Nuclear mitochondrial-like sequences in ants: Evidence from Atta cephalotes (Formicidae: Attini)

Nuclear mitochondrial-like sequences (numts) are copies of mitochondrial DNA that have migrated to the genomic DNA. We present the first characterization of numts in ants, these numts being homologues to a mitochondrial DNA fragment containing loci the 3′ portion of the cytochrome oxidase I gene, an intergenic spacer, the tRNA leucine gene and the 5′ portion of the cytochrome oxidase II gene. All 67 specimens of Atta cephalotes (Hymenoptera: Formicidae: Attini) investigated had these homologues, which are within two monophyletic groups that we called numt1 and numt2. Numt1 and numt2 sequences are less variable than mitochondrial sequences and released from the severe purifying selection constraining the evolution of mitochondrial genes. Their formation probably involved bottlenecks related to two distinct transfer events of ancient and fast evolving mitochondrial DNA fragments to comparative slowly evolving nuclear DNA regions. © 2007 The Authors.

Mitochondrial genome sequence of the Brazilian luminescent click beetle Pyrophorus divergens (Coleoptera: Elateridae): Mitochondrial genes utility to investigate the evolutionary history of Coleoptera and its bioluminescence

The Coleoptera order is the richest group among Metazoa, but its phylogenetics remains incompletely understood. Among Coleoptera, bioluminescence is found within the Elateroidea, but the evolution of this character remains a mystery. Mitochondrial DNA has been used extensively to reconstruct phylogenetic relationships, however, the evolution of a single gene does not always correspond to the species evolutionary history and the molecular marker choice is a key step in this type of analysis. To create a solid basis to better understand the evolutionary history of Coleoptera and its bioluminescence, we sequenced and comparatively analyzed the mitochondrial genome of the Brazilian luminescent click beetle Pyrophorus divergens (Coleoptera: Elateridae). © 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.

A simple protocol for a low invasive DNA accessing in Stenella longirostris (Cetacea: Delphinidae)

The most significant studies about the spinner dolphin (Stenella longirostris) in the Southwestern Atlantic Ocean were conducted in Fernando de Noronha Archipelago, off Northeastern Brazil. The continuity of these studies depends upon the development of non-invasive methods. In this work, we present results from the skin swabbing sampling procedure for this species. We tested the performance of this method for nuclear and mitochondrial DNA analysis, unknown for this population. A total of skin 161 samples were collected during two expeditions. After the contacts the most of the dolphins remained close to the boat. Microsatellites markers and cytochrome b region primers were evaluated and the respective fragments were successfully amplified. Thus, skin swabbing may be considered an efficient strategy to obtain tissue samples for spinner dolphin genetic analysis in Fernando de Noronha Archipelago.

Utlização do DNA mitocondrial no contexto forense brasileiro

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise de polimorfismos da região controle do dna mitocondrial em indivíduos nascidos e residentes no estado do espírito santo para utilização na identificação humana

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Análise genética do tubarão-raposa Alopias superciliosus no Oceano Atlântico, utilizando região controle do DNA mitocondrial

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Filogeografia do tubarão mako Isurus oxyrinchus utilizando marcadores moleculares do DNA mitocondrial

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Genética) - IBB

Variabilidade genética de três colônias de Triatoma rubrovaria (Blanchard, 1843), (Hemiptera, Reduviidae), oriundas do estado do Rio Grande do Sul, avaliadas por meio do seqüenciamento de genes do DNA mitocondrial e ribossomal

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise da variabilidade e estruturação genética do tubarão azul, Prionace glauca (Chondrichthyes, Carcharhinidae) no Oceano Atlântico Sul Ocidental utilizando marcador molecular do DNA mitocondrial

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análise de polimorfismos do DNA mitocondrial em indivíduos residentes na grande São Paulo para aplicação na identificação humana

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Aplicação de redes neurais artificiais na classificação de padrões filogeográficos com base na variabilidade genômica do DNA mitocondrial

Historicamente, o processo de formação das populações da Amazônia, assim como de todo território brasileiro, envolveu três grupos étnicos principais: o ameríndio, o europeu e o africano. Como conseqüência, estas populações possuem em geral constituição miscigenada do ponto de vista social e biológico. Desde o final do século passado, estudos do DNA mitocondrial (mtDNA) tem sido desenvolvidos com o propósito de estimar a mistura interétnica presente nestas populações. Para isto, é de fundamental importância a classificação de uma determinada linhagem de mtDNA em um dos mais de 250 haplogrupos/subclados propostos na literatura. Com o objetivo de desenvolver um sistema automatizado, preciso e acurado de classificação de seqüências (linhagens) de mtDNA, o presente trabalhou lançou mão da técnica de Redes Neurais Artificiais (RNA’s) tendo como base os estudos de filogeografia. Para esta classificação, foram desenvolvidas quatro redes neurais artificiais diretas, com múltiplas camadas e algoritmo de aprendizagem de retropropagação. As entradas de cada rede equivalem às posições nucleotídicas polimórficas da região hipervariável do DNA mitocondrial, as quais retornam como saída a classificação específica de cada linhagem. Posterior ao treinamento, todas as redes apresentaram índices de acerto de 100%, demonstrando que a técnica de Rede Neural Artificial pode ser utilizada, com êxito, na classificação de padrões filogeográficos com base no DNA mitocondrial.

Análises moleculares da região controle do DNA mitocondrial de astrocitomas na população paraense

O câncer do sistema nervoso central representa 2% de todas as neoplasias malignas na população mundial e 23% dos casos de câncer infantil. No Brasil, estimam-se 4.820 casos deste câncer em homens e 4.450 em mulheres para o ano de 2012. Os gliomas são tumores do sistema nervoso central formados a partir de células da glia e somam mais de 70% do tumores cerebrais. A propriedade mais importante dos gliomas é sua capacidade de evasão imunológica. Idade, etnia, gênero e ocupação podem ser considerados fatores de risco para o surgimento de gliomas, e são duas vezes mais frequentes em afro-americanos. O astrocitoma é o tumor glial mais frequente, constituindo cerca de 75% dos casos de gliomas. Estes tumores são classificados em quatro graus, de acordo com a Organização Mundial de Saúde. O DNA mitocondrial está relacionado com o desenvolvimento e a progressão de vários tipos de tumores. A mitocôndria é responsável pelo balanço energético celular e está envolvida no disparo da apoptose em resposta ao estresse oxidativo. Mutações na D-LOOP podem alterar a taxa de replicação do DNA e aumentar o risco do desenvolvimento do câncer. Neste estudo foram analisadas 29 amostras de astrocitoma classificados de acordo com a OMS. Nossos dados sugerem que os astrocitomas de baixo grau podem estar relacionados à herança genética, tornando portadores de alguns polimorfismos ou mutações específicas, mais suscetíveis ao risco de desenvolver a doença, e os de alto grau podem estar relacionados à exposição prolongada aos agentes carginógenos. Foram identificados polimorfismos e mutações onde alguns apresentaram relação com o risco do desenvolvimento de astrocitomas e com a progressão da doença. A inserção de dois ou mais nucleotídeos nas regiões de microssatélites pode causar sua instabilidade e contribuir com o surgimento do câncer. A deleção no sítio 16132 pode ser um marcador para astrocitoma de alto grau, assim como a inserção de duas ou mais citosinas no sítio 16190 pode ser um marcador específico para astrocitomas. As mutações heteroplásmicas podem ser determinantes para o surgimento e/ou progressão de astrocitomas de alto grau.

Análise das relações filogenéticas entre as subfamílias de characidae (Ostariophysi: Characoformes) utilizando sequências de DNA mitocondrial e nuclear

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Multiple mitochondrial genes of some sylvatic Brazilian Triatoma: Non-monophyly of the T. brasiliensis subcomplex and the need for a generic revision in the Triatomini

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Análise de SNPs do DNA mitocondrial em indivíduos residentes no estado do Espírito Santo para aplicação na Identificação Humana

Pós-graduação em Biotecnologia - IQ