Molecular probes and polymerase chain reaction (PCR) -based kits for diagnosis of shrimp diseases

Technology for effective and fast diagnosis of animal diseases is essential for developing aquaculture management strategies. This paper reviews the conventional techniques for shrimp disease diagnosis and discusses the emergence of nuclei acid probes and polymerase chain reaction (PCR)-based kits as powerful tools for rapid and accurate detection of shrimp diseases.

Compara����o interlaboratorial entre metodologias e estabilidade da amostra na dosagem do perfil lip��dico e PCR-US

Segundo O`Kane et al, em 2008, foi demonstrado que 88,9% dos erros laboratoriais s��o realizados na fase pr��-anal��tica. No laborat��rio de an��lises cl��nicas, o sistema de controle da qualidade pode ser definido como toda a a����o sistem��tica necess��ria para dar confian��a e seguran��a em todos os exames e prevenir a ocorr��ncia de erros. O tempo de armazenamento pode variar de dias a meses ou mesmo anos, influenciando na defini����o da temperatura de estocagem. O armazenamento de longo prazo pode resultar na criopreserva����o inadequada para determinados analitos e pode desnaturar as lipoprote��nas. Objetivos: Este trabalho teve como objetivo avaliar a fase pr��-anal��tica, controle da qualidade interno e tamb��m avaliar o efeito do congelamento (- 80C) quanto ao tempo de armazenamento do soro e plasma de sangue colhido com ��cido etilenodiamino tetra-ac��tico (EDTA). As dosagens foram realizadas no Laborat��rio de L��pides LabLip, e estocadas em - 80 C por tr��s anos, as mesmas foram redosadas no Servi��o de Patologia Cl��nica da Policl��nica Piquet Carneiro da UERJ com metodologias iguais e realizada a comparabilidade dos resultados. Foram analisados o perfil lip��dico (CT, HDLc e TG) e PCR-US de 103 amostras, 73 no soro e 30 no plasma em dois laborat��rios altamente qualificados. Discuss��o: Ap��s redosagem foram encontrados nas dosagens de HDLc e CT resultados diminu��dos respectivamente (correla����o coeficiente no soro 0,48 e 0,62) teste t pareado no soro (CT p 0,0012 e HDLc p 0,0001). Conclus��es: Os dados obtidos nas avalia����es dos resultados de diferentes laborat��rios e tempo de estocagem revelaram que as amostras quando armazenadas por um longo per��odo ap��s redosagem no soro, apresentaram diferen��as em certos analitos, tais como CT e HDLc, no qual obteve-se resultados significativamente diminu��dos, diferentemente no plasma, que ap��s tr��s anos de estocagem a -80C foram redosados e aplicados no teste t pareado, os analitos CT e PCR-US mantiveram a estabilidade.

PCR-SSCP and Isoelectric Focusing as Screening Methods for Identification of (Sub-) Tropical Fish Species

To ensure the authentication of fishery products lacking biological characters, rapid species identification methods are required. Two DNA- and protein-based methods, PCR-SSCP (polymerase chain reaction - single strand conformation polymorphism) of a 464 bp segment of the cytochrome b ��� gene and isoelectric focusing (IEF) of water-soluble proteins from fish fillets, were applied to identify fillets of (sub-) tropical fish species available on the European market. Among the samples analysed were two taxonomically identified species from the family Sciaenidae and one from Sphyraenidae. By comparison of DNA- and protein patterns of different samples, information about intra-species variability of patterns, and homogeneity of batches (e.g. fillet blocks or bags) can be obtained. PCR-SSCP and IEF may be useful for pre-checking of a large number of samples by food control laboratories. Zusammenfassung Zur Sicherstellung der Authentizit��t von Fischerei-Erzeugnissen ohne biologische Merkmale sind schnelle Verfahren zur Speziesidentifizierung hilfreich. Zwei Methoden der DNA- bzw. Protein-Analyse wurden eingesetzt, um Filets (sub-) tropischer Fischarten, die auf dem europ��ischen Markt angeboten werden, zu identifizieren. Bei diesen Methoden handelt es sich um die PCR-SSCP (Polymerase-Kettenreaktion ��� Einzelstrang-Konformationspolymorphismus) ��� Analyse der PCR-Produkte und die IEF (isoelektrische Fokussierung) der wasserl��slichen Fischmuskelproteine. Unter den untersuchten Proben waren zwei taxonomisch bestimmte Arten aus der Familie Sciaenidae und eine Spezies aus der Familie Sphyraenidae. Durch Vergleich der DNA- bzw. Proteinmuster lassen sich Informationen ��ber die intra-spezifische Variabilit��t solcher Muster und die Einheitlichkeit von Partien (beispielsweise Filetbl��cke oder Filetbeutel) gewinnen. PCR-SSCP und IEF k��nnen in Laboratorien der Lebensmittel��berwachung als Vortest gerade bei hohen Probenzahlen sinnvoll eingesetzt werden.