Diagnóstico molecular de cancros hereditários por sequenciação de nova geração: cancro da mama e cancro colorretal

O cancro da mama e o cancro colorretal constituem duas das principais causas de morte a nível mundial. Entre 5 a 10% destes casos estão associados a variantes germinais/hereditárias em genes de suscetibilidade para cancro. O objetivo deste trabalho consistiu em validar a utilização da sequenciação de nova geração (NGS) para identificar variantes previamente detetadas pelo método de Sanger em diversos genes de suscetibilidade para cancro da mama e colorretal. Foram sequenciadas por NGS 64 amostras de DNA de utentes com suspeita clínica de predisposição hereditária para cancro da mama ou colorretal, utilizando o painel de sequenciação TruSight Cancer e a plataforma MiSeq (Illumina). Estas amostras tinham sido previamente sequenciadas pelo método de Sanger para os genes BRCA1, BRCA2, TP53, APC, MUTYH, MLH1, MSH2 e STK11. A análise bioinformática dos resultados foi realizada com os softwares MiSeq Reporter, VariantStudio, Isaac Enrichment (Illumina) e Integrative Genomics Viewer (Broad Institute). A NGS demonstrou elevada sensibilidade e especificidade analíticas para a deteção de variantes de sequência em 8 genes de suscetibilidade para cancro colorretal e da mama, uma vez que permitiu identificar a totalidade das 412 variantes (93 únicas, incluindo 27 variantes patogénicas) previamente detetadas pelo método de Sanger. A utilização de painéis de sequenciação de genes de predisposição para cancro por NGS vem possibilitar um diagnóstico molecular mais abrangente, rápido e custo-eficiente, relativamente às metodologias convencionais.

Prevalência de asma e sintomas asmáticos em escolares de 13 e 14 anos de idade

OBJETIVO: Antes do uso do questionário padronizado ISAAC (International Study of Asthma and Allergies in Childhood) em inquéritos epidemiológicos, pouco se conhecia sobre a ocorrência comparativa de asma no mundo, dados os diferentes métodos empregados. No Brasil, outros estudos utilizaram o questionário ISAAC em regiões urbanas. Realizou-se estudo utilizando esse questionário nas zonas urbana e rural com o objetivo de estimar a prevalência de asma em escolares. MÉTODOS: Estudo transversal com o questionário escrito ISAAC, acrescido de perguntas sobre exposições de interesse, auto-aplicado em 3.770 escolares de 13 e 14 anos de idade do município de Montes Claros (MG) selecionados por sorteio. RESULTADOS: A prevalência de "sibilos no último ano" foi 15,8%, e de "asma ou bronquite alguma vez na vida" 23,8%, sem diferença significativa entre sexos. Houve diferença estatística (p<0,05) entre sexos (feminino e masculino, respectivamente) em "sibilos alguma vez na vida" (37,8% e 33,6%), "sono alterado devido à crise de sibilos" (13,7% e 9,5%) e "tosse seca noturna sem infecção respiratória" (36,6% e 28,7%). Houve associação nociva entre "sibilos no último ano", "contato com animais domésticos" (OR=1,27; IC 95%: 1,03-1,56) e "história familiar de asma" (OR=1,79; IC 95%: 1,50-2,14), e associação protetora entre "sibilos no último ano" e "localização rural da escola" (OR=0,63; IC 95%: 0,44-0,91), mas não houve associação com sexo, idade, domínio escolar e tabagismo passivo. CONCLUSÕES: A prevalência de asma na amostra estudada foi elevada, com alguns sintomas predominantes no sexo feminino. A ocorrência de "sibilos no último ano" mostrou-se associada à história familiar, contato com animais domésticos e localização urbana das escolas.

Doença periodontal materna como fator associado ao baixo peso ao nascer

OBJETIVO: Estudos recentes têm apresentado evidências de que a doença periodontal em gestantes pode ser um dos determinantes do baixo peso ao nascer. Realizou-se estudo para verificar a existência de associação entre doença periodontal materna e baixo peso ao nascer. MÉTODOS: Estudo do tipo caso-controle com 302 mulheres, sendo 102 mães de nascidos vivos de baixo peso (grupo caso) e 200 mães de nascidos vivos com peso normal (grupo controle). A existência de associação entre doença periodontal e baixo peso ao nascer foi avaliada mediante modelo multivariado de regressão logística, considerando outros fatores de risco para o baixo peso. RESULTADOS: Ambos os grupos de mães eram comparáveis no que se refere a idade, altura, peso pré-gestacional, tabagismo, alcoolismo, doenças prévias, estado civil, situação socioeconômica, número de escovações e uso de fio dental, número de refeições diárias, e visitas ao dentista. A doença periodontal foi diagnosticada em 57,8% das mães do grupo caso e 39,0% do grupo controle. A análise de regressão logística indicou associação positiva entre doença periodontal e baixo peso ao nascer (ORbruto=2,15; IC 95%: 1,32-3,48), especialmente entre as mães com escolaridade menor ou igual a quatro anos (ORajustada=3,98; IC 95%: 1,58-10,10). CONCLUSÕES: A doença periodontal é um possível fator de risco para o baixo peso ao nascer.

Prevalência de chiado no peito em adultos da coorte de nascimentos de 1982, Pelotas, RS

OBJETIVO: Estimar a prevalência de chiado no peito em adultos jovens, explorando o efeito de algumas variáveis sobre a ocorrência desta morbidade. MÉTODOS: Estudo prospectivo de coorte dos nascidos em 1982 na cidade de Pelotas (RS). Foram localizados 4.297 (77,4%) dos membros da coorte em 2004-5, cujos dados foram coletados por meio de entrevista, utilizando o questionário ISAAC (International Study of Asthma and Allergies in Childhood Steering Committee). A associação entre o desfecho "ocorrência de chiado no peito nos 12 meses anteriores à entrevista" e variáveis socioeconômicas, demográficas e características ao nascimento foi calculada por análise multivariável utilizando regressão de Poisson. RESULTADOS: A prevalência de chiado no último ano foi de 24,9%. Entre aqueles que relataram chiado, 54,6% referiram dificuldade para dormir e 12,9% para falar devido ao chiado. A prevalência de chiado no peito foi significativamente maior entre as mulheres, mantendo associação na análise ajustada com cor de pele não branca, com história familiar de asma e nível socioeconômico baixo. Entre os homens, não houve associação significativa na análise ajustada para cor de pele e renda familiar ao nascimento; história familiar de asma e pobreza durante a vida mostraram associação significativa com chiado no peito. Para ambos os sexos, não houve associação com as variáveis peso ao nascer e duração da amamentação. CONCLUSÕES: A prevalência de chiado no peito foi alta e as pessoas com renda familiar baixa ao nascer tiveram maior risco de chiado no peito no último ano.

O currículo específico individual práticas de construção e Implementação: um estudo exploratório no segundo ciclo

Dissertação apresentada à Escola Superior de Educação de Lisboa para obtenção do grau de Mestre em Educação - Especialização em Educação Especial

The 27th British liquid crystal society annual meeting 2013, Cambridge

Attending the British Liquid Crystal Society’s (BLCS) Annual Meeting was a formative experience in my days as a PhD student, starting way back in the 1990s. At that time, this involved travelling to (to me) exotic parts of the United Kingdom, such as Reading, Oxford or Manchester, away from Southampton where I was based. Some postdoctoral years in a different country followed, and three BLCS Meetings were missed, until in 1997 and 1998, I was able to attend again, in Southampton and Leeds, respectively. Not much had changed from my student days, the size and the format were still about the same, many of the leading characters were still around, and the closing talk would still be given by John Lydon. Well, at some point, I got myself a proper academic job on the Continent and stopped attending BLCS Annual Meetings altogether. The fond memories of my youth started to fade. Were the Meetings still on? It seemed so, as old friends and acquaintances would occasionally recount attending them, and even winning prizes at them. But, it all seemed rather remote now. Until, that is, it came to pass that the 27th BLCS Meeting would be held in Selwyn College, Cambridge, just down (or up, depending on how you look at it) the road from the Isaac Newton Institute, where I was spending part of my sabbatical leave. The opportunity to resume attendance could not be missed. A brief e-mail exchange with the organisers, and a cheque to cover the fee, duly secured this. And thus, it was with trepidation that I approached my first BLCS Annual Meeting in more than a decade.

Temporal trends in the prevalence of asthma and rhinoconjunctivitis in adolescents

ABSTRACT OBJECTIVE To analyze the temporal trend of asthma and rhinoconjunctivitis prevalences as well as their symptoms in adolescents. METHODS Two cross-sectional studies were conducted using the same methodology and questionnaire as was used for adolescents aged 12 to 14 years in the Brazilian city of Florianopolis, SC, Southern Brazil. Based on the international protocol of the International Study of Asthma and Allergies in Childhood (ISAAC) study, adolescents were evaluated in 2001 and 3,150 in 2012. The schools included in this study were the same as in the 2001 study. These schools were randomly selected after stratification by network (public and private) and geographic location. The total average percentage variation was estimated for the prevalence of asthma and rhinoconjunctivitis and their symptoms. RESULTS The prevalence of reported asthma was 10.9% in 2001 and 14.8% in 2012, with an average variation of 2.8% in the period. The highest average variation in the period was observed among female adolescents (4.1%). In parallel a significant increase occurred in reported physician-diagnosed asthma, 7.3% in 2001 and 11,1% in 2012, with an annual variation of 4.5%. The largest increases in reported physician-diagnosed asthma were seen in female (5.9%) and male (4.5%) public school pupils. In addition, a significant increase in reported rhinoconjunctivitis occurred, with the average variation in the period being 5.2%. Reports of severe asthma symptoms remained unchanged during the period, while the annual variation for reported current wheezing (-1.3%) and wheezing during exercise (-1.2%) decreased. CONCLUSIONS The results showed a significant increase in the annual average variation for asthma and rhinoconjunctivitis prevalence during the 2001 to 2012 period.

Imunofluorescência indireta no pênfigo foliáceo endêmico. contribuição para sua padronização

O propósito da presente investigação foi padronizar a reação de imunofluorescência indireta para Pênfigo Foliáceo Endêmico (Fogo Selvagem). Verificamos que a pele humana normal é o substrato ideal e que pode proceder de prepúcio, cabeça, pescoço ou da parede abdominal anterior. A lavagem prévia da pele precedendo a incubação com o soro deve ser evitada pois a antigenicidade pode ser diminuída. O TAS-cálcio preserva as propriedades antigênicas da pele e deve ser preferido como diluente para os soros. Lâminas cobertas com albumina são úteis porque aumentam a aderência dos cortes de pele. A diluição apropriada do conjugado é convenientemente determinada pelo teste de imunodifusão radial (método de Ouch-terlony). Com referência à correlação entre título de anticorpos e atividade clínica, concluímos que um título igual ou maior do que 160 era de mau prognóstico pois estava associado à forma generalizada da doença ou à casos de forma localizada refratários à terapêutica usual. Contudo, esta obervação requer confirmação através de estudos que envolvam uma abordagem clínica apropriada.

Determinação dos factores intervenientes na fórmula de capacidade de carga. Comparação com o EC7 e com os da literatura existente

Dissertação apresentada à Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa para obtenção do grau de Mestre em Engenharia Geológica (Geotecnia)

Prevalence of Asthma in a Portuguese Countryside Town:Repercussions on Absenteeism and Self-Concept

Background: Childhood asthma represents an increasing health problem and is the leading cause of hospital admission and absenteeism in children with chronic disease. It also compromises quality of life, eventually contributing to disturbances in self-concept. Self-concept is a recent and global perspective of “the self” and relates to skills, self-image and self-esteem. Little information is available on this topic and there are no data from Portuguese countryside towns. Objective: The aim of this study was to determine the prevalence of asthma among all school children in the 5th and 6th grades in a Portuguese countryside town and to establish its possible correlation with absenteeism and self-concept. Methods: In April 2002, two questionnaires were administered in the presence of the researcher to a group of 950 children attending different schools. The children completed the internationally renowned questionnaires: ISAAC and the Self-Concept Scale by Susan Harter. Results: Our sample (n = 818) had a mean age of 11 years (10-15 years) and a male-to-female ratio of 1/1. The cumulative prevalence of asthma was11.9% and that of active asthma was 8.8 %; 63.9% of asthmatics were male and 36.1 % were female. The mean age of asthmatics was 11.34 years and 74 % had active symptoms. Comparison of this group of 97 asthmatic children with the remaining children revealed a statistically significant correlation between the presence of asthma and school absenteeism (global: p = 0.04; gymnastics: 0.05). Regarding the Self-Concept Scale a statistically significant association was found between the presence of asthma and school achievement (p = 0.027), physical appearance (p = 0.015), behavior (p < 0.000) and self-esteem (p < 0.000). No statistically significant correlations were found in social acceptance (p = 0.289) or athletic competence (p = 0.085). Asthmatic boys had higher self-concept scores than girls, except in the domain of behavior. Conclusions: Twelve percent of the population studied was asthmatic. In asthmatic children, absenteeism was higher and self-concept was lower for almost all domains, except social acceptance and athletic achievement, probably due to overprotection.

Tempo, temporalidades, durações - das ciências exactas às ciências sociais, o tempo da geografia no historial e do lugar

Em Galileu (1564-1642) a noção de tempo revela-se associada a movimento no sistema solar do Universo. Pouco tempo depois, Isaac Newton (1642-1727) considera o Espaço e o Tempo em termos absolutos na Lei da gravitação e Leibnitz (1646- -1716), contestando o caracter absoluto do tempo, afirmou o caracter relacionai do Espaço e do Tempo, considerando-o importante como contexto em que os objectos têm uma posição e relação lógica no Espaço e no Tempo. Por influência dos Naturalistas no século XVIII, a noção de sistema e de organismo integra os fenômenos da Natureza e da Sociedade em que o Tempo é relevante com o significado imprescindível de Evolução e Evolucionismo. À superfície da Terra, a evolução no Tempo era cíclica e estacionai, a variação no Espaço era zonal de acordo com a proximidade do Sol em relação ao Equador.

Seroprevalence of selected viral, bacterial and parasitic infections among inpatients of a public psychiatric hospital of Mexico

We sought to determine the frequency of serological markers of selected infections in a population of psychiatric patients in Durango City, Mexico, and to determine whether there are any epidemiological characteristics of the subjects associated with the infections. One hundred and five inpatients of a public psychiatric hospital of Durango were examined for HBsAg, anti-HCV antibodies, anti-HIV antibodies, anti-Brucella antibodies, rapid plasma reagin and anti-Cysticercus antibodies by commercially available assays. Anti-Cysticercus antibodies were confirmed by Western blot and HBsAg by neutralization assay. Epidemiological data from each participant were also obtained. Seroprevalences of HBsAg, anti-HCV, anti-HIV, anti-Brucella, rapid plasma reagin and anti-Cysticercus antibodies found were 0.0%, 4.8%, 0.9%, 0.0%, 1.9%, and 0.9%, respectively. Overall, 9 (8.6%) inpatients showed seropositivity to any infection marker. We concluded that our psychiatric inpatients have serological evidence of a number of infections. HCV is an important pathogen among our psychiatric inpatients. Health care strategies for prevention and control of infections in Mexican psychiatric patients should be considered.

Smqnr VARIANTS IN CLINICAL ISOLATES OF Stenotrophomonas maltophilia IN BRAZIL

SUMMARYStenotrophomonas maltophilia contains a novel chromosomally-encoded qnr gene named Smqnr that contributes to low intrinsic resistance to quinolone. We described Smqnr in 13 clinical isolates of S. maltophilia from two Brazilian hospitals, over a 2-year period. The strains were identified by API 20 NE (bioMérieux, France). Susceptibility by microdilution method to trimetroprim/sulfamethoxazole, ciprofloxacin, levofloxacin, minocycline, ceftazidime, chloramphenicol and ticarcillin/clavulanate was performed according to CLSI. PCR detection of Smqnr gene was carried out. The sequence of Smqnr was compared with those deposited in GenBank. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) of all strains was performed. Thirteen Smqnr positives isolates were sequenced and three novel variants of Smqnr were identified. All 13 Smqnr isolates had distinguishable patterns by PFGE. This is the first report of Smqnr in S. maltophilia isolated in Brazil.

Medição do Óxido Nítrico no Ar Exalado: Utilização na Avaliação de Crianças com História de Sibilância

Encontram -se publicados múltiplos trabalhos sobre o papel das determinações do óxido nítrico no ar exalado (FENO) no âmbito do estudo da inflamação brônquica que nos permitem afirmar que se trata duma medição simples, não invasiva e de grande utilidade na avaliação do doente asmático.No decurso de um estudo prospectivo sobre o impacto da poluição do ar sobre a saúde da população na cidade de Viseu (Projecto Saud’AR), foram identificadas crianças com história clínica de sibilância, mediante a aplicação de questionários do International Study of Asthma and Allergy in Childhood (ISAAC). As crianças foram submetidas posteriormente a um questionário padronizado, testes cutâneos prick para aeroalergénios, espirometria com prova de broncodilatação e medição de FENO. A idade média era de 7,8±1,1 anos. Comparando os doentes com queixas de sibilância e/ou dispneia nos 6 meses anteriores à avaliação (n=27) com os que não apresentaram estes sintomas, observaram-se diferenças estatisticamente significativas para o ΔFEV1 (mediana: 4,5% vs 8%, p=0,0399) e para o FENO (mediana: 12 ppb vs 23 ppb, p=0,0195, respectivamente). Se olharmos para as crianças que recorreram a broncodilatador nos seis meses anteriores à avaliação (n=19) e as compararmos com as que não necessitaram, encontramos diferenças para o FENO: mediana de 27 ppb versus mediana de 11 ppb, respectivamente; p<0,0001. Ao compararmos as crianças que recorreram a uma consulta de urgência nos seis meses anteriores à avaliação(n=9) e as compararmos com as que não recorreram, encontramos também diferenças estatisticamente significativas para o FENO: mediana de 28 ppb versus mediana de 13 ppb, p=0.0029. Constatou -se assim que a existência de sintomas se associou melhor com o FENO de que com a espirometria.