941 resultados para Molecular mechanics simulations
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Few studies have focused on experimental testosterone deprivation in immature animals. Therefore, this study used sexually immature rats aiming to evaluate the testes and epididymis histology and proteins expression in these organs on PND50 and 75, after premature antiandrogen exposure, from PND21 to 44. Although the androgen deprivation from pre-puberty up to peripuberty did not alter the histological organization of the testes and epididymis either at puberty or at adulthood, the treatment impaired the expression of specific proteins in epididymal tissue at puberty and adulthood (androgen receptor, calmodulin, Rab11A). These changes may be related to impaired epididymal function, sperm quality and fertility capacity as observed in a previous study. Further studies are necessary to better investigate the molecular mechanisms involved in the impairment on reproductive competence of male rats after precocious hormonal injury. © 2013 Elsevier Inc.
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The cysteine proteinase inhibitor cystatin C inhibited RANKL-stimulated osteoclast formation in mouse bone marrow macrophage cultures, an effect associated with decreased mRNA expression of Acp5, Calcr, Ctsk, Mmp9, Itgb3, and Atp6i, without effect on proliferation or apoptosis. The effects were concentration dependent with half-maximal inhibition at 0.3 μM. Cystatin C also inhibited osteoclast formation when RANKL-stimulated osteoclasts were cultured on bone, leading to decreased formation of resorption pits. RANKL-stimulated cells retained characteristics of phagocytotic macrophages when cotreated with cystatin C. Three other cysteine proteinase inhibitors, cystatin D, Z-RLVG-CHN2 (IC50 0.1 μM), and E-64 (IC 50 3 μM), also inhibited osteoclast formation in RANKL-stimulated macrophages. In addition, cystatin C, Z-RLVG-CHN2, and E-64 inhibited osteoclastic differentiation of RANKL-stimulated CD14+ human monocytes. The effect by cystatin C on differentiation of bone marrow macrophages was exerted at an early stage after RANKL stimulation and was associated with early (4 h) inhibition of c-Fos expression and decreased protein and nuclear translocation of c-Fos. Subsequently, p52, p65, IκBα, and Nfatc1 mRNA were decreased. Cystatin C was internalized in osteoclast progenitors, a process requiring RANKL stimulation. These data show that cystatin C inhibits osteoclast differentiation and formation by interfering intracellularly with signaling pathways downstream RANK. © FASEB.
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
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Nas últimas décadas, diversos pesquisadores têm tentado empregar moléculas em dispositivos eletrônicos de nanoescala. Por este motivo, diferentes parâmetros eletro/ópticos, que regem o transporte eletrônico em moléculas orgânicas, precisam ser analisados. Neste trabalho foi desenvolvido um estudo de transporte de carga para o composto Vermelho de Propila, popularmente utilizado como indicador de pH. A motivação para estudá-lo resulta de sua estrutura constituída por subunidades doadora-aceitadora, acopladas via grupo azo (N=N), uma característica bem conhecida em retificadores moleculares. A metodologia utilizada para tratar o sistema em equilíbrio é baseada em métodos de Mecânica Molecular e Hartree-Fock. Sendo que, para simular o sistema em não-equilíbrio, foi empregado o formalismo de Landauer-Büttiker. Através desses métodos, as curvas características do sistema molecular foram traçadas e comparadas. O resultado da comparação permitiu explicar os fenômenos que regem o transporte eletrônico na nanoestrutura. Além disso, foram analisados os efeitos de contatos metálicos, ligados a molécula na presença de campo elétrico externo.
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Esta dissertação aborda a análise espectroscópica de algumas estruturas moleculares presentes no tabaco (Nicotiana glauca), matéria-prima do cigarro, e suas interações com a molécula de DNA. De acordo com sua importância, dentre a grande variedade presentes no cigarro, às moléculas estudadas foram as derivadas do ácido nicotínico: ácido nicotínico (niacina/vitamina B3), nicotinamida, trigonelina, nicotina, nornicotina e anabasina. As otimizações dessas estruturas foram inicialmente obtidas no software computacional Hyperchem 8.0, baseadas na teoria da mecânica molecular. Em seguida, elas foram otimizadas, utilizando-se o método de Teoria do Funcional da Densidade, na base B3LYP/ 6-311++G(d,p), simulado no software Gaussian 03. Uma vez as estruturas otimizadas, obtivemos os espectros de absorção UV, Raman, Infravermelho, Dicroísmo Circular e Densidade de Estados para caracterizar as mesmas utilizando método de Teoria do Funcional da Densidade Dependente do Tempo, também simulados no mesmo software. Ao final desse processo, foi também simulado via mecânica molecular, as interações dessas estruturas com a molécula de DNA com o intuito de verificar a potencialidade cancerígena, ou não, dessas substâncias.
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Pós-graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais - FC
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
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Graphene, in single layer or multi-layer forms, holds great promise for future electronics and high-temperature applications. Resistance to oxidation, an important property for high-temperature applications, has not yet been extensively investigated. Controlled thinning of multi-layer graphene (MLG), e.g., by plasma or laser processing is another challenge, since the existing methods produce non-uniform thinning or introduce undesirable defects in the basal plane. We report here that heating to extremely high temperatures (exceeding 2000 K) and controllable layer-by-layer burning (thinning) can be achieved by low-power laser processing of suspended high-quality MLG in air in "cold-wall" reactor configuration. In contrast, localized laser heating of supported samples results in non-uniform graphene burning at much higher rates. Fully atomistic molecular dynamics simulations were also performed to reveal details of oxidation mechanisms leading to uniform layer-by-layer graphene gasification. The extraordinary resistance of MLG to oxidation paves the way to novel high-temperature applications as continuum light source or scaffolding material.