Application of a rank-based genetic association test to age-at-onset data from the Collaborative Study on the Genetics of Alcoholism study.

Association studies of quantitative traits have often relied on methods in which a normal distribution of the trait is assumed. However, quantitative phenotypes from complex human diseases are often censored, highly skewed, or contaminated with outlying values. We recently developed a rank-based association method that takes into account censoring and makes no distributional assumptions about the trait. In this study, we applied our new method to age-at-onset data on ALDX1 and ALDX2. Both traits are highly skewed (skewness > 1.9) and often censored. We performed a whole genome association study of age at onset of the ALDX1 trait using Illumina single-nucleotide polymorphisms. Only slightly more than 5% of markers were significant. However, we identified two regions on chromosomes 14 and 15, which each have at least four significant markers clustering together. These two regions may harbor genes that regulate age at onset of ALDX1 and ALDX2. Future fine mapping of these two regions with densely spaced markers is warranted.

A Monte Carlo model of DNA double-strand break clustering and rejoining kinetics for the analysis of pulsed-field gel electrophoresis data

In studies of radiation-induced DNA fragmentation and repair, analytical models may provide rapid and easy-to-use methods to test simple hypotheses regarding the breakage and rejoining mechanisms involved. The random breakage model, according to which lesions are distributed uniformly and independently of each other along the DNA, has been the model most used to describe spatial distribution of radiation-induced DNA damage. Recently several mechanistic approaches have been proposed that model clustered damage to DNA. In general, such approaches focus on the study of initial radiation-induced DNA damage and repair, without considering the effects of additional (unwanted and unavoidable) fragmentation that may take place during the experimental procedures. While most approaches, including measurement of total DNA mass below a specified value, allow for the occurrence of background experimental damage by means of simple subtractive procedures, a more detailed analysis of DNA fragmentation necessitates a more accurate treatment. We have developed a new, relatively simple model of DNA breakage and the resulting rejoining kinetics of broken fragments. Initial radiation-induced DNA damage is simulated using a clustered breakage approach, with three free parameters: the number of independently located clusters, each containing several DNA double-strand breaks (DSBs), the average number of DSBs within a cluster (multiplicity of the cluster), and the maximum allowed radius within which DSBs belonging to the same cluster are distributed. Random breakage is simulated as a special case of the DSB clustering procedure. When the model is applied to the analysis of DNA fragmentation as measured with pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), the hypothesis that DSBs in proximity rejoin at a different rate from that of sparse isolated breaks can be tested, since the kinetics of rejoining of fragments of varying size may be followed by means of computer simulations. The problem of how to account for background damage from experimental handling is also carefully considered. We have shown that the conventional procedure of subtracting the background damage from the experimental data may lead to erroneous conclusions during the analysis of both initial fragmentation and DSB rejoining. Despite its relative simplicity, the method presented allows both the quantitative and qualitative description of radiation-induced DNA fragmentation and subsequent rejoining of double-stranded DNA fragments. (C) 2004 by Radiation Research Society.

Clustering algorithms and shape factor methods to discriminate among small GTPase phenotypes using DIC image analysis.

Naïvement perçu, le processus d’évolution est une succession d’événements de duplication et de mutations graduelles dans le génome qui mènent à des changements dans les fonctions et les interactions du protéome. La famille des hydrolases de guanosine triphosphate (GTPases) similaire à Ras constitue un bon modèle de travail afin de comprendre ce phénomène fondamental, car cette famille de protéines contient un nombre limité d’éléments qui diffèrent en fonctionnalité et en interactions. Globalement, nous désirons comprendre comment les mutations singulières au niveau des GTPases affectent la morphologie des cellules ainsi que leur degré d’impact sur les populations asynchrones. Mon travail de maîtrise vise à classifier de manière significative différents phénotypes de la levure Saccaromyces cerevisiae via l’analyse de plusieurs critères morphologiques de souches exprimant des GTPases mutées et natives. Notre approche à base de microscopie et d’analyses bioinformatique des images DIC (microscopie d’interférence différentielle de contraste) permet de distinguer les phénotypes propres aux cellules natives et aux mutants. L’emploi de cette méthode a permis une détection automatisée et une caractérisation des phénotypes mutants associés à la sur-expression de GTPases constitutivement actives. Les mutants de GTPases constitutivement actifs Cdc42 Q61L, Rho5 Q91H, Ras1 Q68L et Rsr1 G12V ont été analysés avec succès. En effet, l’implémentation de différents algorithmes de partitionnement, permet d’analyser des données qui combinent les mesures morphologiques de population native et mutantes. Nos résultats démontrent que l’algorithme Fuzzy C-Means performe un partitionnement efficace des cellules natives ou mutantes, où les différents types de cellules sont classifiés en fonction de plusieurs facteurs de formes cellulaires obtenus à partir des images DIC. Cette analyse démontre que les mutations Cdc42 Q61L, Rho5 Q91H, Ras1 Q68L et Rsr1 G12V induisent respectivement des phénotypes amorphe, allongé, rond et large qui sont représentés par des vecteurs de facteurs de forme distincts. Ces distinctions sont observées avec différentes proportions (morphologie mutante / morphologie native) dans les populations de mutants. Le développement de nouvelles méthodes automatisées d’analyse morphologique des cellules natives et mutantes s’avère extrêmement utile pour l’étude de la famille des GTPases ainsi que des résidus spécifiques qui dictent leurs fonctions et réseau d’interaction. Nous pouvons maintenant envisager de produire des mutants de GTPases qui inversent leur fonction en ciblant des résidus divergents. La substitution fonctionnelle est ensuite détectée au niveau morphologique grâce à notre nouvelle stratégie quantitative. Ce type d’analyse peut également être transposé à d’autres familles de protéines et contribuer de manière significative au domaine de la biologie évolutive.

Dynamic Niche Clustering: a fuzzy variable radius niching technique for multimodal optimisation in GAs

This paper describes the recent developments and improvements made to the variable radius niching technique called Dynamic Niche Clustering (DNC). DNC is fitness sharing based technique that employs a separate population of overlapping fuzzy niches with independent radii which operate in the decoded parameter space, and are maintained alongside the normal GA population. We describe a speedup process that can be applied to the initial generation which greatly reduces the complexity of the initial stages. A split operator is also introduced that is designed to counteract the excessive growth of niches, and it is shown that this improves the overall robustness of the technique. Finally, the effect of local elitism is documented and compared to the performance of the basic DNC technique on a selection of 2D test functions. The paper is concluded with a view to future work to be undertaken on the technique.

What drives ICT clustering in European Cities?

ICT clusters have attracted much attention because of their rapid growth and their value for other economic activities. Using a nested multi-level model, we examine how conditions at the country level and at the city level affect ICT clustering activity in 227 cities across 22 European countries. We test for the influence of three country regulations (starting a business, registering property, enforcing contracts) and two city conditions (proximity to university, network density) on ICT clustering. We consider heterogeneity within the sector and study two types of ICT activities: ICT product firms and ICT content firms. Our results indicate that country conditions and city conditions each have idiosyncratic implications for ICT clustering, and further, that these can vary by activities in ICT products or ICT content manufacturing.

On L2 Clustering and Resetting the Null Subject Parameter in L2 Spanish: Implications and Observations.

In this article, along with others, we take the position that the Null-Subject Parameter (NSP) (Chomsky 1981; Rizzi 1982) cluster of properties is narrower in scope than some originally contended. We test for the resetting of the NSP by English L2 learners of Spanish at the intermediate level, including poverty-of-the stimulus knowledge of the Overt Pronoun Constraint (Montalbetti 1984). Our participants are tested before and after five months' residency in Spain in an effort to see if increased amounts of native exposure are particularly beneficial for parameter resetting. Although we demonstrate NSP resetting for some of the L2 learners, our data essentially demonstrate that even with the advent of time/exposure to native input, there is no immediate gainful effect for NSP resetting.

Partitions selection strategy for set of clustering solutions

Clustering is a difficult task: there is no single cluster definition and the data can have more than one underlying structure. Pareto-based multi-objective genetic algorithms (e.g., MOCK Multi-Objective Clustering with automatic K-determination and MOCLE-Multi-Objective Clustering Ensemble) were proposed to tackle these problems. However, the output of such algorithms can often contains a high number of partitions, becoming difficult for an expert to manually analyze all of them. In order to deal with this problem, we present two selection strategies, which are based on the corrected Rand, to choose a subset of solutions. To test them, they are applied to the set of solutions produced by MOCK and MOCLE in the context of several datasets. The study was also extended to select a reduced set of partitions from the initial population of MOCLE. These analysis show that both versions of selection strategy proposed are very effective. They can significantly reduce the number of solutions and, at the same time, keep the quality and the diversity of the partitions in the original set of solutions. (C) 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.

Avaliação do nível de concordância do teste imunocromatográfico OptiMAL-IT® e a gota espessa no diagnóstico da malária, no município de Mazagão-AP, Brasil

O diagnóstico precoce e o tratamento adequado dos casos de malária é a principal estratégia para o controle da doença. Várias alternativas para o diagnóstico microscópico tradicional foram propostas nos últimos anos, os testes imunocromatográficos que capturam antígenos alvos dos parasitos da malária estão sendo propostos, como o teste OptiMAL-IT® que detecta a desidrogenase lática do Plasmodium sp.. O estudo teve como objetivo a avaliação do nível de concordância entre o teste imunocromatográfico (OptiMAL-IT®) e a gota espessa para o diagnóstico da malária no Município de Mazagão – Amapá. Foram analisados 413 indivíduos com sintomatologia de malária, que procuraram o serviço da Unidade Mista de Saúde de Mazagão, com idade entre 01-68 anos. Os resultados do teste OptiMAL-IT® foram comparados com os resultados obtidos (das amostras) através da gota espessa corada pelo Giemsa. Dos 413 pacientes suspeitos de apresentarem malária, 317(76.8%) eram positivos através da GE e 311 (75.3%) eram positivos pelo TDR. Das lâminas de GE positivas, foram encontrados 27.4% de P. falciparum e 72.6% de P. vivax. O teste OptiMAL-IT® detectou 27.7% de P. falciparum e 72.3% de P. vivax. A sensibilidade obtida com o TDR para o P. falciparum foi de 97.7% e para o P. vivax foi de 98.2%, a sensibilidade global do TDR foi de 98.1% e a especificidade global e para ambas as espécies foi de 100%. Foram encontrados valores preditivos positivos e negativos de 100% e 94.1%, respectivamente. O teste OptiMAL-IT®, teve uma alta concordância com a GE, foi específico e eficiente, podendo ser usado no diagnóstico de malária nas situações onde a microscopia não está disponível.

Ecologia da ictiofauna e análise ecossistêmica das áreas de influência direta da UHE Coaracy Nunes, Ferreira Gomes - AP

O reservatório da UHE Coaracy Nunes no rio Araguari esta localizado entre os municípios de Ferreira Gomes e Porto Grande no estado do Amapá-Brasil, distando 200 km do Oceano Atlântico. A usina Coaracy Nunes foi a primeira hidrelétrica a ser construída na Amazônia brasileira, tendo suas obras iniciadas em 1967. O rio Araguari e o principal rio do estado do Amapá e representa fonte de geração de renda através da pesca, atividades agropecuárias em sua várzea, navegação, mineração, geração de energia e lazer. O presente estudo teve por objetivo avaliar as alterações impostas pela construção do reservatório da UHE Coaracy Nunes, através das assembleias de peixes de quatro áreas de influencia direta desta usina. Para isso, no período de maio de 2009 a julho de 2010, foram realizadas coletas bimensais, de peixes, com redes de malhas padronizadas variando de 1,0 a 10,0 cm entre nos adjacentes e outras técnicas auxiliares. A partir destas coletas, no capitulo 1 foi verificado a composição, abundancia (CPUEn) e biomassa (CPUEp) relativas da ictiofauna, eficiência amostral (curva do coletor, curva de rarefação e Jacknife) e descritores ecológicos de comunidades (riqueza, diversidade, equitabilidade e dominância) das assembleias das quatro áreas. Foram efetuadas analises de variância (ANOVA: bifatorial), Kruskal-Wallis, teste-T e Mann-Whitney para verificar se havia diferenças significativas dos descritores entre as áreas e períodos sazonais. Estas análises foram corroboradas por analises multivariadas de agrupamento (cluster), ordenamento (MDS), Anosim e Simper. No capitulo 2, os estados ecológicos das quatro áreas foram verificados utilizando como indicadores: curvas espécie abundancia, curvas K-dominância e curvas ABC, assim como modelos espécie-abundancia serie geométrica, log serie, log normal e broken stick, e modelo de regressão linear de espectros de tamanho. No capitulo 3, a estrutura trófica foi estimada a partir da categorização das espécies de cada área em 5 guildas: piscívora, onívora, detritívora, carnívora e herbívora. A abundancia, biomassa e índices ecológicos destas guildas foram estimados e verificados suas variações espaço-temporais, por analises de variância (ANOVA: bifatorial e Kruskal-Wallis) e teste t. No capitulo 4, a dieta das espécies mais abundantes das assembleias de cada área foi verificada e suas variações espaço-temporais detectadas por analise de variância (ANOVA: bifatorial e Kruskal-Wallis). Também foram estimados a amplitude e sobreposição de nicho das espécies mais abundantes, assim como a existência de competição entre as espécies através de modelagem nula. No capitulo 5 foi realizada a avaliação ecossistêmica das quatro áreas através de modelos de fluxo de biomassa na rede trófica do ecossistema, usando como instrumento de modelação o software Ecopath. Essas análises tinham por objetivo descrever as variações dos atributos ecológicos que quantificam as propriedades de maturidade, estabilidade e resiliência ecossistêmica que pudessem refletir os estados ecológicos dessas áreas. O modelo incluiu compartimentos funcionais desde produtores primários ate predadores de topo. No geral, todas as análises indicaram sensíveis alterações na ictiofauna atribuídas a implantação da UHE Coaracy Nunes, que se refletem nos três níveis de organização: ecossistema, comunidade (assembleia) e guilda. Os resultados indicaram a captura de 1.977 peixes distribuídos em 2 classes, 9 ordens, 23 famílias, 73 gêneros e 108 espécies. As curvas de acumulação de espécies e curvas de rarefação individualizadas demonstraram que houve suficiência amostral nas áreas Reservatório e Lacustre. Os resultados mostraram que a área Jusante foi mais rica, diversa e equitativa em relação as demais e que a sazonalidade não influenciou na variação destes índices. A abundancia relativa (CPUEn) foi superior nas áreas Reservatório e Lacustre e a biomassa relativa (CPUEb) foi superior na área Jusante, não havendo diferenças sazonais para esses descritores em todas as áreas. As analises de agrupamento (cluster) e ordenamento (MDS) da ictiofauna permitiram identificar a formação de três assembleias distintas: Jusante, Montante e uma assembleia que compreende as áreas Reservatório e Lacustre, ratificando a similaridade dessas duas áreas. Os resultados das curvas whitakeplot, ABC e K-dominância, assim como o ajuste satisfatório do modelo broken stick e os padrões das curvas de espectro de tamanho para a assembleia da área a jusante indicam que esta área foi a mais equilibrada em termos ecológicos. Nas áreas Lacustre e Reservatório, os resultados tanto do ajuste ao modelo serie geométrica, quanto os resultados das curvas whitake-plot, ABC e K-dominância e o espectro de tamanho, assim como os resultados das curvas e ajustes ao modelo série e menor espectro de tamanho para a assembleia da área Reservatório, refletem que os peixes destas áreas, em sua maioria, são indivíduos pequenos com elevada dominância e baixa equitabilidade, caracterizando comunidades típicas de áreas impactadas. A estrutura trófica das assembleias de peixes das áreas represadas (Reservatório e Lacustre) foram formatadas em função do barramento do rio, que isolou e fragmentou o ambiente, determinando sua modificação física, impondo o estabelecimento de uma ictiofauna de espécies pré-adaptadas as condições ambientais de represamento, diferente, em parte, da estrutura da ictiofauna fluvial pre-barramento, destacando as piscívoras, onívoras e detritívoras, que foram as mais ricas e abundantes em função da disponibilidade, nas duas áreas, dos recursos alimentares de sua preferencia. Os resultados demonstraram que as dietas das assembleias de todas as áreas foram similares quanto ao predomínio do consumo de peixes e detritos, seguidos de alimento vegetal aloctone, revelando um padrão com poucos nichos amplos e uma concentração maior de espécies com nichos mais estreitos. Contudo, o padrão de baixa amplitude trófica foi evidenciado pelo predomínio da guilda piscívora, somada as guildas detritívora e herbívora. A sazonalidade pouco influenciou na alimentação da maioria das espécies em todas as áreas. Os padrões comparativos da dieta entre as áreas Montante e Jusante com as áreas Reservatório e Lacustre indicam que a maioria das espécies das áreas represadas pertenciam as guildas piscívora, onívora e detritívora antes do barramento do rio, que colonizaram estes ambientes, influenciadas, principalmente, pela abundancia dos recursos alimentares de suas preferencias e das condições físicas ambientais favoráveis. Interações competitivas foram evidenciadas pelos modelos nulos, sugerindo que a competição também foi um fator importante na estruturação das assembleias. Ecossistemicamente, os quatro modelos de fluxo de biomassa representam ecossistemas com elevada produção primaria oriunda da floresta riparia e algas filamentosas, que são utilizadas parcialmente. A cadeia trófica baseada em detrito apresentou ser mais importante que a que tem como base a produção primaria nas áreas Reservatório e Lacustre. A maioria dos fluxos ocorre nos compartimentos de níveis tróficos baixos. As propriedades ecossistêmicas da área Jusante indicam que este ambiente se encontra mais desenvolvido e maduro em relação aos outros, caracterizado por resiliência e entropia altas. As áreas represadas (Reservatório e Lacustre) apresentaram atributos ecossistêmicos que lhe conferiram características de menos resiliente e menos maduro que as áreas de rio. A área Montante apresentou um padrão intermediário de resiliência, estabilidade e maturidade. Esses resultados evidenciam que apos quarenta anos da construção da barragem do reservatório de Coaracy Nunes, a fragmentação do ambiente proporcionou alterações ecossistêmicas negativas, refletidas nas assembleias de peixes das áreas acima do barramento e na analise ecossistêmica, evidenciando que a área jusante apresenta características de ambiente em bom estado ecológico, com baixa alteração de origem antrópica e capaz de suportar distúrbios.

A new evolutionary clustering search for a no-wait flow shop problem with set-up times

This paper addresses the m-machine no-wait flow shop problem where the set-up time of a job is separated from its processing time. The performance measure considered is the total flowtime. A new hybrid metaheuristic Genetic Algorithm-Cluster Search is proposed to solve the scheduling problem. The performance of the proposed method is evaluated and the results are compared with the best method reported in the literature. Experimental tests show superiority of the new method for the test problems set, regarding the solution quality. (c) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Clustering di ammassi di galassie con cataloghi otticamente selezionati

In questo lavoro di tesi si è studiato il clustering degli ammassi di galassie e la determinazione della posizione del picco BAO per ottenere vincoli sui parametri cosmologici. A tale scopo si è implementato un codice per la stima dell'errore tramite i metodi di jackknife e bootstrap. La misura del picco BAO confrontata con i modelli cosmologici, grazie all'errore stimato molto piccolo, è risultato in accordo con il modelli LambdaCDM, e permette di ottenere vincoli su alcuni parametri dei modelli cosmologici.

Sviluppo di algoritmi di grid data clustering basati su metodi statistici

Lo scopo del clustering è quindi quello di individuare strutture nei dati significative, ed è proprio dalla seguente definizione che è iniziata questa attività di tesi , fornendo un approccio innovativo ed inesplorato al cluster, ovvero non ricercando la relazione ma ragionando su cosa non lo sia. Osservando un insieme di dati ,cosa rappresenta la non relazione? Una domanda difficile da porsi , che ha intrinsecamente la sua risposta, ovvero l’indipendenza di ogni singolo dato da tutti gli altri. La ricerca quindi dell’indipendenza tra i dati ha portato il nostro pensiero all’approccio statistico ai dati , in quanto essa è ben descritta e dimostrata in statistica. Ogni punto in un dataset, per essere considerato “privo di collegamenti/relazioni” , significa che la stessa probabilità di essere presente in ogni elemento spaziale dell’intero dataset. Matematicamente parlando , ogni punto P in uno spazio S ha la stessa probabilità di cadere in una regione R ; il che vuol dire che tale punto può CASUALMENTE essere all’interno di una qualsiasi regione del dataset. Da questa assunzione inizia il lavoro di tesi, diviso in più parti. Il secondo capitolo analizza lo stato dell’arte del clustering, raffrontato alla crescente problematica della mole di dati, che con l’avvento della diffusione della rete ha visto incrementare esponenzialmente la grandezza delle basi di conoscenza sia in termini di attributi (dimensioni) che in termini di quantità di dati (Big Data). Il terzo capitolo richiama i concetti teorico-statistici utilizzati dagli algoritimi statistici implementati. Nel quarto capitolo vi sono i dettagli relativi all’implementazione degli algoritmi , ove sono descritte le varie fasi di investigazione ,le motivazioni sulle scelte architetturali e le considerazioni che hanno portato all’esclusione di una delle 3 versioni implementate. Nel quinto capitolo gli algoritmi 2 e 3 sono confrontati con alcuni algoritmi presenti in letteratura, per dimostrare le potenzialità e le problematiche dell’algoritmo sviluppato , tali test sono a livello qualitativo , in quanto l’obbiettivo del lavoro di tesi è dimostrare come un approccio statistico può rivelarsi un’arma vincente e non quello di fornire un nuovo algoritmo utilizzabile nelle varie problematiche di clustering. Nel sesto capitolo saranno tratte le conclusioni sul lavoro svolto e saranno elencati i possibili interventi futuri dai quali la ricerca appena iniziata del clustering statistico potrebbe crescere.

Cosmologia con missione spaziale "Euclid"

Nel 2020 verrà lanciata la missione spaziale Euclid per investigare la natura dell’energia oscura. Euclid otterrà un’immensa quantità di dati fotometrici e spettrometrici finalizzati, soprattutto, alla misura di lenti gravitazionali deboli e oscillazioni acustiche barioniche. In questa tesi daremo una descrizione generale dello strumento e della scienza che potrà essere fatta grazie ad esso. In particolare, nel capitolo 2 verrà fornita una introduzione alla cosmologia e verranno introdotti i vari parametri cosmologici che Euclid sarà in grado di vincolare. Nel capitolo 3 si farà un’analisi dei principali fenomeni fisici che Euclid indagherà. Nel capitolo 4 verrà data una panoramica del satellite, descrivendo in dettaglio gli obiettivi, cosa osserverà e come farà le osservazioni, e quali sono gli strumenti che lo compongono (satellite, telescopio, VIS e NISP). Infine, nel capitolo 5 verranno mostrati dei primi risultati preliminari, ottenuti in questa tesi, riguardanti il test di un programma che servirà per la misura della funzione di correlazione a due punti di Euclid.

L'evoluzione della funzione di massa stellare delle galassie: un test per i modelli della loro formazione

Per lo sviluppo di un modello realistico di formazione ed evoluzione delle galassie è necessario un confronto sistematico con le osservazioni in modo da verificare che i dati vengano ben riprodotti. Lo scopo che si prefigge questo lavoro di Tesi è un confronto tra le caratteristiche delle galassie presenti nei cataloghi simulati (mock), costruiti sulla base di alcuni modelli, e quelle evinte dai dati osservativi di campioni di galassie (surveys) con l'obbiettivo di far luce su quali siano le maggiori discrepanze e quindi sulla direzione in cui i modelli andrebbero perfezionati. Per far questo, si è scelto di far uso della funzione di massa stellare delle galassie (MF), in quanto strumento statistico più indicativo di una popolazione di galassie, considerando sia la totalità delle galassie, sia separatamente le star-forming e le quiescenti. Questo lavoro di Tesi attua un confronto tra le MF a 0

Timely follow-up of abnormal diagnostic imaging test results in an outpatient setting: are electronic medical records achieving their potential?

BACKGROUND: Given the fragmentation of outpatient care, timely follow-up of abnormal diagnostic imaging results remains a challenge. We hypothesized that an electronic medical record (EMR) that facilitates the transmission and availability of critical imaging results through either automated notification (alerting) or direct access to the primary report would eliminate this problem. METHODS: We studied critical imaging alert notifications in the outpatient setting of a tertiary care Department of Veterans Affairs facility from November 2007 to June 2008. Tracking software determined whether the alert was acknowledged (ie, health care practitioner/provider [HCP] opened the message for viewing) within 2 weeks of transmission; acknowledged alerts were considered read. We reviewed medical records and contacted HCPs to determine timely follow-up actions (eg, ordering a follow-up test or consultation) within 4 weeks of transmission. Multivariable logistic regression models accounting for clustering effect by HCPs analyzed predictors for 2 outcomes: lack of acknowledgment and lack of timely follow-up. RESULTS: Of 123 638 studies (including radiographs, computed tomographic scans, ultrasonograms, magnetic resonance images, and mammograms), 1196 images (0.97%) generated alerts; 217 (18.1%) of these were unacknowledged. Alerts had a higher risk of being unacknowledged when the ordering HCPs were trainees (odds ratio [OR], 5.58; 95% confidence interval [CI], 2.86-10.89) and when dual-alert (>1 HCP alerted) as opposed to single-alert communication was used (OR, 2.02; 95% CI, 1.22-3.36). Timely follow-up was lacking in 92 (7.7% of all alerts) and was similar for acknowledged and unacknowledged alerts (7.3% vs 9.7%; P = .22). Risk for lack of timely follow-up was higher with dual-alert communication (OR, 1.99; 95% CI, 1.06-3.48) but lower when additional verbal communication was used by the radiologist (OR, 0.12; 95% CI, 0.04-0.38). Nearly all abnormal results lacking timely follow-up at 4 weeks were eventually found to have measurable clinical impact in terms of further diagnostic testing or treatment. CONCLUSIONS: Critical imaging results may not receive timely follow-up actions even when HCPs receive and read results in an advanced, integrated electronic medical record system. A multidisciplinary approach is needed to improve patient safety in this area.