Database construction and Peptide identification strategies for proteogenomic studies on sequenced genomes.

Since the advent of high-throughput DNA sequencing technologies, the ever-increasing rate at which genomes have been published has generated new challenges notably at the level of genome annotation. Even if gene predictors and annotation softwares are more and more efficient, the ultimate validation is still in the observation of predicted gene product( s). Mass-spectrometry based proteomics provides the necessary high throughput technology to show evidences of protein presence and, from the identified sequences, confirmation or invalidation of predicted annotations. We review here different strategies used to perform a MS-based proteogenomics experiment with a bottom-up approach. We start from the strengths and weaknesses of the different database construction strategies, based on different genomic information (whole genome, ORF, cDNA, EST or RNA-Seq data), which are then used for matching mass spectra to peptides and proteins. We also review the important points to be considered for a correct statistical assessment of the peptide identifications. Finally, we provide references for tools used to map and visualize the peptide identifications back to the original genomic information.

Causes of subcontracting: Evidence from panel data on construction firms

This paper examines factors explaining subcontracting decisions in the construction industry. Rather than the more common cross-sectional analyses, we use panel data to evaluate the influence of all relevant variables. We design and use a new index of the closeness to small numbers situations to estimate the extent of hold-up problems. Results show that as specificity grows, firms tend to subcontract less. The opposite happens when output heterogeneity and the use of intangible assets and capabilities increase. Neither temporary shortage of capacity nor geographical dispersion of activities seem to affect the extent of subcontracting. Finally, proxies for uncertainty do not show any clear effect.

Waste Reduction, Construction and Demolition Debris: Guide for Building, Construction and Environmental Professionals, Revised November 2008

This document is intended to lay the foundation for resource reduction strategies in new construction, renovation and demolition. If you have an innovative idea or information that you believe should be included in future updates of this manual please email Shelly Codner at scodner@region12cog.org or Jan Loyson at Jan.Loyson@Iowalifechanging.com. Throughout this manual, we use the term “waste reduction” to define waste management initiatives that will result in less waste going to the landfill. In accordance with the waste management hierarchy these practices include reducing (waste prevention), reusing (deconstruction and salvage), recycling and renewing (making old things new again) - in that order. This manual will explain what these practices are and how to incorporate them into your projects.

Construction Code, November 25, 2008

Construction codes establish minimum standards for structural integrity, life safety, accessibility and energy conservation in construction of buildings and facilities intended for human occupancy. These requirements affect all of the major systems of buildings and facilities.

L’IMPACT DES CHANTIERS À HAUTE INTENSITÉ DE LA MAIN-D’OEUVRE SUR L’EMPOWERMENT DES FEMMES RURALES AU CAP VERT

Les Chantiers à haute intensité de la main d’oeuvre (Faimo) donnent la possibilité aux femmes des Villages d’Achada Costa et Levada l’opportunité de se rencontrer en dehors des espaces traditionnels (funérailles, messe, baptême etc.). Ces rencontres facilitent l’établissement des liens sociaux et d’amitié qui aboutissent à une certaine complicité et à la réalisation de projets communs. Le revenu et l’apprentissage d’un métier que les Faimo procurent aux femmes ouvrent à celles-ci la voie menant à un « empowerment » économique (synonyme d’autonomie financière et économique) et social en leur permettant un certain contrôle de ses ressources et l’accès à une forme de savoir professionnel. Nous sommes ainsi devant un cas de ‘ pouvoir de’ qui renvoie aux capacités intellectuelles (la connaissance objective, le savoir) et émotionnelles (savoir-être), mais aussi économiques (avoir) : avoir l'accès et le contrôle des moyens de production et des bénéfices » (Charlier : 2011). De telles acquisitions sont sources d’une plus grande estime de soi et confiance en soi qui mènent à l’action et donc d’un ‘pouvoir intérieur’ qui « renvoie à la [capacité individuelle d’analyser et d’influencer] sa vie et de proposer des changements » (Charlier : 2011). L’association du développement communautaire est l’espace où les femmes affirment leur pouvoir social et politique en s’appuyant sur une solidarité et complicité intelligentes. Grâce à la solidarité entre elles, les femmes contrôlent l’association locale et parviennent à « négocier » et à faire valoir leur vision des priorités pour leur village et ainsi influencer le processus de son développement. Nous sommes, dans ce contexte, face à un cas de ‘pouvoir avec’, (pouvoir social et politique, [qui] met en évidence la notion de solidarité, la capacité de s’organiser pour négocier et pour défendre un objectif commun) (Charlier 2011) même si la solidarité entre les femmes suscite une certaine méfiance et résistance des hommes.

Ecole et construction du sens

Peut-on continuer à invoquer la neutralité abstentionniste de l'État pour proscrire un enseignement sur la religion à l'école ? Cet argument qui a eu sa légitimité historique vaut-il encore aujourd'hui ? En d'autres termes, l'existence d'un tel enseignement ne pourrait-il pas s'avérer compatible avec un régime de séparation Églises-État ? Qu'en pensent les acteurs directement concernés ? Refusant de rejeter la religion du côté du privé, les enseignants en nombre croissant déplorent le peu de place accordé à la « spiritualité » en classe. Quant aux élèves, reflétant l'attitude incertaine de leurs parents quant aux valeurs à transmettre, ils expriment des besoins plus difficiles à déchiffrer. Mais derrière ce débat relatif à l'inscription d'une case religieuse dans les programmes scolaires, ne s'en cache-t-il pas un autre touchant directement aux objectifs du système éducatif et au rôle des enseignants ?

Iowa Construction Site Erosion Control Manual, 2006

The purpose of this Iowa manual is to serve as a guide, provide solutions, and offer suggestions on construction sites to comply with Iowa's current soil erosion and storm water runoff regulations. This need is particularly important when land undergoes a land use change. Information provided in this manual will be helpful to land owners, developers, consultants, contractors, planners, local government, as well as the general public. This manual is intended to provide techniques that will meet the mandates of current legislation. Innovations that will benefit the user and still provide effective control are encouraged.