Análise das mudanças no perfil protéico durante o estresse oxidativo in vivo e atuação da MutY-Glicosilase em respostas celulares

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

Análise proteômica diferencial de Trypanosoma cruzi na presença de substâncias extraídas de plantas da família piperaceae

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Predição computacional de promotores em Xanthomonas axonopodis pv. citri

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudo metalômico do mercúrio em leite materno coletado da população ribeirinha da área de influência do Ahe Jirau-bacia do rio Madeira

Pós-graduação em Biologia Geral e Aplicada - IBB

Analisando a determinação sexual de vertebrados com base em redes de interação entre proteínas

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Genética) - IBB

Análise proteômica do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise proteômica da resposta ao arsênio e do exoproteoma de Chromobacterium violaceum

A Chromobacterium violaceum é uma beta-proteobactéria Gram-negativa comum da microbiota tropical e um patógeno oportunista para animais e humanos. A infecção causada pela C. violaceum apresenta alta taxa de mortalidade, mas os mecanismos da patogenicidade ainda não foram caracterizados. Como outros microorganismos ambientais, essa bactéria está exposta a condições externas muito variáveis, que exigem grande adaptabilidade e sistemas de proteção eficientes. Entre esses sistemas encontra-se um operon arsRBC de resistência ao arsênio, metaloide danoso à saúde humana associado a lesões de pele, doenças neurológicas e câncer. O objetivo deste trabalho foi investigar as alterações na expressão proteica de C. violaceum ATCC 12472 na presença do arsenito e caracterizar as diversas proteínas secretadas pela bactéria. As proteínas da C. violaceum foram analisadas por eletroforese bidimensional e espectrometria de massas. A análise proteômica revelou que o arsenito induz um aumento na quantidade das proteínas envolvidas na resposta ao estresse oxidativo, reparo do DNA e metabolismo energético. Entre as proteínas secretadas, foram identificados fatores de virulência (metalopeptidases, colagenase e toxinas), transportadores, proteínas de proteção contra estresses e com potencial aplicação biotecnológica. Os resultados mostraram que a C. violaceum possui um arsenal molecular de adaptação que a torna capaz de conservar suas atividades celulares e provocar lesões em outros organismos.

Análise das proteínas relacionadas a formação de metástase em linhagens de adenocarcinoma gástrico

O câncer gástrico representa um grave problema de saúde pública mundial. A alta incidência de tumores avançados com baixa sobrevida pelas metástases, sobretudo no norte do país, nos fez realizar o estudo comparativo das linhagens de adenocarcinomas gástricos metastáticos (AGP01) com adenocarcinomas gástricos sem metástases (ACP02) através da avaliação proteômica da via de mobilidade celular, que possam ter relação com a formação dessas metástases. Foi realizado estudo proteômico das linhagens AGP01 e ACP02 através da técnica da cromatografia líquida de alta performance 2D Nanoultra (UPLC) em conjunto com nanoESI-MS^E (MudPIT) e análise funcional das proteínas diferencialmente expressas no programa Ingenuity Pathways Analysis (IPA). Observamos 19 proteínas com aumento da expressão na linhagem AGP01 em relação a ACP02, as quais apresentam relação com movimento, organização e morfologia celular, onde podemos sugerir que as proteínas ACTB, ANXA1, LGALS1, IQGAP1, EZR, MSN, MYH9 e S100A11, de acordo com nossos achados e corroborados pela literatura pesquisada, tem associação com a metástase de adenocarcinomas gástricos. Outras proteínas se mostraram em forte expressão em nosso estudo, mas na literatura pesquisada sua expressão tem relação com as vias de disseminação apenas de outros tumores, como: mama (RAB5C), pulmão (PLS1 e CAP1), reto (ACTN1) e GIST (SYNE2). Conflitantes com nosso estudo, as expressões das proteínas CAPZA1, FLNA e FLNC, foram observadas na literatura como um inibidor de avanço tumoral, enquanto que as expressão das proteínas MYL6, MYL6B, e ACTN2, aparecem pela primeira vez como tendo relação com a mobilidade celular, invasão e metástase em câncer.

Análise proteômica do veneno da vespa social Polistes lanio lanio (Hymenoptera; vespidae)

Os venenos dos insetos da ordem Hymenoptera (abelhas, vespas e formigas) são responsáveis por um grande número de acidentes causados por ferroadas. Estes acidentes podem produzir uma série de reações, variando desde uma reação local, até uma reação sistêmica e anafilaxia. Estudos mostraram que 0,8% a 5% da população mundial sofrem de reações sistêmicas generalizadas após ferroadas de insetos pertencentes à ordem Hymenoptera. As espécies pertencentes ao gênero Polistes são tipicamente encontradas no sudeste do Brasil, causando muitos acidentes por ferroadas devido principalmente à proximidade dos ninhos destes insetos das habitações humanas. P.lanio lanio é uma das vespas sociais que mais causam acidentes no Estado de São Paulo e pouco se sabe sobre a composição de seu veneno. As vespas do gênero Polistes são capazes de ferroar múltiplas vezes e causar reações alérgicas severas. Dessa forma, a identificação das proteínas mais abundantes do veneno da vespa social Polistes lanio lanio por uma abordagem proteômica, se faz necessária para uma melhor compreensão dos mecanismos de ação desse veneno. A identificação de várias proteínas do veneno de P. l. lanio, revelou importantes aspectos sobre o processo de envenenamento por vespas do gênero Polistes, os quais podem ajudar no melhor entendimento dos mecanismos de ação destes venenos. A compreensão dos principais alérgenos é uma etapa importante para o desenvolvimento de novos extratos específicos para diagnósticos de alergia e imunoterapia de pacientes sensíveis ao veneno de vespas.

Abordagem metalômica quantitativa de mercúrio em peixes da região amazônica

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Ação da histatina 5, uma proteína antimicrobiana, no desenvolvimento de biofilmes de Candida Albicans

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Avaliação proteômica do conteúdo vaginal em resposta ao tratamento da vaginose bacteriana

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Avaliação dos constituintes proteicos do plasma seminal e da membrana plasmática se espermatozóides e sua correlação com a fertilidade de garanhões

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Potencial anti-inflamatório e antiproliferativo de compostos inibidores da enzima desoxi-hipusina sintase

Pós-graduação em Biotecnologia - IQ

Peptidomics of Three Bothrops Snake Venoms: Insights Into the Molecular Diversification of Proteomes and Peptidomes

Snake venom proteomes/peptidomes are highly complex and maintenance of their integrity within the gland lumen is crucial for the expression of toxin activities. There has been considerable progress in the field of venom proteomics, however, peptidomics does not progress as fast, because of the lack of comprehensive venom sequence databases for analysis of MS data. Therefore, in many cases venom peptides have to be sequenced manually by MS/MS analysis or Edman degradation. This is critical for rare snake species, as is the case of Bothrops cotiara (BC) and B. fonsecai (BF), which are regarded as near threatened with extinction. In this study we conducted a comprehensive analysis of the venom peptidomes of BC, BF, and B. jararaca (BJ) using a combination of solid-phase extraction and reversed-phase HPLC to fractionate the peptides, followed by nano-liquid chromatography-tandem MS (LC-MS/MS) or direct infusion electrospray ionization-(ESI)-MS/MS or MALDI-MS/MS analyses. We detected marked differences in the venom peptidomes and identified peptides ranging from 7 to 39 residues in length by de novo sequencing. Forty-four unique sequences were manually identified, out of which 30 are new peptides, including 17 bradykinin-potentiating peptides, three poly-histidine-poly-glycine peptides and interestingly, 10 L-amino acid oxidase fragments. Some of the new bradykinin-potentiating peptides display significant bradykinin potentiating activity. Automated database search revealed fragments from several toxins in the peptidomes, mainly from L-amino acid oxidase, and allowed the determination of the peptide bond specificity of proteinases and amino acid occurrences for the P4-P4' sites. We also demonstrate that the venom lyophilization/resolubilization process greatly increases the complexity of the peptidome because of the imbalance caused to the venom proteome and the consequent activity of proteinases on venom components. The use of proteinase inhibitors clearly showed different outcomes in the peptidome characterization and suggested that degradomic-peptidomic analysis of snake venoms is highly sensitive to the conditions of sampling procedures. Molecular & Cellular Proteomics 11: 10.1074/mcp.M112.019331, 1245-1262, 2012.