Reciprocal N ((NH4+)-N-15 or (NO3-)-N-15) transfer between nonN(2)-fixing Eucalyptus maculata and N-2-fixing Casuarina cunninghamiana linked by the ectomycorrhizal fungus Pisolithus sp.

Two-way N transfers mediated by Pisolithus sp. were examined by excluding root contact and supplying (NH4+)-N-15 or (NO3-)-N-15 to 6-month-old Eucalyptus maculata or Casuarina cunninghamiana grown in two-chambered-pots separated by 37 m screens. Mycorrhizal colonization was 35% in Eucalyptus and 66% in Casuarina (c. 29% N-2-fixation). Using an environmental scanning electron microscope, living hyphae were observed to interconnect Eucalyptus and Casuarina. Biomass and N accumulation was greatest in nodulated mycorrhizal Casuarina/mycorrhizal Eucalyptus pairs, less in nonnodulated mycorrhizal Casuarina/mycorrhizal Eucalyptus pairs, and least in nonnodulated nonmycorrhizal Casuarina/nonmycorrhizal Eucalyptus pairs. In nonnodulated mycorrhizal pairs, N transfers to Eucalyptus or to Casuarina were similar (2.4-4.1 mg per plant in either direction) and were 2.6-4.0 times greater than in nonnodulated nonmycorrhizal pairs. In nodulated mycorrhizal pairs, N transfers were greater to Eucalyptus (5-7 times) and to Casuarina (12-18 times) than in nonnodulated mycorrhizal pairs. Net transfer to Eucalyptus or to Casuarina was low in both nonnodulated nonmycorrhizal (< 0.7 mg per plant) and nonnodulated mycorrhizal pairs (< 1.1 mg per plant). In nodulated mycorrhizal pairs, net transfer to Casuarina was 26.0 mg per plant. The amount and direction of two-way mycorrhiza-mediated N transfer was increased by the presence of Pisolithus sp. and Frankia, resulting in a net N transfer from low-N-demanding Eucalyptus to high-N-demanding Casuarina.

Molecular characterisation, pathogenesis and fungicide sensitivity of Pythium spp. from table beet (Beta vulgaris var. vulgaris) grown in the Lockyer Valley, Queensland

Table beet production in the Lockyer Valley of south-eastern Queensland is known to be adversely affected by soilborne root disease from infection by Pythium spp. However, little is known regarding the species or genotypes that are the causal agents of both pre- and post-emergence damping off. Based on RFLP analysis with HhaI, HinfI and MboI of the PCR amplified ITS region DNA from soil and diseased plant samples, the majority of 130 Pythium isolates could be grouped into three genotypes, designated LVP A, LVP B and LVP C. These groups comprised 43, 41 and 7% of all isolates, respectively. Deoxyribonucleic acid sequence analysis of the ITS region indicated that LVP A was a strain of Pythium aphanidermatum, with greater than 99% similarity to the corresponding P. aphanidermatum sequences from the publicly accessible databases. The DNA sequences from LVP B and LVP C were most closely related to P. ultimum and P. dissotocum, respectively. Lower frequencies of other distinct isolates with unique RFLP patterns were also obtained with high levels of similarity (> 97%) to P. heterothallicum, P. periplocum and genotypes of P. ultimum other than LVP B. Inoculation trials of 1- and 4-week-old beet seedlings indicated that compared with isolates of the LVP B genotype, a higher frequency of LVP A isolates caused disease. Isolates with the LVP A, LVP B and LVP C genotypes were highly sensitive to the fungicide Ridomil MZ, which suppressed radial growth on V8 agar between approximately four and thirty fold at 5 mu g/mL metalaxyl and 40 mu g/mL mancozeb, a concentration far lower than the recommended field application rate.

Methyl jasmonate vapour treatment suppresses specking caused by Botrytis cinerea on cut Freesia hybrida L. flowers

Treatment of cut freesia var. Cote d'Azur flowers with methyl jasmonate (MeJA, 0.1 mu l MeJA l(-1)) vapour suppressed petal specking caused by Botrytis cinerea infection. MeJA efficacy was concentration and incubation temperature dependent. Disease severity, lesion numbers and lesion diameters decreased with increasing MeJA concentration from 0.025 to 0.1 mu l MeJA l(-1). However, there were no significant (P > 0.05) differences among MeJA concentrations examined. MeJA was more effective in reducing B. cinerea flower specking at 20 degrees C than at 12 degrees C. MeJA treatment was ineffective at 5 degrees C. At 20 degrees C, MeJA treatment at 0.1 mu l MeJA l(-1) reduced disease severity, lesion numbers and lesion diameters by 58, 50 and 48%, respectively, as compared to untreated controls. In a repeat experiment, disease severity, lesion numbers and lesion diameters on MeJA vapour treated flowers after 12 h of incubation were reduced by 68, 56 and 50%, respectively. MeJA did not exert direct antifungal activity in-vitro, suggesting that treatment in-vivo reduced B. cinerea-induced flower specking by induction of host defence responses. MeJA at 0.1 mu l MeJA l(-1) significantly (P &lt; 0.05) increased vase life of cut freesia flowers and delayed senescence judged by lower wilt scores and higher fresh weights as compared to untreated controls. (c) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved.

Detection sensitivity and quantitation of Plasmodium falciparum var gene transcripts by real-time RT-PCR in comparison with conventional RT-PCR

Antigenic variation in Plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein 1, caused by a switch in transcription of the encoding var gene, is an important feature of malaria. In this study, we quantified the relative abundance of var gene transcripts present in P. falciparum parasite clones using real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and conventional RT-PCR combined with cloning and sequencing, with the aim of directly comparing the results obtained. When there was sufficient abundance of RNA for the real-time RT-PCR assay to be operating within the region of good reproducibility, RT-PCR and real-time RT-PCR tended to identify the same dominant transcript, although some transcript-specific issues were identified. When there were differences in the estimated relative amounts of minor transcripts, the RT-PCR assay tended to produce higher estimates than real-time RT-PCR. These results provide valuable information comparing RT-PCR and real-time RT-PCR analysis of samples with small quantities of RNA as might be expected in the analysis of field or clinical samples.

Utilizzo di Roslyn per l'analisi e il refactoring di codice C#

Microsoft ha introdotto nella versione 2015 di Visual Studio un nuovo compilatore per i linguaggi C# e Visual Basic chiamato Roslyn. Oltre che un compilatore, Roslyn è una piattaforma che mette a disposizione degli sviluppatori servizi per analizzare e modificare progetti .NET, interagire con le varie fasi della compilazione e creare applicazioni per l'analisi e generazione di codice sorgente. Obiettivo della tesi vuole essere lo studio della suddetta piattaforma ed il suo utilizzo nello sviluppo di estensioni per Visual Studio. La tesi si pone pertanto nel contesto delle tecniche di analisi e generazione di codice sorgente. Il lavoro di tesi ha previsto lo sviluppo di due applicazioni facenti uso delle API di Roslyn. La prima applicazione consiste in un analizzatore di codice C# che provvede alla segnalazione di warning riguardanti l'errato utilizzo del costrutto var e all'esplicitazione del tipo relativo. La seconda applicazione riguarda un generatore di codice C# che utilizza i servizi di Roslyn per semplificare e automatizzare la scrittura di codice nel contesto del framework Phoenix. I risultati ottenuti possono essere d'aiuto per un successivo studio della piattaforma Roslyn ed essere usati come punto di partenza per la creazione dei propri applicativi per l'analisi e generazione di codice sorgente.

Concentración de cationes (Ca2+, Mg2+, Fe2+3+, K+) en semillas de frijol negro (Phaseolus vulgaris L.) usando espectroscopia de absorción atómica

Se investiga la concentración de cationes (Ca,Fe,K,Mg),en el frijol negro,(Phaseolus vulgaris L. var. Tineco), usando un analizador de absorción atómica. Para tal efecto se procede a secar la muestra y luego se digiere en un medio acido. Se preparan las soluciones standard correspondiente a los cationes que se quiere investigar y luego se comparan estas concentraciones con las concentraciones de los iones en la muestra. El cálculo de la concentración (desconocida), de los cationes en la muestra, se hace por medio de simple aritmética. En este trabajo se reporta la cantidad en p. p. m. de los elementos arriba mencionados, presente en un gramo de la muestra original. Los resultados obtenidos fueron: Fe = 337.5 p. p. m. ; Ca = 150 p. p. m. ; Mg = 150 p. p. m. y K = 4X104p. p. m.

Contribution à l'étude des algues littorales du Vietnam 1: le genre Sargassum

Thirty-six species of Sargassum collected on the sea shore of Vietnam are studied. Four taxa are new: S. Feldmannii, S. Congkinhii, S. piluliferum var. nhatrangensis and S. hemiphyllum forma serrata.

Qualification zoo-sanitaire du naissain de captage 2013 de l'huître creuse Crassostrea gigas (QUALIF) - Détection précoce des maladies en épreuve thermique de laboratoire

Depuis 2008, des mortalités massives d’huîtres creuses âgées de moins d’un an sont relevées sur le littoral français dès que la température de l���eau de mer atteint le seuil de 16°C. Ces mortalités de naissains sont associées à la détection du virus OsHV-1 μVar. Des travaux de qualification zoo-sanitaire menés depuis 2010 ont montré qu’un lot de naissains issus du captage naturel sur deux était infecté par le virus bien avant l���apparition des mortalités dans le milieu naturel, mais qu’a contrario les naissains d’écloserie expertisés présentaient une fréquence plus faible de portage latent. Dans ce contexte de crise zoo-sanitaire chronique, l���objectif de notre étude consistait à obtenir une information du statut zoo-sanitaire OsHV-1 μVar des populations de naissains du captage 2013 à l���échelle national. Ce travail avait pour finalité de permettre l���identification précoce des zones de captage associées à un risque de mortalité due à l���infection par OsHV-1 μVar. La méthodologie de l���épreuve thermique de laboratoire (ETL) correspond en une période de 1 mois d’isolement des naissains à évaluer en conditions contrôl��es de laboratoire. Lors de cette période la température de l���eau de mer est maintenue constante à 21°C et la mortalité est relevée tous les 10 jours. La survie finale associée à des analyses qPCR permettent de qualifier le statut sanitaire en terme de portage OsHV-1 μVar de l���échantillon (statut infecté ou non infecté). Entre février et mars 2014, vingt et un échantillons de naissains âgés de 5 à 7 mois ont été échantillonnés dans six sites du littoral français (étang de Thau, bassin d’Arcachon, pertuis Charentais, baie de Bourgneuf, baie de Vilaine et rade de Brest) pour être qualifiés par ETL au site expérimental Ifremer d’Argenton. Les résultats de la campagne 2014 de qualification zoo-sanitaire confirment qu’en période hivernale, dans le milieu naturel, des naissains de captage peuvent être infectés par OsHV-1 μVar sans développement apparent de maladies ni mortalité. En revanche en ETL, ces lots de naissains infectés par OsHV-1 μVar présentent des taux de mortalité importants. Ainsi, sur les 20 échantillons de naissains de captage étudiés, onze ont révél�� des maladies en ETL avec des mortalités cumul��es variant de 16 % à 80 %. Ce ratio d’un échantillon sur deux de naissains infectés par OsHV-1 μVar demeure proche de celui observé de 2010 à 2013 lors des travaux précédents qui avaient permis de définir l���ETL. les six sites étudiés ont montré des résultats contrastés. En effet, les résultats se sont révél��s favorables pour l���étang de Thau et la baie de Bourgneuf et défavorables dans le cas de la rade de Brest et la Baie de Vilaine. Pour ces deux derniers sites, tous les échantillons de naissains testés ont montré de fortes mortalités pendant l���ETL. Des différences s’observent également intra-site, notamment à Marennes Ol��ron avec 1 échantillon sur 3 infectés par OsHV-1 μVar ou dans pour Arcachon avec 3 échantillons sur 5. Dans le contexte préoccupant de l���épizootie actuelle, nos résultats confirment que certains lots de naissains de captage sont infectés par OsHV-1 μVar dès les mois de février-mars et pourrait être des acteurs actifs dans le déclenchement annuel du processus infectieux en milieu naturel quand la température de l���eau dépasse 16°C. Par ailleurs, notre étude démontre qu’il serait possible chaque année d’obtenir une qualification sanitaire précoce des zones de captage. Cela permettrait d’améliorer la gestion des risques liés aux transferts de naissains infectés par OsHV-1 μVar dans les différents bassins de production.

Qualification zoo-sanitaire du naissain de captage 2014 de l'huître creuse Crassostrea gigas (QUALIF) - Détection précoce des maladies en épreuve thermique de laboratoire

Depuis 2008, des mortalités massives d’huîtres creuses âgées de moins d’un an sont relevées sur le littoral français dès que la température de l���eau de mer atteint le seuil de 16°C. Ces mortalités de naissains sont associées à la détection du virus OsHV-1 μVar. Depuis 2010, des travaux de qualification zoo-sanitaire ont montré qu’environ un lot de naissains de captage sur deux était infecté par le virus avant l���apparition des mortalités dans le milieu naturel. En 2014, dans le cadre de la première action QUALIF, les résultats de la qualification zoo-sanitaire des naissains du captage de l���année 2013 à l���échelle nationale ont mis en évidence le caractère infectieux des maladies développées par ces naissains porteurs latents d’OsHV-1 μVar. L���objectif 2015 du second volet QUALIF consistait à reproduire le travail de qualification zoo-sanitaire OsHV-1 μVar pour les naissains du captage de l���année 2014. Les résultats (2014 et 2015) permettront d’aborder la variation interannuelle du statut zoo-sanitaire des naissains pour chacun des sites étudiés. La méthodologie de l���épreuve de qualification zoo-sanitaire consiste en une période de 1 mois d’isolement des naissains en conditions contrôl��es de laboratoire. Lors de cette épreuve, la température de l���eau de mer est maintenue constante à 21°C et la mortalité est relevée tous les 10 jours. La survie finale et les analyses qPCR permettent de qualifier le statut sanitaire en terme de portage OsHV-1 μVar de l���échantillon (infecté ou non infecté). De début janvier à fin mars 2015, 39 échantillons de naissains âgés de 5 à 7 mois ont été prélevés dans 6 sites du littoral français (étang de Thau, bassin d’Arcachon, bassin de Marennes Ol��ron, baie de Bourgneuf, embouchure de La Vilaine et rade de Brest) pour être testés en épreuve thermique de laboratoire (ETL) dans l���outil expérimental Ifremer à Argenton. Les résultats montrent que 25 des 39 (soit 64 %) lots de naissains de captage testés ont développé des maladies en ETL associés à des mortalités cumul��es variant de 6 à 72 %. Cette valeur de 64 % de lots détectés est plus élevée que celle précédemment observée en 2014 (55 %). Les résultats de cette seconde campagne de qualification zoo-sanitaire sont favorables pour les naissains de l���étang de Thau (absence de mortalité), moins favorables pour ceux d’Arcachon, Marennes Ol��ron, et ceux de la baie de Bourgneuf (réponses contrastées en terme de mortalité intra-site) et très défavorables pour les naissains de La Vilaine et de la rade de Brest (mortalités observées sur tous les échantillons testés). La principale conclusion de cette seconde étude de qualification zoo-sanitaire est identique à celle de 2014, à savoir qu’il est existe dans le milieu naturel en période hivernale des lots de naissains de captage infectés par OsHV-1 μVar sans développement apparent des maladies. Ces lots de naissains porteurs latents d’OsHV-1 μVar sont détectables en ETL et la présence d’OsHV-1 μVar peut alors être confirmée par qPCR. Dans le contexte actuel d’épizooties chroniques, nos résultats confirment à nouveau qu’il est possible d’identifier précocement les lots de naissains infectés ou non par OsHV-1 μVar. Ces animaux infectés sont un réservoir du virus en période hivernale. Dès que la température de l���eau de mer franchit le seuil de 16°C, ils participeront à la réémergence des maladies en milieu naturel. Par ailleurs, cette seconde étude de qualification zoo-sanitaire confirme la possibilité d’apprécier le risque sanitaire pour chaque zone de captage en fonction de la détection précoce des lots de naissains infectés par OsHV-1 μVar.

Influência da radiação por feixe de eletrões no perfil cromatográfico de Bauhinia variegata var candida: flor comestível proveniente do brasil

As flores de Bauhinia variegata var candida apresentam coloração branca e são vulgarmente conhecidas como “patas de vaca branca”, sendo muito utilizadas na cozinha gourmet como forma de aumentar a qualidade sensorial e nutricional dos alimentos [1,2]. No presente estudo, as flores foram submetidas a radiação por feixe de eletrões em diferentes doses (0,5 e 0,8 kGy) como forma de descontaminação, e seguidamente analisadas em termos de parâmetros nutricionais (humidade, proteínas, gordura, hidratos de carbono e cinzas) e perfis em açúcares livres (HPLCRI), ácidos gordos (GC-FID), tocoferóis (HPLC-Fluorescência) e ácidos orgânicos (HPLC-DAD). As amostras não irradiadas e irradiadas mostraram um perfil nutricional semelhante, sendo os hidratos de carbono os nutrientes mais abundantes, seguidos das proteínas, gorduras e cinzas. Os perfis em açúcares foram também similares, estando presente a frutose em maior quantidade, seguida da glucose e da sacarose. Os ácidos mirístico (C14:0), palmítico (C16:0), esteárico (C18:0) e oleico (C18:1n9), foram os ácidos gordos mais abundantes. Os ácidos gordos saturados (SFA) foram os mais abundantes, seguidos dos mono (MUFA) e polinsaturados (PUFA). Neste caso, com maior dose de radiação verificou-se que a percentagem de SFA e MUFA diminui ligeiramente (principalmente pelo aumento dos ácidos esteárico e oleico, respetivamente), aumentando a percentagem de PUFA (principalmente pelo aumento dos ácidos linoleico e α-linol��nico). No que respeita aos tocoferóis, só a isoforma α foi encontrada, apresentando aproximadamente o mesmo conteúdo nas amostras irradiadas e não irradiadas (1,75±0,06 mg/mL). O ácido cítrico foi o ácido orgânico mais abundante nas amostras, seguido dos ácidos: málico, ascórbico, oxálico e fumárico. Também neste caso os valores mantiveram-se, com exceção do ácido cítrico que aumentou ligeiramente com as doses de irradiação (55,94, 61,70 e 67,64 mg/mL, respetivamente). Em síntese, verificou-se que as doses de irradiação aplicadas não alteraram significativamente a composição química das amostras em estudo, e pode ser considerada uma técnica de descontaminação e preservação de flores comestíveis.

Crecimiento del Schizolobium parahyba var. amazonicum cultivado en presencia de Ananas comosus var. erectifolius en Pará, Brasil.

El incremento en la perturbación ambiental y la presión mundial para preservar la selva amazónica han fomentado el cultivo de especies nativas. Con el objetivo de evaluar el crecimiento de Schizolobium parahyba var. amazonicum (Huber ex Ducke) barneby cultivado en presencia de componentes agrícolas como Ananas comosus var. erectifolius, se desarrolló un estudio en la Estación Experimental de la empresa Tramontina Belem S.A., ubicada en la Ciudad de Aurora do Pará (PA), Brasil. El diseño experimental fue factorial de bloques completos al azar con parcelas subdivididas en el tiempo, para que los arreglos formaron los tratamientos de la parcela y las subparcelas fueron el tiempo de observación, con seis tratamientos y cuatro repeticiones: 1) S. parahyba var. amazonicum, Cordia goeldiana y Switenia macrophylla:GLC; 2) S. parahyba var. amazonicum, C. goeldiana, S. macrophylla y A. comosus var. erectifolius: GLCc; 3) S. parahyba var. amazonicum y C. goeldiana: GL; 4) S. parahyba var. amazonicum, C. goeldiana y A.comosus var. erectifolius; GLCc; 5) S. parahyba var. amazonicum: G; y 6) S.parahyba var. amazonicum y A. comosus var. Erectifolius: Gc. La distancia entre las especies forestales fue 4 x 3 m y para las plantas de A. comosus 0.80 m x 0.50 m. El tamaño de la parcela fue 18 x 24 m con cuatro repeticiones por tratamiento, el total de parcelas fue 24 y de área experimental 10 368 m2. Las variables analizadas para inferir el crecimiento del componente forestal fueron altura (H) y diámetro a la altura del pecho (DAP), cada 6 meses durante 3 años. En los seis sistemas de cultivo la tasa semestral de crecimiento de la altura y DAP de S. parahyba var. amazonicum fue mayor en los dos primeros años, y siguió con una tendencia de crecimiento lento y continuo durante los 36 meses de estudio. El efecto positivo de la presencia de A. comosus var. erectifolius se observó en el crecimiento de las plantas de S. parahyba var.amazonicum.

The influence of different photosynthetically active radiation levels on Ananas comosus (var. erectifolius LB Smith) plant sunder multiple cropping systems in the upland region of the Guama River, eastern Amazonia.

2016

Tamanho efetivo populacional e diversidade genética em progênies de Pinus caribaea var. hondurensis.

2015