Genetic analysis of the porcine group B rotavirus NSP2 gene from wild-type Brazilian strains

Group B rotaviruses (RV-B) were first identified in piglet feces, being later associated with diarrhea in humans, cattle, lambs, and rats. In human beings, the virus was only described in China, India, and Bangladesh, especially infecting adults. Only a few studies concerning molecular analysis of the RV-B NSP2 gene have been conducted, and porcine RV-B has not been characterized. In the present study, three porcine wild-type RV-B strains from piglet stool samples collected from Brazilian pig herds were used for analysis. PAGE results were inconclusive for those samples, but specific amplicons of the RV-B NSP2 gene (segment 8) were obtained in a semi-nested PCR assay. The three porcine RV-B strains showed the highest nucleotide identity with the human WH1 strain and the alignments with other published sequences resulted in three groups of strains divided according to host species. The group of human strains showed 92.4 to 99.7% nucleotide identity while the porcine strains of the Brazilian RV-B group showed 90.4 to 91.8% identity to each other. The identity of the Brazilian porcine RV-B strains with outer sequences consisting of group A and C rotaviruses was only 35.3 to 38.8%. A dendrogram was also constructed to group the strains into clusters according to host species: human, rat, and a distinct third cluster consisting exclusively of the Brazilian porcine RV-B strains. This is the first study of the porcine RV-B NSP2 gene that contributes to the partial characterization of this virus and demonstrates the relationship among RV-B strains from different host species.

Phenolic compounds and antioxidant activity of hydroalcoholic extracts of wild and cultivated murtilla (Ugni molinae Turcz.)

Over the last decade a considerable increase in the number of studies addressing the use of antioxidants from natural sources has led to the identification and understanding of the potential mechanisms of biologically active components. This results from the fact that they can be used to replace synthetic antioxidants commonly used in food. Murtilla (Ugni molinae Turcz) is a native berry grown in Chile, and in the present study, the phenolic composition and antioxidant activity of its fruits were studied. Hydroalcoholic extracts of dehydrated fruits from two genotypes of murtilla (Ugni molinae Turcz.) were produced. Extracts of wild murtilla and 14-4 genotype fruits had 19.35 and 40.28mg GAE/g for Total Phenolic Compounds, 76.48, and 134.35μmol TEAC/g for DPPH, and 157.04 and 293.99 μmol TEAC/g for ABTS, respectively. Components such as quercetin, epicatechin, and gallic, benzoic and hydrocaffeic acids were identified by CG/MS analysis. All of them showed antioxidant activity. Therefore, it is possible to say that the hydroalcoholic extracts of murtilla have antioxidant potential to be used in lipidic food.

Wild Civility: Cultivating the Foundations of Social Justice through Participation in a Wilderness Program

This heuristic inquiry examined if the foundations of social justice knowledge and beliefs were developed as a result of participation in a wilderness program and what knowledge and beliefs were developed. There were six participants in this study. Data collection involved participants completing pre- and post- program interviews and daily journals during the program. Through inductive analysis six themes emerged. Three of these were related to the development of certain foundations of social justice: (a) experienced conflict development and resolution; (b) experienced relationship change and development; and (c) shift from “me” to “we” mentality. The remaining three themes were included as additional findings: (a) experienced personal change and development; (b) identification of specific factors of the program responsible for changes; and (c) bringing learning back to everyday life. Results highlight wilderness program impacts on participants’ social justice knowledges and beliefs and inform wilderness program providers and social justice educators.

Canadianness is Wilderness? Violent Love Relationships with ‘Wild’ Bodies

This thesis reveals contradictions that Canadians experience with groups attached to western construction of wilderness namely Indigenous people and wildlife. My study analyzes how the discourse of Canadian wilderness identity is played out in Algonquin Provincial Park and Bruce Peninsula National Park in comparison to non-nature/urban spaces (Greater Toronto Area). My investigation employs a critical discourse analysis and participant observation. I undertake three main tasks: 1) I describe how violent love is a dominant discourse at the Parks, 2) I examine evidence of animals and Indigenous people being produced relationally in the Parks, and 3) I analyze how relationships are spatially organized. My research reveals that the Parks conceal practices of violence that are central to the intersections of speciesism and colonialism. I demonstrate how violent love operates across a continuum that is influenced by spatial belonging and distance. This research is a contribution to the production of non-speciesist knowledge.

ASSESSING THE PERFORMANCE OF EMERGING MARKET MUTUAL FUNDS IN CANADA

Emerging markets have received wide attention from investors around the globe because of their return potential and risk diversification. This research examines the selection and timing performance of Canadian mutual funds which invest in fixed-income and equity securities in emerging markets. We use (un)conditional two- and five-factor benchmark models that accommodate the dynamics of returns in emerging markets. We also adopt the cross-sectional bootstrap methodology to distinguish between ‘skill’ and ‘luck’ for individual funds. All the tests are conducted using a comprehensive data set of bond and equity emerging funds over the period of 1989-2011. The risk-adjusted measures of performance are estimated using the least squares method with the Newey-West adjustment for standard errors that are robust to conditional heteroskedasticity and autocorrelation. The performance statistics of the emerging funds before (after) management-related costs are insignificantly positive (significantly negative). They are sensitive to the chosen benchmark model and conditional information improves selection performance. The timing statistics are largely insignificant throughout the sample period and are not sensitive to the benchmark model. Evidence of timing and selecting abilities is obtained in a small number of funds which is not sensitive to the fees structure. We also find evidence that a majority of individual funds provide zero (very few provide positive) abnormal return before fees and a significantly negative return after fees. At the negative end of the tail of performance distribution, our resampling tests fail to reject the role of bad luck in the poor performance of funds and we conclude that most of them are merely ‘unlucky’.

Returning from the Wild: Exploring Participant's Experiences of Re-entry from Extended Wilderness Trips

The experience of a strong sense of community developed while participating in extended wilderness expeditions is one of the most significant and meaningful experiences associated with taking part in this form of outdoor recreation. The experience of returning to a home community from an extended wilderness expedition is explored through the impacts associated with psychological sense of community (McMillian & Chavis, 1986; McMillian, 1996). A phenomenological approach was used to investigate the re-entry experiences of six individuals through the use of semi-structured interviews. Twelve main themes and seventeen subthemes emerged within the findings and illustrate a lack of preparation for the difficulties associated with re-entry, negative impacts associated with the experience of sense of community, and problems transferring aspects of a wilderness community into participant’s post-expedition lives.

Prévisibilité de la prime de risque sur les obligations: Inférence de Bootstrap.

Rapport de recherche

L'utilisation du bootstrap pour tester la stationnarité des taux de change réels avec un modèle non linéaire. L'évidence pour le Canada.

Rapport de recherche

Le bootstrap pour mesurer la volatilité réalisée.

Rapport de recherche

Identification, Weak Instruments and Statistical Inference in Econometrics

We discuss statistical inference problems associated with identification and testability in econometrics, and we emphasize the common nature of the two issues. After reviewing the relevant statistical notions, we consider in turn inference in nonparametric models and recent developments on weakly identified models (or weak instruments). We point out that many hypotheses, for which test procedures are commonly proposed, are not testable at all, while some frequently used econometric methods are fundamentally inappropriate for the models considered. Such situations lead to ill-defined statistical problems and are often associated with a misguided use of asymptotic distributional results. Concerning nonparametric hypotheses, we discuss three basic problems for which such difficulties occur: (1) testing a mean (or a moment) under (too) weak distributional assumptions; (2) inference under heteroskedasticity of unknown form; (3) inference in dynamic models with an unlimited number of parameters. Concerning weakly identified models, we stress that valid inference should be based on proper pivotal functions —a condition not satisfied by standard Wald-type methods based on standard errors — and we discuss recent developments in this field, mainly from the viewpoint of building valid tests and confidence sets. The techniques discussed include alternative proposed statistics, bounds, projection, split-sampling, conditioning, Monte Carlo tests. The possibility of deriving a finite-sample distributional theory, robustness to the presence of weak instruments, and robustness to the specification of a model for endogenous explanatory variables are stressed as important criteria assessing alternative procedures.

La prévisibilité des rendements des actifs financiers : une analyse de Bootstrap.

Rapport de recherche

Expression profile of plasticity-related mRNAs in the cortex and hippocampus of young and aged rats and of 3xTg and wild type mice

De récents travaux ont mis en évidence que des dysfonctionnements dans l’expression de gènes impliqués dans la plasticité synaptique contribuent aux déclins cognitifs qu’on observe chez les gens âgés et à la progression de la maladie d’Alzheimer. Notre étude avait comme objectif d’étudier le profil d’expression d’ARNm spécifiques impliqués dans la plasticité synaptique chez des rats jeunes et âgés et chez des souris transgéniques 3xTg et WT. Des expériences en qRT-PCR ont été effectuées dans des extraits de cortex et d’hippocampe de rats jeunes et âgés et de souris 3xTg et WT, respectivement. Les résultats ont démontré une augmentation significative de l’expression d’ARNm MAP1B, Stau2, BDNF, CREB et AGO2 principalement dans l’hippocampe (régions CA1-CA3) des souris 3xTg comparé aux souris WT. Une diminution significative a également été observée pour l’ARNm αCaMKII dans le cortex des souris 3xTg comparé aux souris WT. Contrairement à ces observations, aucun changement n’a été observé pour l’expression de gènes impliqués dans la plasticité synaptique chez les rats âgés comparé aux rats jeunes. Ces résultats démontrent qu’un dysfonctionnement existe réellement au début de la maladie d’Alzheimer dans l’expression de gènes spécifiques impliqués dans la plasticité synaptique et contribue potentiellement à la progression de la maladie en engendrant un déséquilibre entre la LTP et la LTD. De plus, les différences d’expressions sont particulièrement observées dans l’hippocampe (régions CA1-CA3) ce qui est consistant avec les études sur la progression de la maladie d’Alzheimer puisqu’il est connu que la région CA1 de l’hippocampe est la plus vulnérable à l’apparition de la maladie. Ces résultats permettent une meilleure compréhension des événements moléculaires qui deviennent dérégulés à l’apparition de la maladie d’Alzheimer.

Bootstrap for panel data models with an application to the evaluation of public policies

Le but de cette thèse est d étendre la théorie du bootstrap aux modèles de données de panel. Les données de panel s obtiennent en observant plusieurs unités statistiques sur plusieurs périodes de temps. Leur double dimension individuelle et temporelle permet de contrôler l 'hétérogénéité non observable entre individus et entre les périodes de temps et donc de faire des études plus riches que les séries chronologiques ou les données en coupe instantanée. L 'avantage du bootstrap est de permettre d obtenir une inférence plus précise que celle avec la théorie asymptotique classique ou une inférence impossible en cas de paramètre de nuisance. La méthode consiste à tirer des échantillons aléatoires qui ressemblent le plus possible à l échantillon d analyse. L 'objet statitstique d intérêt est estimé sur chacun de ses échantillons aléatoires et on utilise l ensemble des valeurs estimées pour faire de l inférence. Il existe dans la littérature certaines application du bootstrap aux données de panels sans justi cation théorique rigoureuse ou sous de fortes hypothèses. Cette thèse propose une méthode de bootstrap plus appropriée aux données de panels. Les trois chapitres analysent sa validité et son application. Le premier chapitre postule un modèle simple avec un seul paramètre et s 'attaque aux propriétés théoriques de l estimateur de la moyenne. Nous montrons que le double rééchantillonnage que nous proposons et qui tient compte à la fois de la dimension individuelle et la dimension temporelle est valide avec ces modèles. Le rééchantillonnage seulement dans la dimension individuelle n est pas valide en présence d hétérogénéité temporelle. Le ré-échantillonnage dans la dimension temporelle n est pas valide en présence d'hétérogénéité individuelle. Le deuxième chapitre étend le précédent au modèle panel de régression. linéaire. Trois types de régresseurs sont considérés : les caractéristiques individuelles, les caractéristiques temporelles et les régresseurs qui évoluent dans le temps et par individu. En utilisant un modèle à erreurs composées doubles, l'estimateur des moindres carrés ordinaires et la méthode de bootstrap des résidus, on montre que le rééchantillonnage dans la seule dimension individuelle est valide pour l'inférence sur les coe¢ cients associés aux régresseurs qui changent uniquement par individu. Le rééchantillonnage dans la dimen- sion temporelle est valide seulement pour le sous vecteur des paramètres associés aux régresseurs qui évoluent uniquement dans le temps. Le double rééchantillonnage est quand à lui est valide pour faire de l inférence pour tout le vecteur des paramètres. Le troisième chapitre re-examine l exercice de l estimateur de différence en di¤érence de Bertrand, Duflo et Mullainathan (2004). Cet estimateur est couramment utilisé dans la littérature pour évaluer l impact de certaines poli- tiques publiques. L exercice empirique utilise des données de panel provenant du Current Population Survey sur le salaire des femmes dans les 50 états des Etats-Unis d Amérique de 1979 à 1999. Des variables de pseudo-interventions publiques au niveau des états sont générées et on s attend à ce que les tests arrivent à la conclusion qu il n y a pas d e¤et de ces politiques placebos sur le salaire des femmes. Bertrand, Du o et Mullainathan (2004) montre que la non-prise en compte de l hétérogénéité et de la dépendance temporelle entraîne d importantes distorsions de niveau de test lorsqu'on évalue l'impact de politiques publiques en utilisant des données de panel. Une des solutions préconisées est d utiliser la méthode de bootstrap. La méthode de double ré-échantillonnage développée dans cette thèse permet de corriger le problème de niveau de test et donc d'évaluer correctement l'impact des politiques publiques.