Régulation de la présentation antigénique par la chaîne invariante Iip35 et la molécule non-classique HLA-DO

Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

La chaîne rompue : lecture et relecture de Né à Québec d'Alain Grandbois de 1933 à nos jours

Ce mémoire s'intéresse à la réception critique de Né à Québec, première œuvre d'Alain Grandbois et aux relectures de ce récit à travers le temps. Cette étude a pour point de départ le paradoxe entre le futur prometteur de l'œuvre que laissait augurer la réception initiale et le rôle bien secondaire que joue désormais Né à Québec dans l'histoire de la littérature québécoise. Le mémoire est divisé en trois chapitres structurés chronologiquement et couvre la réception de l'œuvre de sa publication en 1933 jusqu'à nos jours. Le premier chapitre se penche sur le contexte de réception initial ainsi que sur l'élaboration d'un discours critique dominant sur Né à Québec. Cette partie de l'étude a aussi pour but de rappeler les conclusions de Marcel Fortin sur la réception immédiate de l'œuvre en question telles que décrites dans son ouvrage Histoire d'une célébration, publié il y a maintenant plus de vingt ans. Ce rappel est primordial afin de bien comprendre comment la pensée critique a évolué au-delà de la décennie 1930. À noter que l'analyse présente dans ce mémoire offre une perspective différente que celle de Fortin sur les commentaires de cette période puisqu'elle s'organise autour de concepts théoriques nouveaux, en particulier la notion de stéréotype telle que définie par Jean-Louis Dufays. Les deux autres chapitres traitent de textes critiques sur Né à Québec qui n'ont jamais dans le passé été directement le sujet d'une étude de réception. Tout au long de cette étude, le discours sur l'œuvre de Grandbois est décrit, analysé et comparé afin de comprendre comment ce récit historique en est venu à être aujourd'hui délaissé par le public et les littérateurs du Québec et d'ailleurs.

Modèles de Markov cachés à haute précision dynamique

La reconnaissance vocale est une technologie sujette à amélioration. Malgré 40 ans de travaux, de nombreuses applications restent néanmoins hors de portée en raison d'une trop faible efficacité. De façon à pallier à ce problème, l'auteur propose une amélioration au cadre conceptuel classique. Plus précisément, une nouvelle méthode d'entraînement des modèles markoviens cachés est exposée de manière à augmenter la précision dynamique des classificateurs. Le présent document décrit en détail le résultat de trois ans de recherche et les contributions scientifiques qui en sont le produit. L'aboutissement final de cet effort est la production d'un article de journal proposant une nouvelle tentative d'approche à la communauté scientifique internationale. Dans cet article, les auteurs proposent que des topologies finement adaptées de modèles markoviens cachés (HMMs) soient essentielles à une modélisation temporelle de haute précision. Un cadre conceptuel pour l'apprentissage efficace de topologies par élagage de modèles génériques complexes est donc soumis. Des modèles HMM à topologie gauche-à-droite sont d'abord entraînés de façon classique. Des modèles complexes à topologie générique sont ensuite obtenus par écrasement des modèles gauche-à-droite. Finalement, un enchaînement successif d'élagages et d'entraînements Baum-Welch est fait de manière à augmenter la précision temporelle des modèles.

Likelihood-Based Inference for Partially Observed Multi-Type Markov Branching Processes

Thesis (Ph.D.)--University of Washington, 2016-08

Conception optimale d’une chaîne de traction électrique pour une voiture de type Formule SAE

La Formule SAE (Society of Automotive Engineers) est une compétition étudiante consistant en la conception et la fabrication d’une voiture de course monoplace. De nombreux événements sont organisés à chaque année au cours desquels plusieurs universités rivalisent entre elles lors d’épreuves dynamiques et statiques. Celles-ci comprennent l’évaluation de la conception, l’évaluation des coûts de fabrication, l’accélération de la voiture, etc. Avec plus de 500 universités participantes et des événements annuels sur tous les continents, il s’agit de la plus importante compétition d’ingénierie étudiante au monde. L’équipe ULaval Racing a participé pendant plus de 20 ans aux compétitions annuelles réservées aux voitures à combustion. Afin de s’adapter à l’électrification des transports et aux nouvelles compétitions destinées aux voitures électriques, l’équipe a conçu et fabriqué une chaîne de traction électrique haute performance destinée à leur voiture 2015. L’approche traditionnelle employée pour concevoir une motorisation électrique consiste à imposer les performances désirées. Ces critères comprennent l’inclinaison maximale que la voiture doit pouvoir gravir, l’autonomie désirée ainsi qu’un profil de vitesse en fonction du temps, ou tout simplement un cycle routier. Cette approche n’est malheureusement pas appropriée pour la conception d’une traction électrique pour une voiture de type Formule SAE. Ce véhicule n’étant pas destiné à la conduite urbaine ou à la conduite sur autoroute, les cycles routiers existants ne sont pas représentatifs des conditions d’opération du bolide à concevoir. Ainsi, la réalisation de ce projet a nécessité l’identification du cycle d’opération routier sur lequel le véhicule doit opérer. Il sert de point de départ à la conception de la chaîne de traction composée des moteurs, de la batterie ainsi que des onduleurs de tension. L’utilisation d’une méthode de dimensionnement du système basée sur un algorithme d’optimisation génétique, suivie d’une optimisation locale couplée à une analyse par éléments-finis a permis l’obtention d’une solution optimale pour les circuits de type Formule SAE. La chaîne de traction conçue a été fabriquée et intégrée dans un prototype de voiture de l’équipe ULaval Racing lors de la saison 2015 afin de participer à diverses compétitions de voitures électriques.

Markov Random Fields in Cancer Mutation Dependencies

Even though a large amount of evidence would suggest that PP2A serine/threonine protein phosphatase acts as a tumour suppressor the genomics data to support this claim is limited. We fit a sparse binary Markov random field with individual sample's total mutational frequency as an additional covariate to model the dependencies between the mutations occurring in the PP2A encoding genes. We utilize the data from recent large scale cancer genomics studies, where the whole genome from a human tumour biopsy has been analysed. Our results show a complex network of interactions between the occurrence of mutations in our twenty examined genes. According to our analysis the mutations occurring in the genes PPP2R1A, PPP2R3A, and PPP2R2B are identified as the key mutations. These genes form the core of the network of conditional dependency between the mutations in the investigated twenty genes. Additionally, we note that the mutations occurring in PPP2R4 seem to be more influential in samples with higher number of total mutations. The mutations occurring in the set of genes suggested by our results has been shown to contribute to the transformation of human cells. We conclude that our evidence further supports the claim that PP2A acts as a tumour suppressor and restoring PP2A activity is an appealing therapeutic strategy.

Análise do crescimento econômico no Rio Grande do Sul através da aplicação de cadeias de Markov

O estudo do crescimento econômico é de suma importância para que possamos averiguar a trajetória de uma economia ao longo do tempo, a proposta desse trabalho é analisar o crescimento econômico no estado do Rio Grande do Sul, através do instrumental das cadeias de Markov, a ideia principal do estudo está na hipótese de convergência de renda. Primeiramente será testado a hipótese de convergência de renda do estado por meio das microrregiões, para isso serão utilizados dados de produto per capita dos anos de 1990, 2000 e 2010. Também será testado a hipótese de convergência para os municípios do Conselho Regional de Desenvolvimento Sul, situado no Rio Grande do Sul, utilizando dados de renda per capita dos anos de 1991, 2000 e 2010. Os resultados obtidos para as microrregiões do Rio Grande do Sul mostram que as economias não estão convergindo em sua totalidade para uma classe de renda especifica, porém é percebido que no longo prazo haverá uma maior concentração das microrregiões nos extratos de renda próximos a média, o tempo esperado para que as economias cheguem ao seu estado estacionário é de seis períodos. Por meio dos resultados obtidos para a região do Corede Sul, temos que as economias convergirão em sua maioria para a classe de renda médio pobre, seguido pela classe dos médios ricos. Ambas as classes estão situadas próximas a média regional, sendo que as classes de renda pobre e rico situadas aos extremos serão extintas no longo prazo. O tempo esperado para que as economias cheguem ao estado estacionário é de onze períodos.

Probabilistic approach of water residence time and connectivity using Markov Chains with application to tidal embayments

Markov Chain analysis was recently proposed to assess the time scales and preferential pathways into biological or physical networks by computing residence time, first passage time, rates of transfer between nodes and number of passages in a node. We propose to adapt an algorithm already published for simple systems to physical systems described with a high resolution hydrodynamic model. The method is applied to bays and estuaries on the Eastern Coast of Canada for their interest in shellfish aquaculture. Current velocities have been computed by using a 2 dimensional grid of elements and circulation patterns were summarized by averaging Eulerian flows between adjacent elements. Flows and volumes allow computing probabilities of transition between elements and to assess the average time needed by virtual particles to move from one element to another, the rate of transfer between two elements, and the average residence time of each system. We also combined transfer rates and times to assess the main pathways of virtual particles released in farmed areas and the potential influence of farmed areas on other areas. We suggest that Markov chain is complementary to other sets of ecological indicators proposed to analyse the interactions between farmed areas - e.g. depletion index, carrying capacity assessment. Markov Chain has several advantages with respect to the estimation of connectivity between pair of sites. It makes possible to estimate transfer rates and times at once in a very quick and efficient way, without the need to perform long term simulations of particle or tracer concentration.

Análise do crescimento econômico no Rio Grande do Sul através da aplicação de cadeias de markov

O estudo do crescimento econômico é de suma importância para que possamos averiguar a trajetória de uma economia ao longo do tempo, a proposta desse trabalho é analisar o crescimento econômico no estado do Rio Grande do Sul, através do instrumental das cadeias de Markov, a ideia principal do estudo está na hipótese de convergência de renda. Primeiramente será testado a hipótese de convergência de renda do estado por meio das microrregiões, para isso serão utilizados dados de produto per capita dos anos de 1990, 2000 e 2010. Também será testado a hipótese de convergência para os municípios do Conselho Regional de Desenvolvimento Sul, situado no Rio Grande do Sul, utilizando dados de renda per capita dos anos de 1991, 2000 e 2010. Os resultados obtidos para as microrregiões do Rio Grande do Sul mostram que as economias não estão convergindo em sua totalidade para uma classe de renda especifica, porém é percebido que no longo prazo haverá uma maior concentração das microrregiões nos extratos de renda próximos a média, o tempo esperado para que as economias cheguem ao seu estado estacionário é de seis períodos. Por meio dos resultados obtidos para a região do Corede Sul, temos que as economias convergirão em sua maioria para a classe de renda médio pobre, seguido pela classe dos médio ricos. Ambas as classes estão situadas próximas a média regional, sendo que as classes de renda pobre e rico situadas aos extremos serão extintas no longo prazo. O tempo esperado para que as economias cheguem ao estado estacionário é de onze períodos.

A path-based framework for analyzing large markov models

Reliability and dependability modeling can be employed during many stages of analysis of a computing system to gain insights into its critical behaviors. To provide useful results, realistic models of systems are often necessarily large and complex. Numerical analysis of these models presents a formidable challenge because the sizes of their state-space descriptions grow exponentially in proportion to the sizes of the models. On the other hand, simulation of the models requires analysis of many trajectories in order to compute statistically correct solutions. This dissertation presents a novel framework for performing both numerical analysis and simulation. The new numerical approach computes bounds on the solutions of transient measures in large continuous-time Markov chains (CTMCs). It extends existing path-based and uniformization-based methods by identifying sets of paths that are equivalent with respect to a reward measure and related to one another via a simple structural relationship. This relationship makes it possible for the approach to explore multiple paths at the same time,· thus significantly increasing the number of paths that can be explored in a given amount of time. Furthermore, the use of a structured representation for the state space and the direct computation of the desired reward measure (without ever storing the solution vector) allow it to analyze very large models using a very small amount of storage. Often, path-based techniques must compute many paths to obtain tight bounds. In addition to presenting the basic path-based approach, we also present algorithms for computing more paths and tighter bounds quickly. One resulting approach is based on the concept of path composition whereby precomputed subpaths are composed to compute the whole paths efficiently. Another approach is based on selecting important paths (among a set of many paths) for evaluation. Many path-based techniques suffer from having to evaluate many (unimportant) paths. Evaluating the important ones helps to compute tight bounds efficiently and quickly.

A risk model with an observer in a Markov environment

We consider a spectrally-negative Markov additive process as a model of a risk process in a random environment. Following recent interest in alternative ruin concepts, we assume that ruin occurs when an independent Poissonian observer sees the process as negative, where the observation rate may depend on the state of the environment. Using an approximation argument and spectral theory, we establish an explicit formula for the resulting survival probabilities in this general setting. We also discuss an efficient evaluation of the involved quantities and provide a numerical illustration.

Reconfigurations de la chaîne de valeur de l’industrie aéronautique au Québec : mises à niveau des processus et des compétences des entreprises sous-traitantes

Étude de cas comparative portant sur l'évolution de la chaîne de valeur aéronautique du grand Montréal. L'objet d'étude est le développement des capacités organisationnelles des firmes sous-traitantes grâce à des mises à niveau de leurs systèmes de production. Ces mises à niveau sont considérées s'inscrire dans un cadre stratégique en lien avec le positionnement de marché visé et générer des opportunités de formation et apprentissage. Un processus d'apprentissage commun aux firmes est relevé et présente des activités de conversion de savoir centrales au développement des compétences. Les analyses indiquent que des mises à niveau de fonction sont à favoriser pour élargir les capacités organisationnelles et l'offre de services correspondante de ces firmes jusqu’à l’atteinte du rang d’intégrateur. Le paradigme des chaînes de valeur et l’approche basée sur les ressources et l’apprentissage issu de la gestion stratégique sont agencés en continuum pour l’analyse des phénomènes.

A Markov switching unobserved component analysis of the CDX index term premium

Using a Markov switching unobserved component model we decompose the term premium of the North American CDX index into a permanent and a stationary component. We establish that the inversion of the CDX term premium is induced by sudden changes in the unobserved stationary component, which represents the evolution of the fundamentals underpinning the probability of default in the economy. We find evidence that the monetary policy response from the Fed during the crisis period was effective in reducing the volatility of the term premium. We also show that equity returns make a substantial contribution to the term premium over the entire sample period.

Reconfigurations de la chaîne de valeur de l’industrie aéronautique au Québec : mises à niveau des processus et des compétences des entreprises sous-traitantes

Étude de cas comparative portant sur l'évolution de la chaîne de valeur aéronautique du grand Montréal. L'objet d'étude est le développement des capacités organisationnelles des firmes sous-traitantes grâce à des mises à niveau de leurs systèmes de production. Ces mises à niveau sont considérées s'inscrire dans un cadre stratégique en lien avec le positionnement de marché visé et générer des opportunités de formation et apprentissage. Un processus d'apprentissage commun aux firmes est relevé et présente des activités de conversion de savoir centrales au développement des compétences. Les analyses indiquent que des mises à niveau de fonction sont à favoriser pour élargir les capacités organisationnelles et l'offre de services correspondante de ces firmes jusqu’à l’atteinte du rang d’intégrateur. Le paradigme des chaînes de valeur et l’approche basée sur les ressources et l’apprentissage issu de la gestion stratégique sont agencés en continuum pour l’analyse des phénomènes.

Anisotropic seismic tomography with the reversible jump Markov chain Monte Carlo

The established isotropic tomographic models show the features of subduction zones in terms of seismic velocity anomalies, but they are generally subjected to the generation of artifacts due to the lack of anisotropy in forward modelling. There is evidence for the significant influence of seismic anisotropy in the mid-upper mantle, especially for boundary layers like subducting slabs. As consequence, in isotropic models artifacts may be misinterpreted as compositional or thermal heterogeneities. In this thesis project the application of a trans-dimensional Metropolis-Hastings method is investigated in the context of anisotropic seismic tomography. This choice arises as a response to the important limitations introduced by traditional inversion methods which use iterative procedures of optimization of a function object of the inversion. On the basis of a first implementation of the Bayesian sampling algorithm, the code is tested with some cartesian two-dimensional models, and then extended to polar coordinates and dimensions typical of subduction zones, the main focus proposed for this method. Synthetic experiments with increasing complexity are realized to test the performance of the method and the precautions for multiple contexts, taking into account also the possibility to apply seismic ray-tracing iteratively. The code developed is tested mainly for 2D inversions, future extensions will allow the anisotropic inversion of seismological data to provide more realistic imaging of real subduction zones, less subjected to generation of artifacts.