Dies sacra perloca sacrae scripturae progrediens in compendium

UANL

Role of the homeodomain transcription factor Hoxa13 in embryonic development and formation of extra-embryonic structures

La famille des gènes Hox code pour des facteurs de transcription connus pour leur contribution essentielle à l’élaboration de l’architecture du corps et ce, au sein de tout le règne animal. Au cours de l’évolution chez les vertébrés, les gènes Hox ont été redéfinis pour générer toute une variété de nouveaux tissus/organes. Souvent, cette diversification s’est effectuée via des changements quant au contrôle transcriptionnel des gènes Hox. Chez les mammifères, la fonction de Hoxa13 n’est pas restreinte qu’à l’embryon même, mais s’avère également essentielle pour le développement de la vascularisation fœtale au sein du labyrinthe placentaire, suggérant ainsi que sa fonction au sein de cette structure aurait accompagné l’émergence des espèces placentaires. Au chapitre 2, nous mettons en lumière le recrutement de deux autres gènes Hoxa, soient Hoxa10 et Hoxa11, au compartiment extra-embryonnaire. Nous démontrons que l’expression de Hoxa10, Hoxa11 et Hoxa13 est requise au sein de l’allantoïde, précurseur du cordon ombilical et du système vasculaire fœtal au sein du labyrinthe placentaire. De façon intéressante, nous avons découvert que l’expression des gènes Hoxa10-13 dans l’allantoïde n’est pas restreinte qu’aux mammifères placentaires, mais est également présente chez un vertébré non-placentaire, indiquant que le recrutement des ces gènes dans l’allantoïde précède fort probablement l’émergence des espèces placentaires. Nous avons généré des réarrangements génétiques et utilisé des essais transgéniques pour étudier les mécanismes régulant l’expression des gènes Hoxa dans l’allantoïde. Nous avons identifié un fragment intergénique de 50 kb capable d’induire l’expression d’un gène rapporteur dans l’allantoïde. Cependant, nous avons trouvé que le mécanisme de régulation contrôlant l’expression du gène Hoxa au sein du compartiment extra-embryonnaire est fort complexe et repose sur plus qu’un seul élément cis-régulateur. Au chapitre 3, nous avons utilisé la cartographie génétique du destin cellulaire pour évaluer la contribution globale des cellules exprimant Hoxa13 aux différentes structures embryonnaires. Plus particulièrement, nous avons examiné plus en détail l’analyse de la cartographie du destin cellulaire de Hoxa13 dans les pattes antérieures en développement. Nous avons pu déterminer que, dans le squelette du membre, tous les éléments squelettiques de l’autopode (main), à l’exception de quelques cellules dans les éléments carpiens les plus proximaux, proviennent des cellules exprimant Hoxa13. En contraste, nous avons découvert que, au sein du compartiment musculaire, les cellules exprimant Hoxa13 et leurs descendantes (Hoxa13lin+) s’étendent à des domaines plus proximaux du membre, où ils contribuent à générer la plupart des masses musculaires de l’avant-bras et, en partie, du triceps. De façon intéressante, nous avons découvert que les cellules exprimant Hoxa13 et leurs descendantes ne sont pas distribuées uniformément parmi les différents muscles. Au sein d’une même masse musculaire, les fibres avec une contribution Hoxa13lin+ différente peuvent être identifiées et les fibres avec une contribution semblable sont souvent regroupées ensemble. Ce résultat évoque la possibilité que Hoxa13 soit impliqué dans la mise en place de caractéristiques spécifiques des groupes musculaires, ou la mise en place de connections nerf-muscle. Prises dans leur ensemble, les données ici présentées permettent de mieux comprendre le rôle de Hoxa13 au sein des compartiments embryonnaires et extra-embryonnaires. Par ailleurs, nos résultats seront d’une importance primordiale pour soutenir les futures études visant à expliquer les mécanismes transcriptionnels soutenant la régulation des gènes Hoxa dans les tissus extra-embryonnaires.

Efectos reglamentarios y jurisdiccionales del derecho comunitario Andino sobre el derecho administrativo colombiano

Este trabajo se soporta sobre una base conformada por dos conceptos, que constituyen el horizonte contextual de la investigación: Derecho Administrativo y Comunidad de integración. Es claro que al hablar de una Comunidad de integración específica como la Comunidad Andina (CAN), incide de forma directa en la actividad del derecho administrativo.Ha sido necesario que los países que conforman los grupos de integración económica cedan parte de sus competencias para crear un ordenamiento jurídico de orden supranacional, el cual modifica la dinámica social de las relaciones comerciales y afecta la estructura de la administración pública, haciendo que el derecho administrativo no se limite a interactuar solo con derecho nacional. Esta mutua dependencia de las políticas internas y las regionales se realiza, entonces, cada vez que existe participación y compromiso de los Estados frente a las decisiones, de carácter vinculante o no. En esa medida surge el problema de investigación tendiente a esclarecer cómo ha sido la adopción de las decisiones e interpretaciones, emanadas de los mecanismos oficiales del Derecho Comunitario Andino, en el ordenamiento jurídico colombiano. La existencia de varios puntos de vista con respecto a la obligatoriedad o no de dicha adopción, moldea un tema de suficiente amplitud y profundidad para ser estudiado en un trabajo de investigación.

Not all sigmodontine rodents in the sugarcane fields in costal Veracruz, Mexico, are pests

Rats and mice have traditionally been considered one of the most important pests of sugarcane. However, "control" campaigns are rarely specific to the target species, and can have an effect on local wildlife, in particular non-pest rodent species. The objective of this study was to distinguish between rodent species that are pests and those that are not, and to identify patterns of food utilization by the rodents in the sugarcane crop complex. Within the crop complex, subsistence crops like maize, sorghum, rice, and bananas, which are grown alongside the sugarcane, are also subject to rodent damage. Six native rodent species were trapped in the Papaloapan River Basin of the State of Veracruz; the cotton rat (Sigmodon hispidus), the rice rat (Oryzomys couesi), the small rice rat (O. chapmani), the white footed mouse (Peromyscus leucopus), the golden mouse (Reithrodontomys sumichrasti), and the pigmy mouse (Baiomys musculus). In a stomach content analysis, the major food components for the cotton rat, the rice rat and the small rice rat were sugarcane (4.9 to 30.1 %), seed (2.7 to 22.9%), and vegetation (0.9 to 29.8%); while for the golden mouse and the pigmy mouse the stomach content was almost exclusively seed (98 to 100%). The authors consider the first three species to be pests of the sugarcane crop complex, while the last two species are not.

Detection of hantaviruses in Brazilian rodents by SYBR-Green-based real-time RT-PCR

Current knowledge of the pathogenic hantavirus indicates that wild rodents are its primary natural reservoir. Specific primers to detect the presence of viral genomes were developed using an SYBR-Green-based real-time RT-PCR protocol. One hundred sixty-four rodents native to the Atlantic Forest biome were captured in So Paulo State, Brazil, and their tissues were tested. The presence of hantavirus RNA was detected in sixteen rodents: three specimens of Akodon montensis, three of Akodon cursor, two of Necromys lasiurus, one of Juliomys sp., one of Thaptomys nigrita, five of Oligoryzomys nigripes, and one of Oryzomys sp. This SYBR Green real-time RT-PCR method for detection of hantavirus may be useful for surveying hantaviruses in Brazil.

New Improvements in Automatic Structure Elucidation Using the LSD (Logic for Structure Determination) and the SISTEMAT Expert Systems

This article describes the integration of the LSD (Logic for Structure Determination) and SISTEMAT expert systems that were both designed for the computer-assisted structure elucidation of small organic molecules. A first step has been achieved towards the linking of the SISTEMAT database with the LSD structure generator. The skeletal descriptions found by the SISTEMAT programs are now easily transferred to LSD as substructural constraints. Examples of the synergy between these expert systems are given for recently reported natural products.

Designing Novel Antitrypanosomal Agents from a Mixed Graph-Theoretical Substructural Approach

Chagas disease is nowadays the most serious parasitic health problem. This disease is caused by Trypanosoma cruzi. The great number of deaths and the insufficient effectiveness of drugs against this parasite have alarmed the scientific community worldwide. In an attempt to overcome this problem, a model for the design and prediction of new antitrypanosomal agents was obtained. This used a mixed approach, containing simple descriptors based on fragments and topological substructural molecular design descriptors. A data set was made up of 188 compounds, 99 of them characterized an antitrypanosomal activity and 88 compounds that belong to other pharmaceutical categories. The model showed sensitivity, specificity and accuracy values above 85%. Quantitative fragmental contributions were also calculated. Then, and to confirm the quality of the model, 15 structures of molecules tested as antitrypanosomal compounds (that we did not include in this study) were predicted, taking into account the information on the abovementioned calculated fragmental contributions. The model showed an accuracy of 100% which means that the ""in silico"" methodology developed by our team is promising for the rational design of new antitrypanosomal drugs. (C) 2009 Wiley Periodicals, Inc. J Comput Chem 31: 882-894. 2010

Design of novel antituberculosis compounds using graph-theoretical and substructural approaches

The increasing resistance of Mycobacterium tuberculosis to the existing drugs has alarmed the worldwide scientific community. In an attempt to overcome this problem, two models for the design and prediction of new antituberculosis agents were obtained. The first used a mixed approach, containing descriptors based on fragments and the topological substructural molecular design approach (TOPS-MODE) descriptors. The other model used a combination of two-dimensional (2D) and three-dimensional (3D) descriptors. A data set of 167 compounds with great structural variability, 72 of them antituberculosis agents and 95 compounds belonging to other pharmaceutical categories, was analyzed. The first model showed sensitivity, specificity, and accuracy values above 80% and the second one showed values higher than 75% for these statistical indices. Subsequently, 12 structures of imidazoles not included in this study were designed, taking into account the two models. In both cases accuracy was 100%, showing that the methodology in silico developed by us is promising for the rational design of antituberculosis drugs.

Use of self-organizing maps and molecular descriptors to predict the cytotoxic activity of sesquiterpene lactones

Some sesquiterpene lactones (SLs) are the active compounds of a great number of traditionally medicinal plants from the Asteraceae family and possess considerable cytotoxic activity. Several studies in vitro have shown the inhibitory activity against cells derived from human carcinoma of the nasopharynx (KB). Chemical studies showed that the cytotoxic activity is due to the reaction of alpha,beta-unsaturated carbonyl structures of the SLs with thiols, such as cysteine. These studies support the view that SLs inhibit tumour growth by selective alkylation of growth-regulatory biological macromolecules, such as key enzymes, which control cell division, thereby inhibiting a variety of cellular functions, which directs the cells into apoptosis. In this study we investigated a set of 55 different sesquiterpene lactones, represented by 5 skeletons (22 germacranolides, 6 elemanolides, 2 eudesmanolides, 16 guaianolides and nor-derivatives and 9 pseudoguaianolides), in respect to their cytotoxic properties. The experimental results and 3D molecular descriptors were submitted to Kohonen self-organizing map (SOM) to classify (training set) and predict (test set) the cytotoxic activity. From the obtained results, it was concluded that only the geometrical descriptors showed satisfactory values. The Kohonen map obtained after training set using 25 geometrical descriptors shows a very significant match, mainly among the inactive compounds (similar to 84%). Analyzing both groups, the percentage seen is high (83%). The test set shows the highest match, where 89% of the substances had their cytotoxic activity correctly predicted. From these results, important properties for the inhibition potency are discussed for the whole dataset and for subsets of the different structural skeletons. (C) 2008 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.

Chemotaxonomic relationships in Celastraceae inferred from principal component analysis (PCA) and partial least squares (PLS)

This paper describes a chemotaxonomic analysis of a database of triterpenoid compounds from the Celastraceae family using principal component analysis (PCA). The numbers of occurrences of thirty types of triterpene skeleton in different tribes of the family were used as variables. The study shows that PCA applied to chemical data can contribute to an intrafamilial classification of Celastraceae, once some questionable taxa affinity was observed, from chemotaxonomic inferences about genera and they are in agreement with the phylogeny previously proposed. The inclusion of Hippocrateaceae within Celastraceae is supported by the triterpene chemistry.

Volsurf Descriptors to Analyse Anti-HCV and Cytotoxic Activities of Sesquiterpene Lactones from Asteraceae Family

Various significant anti-HCV and cytotoxic sesquiterpene lactones (SLs) have been characterized. In this work, the chemometric tool Principal Component Analysis (PCA) was applied to two sets of SLs and the variance of the biological activity was explored. The first principal component accounts for as much of the variability in the data as possible, and each succeeding component accounts for as much of the remaining variability as possible. The calculations were performed using VolSurf program. For anti-HCV activity, PC1 (First Principal Component) explained 30.3% and PC2 (Second Principal Component) explained 26.5% of matrix total variance, while for cytotoxic activity, PC1 explained 30.9% and PC2 explained 15.6% of the total variance. The formalism employed generated good exploratory and predictive results and we identified some structural features, for both sets, important to the suitable biological activity and pharmacokinetic profile.

Implementação de estratégias de internacionalização de empresas: um processo de aprendizagem organizacional

Este trabalho investigou a implementação de Estratégias de Internacionalização de Empresas instaladas na Região de Curitiba com o objetivo de descobrir como diferentes empresas aumentam seu envolvimento fora de sua base. Para responder a esta questão, considerou-se a literatura sobre Estratégia Empresarial, Processos de Internacionalização de Empresas e Aprendizagem Organizacional, de fonna a construir hipótese orientadora para a pesquisa. Investigou-se a existência de Processos de Aprendizagem Organizacional sustentando o Processo de Internacionalização das Empresas. A pesquisa de campo utilizou o método qualitativo, observacional, tendo a entrevista como ferramenta, identificando as trajetórias de internacionalização das empresas. Em cada uma destas, buscou projetos cujas taxas de crescimento do seu comprometimento com o ambiente externo fossem altas. Explorou as soluções adotadas para as dificuldades geradas pelas incertezas encontradas na implementação desses projetos, com o objetivo de verificar a presença de Processos de Aprendizagem Organizacional. Como resultado da investigação em sete empresas diferentes, com estratégias diferentes, em diferentes estágios de internacionalização, com projetos de naturezas diversas, este estudo concluiu pela existência de um fenômeno comum: em cem por cento das empresas pesquisadas, as altas taxas de crescimento de seu envolvimento fora de suas bases, foram sustentados por uma acentuada dinâmica de Aprendizagem Organizacional. Esta constatação resgata os conceitos da Universidade de Uppsala e introduz a abordagem sistêmica da Aprendizagem Organizacional no estudo do Processo de Internacionalização de Empresas, proporcionando explicação para as Born Global e para a internacionalização através dos network.

Hidrodinâmica costeira e quantificação do transporte longitudinal de sedimentos não coesivos na zona de surfe das praias adjacentes aos molhes da Barra do Rio Grande, RS, Brasil (aplicação às praias do Cassino, Mar Grosso e adjacências dos Molhes Leste e Oeste da embocadura do estuário da Lagoa dos Patos)

A ocupação do litoral por empreendimentos sócio-econômicos e a realização de obras de engenharia capazes de atender estas demandas tem despertado a necessidade de estudos detalhados do transporte litorâneo. Usando metodologia de coleta de sedimentos por ‘traps’ (fundo e suspensão) dentro da zona de surfe e metodologias de aquisição de imagens, topografia e sedimentologia conduzidas com o auxílio de filmadora, estação total e trabalhos em laboratório, respectivamente, determinou-se os parâmetros hidrodinâmicos e morfométricos da região. Dados de ondas em águas profundas foram obtidos a partir de modelo do CPTEC/INPE. Os trabalhos de campo foram realizados em 50 campanhas distribuídas pelo período de 1 ano. Do total, 42 foram dedicadas exclusivamente a dados hidrodinâmicos e morfométricos enquanto que as 8 restantes foram utilizadas também para coleta de sedimentos. Ao mesmo tempo foram obtidos dados sobre a velocidade dos fluxos e sobre o transporte transversal no espraiamento. Todos os dados foram obtidos em condições atmosféricas normais. Os trabalhos de campo foram conduzidos em 6 perfis transversais distribuídos entre as praias do Cassino e Mar Grosso (3 de cada lado da embocadura). Dois perfis situados na adjacência dos Molhes Leste e Oeste, 2 posicionados a 3 Km da base dos respectivos molhes e 2 distantes 10 Km destas mesmas bases. Concomitante com as medições do transporte longitudinal foram realizadas observações específicas sobre a participação dos diferentes níveis coletados na formação do transporte total. A distribuição dos sedimentos na coluna d’água e ao longo do perfil foram estudadas considerando o diâmetro médio do grão. Foi estudada também a participação do transporte de fundo (bedload) e em suspensão (suspended load) obtendo-se evidencias de que o transporte de fundo representa aproximadamente 18% do transporte total. Os resultados das medições indicaram uma vazão bidirecional de sedimentos, com baixa intensidade de transporte e resultante positiva direcionada para nordeste, conforme apresentado a seguir: Perfil-1(01/07/03) 1,92 m3/h NE-SW; Perfil-2 (19/07/02) 2,60 m3/h NE-SW, (16/01/03) 0,23 m3/h NE-SW e (20/02/03) 25,1 m3/h SW-NE; Perfil-3 (02/05/03) 4,24 m3/h SW-NE; Perfil-4 (05/09/03) 43,33 m3/h SW-NE; Perfil-5 (17/01/03) 2,54 m3/h NE-SW e Perfil-6 (21/02/03) 31,74 m3/h SW-NE. As baixas taxas de transporte total (máx. 940 e mín. 402 m³/ano/m) e líquido (máx. 574 e mín. 218 m³/ano/m) encontrados na região são consistentes com o comportamento dos estoques sedimentares acumulados no entorno dos molhes nos últimos 90 anos, embora estas taxas anuais representem apenas uma ordem de grandeza do transporte na região, já que são uma simples extrapolação dos dados horários não traduzindo, portanto os efeitos do clima de ondas local. Os dados obtidos serviram para calibrar 2 equações empíricas CERC e Kamphuis-91 que foram utilizadas para extrapolar as taxas de transporte longitudinal pelo período de 1 ano, considerando também a deriva ocasionada por ondas de tempestades. Finalmente, concluiu-se que o baixo transporte longitudinal é ocasionado pelos pequenos ângulos de incidência (em relação a normal) das ondas na arrebentação, que a direção da corrente longitudinal apresenta forte convergência com a componente longitudinal do vento na costa e que a baixa deriva litorânea (em condições atmosféricas normais) para nordeste só é magnificada pela presença das ondas de tempestades que varrem a costa vindas do quadrante sul e que representam aproximadamente 16% do ano.

A assembléia de pequenos mamíferos da floresta paludosa do faxinal, Torres-RS : sua relação com a borda e o roedor Akodon montensis (Rodentia, Muridae) como potencial dispersor de sementes endozoocóricas

Embora a assembléia de pequenos mamíferos desempenhe diferentes e importantes papéis na dinâmica das florestas, o conhecimento sobre a riqueza e o papel ecológico desempenhado pelas espécies nas restingas do estado do Rio Grande do Sul é ainda limitado, tendo-se poucas informações ecológicas sobre quem são esses animais nos diferentes fragmentos de florestas e como é sua relação espacial em ambientes de borda. Apesar da relevância, poucos estudos buscaram verificar se a assembléia de pequenos mamíferos em fragmentos florestais é sensível aos efeitos de borda, qual a extensão da borda para esses animais e se ela varia em diferentes estações do ano. No extremo norte da planície costeira do estado do Rio Grande do Sul, em um fragmento de floresta paludosa, denominada “Faxinal”, o presente trabalho foi realizado com o objetivo de investigar qual a riqueza e sucesso de captura de pequenos mamíferos, como é sua relação com a distância da beira do fragmento e se essa relação varia entre as estações do ano. Nos meses amostrais de janeiro (verão), abril (outono) e agosto (inverno) de 2004 foram colocadas armadilhas de arame de dois tamanhos nos estratos terrestre e arbustivo, em um gradeado com seis transecções paralelas que cobriram parte de formação florestal (3,17ha) e parte de campestre (0,31ha). A distância dos postos de captura do gradeado à beira mais próxima da floresta foram agrupadas em seis classes (1: 0-30m; 2: 31-70m; 3: 71-100; 4: 101-120; 5: 121-131; 6: 131-160m, no solo e 1: 0-20m; 2: 40-71m; 3: 80-100m; 4: 101-120m; 5: 121-131m; 6: 132-160m, no estrato arbustivo) para verificar se os dados de sucesso de captura das espécies de pequenos mamíferos diferem entre os fatores distância da beira e períodos amostrais (estações do ano). Onze espécies de pequenos mamíferos foram capturadas somente na parte florestada do gradeado (sucesso de captura total de 15,49%), sendo que maior riqueza, número de indivíduos e de capturas foram de roedores e no estrato terrestre. As espécies mais capturadas foram Akodon montensis (154 indivíduos), Oligoryzomys nigripes (34 indivíduos), Brucepattersonius iheringi (19 indivíduos), Oryzomys angouya (12 indivíduos) e Micoureus cf. demerarae (8 indivíduos) e Didelphis albiventris (7 indivíduos). O mês amostral de inverno foi aquele que apresentou maior riqueza, maior sucesso de captura e maior biomassa. As análises demonstraram relação significativa entre o sucesso de captura do conjunto das espécies de pequenos mamíferos capturadas no solo e a distância da beira, cuja relação esteve fortemente associada à estação do ano. A estrutura e/ou composição da assembléia diferiram entre as duas primeiras classes de distância, que por sua vez diferiram das demais. Isso indica que a assembléia de pequenos mamíferos, capturada no solo, é sensível à beira da floresta e que a sensibilidade varia conforme a estação do ano. Por outro lado, quando avaliada individualmente a relação para a espécie dominante Akodon montensis, o sucesso de captura do roedor não evidenciou com nitidez diferença entre as classes de distância, mas houve diferença entre os períodos amostrais, sendo o mês amostral com menor média de temperatura anual aquele com maior número de indivíduos e de capturas. Além disso, por Akodon montensis ter sido a espécie mais comum e abundante em todos períodos amostrais e em todos os pontos do gradeado, coletou-se 249 amostras fecais para investigar a capacidade dessa espécie em realizar dispersão endozoocórica As amostras coletadas foram analisadas sob lupa para verificar se existiam sementes intactas e, quando colocadas em experimento de germinação, se seriam capazes de germinar. O registro de sementes inteiras nas fezes de Akodon montensis e o tratamento dado às sementes, de não comprometer a capacidade de germinação, permite que a espécie seja, ao menos em parte, considerada legítima e efetiva dispersora de Ficus organensis e de Piper cf. solmisianum