New insights regarding HCV-NS5A structure/function and indication of genotypic differences

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Crystallization of bothrombin, a fibrinogen-converting serine protease isolated from the venom of Bothrops jararaca

Bothrombin, a snake-venom serine protease, specifically cleaves fibrinogen, releasing fibrinopeptide A to form non-crosslinked soft clots, aggregates platelets in the presence of exogeneous fibrinogen and activates blood coagulation factor VIII. Bothrombin shares high sequence homology with other snake-venom proteases such as batroxobin (94% identity), but only 30 and 34% identity with human alpha-thrombin and trypsin, respectively. Single crystals of bothrombin have been obtained and X-ray diffraction data have been collected at the Laboratorio Nacional de Luz Sincrotron to a resolution of 2.8 Angstrom. The crystals belong to the space group P2(1)2(1)2(1), with unit-cell parameters a = 94.81, b = 115.68, c = 155.97 Angstrom.

Purification, biochemical and functional characterization of miliin, a new thiol-dependent serine protease isolated from the latex of Euphorbia milii

Miliin, a new thiol-dependent serine protease purified from the latex of Euphorbia milii possesses a molecular weight of 79 kDa, an isoelectric point of 4.3 and is optimally active at 60 degrees C in the pH range of and 7.5-11.0. Activity tests indicate that milliin is a thiol-dependent serine protease.

Partial characterization of protease from a thermophilic fungus, Thermoascus aurantiacus, and its hydrolytic activity on bovine casein

Proteases are one of the most important groups of industrial enzymes, with considerable application in the food industry. The aim of this work was to study a novel protease produced by the thermophilic fungus, Thermoascus aurantiacus, through solid-state fermentation (SSF). The enzyme acted optimally at pH 5.5 and 60 degrees C it was stable up to 60 degrees C for 1 h and in the pH range 3.0-9.5. To elucidate the enzyme's proteolytic activity, its hydrolytic profile on bovine casein, an important protein in the food industry, was studied by enzymatic hydrolysis on skim milk, analyzed by gel electrophoresis (UREA-PAGE), which clearly showed that the protease does not have the same specificity as bovine chymosin. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Purification and characterization of a new alkaline serine protease from the thermophilic fungus Myceliophthora sp.

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Development of a rapid one-step immunochromatographic assay for HCV core antigen detection

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Alkyl Hydroxybenzoic Acid Derivatives that Inhibit HIV-1 Protease Dimerization

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Protease inhibition activity of extracts from Salicaceae species from Brazilian Cerrado and Atlantic Rain Forest and of an enriched fraction of clerodane diterpenes (casearins)

Considerando o uso popular de Casearia sylvestris Sw., Salicaceae, para o tratamento de problemas gástricos e resultados pré-clínicos que mostraram potencial atividade anti-ulcerogênica, foi realizado um screening farmacológico para avaliar a atividade biológica de outras espécies de Salicaceae. Para isso, foi utilizado um ensaio de inibição de proteases como um modelo farmacológico molecular para screening de extratos com atividade anti-ulcerogênica. Os extratos etanólico e aquoso dos galhos e folhas de C. gossypiosperma, C. decandra e C. rupestris mostraram inibição da atividade da pepsina em aproximadamente 50% com a concentração de 1 μg/mL. Curiosamente, C. obliquoa e Flacourtia ramontchi não apresentaram atividade sobre a pepsina, mas seus extratos mais apolares mostraram atividade inibitória sobre a subtilisina. A fração enriquecida de diterpenos clerodânicos mostrou atividade inibitória (42,75%) sobre a pepsina com a concentração de 1 μg/mL, mas não sobre a subtilisina (23,76%). Os resultados obtidos com os extratos e folhas das espécies testadas mostraram um padrão de atividade diferente sobre os dois tipos de proteases, a pepsina e a subtilisina, as quais estão relacionadas com diferentes tipos de atividades biológicas. Ainda mais, os resultados com a fração enriquecida de diterpenos clerodânicos sugerem que estas substâncias podem estar relacionadas com a atividade do extrato bruto de C. sylvestris.

Co-infecção HIV/HCV em pacientes de Botucatu e região

Devido à similaridade nas rotas de transmissão, a co-infecção HIV/HCV é freqüente, afetando em média 30 a 50% dos portadores de HIV. O presente estudo visou avaliar uma possível associação entre os subtipos do HIV e genótipos do HCV em pacientes co-infectados, com base na análise das freqüências em pacientes mono e co-infectados. Para determinação da freqüência dos subtipos HIV e genótipos HCV, foram analisados respectivamente 124 e 496 pacientes mono-infectados. O estudo da co-infecção foi realizado num grupo de 150 pacientes HIV positivos e esteve presente em 22 (14,7%) dos pacientes. A freqüência dos subtipos do HIV-1 em mono-infectados foi: subtipo B (85,5%), subtipo F (12,9%) e recombinante B/F (1,6%), enquanto nos genótipos HCV foi: 1a (25%), 1b (29,4%), 1a/1b (3,6%), 3a (35%), 2 (1,8%) e 5 (0,4%). Nos co-infectados o padrão de distribuição dos subtipos HIV-1 é semelhante aos mono-infectados, ou seja, subtipo B (85,0%), seguido do subtipo F (15,0%). A distribuição de freqüência de genótipos HCV nos co-infectados foi: 1a (36,3%), 1b (27,3%), 1a/1b (9,1%) e 3a (27,3%) mostrando um aumento de 10% na freqüência do genótipo 1, queda de 7,7% no genótipo 3 e ausência de outros genótipos. A análise estatística de associação entre os subtipos HIV e genótipos HCV (Goodman) mostrou que no genótipo 1 (HCV) ocorreu predominância do subtipo B, enquanto no genótipo 3 (HCV) a distribuição dos subtipos B e F (HIV-1) foi casual. Isto aponta para a necessidade de mais estudos desse grupo e um maior valor amostral.

Recombinant expression and characterization of a Xylella fastidiosa cysteine protease differentially expressed in a nonpathogenic strain

Xylella fastidiosa is a xylem-limited, Gram-negative bacterium responsible for citrus variegated chlorosis (CVC) in sweet oranges. In the present study, we present the recombinant expression, purification and characterization of an X. fastidiosa cysteine protease (dubbed Xylellain). The recombinant Xylellain ((HIS)Xylellain) was able to hydrolyze carbobenzoxy-Phe-Arg-7-amido-4-methylcoumarin (Z-FR-MCA) and carbobenzoxy-Arg-Arg-7-amido-4-methylcoumarin (Z-RR-MCA) with similar catalytic efficiencies, suggesting that this enzyme presents substrate specificity requirements similar to cathepsin B. The immunization of mice with (HIS)Xylellain provided us with antibodies, which recognized a protein of c. 31 kDa in the X. fastidiosa pathogenic strains 9a5c, and X. fastidiosa isolated from coffee plants. However, these antibodies recognized no protein in the nonpathogenic X. fastidiosa J1a12, suggesting the absence or low expression of this protein in the strain. These findings enabled us to identify Xylellain as a putative target for combating CVC and other diseases caused by X. fastidiosa strains.