Simultaneous prediction of symptom severity and cause in data from a test battery for Parkinson patients, using machine learning methods

The main purpose of this thesis project is to prediction of symptom severity and cause in data from test battery of the Parkinson’s disease patient, which is based on data mining. The collection of the data is from test battery on a hand in computer. We use the Chi-Square method and check which variables are important and which are not important. Then we apply different data mining techniques on our normalize data and check which technique or method gives good results.The implementation of this thesis is in WEKA. We normalize our data and then apply different methods on this data. The methods which we used are Naïve Bayes, CART and KNN. We draw the Bland Altman and Spearman’s Correlation for checking the final results and prediction of data. The Bland Altman tells how the percentage of our confident level in this data is correct and Spearman’s Correlation tells us our relationship is strong. On the basis of results and analysis we see all three methods give nearly same results. But if we see our CART (J48 Decision Tree) it gives good result of under predicted and over predicted values that’s lies between -2 to +2. The correlation between the Actual and Predicted values is 0,794in CART. Cause gives the better percentage classification result then disability because it can use two classes.

Predictive models for chronic renal disease using decision trees, naïve bayes and case-based methods

Data mining can be used in healthcare industry to “mine” clinical data to discover hidden information for intelligent and affective decision making. Discovery of hidden patterns and relationships often goes intact, yet advanced data mining techniques can be helpful as remedy to this scenario. This thesis mainly deals with Intelligent Prediction of Chronic Renal Disease (IPCRD). Data covers blood, urine test, and external symptoms applied to predict chronic renal disease. Data from the database is initially transformed to Weka (3.6) and Chi-Square method is used for features section. After normalizing data, three classifiers were applied and efficiency of output is evaluated. Mainly, three classifiers are analyzed: Decision Tree, Naïve Bayes, K-Nearest Neighbour algorithm. Results show that each technique has its unique strength in realizing the objectives of the defined mining goals. Efficiency of Decision Tree and KNN was almost same but Naïve Bayes proved a comparative edge over others. Further sensitivity and specificity tests are used as statistical measures to examine the performance of a binary classification. Sensitivity (also called recall rate in some fields) measures the proportion of actual positives which are correctly identified while Specificity measures the proportion of negatives which are correctly identified. CRISP-DM methodology is applied to build the mining models. It consists of six major phases: business understanding, data understanding, data preparation, modeling, evaluation, and deployment.

Um estudo sobre a curva de demanada agregada brasileira

Muitos trabalhos têm sido elaborados a respeito da curva de demanda agregada brasileira, a curva IS, desde a implementação do Plano Real e, principalmente, após a adoção do regime de câmbio flutuante. Este trabalho tem como objetivo estimar algumas especificações para a curva IS brasileira, para o período após a implementação do câmbio flutuante, do regime de metas de inflação e da Lei de Responsabilidade Fiscal, i.e. após o ano 2000. As especificações para as curvas estimadas tiveram como base o modelo novo-keynesiano, tendo sido incluídas algumas variáveis explicativas buscando captar o efeito na demanda agregada da maior intermediação financeira na potência da política monetária e o efeito do esforço fiscal feito pelo governo brasileiro. O trabalho utiliza o Método dos Momentos Generalizados (MMG) para estimar a curva IS em sua especificação foward-looking e o Método dos Mínimos Quadrados Ordinários (MQO) para estimar a curva IS em sua versão backward-looking. Os resultados mostram forte significância para o hiato do produto em todas as especificações. As especificações foward-looking mostram coeficientes significantes, porém com sinais opostos ao esperado para os juros e superávit primário. Nas regressões backward-looking o sinal dos coeficientes encontrados são os esperados, porém, mostram-se não significantes.

Taxa não inflacionária da capacidade utilizada: uma abordagem usando microdados brasileiros

Esta dissertação baseia-se na criação de uma taxa não inflacionária da capacidade utilizada (NIRCU) para economia brasileira, utilizando microdados da Sondagem da Indústria de Transformação e Índice de Preços ao Produtor Amplo – M (IPA-M), pesquisas desenvolvidas pela FGV/IBRE. Foram criadas três taxas: NIRCU Sondagem, NIRCU Coincidente e NIRCU Antecedente. A primeira utiliza apenas dados da sondagem e a ideia é verificar que não há pressão inflacionária quando as empresas informam para sondagem que não irão variar os seus preços para os próximos três meses e que o número de turnos trabalhado é igual à média do setor. Já as demais, cruzam as informações das empresas que respondem tanto a Sondagem da Indústria de Transformação quanto no IPA-M e verifica se as que informam que não irão alterar os seus preços nos próximos três meses se concretiza quando comparados às variações do índice. A diferença entre as duas últimas abordagens é que a primeira, NIRCU Coincidente, verifica no mesmo período e a outra, NIRCU Antecedente, no trimestre seguinte. A forma encontrada para verificar a eficácia dos indicadores em mensurar a existência de pressão inflacionária foi inserir os diferentes hiatos de produto das NIRCU no modelo de Curva de Phillips, usando a metodologia de Mínimos Quadrados Ordinários (MQO). De acordo com as estimativas, a NIRCU Antecedente foi a única das três que não apresentou um bom desempenho no resultado; as NIRCU Sondagem e Coincidente tiveram uma performance muita boa, principalmente a última. Ou seja, esses dois indicadores tiveram um resultado tão bom quanto as mais tradicionais medidas de hiato de produto.

Efeitos ambientais e genéticos sobre escores visuais e ganho de peso à desmama de animais formadores da raça Brangus

Estudaram-se os efeitos da idade da vaca ao parto e da idade do animal à desmama, bem como os efeitos genéticos aditivo direto e materno e da heterozigose individual, sobre os escores visuais de conformação, precocidade e musculatura e ganho de peso do nascimento à desmama, de animais formadores da raça Brangus. Foram analisados 53.683, 45.136, 52.937 e 56.471 dados de conformação, precocidade e musculatura à desmama e ganho de peso do nascimento à desmama, respectivamente, de animais nascidos entre 1986 e 2002, provenientes do arquivo zootécnico da empresa Gensys Consultores Associados S/C Ltda. Os efeitos de ambiente e genéticos sobre as características em estudo foram analisados pelo método de quadrados mínimos usando modelos matemáticos que incluíram grupo de contemporâneos como variável classificatória e a idade da vaca ao parto, a idade do animal à desmama e os efeitos aditivo direto e materno e da heterozigose individual como co-variáveis. Todos os efeitos incluídos nos modelos afetaram significativamente as características avaliadas, com exceção do efeito da idade da vaca ao parto sobre o ganho de peso do nascimento à desmama e do efeito aditivo materno sobre todas as características estudadas. Os efeitos ambientais e genéticos revelaram-se importantes fontes de variação para as características estudadas e devem, pois, ser considerados na distinção e comparação dos animais para seleção.

Endogamia em um rebanho da raça Guzerá

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Effect of crude protein levels and organic selenium supplementation in the diets fed during the breeding season on reproductive parameters of red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens)

There is little information on the nutrition of red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens) reared in captivity, and their nutritional requirements still need to be determined. This study aimed at determining dietary crude protein requirements and testing four organic selenium supplementation levels in the diet of red-winged tinamous during the breeding season. Birds were housed in a conventional broiler house divided in 16 boxes with one male and three females each. Iso-energy (2800kcal ME/kg) pelleted feeds, based on corn and soybean meal, were supplied in tube feeders. In the first experiment, treatments consisted of four different diets containing different crude protein (CP) contents (15, 18, 21, or 24%) and in the second experiment, the four diets contained equal protein level (22.5%) and four different organic selenium levels (0, 0.2, 0.4, or 0.8ppm). Data were analyzed by the least square method. The best egg weight and eggshell thickness were obtained with 22.5% dietary CP. Organic selenium did not influence the studied reproductive traits of red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens) males or females.

Degradação in situ da matéria seca e da fração fibrosa do capim marandu obtido por diferentes métodos de amostragem, no período seco do ano

Este trabalho foi realizado na Faculdade de Ciências Agrárias Veterinárias - Unesp - Jaboticabal e foi conduzido, com o objetivo de avaliar a influência do método de amostragem do pasto sobre a degradabilidade in situ da matéria seca e da fração fibrosa de capim Marandu, colhido no período seco dos anos de 2003 e 2005. O experimento foi instalado em delineamento de blocos casualizados com parcela subdividida, com três repetições, representadas pelos piquetes amostrados. Nas parcelas, foram avaliados cinco métodos de amostragens de forragem (método do quadrado metálico; método de avaliação através de extrusa de bovino da raça Nelore; método de avaliação por meio de extrusa de bovino Cruzado (Red Angus x Nelore); método de avaliação por meio do pastejo, simulando bovino da raça Nelore; método de avaliação por meio do pastejo, simulando bovino Cruzado (Red Angus x Nelore) e as subparcelas foram constituídas pelos anos de amostragem, 2003 e 2005. Foram determinadas as frações da cinética ruminal: solúvel A; insolúvel potencialmente degradável B; taxa de degradação Kd; degradação potencial (DP) e fração não degradável C da MS e degradação potencial (DP), fração não degradável C e taxa de degradação Kd da FDN e da FDA. de acordo com os resultados obtidos, observou-se que o método do quadrado metálico subestimou as características da degradação do capim. Os métodos do pastejo simulado se assemelharam muito ao das extrusas, no entanto, a prática do simulador é que assegurou a amostragem eficiente, conforme foi constatado pelos dados obtidos no ano de 2003 e 2005.

Cidadania ambiental em centros urbanos : um estudo com estudantes do ensino superior

This work presents a study of the ambient management in urban centers, considering the ambient perception as element necessary to develop in the population the conscience of the necessity to preserve the environment. For this, the attitudes and behaviors of the community, represented for students of an Institution had been evaluated, so that strategies and actions are traced that come to minimize the ambient degradation and to provide an aggregate sustainable development to the economic development. The objective of this research consists of studying the problematic one of the ambient management in urban centers under the point of view of the awareness, of the ambient perception and of the participation of the population, this because the ambient questions are inserted in the aspects that involve the practical life and the daily one, for what becomes excellent to understand that the environment is a right of all, therefore, must be preserved. The methodology used in this work constitutes in the application of a questionnaire with scales of the type likert contends variables that compose the acts and mannering aspects, beyond a partner-demographic scale. The Chi-square method was used in the analysis statistics de Pearson to verify the dependence of the associations between the partner-demographic 0 variable and the acts and mannering variables. The results point that the academic environment is opportune to deal with the subject, in view of that the ambient preservation goes for all the contents, and that the pupils of today will be able, in the future, in its areas of performance to plan action to safeguard the sustainable development. One concludes that the strategies to manage the environment pass for the awareness of the citizen, therefore when it is educated its attitudes will be more responsible, a time that the ambient concern will be present in its day-by-day. Therefore, the Public Power when planning programs of ambient preservation that comes to promote changes of habits of the population, such as: management of the solid residues generated by the population, recycling, programs of selective collections, ambient education, etc. the local community for the success of its actions will have to be involved

Estudo preliminar da influência do perímetro escrotal sobre a libido em touros jovens da raça Nelore

O perímetro escrotal (PE) de 202 touros jovens da raça Nelore, sem experiência sexual prévia, classificados pela Associação Brasileira de Criadores de Zebu como superiores ou elite, foi medido aos 7, 12, 18 e 28 meses de idade, aproximadamente. Após a última medição, eles foram submetidos ao teste de libido e procedeu-se à colheita de sêmen por eletroejaculação, seguida de avaliação andrológica. As medidas do PE aos 7, 12, 18 e 28 meses foram de 18,30; 22,29; 27,54 e 33,26cm, respectivamente. Os coeficientes de correlação simples entre estas medidas variaram de 0,35 a 0,53. O coeficiente de correlação entre PE aos 28 meses e peso corporal na mesma idade foi de 0,43. A correlação entre a nota da libido e o perímetro escrotal medido aos l8 meses foi de 0,15 e entre aquela e o perímetro escrotal aos 28 meses foi de 0,13. Observou-se elevado crescimento do perímetro escrotal entre o 7º e 18º meses de idade. Utilizou-se o método de quadrados mínimos para analisar a libido, incluindo ano de nascimento como efeito fixo e como covariáveis os efeitos lineares da idade e peso no momento da avaliação e medidas de perímetro escrotal aos 7, l2, l8 e 28 meses. Cada covariável foi retida de forma seqüencial obtendo-se vários modelos de análises e as somas de quadrados foram decompostas de forma seqüencial e parcial. O ano de nascimento, a idade e o perímetro escrotal aos 18 meses de idade afetaram significativamente a libido. Os coeficientes de correlação entre a libido e concentração espermática, motilidade, peso e idade do animal no momento da avaliação foram de 0,34, 0,l6, 0,38 e 0,35, respectivamente.

Efeito da endogamia sobre características de crescimento de bovinos da raça Gir no Brasil

Esta pesquisa foi conduzida com o objetivo de avaliar o efeito da endogamia e suas possíveis influências sobre o crescimento de bovinos de corte. Foram utilizadas 27.406 observações de peso à desmama, padronizado aos 205 dias (PD), e 14.317 informações de peso ao ano, padronizado aos 365 dias (PA), de animais da raça Gir, no período de 1970 a 1995. As análises foram feitas pelo método dos quadrados mínimos, incluindo-se o efeito aleatório de grupo contemporâneo e os efeitos fixos de geração (discreto), idade da vaca ao parto e taxa de endogamia do bezerro e da vaca como variáveis contínuas, considerando-se os efeitos linear e quadrático. Apenas 11,65% das vacas, 19,84% dos touros e 9,23% dos bezerros da raça Gir estudados apresentaram algum grau de endogamia e as estimativas das médias de endogamia foram de pequena magnitude, constatando-se valores de 1,04; 0,96; e 1,66% para vacas, touros e bezerros, respectivamente. O efeito da endogamia do animal foi significativo e quadrático para as duas características estudadas. Os resultados mostraram depressão endogâmica para ambas as características (PD e PA). Recomenda-se evitar os acasalamentos, intencionalmente, endogâmicos e monitorar os acasalamentos com base no parentesco entre os indivíduos, visando manter baixas as taxas de endogamia.

Gestão de resíduos sólidos: um estudo da conscientização ambiental em uma cidade do Brasil

The present study inserts on the international environmental thematic, approaching the integrated management of solid waste and the participation of the social actors in the search of the sustainable development. The awareness in combining it still describes a Selective Collection Program SCP of solid waste, in partnership with the municipal public power, in the development of joint actions that result in better alternatives of waste management in the urban centers, providing better life quality for the population and conservation of the environment. The aim of this research is to study problematic of the management of solid waste under the point of view of the environmental awareness and the participation of the population in a city of Brazil. In this matter, the target of the work is focusing on the strategy of solid waste management, through the attitudes and the respondents behaviors to aid in the making decision of the public manager related to the implantation of a selective collection program in Natal/RN. The methodology used in this work constitutes in the application of a questionnaire with scales of the type Likert being constituted of variables that compose the aspects of attitudes and of behaviors, besides a social-demographic scale. For analysis statistics is used the Pearson s Chi-Square Method in order to verify the dependence of the associations between the social-demographic variables and the attitude and the behavior ones. The results appear for a larger participation in a SCP, since this provides a better quality of life of the population (28,3 %), followed for offering a financial advantage (27,3%). Other results indicate the existence of the variables that exercise influence on the environmental awareness of the population to its demographic aspects

Análise de séries temporais de coordenadas estimadas com GPS: uma proposta metodológica para detecção, remoção e recuperação de efeitos sazonais

GPS active networks are more and more used in geodetic surveying and scientific experiments, as water vapor monitoring in the atmosphere and lithosphere plate movement. Among the methods of GPS positioning, Precise Point Positioning (PPP) has provided very good results. A characteristic of PPP is related to the modeling and/or estimation of the errors involved in this method. The accuracy obtained for the coordinates can reach few millimeters. Seasonal effects can affect such accuracy if they are not consistent treated during the data processing. Coordinates time series analyses have been realized using Fourier or Harmonics spectral analyses, wavelets, least squares estimation among others. An approach is presented in this paper aiming to investigate the seasonal effects included in the stations coordinates time series. Experiments were carried out using data from stations Manaus (NAUS) and Fortaleza (BRFT) which belong to the Brazilian Continuous GPS Network (RBMC). The coordinates of these stations were estimated daily using PPP and were analyzed through wavelets for identification of the periods of the seasonal effects (annual and semi-annual) in each time series. These effects were removed by means of a filtering process applied in the series via the least squares adjustment (LSQ) of a periodic function. The results showed that the combination of these two mathematical tools, wavelets and LSQ, is an interesting and efficient technique for removal of seasonal effects in time series.

Evaluation of TNF-alpha, IL-4, and IL-10 and parasite density in spleen and liver of L. (L.) chagasi naturally infected dogs

Dogs are the main domestic reservoirs of L. (L.) chagasi. Once in the vertebrate host, the parasite can cause visceral leishmaniasis, which can also be transmitted to humans. Cytokines are key elements of the host immune response against Leishmania spp. To investigate whether tumor necrosis factor (TNF)-alpha, interleukin (IL)-4 and IL-10 are associated with pattern infection in dogs, these cytokines were quantified in the spleen and liver of dogs naturally infected with L. (L.) chagasi, with or without clinical manifestations, and their levels were correlated with the parasite load verified in these organs. A total of 40 adult dogs naturally infected with L. (L.) chagasi were assessed, together with 12 uninfected control dogs. Samples from spleen and liver were used to determine the cytokine levels by capture ELISA and for quantifying parasite load by real-time PCR. Statistical analysis was performed using the minimum Chi square method and group means were compared using the Tukey test. TNF-alpha, IL-4 and IL-10 levels in infected dogs were higher than in control groups; the liver was the main cytokine-producing organ during infection. The level of splenic TNF-alpha showed correlation with parasite load and may represent an important marker for infection process evolution, with the participation of IL-10. These results may contribute to a clearer understanding of the immune response in dogs infected with L. (L.) chagasi, which may lead to the development of prophylactic or preventive measures for these animals.

Biology and shell relationship in Clibanarius vittatus (Bosc, 1802) (Crustacea, Diogenidae) from Sao Vicente, SP, Brasil.

This study aimed to characterize the populational structure of Clibanarius vittatus (Bosc, 1802), as well as to determine the morphometric relations between the animal's size and the variables: length of their chelar propodus and the size of the shell opening. C. vittatus is a relatively abundant pagurid on the west Atlantic coast, it occurs in the intertidal region from 38 degrees N to 28 degrees S. The animals in this study were randomly sampled every month on the Paranapu (a) over tilde Beach (46 degrees 23' S e 23 degrees 59' W), S (a) over tilde $ o Vicente (SP), Brazil. The biometrics data were adjusted to the power equation (y = ax(b)), by means of the minimum square method. A total of 427 individuals were collected. The size of the cephalothoraxic shield ranged from 2.5 to 12.7 mm, evidencing a representative sample of the population. The of most commonly genus of Gastropoda shells occupied by the hermits was Thais (97,26%). In relation to the morphometric analyses performed, it was observed a positive correlation between the animal size and the variables length of the chelar propodus and the size of the shells.