, notre laboratoire sintresse aussi aux effets ngatifs des acides gras sur la cellule bta. La glucolipotoxicit, rsultant dune exposition chronique aux acides gras saturs en prsence dune concentration leve de glucose, est dun intrt particulier vu la prpondrance de lobsit. Lisoforme microsomal de GPAT a aussi utilis comme outil molculaire dans le contexte de la glucolipotoxicit afin dtudier le rle de la synthse de novo de lipides complexes dans le contexte de dcompensation o la fonction des cellules bta diminue. La surexpression de lisoforme microsomal de la GPAT, menant laugmentation de lestrification des acides gras et une diminution de la bta-oxydation, nous permet de conclure que cette modification mtabolique est instrumentale dans la glucolipotoxicit.
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Le but de ce projet tait de dvelopper des mthodes d'assemblage de novo dans le but d'assembler de petits gnomes, principalement bactriens, partir de donnes de squenage de nouvelle-gnration. ventuellement, ces mthodes pourraient tre appliques l'assemblage du gnome de StachEndo, une Alpha-Protobactrie inconnue endosymbiote de l'amibe Stachyamoeba lipophora. Suite plusieurs analyses prliminaires, il fut observ que lutilisation de lectures Illumina avec des assembleurs par graphe DeBruijn produisait les meilleurs rsultats. Ces expriences ont galement montr que les contigs produits partir de diffrentes tailles de k-mres taient complmentaires pour la finition des gnomes. Lajout de longues paires de lectures chevauchantes se montra essentiel pour la finition complte des grandes rptitions gnomiques. Ces mthodes permirent d'assembler le gnome de StachEndo (1,7 Mb). L'annotation de ce gnome permis de montrer que StachEndo possde plusieurs caractristiques inhabituelles chez les endosymbiotes. StachEndo constitue une espce d'intrt pour l'tude du dveloppement endosymbiotique.
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La gestion des villes dAfrique de lOuest pose problme la priode contemporaine : extension urbaine non maitrise, services de base insuffisants, inscurit foncire. travers laide internationale, dimportantes rformes visant amliorer son efficacit ont pourtant t mises en place, mais elles semblent avoir t inefficaces. Dpassant ce constat dchec, la thse vise comprendre comment se droule lacte de grer la ville dans les circonstances particulires des villes dAfrique de lOuest. La mise en uvre du Registre foncier urbain (RFU), systme dinformation foncire municipal multi-fonctions introduit au Bnin travers des programmes de dveloppement au dbut des annes 1990, constitue le prisme travers lequel la gestion urbaine est analyse. Celle-ci est ainsi approche par les actes plutt que par les discours. Sappuyant sur une dmarche socio-anthropologique, la mise en uvre de linstrument est analyse depuis le point de vue des acteurs locaux et selon une double grille de lecture : dune part, il sagit de saisir les logiques de lappropriation locale dont le RFU a fait lobjet au sein des administrations; dautre part, il sagit de comprendre son interaction avec le territoire, notamment avec les dynamiques complexes daccs au sol et de scurisation foncire. Une tude de cas multiple a t mene dans trois communes : Cotonou, Porto-Novo et Bohicon. Deux ensembles de conclusions en dcoulent. Tout dabord, le RFU sest impos comme linstrument pivot de la fiscalit locale, mais est mis en uvre de manire minimale. Ce fonctionnement particulier est une adaptation optimale un contexte fait de rivalits professionnelles au sein dadministrations cloisonnes, denjeux politico-financiers lis aux diffrentes sources de revenus communaux et de tensions politico-institutionnelles lies une dcentralisation tardive. Les impacts du RFU en termes de dveloppement des comptences professionnelles nationales sont insuffisants pour rformer la gestion urbaine depuis lintrieur de ladministration municipale. Ensuite, alors quil vise centraliser linformation sur les propritaires prsums de la terre, le RFU se heurte la marchandisation de cette information et la territorialisation de la rgulation foncire. La mise en uvre du RFU sen trouve affecte de deux manires : dune part, elle sinsre dans ces circuits marchands de linformation foncire, avec cependant peu de succs ; dautre part, elle a un impact diffrenci selon les territoires de la rgulation foncire. En dfinitive, lacte de grer la ville au Bnin nest pas devenu automatique avec lintroduction dinstruments comme le RFU. La municipalit se repose plutt sur les piliers classiques de laction publique, ladministration et le politique, pour grer la ville plurielle de manire diffrencie. lendroit des concepteurs daction publique, cette thse plaide pour une prise en compte des modes de rgulation existant dans les socits africaines, fussent-ils pluriels, reconnaissant les voies originales que prend la construction des institutions en Afrique.
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Lipid droplets (LDs) are the universal storage form of fat as a reservoir of metabolic energy in animals, plants, bacteria and single celled eukaryotes. Dictyostelium LD formation was investigated in response to the addition of different nutrients to the growth medium. LDs were induced by adding exogenous cholesterol, palmitic acid (PA) as well as growth in bacterial suspension, while glucose addition fails to form LDs. Among these nutrients, PA addition is most effective to stimulate LD formation, and depletion of PA from the medium caused LD degradation. The neutral lipids incorporated into the LD-core are composed of triacylglycerol (TAG), steryl esters, and an unknown neutral lipid (UKL) species when the cells were loaded simultaneously with cholesterol and PA. In order to avoid the contamination with other cellular organelles, the LD-purification method was modified. The isolated LD fraction was analysed by mass spectrometry and 100 proteins were identified. Nineteen of these appear to be directly involved in lipid metabolism or function in regulating LD morphology. Together with a previous study, a total of 13 proteins from the LD-proteome were confirmed to localize to LDs after the induction with PA. Among the identified LD-proteins, the localization of Ldp (lipid droplet membrane protein), GPAT3 (glycerol-3-phosphate acyltransferase 3) and AGPAT3 (1-acylglycerol-3-phosphate-acyltransferase 3) were further verified by GFP-tagging at the N-termini or C-termini of the respective proteins. Fluorescence microscopy demonstrated that PA-treatment stimulated the translocation of the three proteins from the ER to LDs. In order to clarify DGAT (diacylglycerol acyltransferase) function in Dictyostelium, the localization of DGAT1, that is not present in LD-proteome, was also investigated. GFP-tagged DGAT1 localized to the ER both, in the presence and absence of PA, which is different from the previously observed localization of GFP-tagged DGAT2, which almost exclusively binds to LDs. The investigation of the cellular neutral lipid level helps to elucidate the mechanism responsible for LD-formation in Dictyostelium cells. Ldp and two short-chain dehydrogenases, ADH (alcohol dehydrogenase) and Ali (ADH-like protein), are not involved in neutral lipid biosynthesis. GPAT, AGPAT and DGAT are three transferases responsible for the three acylation steps of de novo TAG synthesis. Knock-out (KO) of AGPAT3 and DGAT2 did not affect storage-fat formation significantly, whereas cells lacking GPAT3 or DGAT1 decreased TAG and LD accumulation dramatically. Furthermore, DGAT1 is responsible for the accumulation of the unknown lipid UKL. Overexpression of DGAT2 can rescue the reduced TAG content of the DGAT1-KO mutant, but fails to restore UKL content in these cells, indicating that of DGAT1 and DGAT2 have overlapping functions in TAG synthesis, but the role in UKL formation is unique to DGAT1. Both GPAT3 and DGAT1 affect phagocytic activity. Mutation of GPAT3 increases it but a DGAT1-KO decreases phagocytosis. The double knockout of DGAT1 and 2 also impairs the ability to grow on a bacterial lawn, which again can be rescued by overexpression of DGAT2. These and other results are incorporated into a new model, which proposes that up-regulation of phagocytosis serves to replenish precursor molecules of membrane lipid synthesis, whereas phagocytosis is down-regulated when excess fatty acids are used for storage-fat formation.
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Premise of the study: Microsatellite markers were developed in Fosterella christophii (Bromeliaceae) to investigate the genetic diversity and population structure within the F. micrantha group, comprising F. christophii, F. micrantha, and F. villosula. Methods and Results: Full-length cDNAs were isolated from F. christophii and sequenced on a Pacific Biosciences RS platform. A total of 1590 high-quality consensus isoforms were assembled into 971 unigenes containing 421 perfect microsatellites. Thirty primer sets were designed, of which 13 revealed a high level of polymorphism in three populations of F. christophii, with four to nine alleles per locus. Each of these 13 loci cross-amplified in the closely related species F. micrantha and F. villosula, with one to six and one to 11 alleles per locus, respectively. Conclusions: The new markers are promising tools to study the population genetics of F. christophii and to discover species boundaries within the F. micrantha group.