Cos i consciència : El paper de les emocions en la unificació de l'ésser humà

El text que presento explora com es transforma l'autoimatge a partir del treball corporal propi del sistema Rio Abierto, el qual cerca la integració de les diverses intel·ligències, motriu, emocional i mental, que conformen la persona. Les emocions són les que permeten l'encontre entre tots els dualismes possibles, entre altres, cos-ment, biologia-cultura o individu-món social, així com la seua unificació.

Understanding the two-component sensing System of virulent bacteria

Report for the scientific sojourn carried out at the l’ Institute for Computational Molecular Science of the Temple University, United States, from 2010 to 2012. Two-component systems (TCS) are used by pathogenic bacteria to sense the environment within a host and activate mechanisms related to virulence and antimicrobial resistance. A prototypical example is the PhoQ/PhoP system, which is the major regulator of virulence in Salmonella. Hence, PhoQ is an attractive target for the design of new antibiotics against foodborne diseases. Inhibition of the PhoQ-mediated bacterial virulence does not result in growth inhibition, presenting less selective pressure for the generation of antibiotic resistance. Moreover, PhoQ is a histidine kinase (HK) and it is absent in animals. Nevertheless, the design of satisfactory HK inhibitors has been proven to be a challenge. To compete with the intracellular ATP concentrations, the affinity of a HK inhibidor must be in the micromolar-nanomolar range, whereas the current lead compounds have at best millimolar affinities. Moreover, the drug selectivity depends on the conformation of a highly variable loop, referred to as the “ATP-lid, which is difficult to study by X-Ray crystallography due to its flexibility. I have investigated the binding of different HK inhibitors to PhoQ. In particular, all-atom molecular dynamics simulations have been combined with enhanced sampling techniques in order to provide structural and dynamic information of the conformation of the ATP-lid. Transient interactions between these drugs and the ATP-lid have been identified and the free energy of the different binding modes has been estimated. The results obtained pinpoint the importance of protein flexibility in the HK-inhibitor binding, and constitute a first step in developing more potent and selective drugs. The computational resources of the hosting institution as well as the experience of the members of the group in drug binding and free energy methods have been crucial to carry out this work.

Estudi de la regulació del procés de formació de la fusta per a l’obtenció de biomassa i biocombustibles: el paper clau de dos factors de transcripció MYB amb funcions antagòniques

Estudi realitzat a partir d’una estada al Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales - Université Toulouse III, entre 2010 i 2012. Durant l’estada s’han pogut complir els principals objectius del projecte de recerca sobre la regulació de la formació de les parets secundàries en un arbre d’importància econòmica, l’eucaliptus. S’ha caracteritzat dos factors de transcripció, EgMYB1 i 2, comparant el seu patró d’expressió espaciotemporal a nivell cel•lular i estudiant l’efecte fenotípic de la pèrdua de funció d’aquests gens. A més, s’ha construït una llibreria de xilema d’eucaliptus adaptada a la tècnica dels dos híbrids i s’ha descobert alguns del partners proteics d’EgMYB1 i 2, els quals estic actualment validant per mètodes alternatius. Augmentant els objectius inicials de la sol•licitud, he aprofitat la recent publicació del genoma de l’Eucalyptus grandis per identificar i caracteritzar el patró d’expressió de vàries famílies gèniques.

Estudi del paper de la JMJD3 en la progressió tumoral induïda per TGFB

La demetilasa d’histones JMJD3 (Jumonji domain containing protein 3), és un enzim capaç de de demetilar específicament la lisina 27 a la histona 3 (H3K27), eliminant així una marca epigenètica relacionada amb la repressió transcripcional. Recentment s’ha descrit que està implicada en el manteniment de la pluripotència de les cèl•lules mare embrionàries (ESCs). A més, també s’ha demostrat el seu paper en la regulació de processos fisiològics d’inflamació, de reprogramació epigenètica i de diferenciació, així com en la progressió del càncer de colon. En aquesta línia, resultats previs del grup han demostrat que l’expressió de JMJD3 està regulada per TGFB, en línies cel•lulars derivades de glioma. Tenint en compte aquests antecedents, l’objectiu principal d’aquest projecte ha estat estudiar el paper principal de la JMJD3 en la regulació epigenètica de la progressió tumoral induïda per TGFB. Els nostres resultats demostren que l’expressió de JMD3 en cèl•lules A549, derivades d’un adenocarcinoma de pulmó, es veu fortament induïda després d’un tractament amb TGFB. Aquest augment es produeix ràpidament i es manté almenys 48 hores, temps en el que té lloc la transició epitelio-mesenquimal (EMT). Per tal d’estudiar el paper de la JMD3 en aquest procés de transdiferenciació, vam generar línies cel•lulars estables mitjançant la infecció amb vectors lentivirals que expressaven shRNAs específics contra la seva seqüència. El knockdown de JMJD3 va bloquejar significativament l’expressió de marcadors mesenquimals, tant a nivell RNA com de proteïna en presència de TGFB. Aquests resultats suggereixen que la demetilasa d’histones JMJD3 té un paper clau en la regulació de la EMT induïda per TGFB.

Antibiotic cement nail for the treatment of posttraumatic intramedullary infections of the tibia: Midterm results in 10 cases.

INTRODUCTION: This is a single, level 1 trauma centre, prospective consecutive patient series with intramedullary infection in the presence of unstable tibial fracture treated using the Kirschner wire-reinforced, antibiotic cement nail. PATIENTS AND METHODS: A total of 10 consecutive patients (eight males and two females) with a mean age of 42 years (range, 20-59) suffering from infection after intramedullary nailing for tibial fracture, admitted during a period of 4 years, were included. An antibiotic cement-coated nail, handmade at the time of surgery, was implanted in all patients. This was followed by a standardised 6-week treatment protocol, extraction of the nail and definitive fixation. RESULTS: At 6 years of follow-up, infection eradication and bony union were possible in all of the patients. No further infection treatment was necessary; however, all of our patients underwent additional procedures (mean: four additional procedures per patient) for cosmetic or other non-infectious reasons (bone grafting, muscle flaps, etc.). CONCLUSIONS: The antibiotic cement-coated nail seems to be an effective treatment for intramedullary infections of the fractured tibia.

Body fluid and tissue analysis using filter paper sampling support prior to LC-MS/MS: application to fatal overdose with colchicine

Because of the various matrices available for forensic investigations, the development of versatile analytical approaches allowing the simultaneous determination of drugs is challenging. The aim of this work was to assess a liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) platform allowing the rapid quantification of colchicine in body fluids and tissues collected in the context of a fatal overdose. For this purpose, filter paper was used as a sampling support and was associated with an automated 96-well plate extraction performed by the LC autosampler itself. The developed method features a 7-min total run time including automated filter paper extraction (2 min) and chromatographic separation (5 min). The sample preparation was reduced to a minimum regardless of the matrix analyzed. This platform was fully validated for dried blood spots (DBS) in the toxic concentration range of colchicine. The DBS calibration curve was applied successfully to quantification in all other matrices (body fluids and tissues) except for bile, where an excessive matrix effect was found. The distribution of colchicine for a fatal overdose case was reported as follows: peripheral blood, 29 ng/ml; urine, 94 ng/ml; vitreous humour and cerebrospinal fluid, < 5 ng/ml; pericardial fluid, 14 ng/ml; brain, < 5 pg/mg; heart, 121 pg/mg; kidney, 245 pg/mg; and liver, 143 pg/mg. Although filter paper is usually employed for DBS, we report here the extension of this alternative sampling support to the analysis of other body fluids and tissues. The developed platform represents a rapid and versatile approach for drug determination in multiple forensic media.

Communication skills training in oncology: a position paper based on a consensus meeting among European experts in 2009.

BACKGROUND: Communication in cancer care has become a major topic of interest. Since there is evidence that ineffective communication affects both patients and oncology clinicians (physicians and nurses), so-called communication skills trainings (CSTs) have been developed over the last decade. While these trainings have been demonstrated to be effective, there is an important heterogeneity with regard to implementation and with regard to evidence of different aspects of CST. METHODS: In order to review and discuss the scientific literature on CST in oncology and to formulate recommendations, the Swiss Cancer League has organised a consensus meeting with European opinion leaders and experts in the field of CST, as well as oncology clinicians, representatives of oncology societies and patient organisations. On the basis of a systematic review and a meta-analysis, recommendations have been developed and agreed upon. RESULTS: Recommendations address (i) the setting, objectives and participants of CST, (ii) its content and pedagogic tools, (iii) organisational aspects, (iv) outcome and (v) future directions and research. CONCLUSION: This consensus meeting, on the basis of European expert opinions and a systematic review and meta-analysis, defines key elements for the current provision and future development and evaluation of CST in oncology.

Little effect of seasonal constraints on population genetic structure in eusocial paper wasps.

Climate has long been suggested to affect population genetic structures of eusocial insect societies. For instance, Hamilton [Journal of Theoretical Biology7 (1964) 17] discusses whether temperate and tropical eusocial insects may show differences in population-level genetic structure and viscosity, and how this might relate to differences in the degree of synchrony in their life cycles or modes of nest founding. Despite the importance of Hamilton's 1964 papers, this specific idea has not been tested in actual populations of wasps, probably due to the paucity of studies on tropical species. Here, we compare colony and population genetic structures in two species of primitively eusocial paper wasps with contrasting ecologies: the tropical species Polistes canadensis and the temperate species P. dominulus. Our results provide important clarifications of Hamilton's discussion. Specifically, we show that the genetic structures of the temperate and tropical species were very similar, indicating that seasonality does not greatly affect population viscosity or inbreeding. For both species, the high genetic differentiation between nests suggests strong selection at the nest level to live with relatives, whereas low population viscosity and low genetic differentiation between nest aggregations might reflect balancing selection to disperse, avoiding competition with relatives. Overall, our study suggests no prevalence of seasonal constraints of the life cycle in affecting the population genetic structure of eusocial paper wasps. These conclusions are likely to apply also to other primitively eusocial insects, such as halictine bees. They also highlight how selection for a kin structure that promotes altruism can override potential effects of ecology in eusocial insects.

Del ciberespai al paper

El món editorial més tradicional tendeix cada vegada més a apostar per medis electrònics com a base per a la difusió del seu contingut o com a complement de l’edició en paper. És pràcticament un pas natural que han fet o estant fent la majoriade publicacions en paper.El creixement d’Internet, tant en nombre d’usuaris com en inversió publicitària, juntament amb la poca necessitat d’inversió per a la creació de revistes online, ha propiciat el sorgiment de revistes exclusivament virtuals que han esdevingut les mésimportants d’Internet, per sobre de publicacions virtuals de revistes amb edició en paper.Però tot i que Internet es el futur, el medi en paper és i serà un mercat molt important a mitjà termini. El mercat publicitari es paga força millor que en les pàgines web, on els models s’esgoten molt ràpidament i s’ha d’innovar constantment per tal de mantenir el click-rate dels usuaris. L’atenció que l’usuari presta a la publicitat en paper és molt més alta que en les pàgines web i menys molesta per l’usuari.El nostre treball es centrarà en fer el pas contrari a l’habitual, és a dir, en convertir una revista exclusivament virtual en una revista que publiqui també en paper. Analitzarem els possibles beneficis d’aquest pas així com els costos que suposaria adaptar un medi virtual al paper.El repte estarà en investigar quin és el model de revista idoni per completar el pas del medi virtual al paper, aconseguint maximitzar els beneficis.

Nevera, mp3, mòbil... quin és el seu paper actual?

Des dels seus inicis, l’ésser humà ha tingut una sèrie de necessitats. Ha requerit d’aliment per sobreviure, d’un sostre on refugiar-se, de roba per vestirse, etc. Conforme han passat els anys, ha anat generant tècniques per a millorar la seva estància al planeta, des del descobriment del foc per escalfarse fins al desenvolupament de màquines complexes. És per això, que ha anat introduint invents a la seva vida que han cobert les necessitats sorgides al llarg del temps.El treball que desenvolupem a continuació es centra en un seguit d’aparells que han sorgit al llarg del segle XX i que han revolucionat la nostra vida. Concretament, els set aparells escollits com a objecte del nostre estudi són: la nevera, la rentadora, l’automòbil, la televisió, el reproductor d’àudio portàtil, el telèfon mòbil i l’ordinador.L’aparició d’electrodomèstics, com la nevera o la rentadora, no només ens ha permès dedicar menys esforç a les tasques domèstiques, sinó també estalviarnos temps a l’hora de realitzar-les. Aquest fet, que ara potser ni tan sols considerem, va ser del tot determinant a l’època que van sorgir, ja que va permetre alliberar mà d’obra domèstica promovent la inserció al mercat laboral d’un sector de la població com el del sexe femení.Per la seva banda, la introducció de l’automòbil també ha estat un gran avenç. Aquest, ha revolucionat la manera de desplaçar-nos, proporcionant-nos una autonomia fins aleshores impensable.Aquest mateix patró segueixen la resta d’altres aparells escollits; tots van provocar un canvi profund a la societat amb la seva aparició i, encara avui, segueixen mantenint un paper destacat al nostre dia a dia. La importància que tenen a les nostres vides ha estat la motivació que ens ha conduït a dur a terme un treball que els tingués com a protagonistes.El nostre treball consta de dues parts:A la primera, de caràcter teòric, ens hem proposat estudiar la història d’aquests aparells, és a dir, hem volgut donar resposta a una sèrie de preguntes com: quan van aparèixer, quins van ser els seus creadors i quines transformacions han anat experimentant al llarg del temps, entre d’altres.A la segona part, més pràctica, hem realitzat un treball de camp (les característiques del qual expliquem detalladament a l’apartat següent) amb l’objectiu d’analitzar la rellevància que tenen aquests aparells a la societat actual. És a dir, hem volgut saber quins aparells, dels escollits, són els més valorats per la població avui dia i quins són els que menys. Pensem que l’ús que els enquestats fan d’aquests béns serà un criteri clau a l’hora de puntuarlos, encara que no l’únic. Hem realitzat aquest anàlisi diferenciant els individus per franges d’edat i sexes. A més, també hem treballat altres qüestions comserien, entre d’altres, si el seu ús s’entén com una necessitat o va encaminat cap a l’oci; quant temps triguen els usuaris a renovar-los, quin és el motiu, etc. En relació amb aquesta segona part, hem formulat un seguit d’hipòtesis amb l’objectiu de contrastar-les posteriorment amb els resultats de les enquestes.Les hipòtesis són:- Avui dia, els individus donen més importància a aquells aparells que són més moderns, (entenent com a tals, aquells que han sorgit més recentment i estan lligats a les noves tecnologies i la innovació contínua), com poden ser l’ordinador i el telèfon mòbil, que els electrodomèstics més tradicionals com serien la nevera o la rentadora. Tot això, a més, considerant que pel que fa als primers, entenem que part del seu ús està destinat a l’oci; mentre que pels segons el seu ús està motivat per una necessitat, com seria l’alimentació en el cas de la nevera.- Pel que fa a les franges d’edat, les valoracions mostraran diferències importants en els diversos aparells. Entre la franja més jove (de 16 a 25 anys) i la de més edat (més de 60 anys), les valoracions seran més extremes, gairebé oposades.- Pel que fa als dos sexes, les valoracions que donin als aparells seran molt semblants.Hem considerat que per a dur a terme un bon anàlisi, el més adequat és presentar la informació de cada aparell per separat. És per això que cada bé constitueix un apartat independent que consta d’una primera part referent a la seva història, i una segona referent als resultats obtinguts de les enquestes.A continuació, hem procedit a ajuntar els resultats extrets dels diferents aparells i a presentant-los de forma conjunta per a comparar-los. Així, hem pogut contrastar les nostres hipòtesis inicials i hem raonat possibles causes que justificarien dels resultats obtinguts.

Procalcitonin for reduced antibiotic exposure in ventilator-associated pneumonia: a randomised study.

In patients with ventilator-associated pneumonia (VAP), guidelines recommend antibiotic therapy adjustment according to microbiology results after 72 h. Circulating procalcitonin levels may provide evidence that facilitates the reduction of antibiotic therapy. In a multicentre, randomised, controlled trial, 101 patients with VAP were assigned to an antibiotic discontinuation strategy according to guidelines (control group) or to serum procalcitonin concentrations (procalcitonin group) with an antibiotic regimen selected by the treating physician. The primary end-point was antibiotic-free days alive assessed 28 days after VAP onset and analysed on an intent-to-treat basis. Procalcitonin determination significantly increased the number of antibiotic free-days alive 28 days after VAP onset (13 (2-21) days versus 9.5 (1.5-17) days). This translated into a reduction in the overall duration of antibiotic therapy of 27% in the procalcitonin group (p = 0.038). After adjustment for age, microbiology and centre effect, the rate of antibiotic discontinuation on day 28 remained higher in the procalcitonin group compared with patients treated according to guidelines (hazard rate 1.6, 95% CI 1.02-2.71). The number of mechanical ventilation-free days alive, intensive care unit-free days alive, length of hospital stay and mortality rate on day 28 for the two groups were similar. Serum procalcitonin reduces antibiotic therapy exposure in patients with ventilator associated pneumonia.

Antibiotic treatment of experimental endocarditis due to methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis.

The natural history and treatment of experimental endocarditis due to heterogeneous and homogeneous methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis was investigated. Amoxicillin/clavulanate or vancomycin were administered for 3 days via a computerized pump to mimic human drug kinetics in animals. After challenge with the minimum inoculum producing 90% of infections (ID90), bacteria in the vegetations grew logarithmically for 16 h. Then, bacterial densities stabilized (at approximately 10(8) cfu/g) and growth rates sharply declined. Both regimens cured &gt; or = 60% of endocarditis (due to heterogeneous or homogeneous bacteria) when started 12-16 h after infection, although the bacterial densities in the vegetations had increased by 20 times in between. In contrast, treatment started after 24 h failed in most animals, while bacterial densities had not increased any more. Thus, while both regimens were equivalent, the therapeutic outcome was best predicted by growth rates in the vegetations, not by bacterial densities. These observations highlight the importance of phenotypic tolerance developing in vivo.

Antibiothérapie empirique lors de neutropénie fébrile [Empirical antibiotic therapy for febrile neutropenia]

Immediate broad-spectrum empirical antibacterial therapy is the key of management in febrile neutropenic patients. These patients can be stratified according to the risk of complications with the clinical MASCC score. Patients at low risk of complications can be efficaciously treated with oral antibiotics (e.g. fluoroquinolone and beta-lactam), provided that compliance and drug absorption are adequate. Early discharge is possible if clinical, logistic, and social criteria are fulfilled. Intravenous antibiotic therapy with broad-spectrum beta-lactam antibiotics in the hospital remains the standard in high-risk patients. The empirical addition of an aminoglycoside and/or a glycopeptide is recommended if the local incidence of infections due to beta-lactam resistant pathogens is high or in critically ill septic patients.