87 resultados para Rhodnius milesi


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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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The presence of the prophenoloxidase (proPO) system in the haemolymph of Rhodnius prolixus and Triatoma infestans and the role played by Trypanosoma rangeli in the in vitro activation of proPO were tested. Both R. prolixus and T. infestans whole blood preparations showed a very active ProPO system. The proPO cascade of the two insect species were differentially activated by microbial-derived extracts: laminarin was a better activator of T. infestans haemolymph than of R. prolixus blood, and lipopolysaccharides from Shigella flexneri or Pseudomonas aeroginosa caused significant proPO activation of T. infestans haemolymph but not of R. prolixus preparations. For the two insect species, neither T. rangeli from culture nor parasite lysates were able to trigger proPO activation. The presence of the parasite in R. prolixus haemolymph/laminarin assays, however, significantly reduced the level of proPO activation to that of spontaneous activating controls. The immobilization of T. rangeli in vitro in haemolymph preparations occurred in both insect species and was dependent on the proPO activation intensity. Our results suggest that the susceptibility of R. prolixus to T. rangeli haemocoel infection may be explained, at least in part, by the suppression of the insect immune defence system i.e., inhibition of proPO in the presence of this protozoan parasite.

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High Throughput Sequencing capabilities have made the process of assembling a transcriptome easier, whether or not there is a reference genome. But the quality of a transcriptome assembly must be good enough to capture the most comprehensive catalog of transcripts and their variations, and to carry out further experiments on transcriptomics. There is currently no consensus on which of the many sequencing technologies and assembly tools are the most effective. Many non-model organisms lack a reference genome to guide the transcriptome assembly. One question, therefore, is whether or not a reference-based genome assembly gives better results than de novo assembly. The blood-sucking insect Rhodnius prolixus-a vector for Chagas disease-has a reference genome. It is therefore a good model on which to compare reference-based and de novo transcriptome assemblies. In this study, we compared de novo and reference-based genome assembly strategies using three datasets (454, Illumina, 454 combined with Illumina) and various assembly software. We developed criteria to compare the resulting assemblies: the size distribution and number of transcripts, the proportion of potentially chimeric transcripts, how complete the assembly was (completeness evaluated both through CEGMA software and R. prolixus proteome fraction retrieved). Moreover, we looked for the presence of two chemosensory gene families (Odorant-Binding Proteins and Chemosensory Proteins) to validate the assembly quality. The reference-based assemblies after genome annotation were clearly better than those generated using de novo strategies alone. Reference-based strategies revealed new transcripts, including new isoforms unpredicted by automatic genome annotation. However, a combination of both de novo and reference-based strategies gave the best result, and allowed us to assemble fragmented transcripts.

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Transposable elements (TEs) are widespread in insect´s genomes. However, there are wide differences in the proportion of the total DNA content occupied by these repetitive sequences in different species. We have analyzed the TEs present in R. prolixus (vector of the Chagas disease) and showed that 3.0% of this genome is occupied by Class II TEs, belonging mainly to the Tc1-mariner superfamily (1.65%) and MITEs (1.84%). Interestingly, most of this genomic content is due to the expansion of two subfamilies belonging to: irritans himar, a well characterized subfamily of mariners, and prolixus1, one of the two novel subfamilies here described. The high amount of sequences in these subfamilies suggests that bursts of transposition occurred during the life cycle of this family. In an attempt to characterize these elements, we performed an in silico analysis of the sequences corresponding to the DDD/E domain of the transposase gene. We performed an evolutionary analysis including network and Bayesian coalescent-based methods in order to infer the dynamics of the amplification, as well as to estimate the time of the bursts identified in these subfamilies. Given our data, we hypothesized that the TE expansions occurred around the time of speciation of R. prolixus around 1.4 mya. This suggestion lays on the Transposon Model of TE evolution, in which the members of a TE population that are replicative active are present at multiple loci in the genome, but their replicative potential varies, and of the Life Cycle Model that states that when present-day TEs have been involved in amplification bursts, they share an ancestral copy that dates back to this initial amplification.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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A doença de Chagas, causada pelo protozoário flagelado Trypanosoma cruzi, foi descrita pelo pesquisador brasileiro Carlos Chagas em 1909. É transmitida ao homem por insetos hemípteros conhecidos como barbeiros dos quais os gêneros mais importantes são Panstrongylus, Rhodnius e Triatoma. Essa zoonose representa um risco para aproximadamente 20 milhões de pessoas em todo o mundo, principalmente na América Latina. Para tentar explicar as diferentes manifestações observadas na doença de Chagas, vários estudos foram realizados com intuito de averiguar as possíveis correlações entre as formas clínicas com a variabilidade genética do parasito. Algumas hipóteses estão relacionadas provavelmente ao fato de a doença ser um processo multifatorial, em que tanto aspectos do parasito como do hospedeiro estão inter-relacionados ou ainda a escolha inadequada de alvos como marcadores de patogenicidade na tentativa de estabelecer a correlação entre as formas clínicas e a variabilidade genética do parasito. Com o intuito de contribuir para ampliar o conhecimento sobre as populações de T. cruzi, foi realizada a cinética de crescimento em meio LIT e o estudo genotípico de seis cepas de T. cruzi isoladas de exemplares de R. montenegrensis, T. rubrovaria e T. sordida por meio de marcadores genotípicos utilizando as sequência dos genes 24Sα do DNA ribossomal, HSP60 e GPI.

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A doença de Chagas, causada pelo protozoário flagelado Trypanosoma cruzi, foi descrita pelo pesquisador brasileiro Carlos Chagas em 1909. É transmitida ao homem por insetos hemípteros conhecidos como barbeiros dos quais os gêneros mais importantes são Panstrongylus, Rhodnius e Triatoma. Essa zoonose representa um risco para aproximadamente 20 milhões de pessoas em todo o mundo, principalmente na América Latina. Para tentar explicar as diferentes manifestações observadas na doença de Chagas, vários estudos foram realizados com intuito de averiguar as possíveis correlações entre as formas clínicas com a variabilidade genética do parasito. Algumas hipóteses estão relacionadas provavelmente ao fato de a doença ser um processo multifatorial, em que tanto aspectos do parasito como do hospedeiro estão inter-relacionados ou ainda a escolha inadequada de alvos como marcadores de patogenicidade na tentativa de estabelecer a correlação entre as formas clínicas e a variabilidade genética do parasito. Com o intuito de contribuir para ampliar o conhecimento sobre as populações de T. cruzi, foi realizada a cinética de crescimento em meio LIT e o estudo genotípico de seis cepas de T. cruzi isoladas de exemplares de R. montenegrensis, T. rubrovaria e T. sordida por meio de marcadores genotípicos utilizando as sequência dos genes 24Sα do DNA ribossomal, HSP60 e GPI.